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Anopheles gambiae
cluster # 7797 cluster # 7797       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7797#0 length = 997 sequences # 8  

consensusID : consensus_7797#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 997
fasta sequence
                              [TTTTTCTGTAAAACGTTTGGCTAGTTTATGTTTCTTAACATGTACAAACATACTTAAAATTTAGTACAATATTGATAAAGGTTACATTTCCTGCACTTCAACTTTA-ACCTTCAACGCGTAATCCTTGGATTGAGACTTGCAGGGCACATCTCTTTGAACATGCTGCTGCCAGTTGTATCGGTTGTGGAACGCTTTCCCACACTTGTCACACCGGAATGCACGTTTGTGTGATGCCAGATGGGCTATTGCCCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTGCAGATGGGACACTTGCAAGGTGTACTACTATCCCTGTGCCTCTGTAAAAGCACCTCATTTGCAAACGATTTGCCACACGTCTTACACCGGAACCGAGGCACGCTTGGAGTAGCATCTCCGGCTTCTCTCCCCTTGCAAATCTTCTCGCAGTGTCTCTTGAAGTTCGATTTGGTGGTAAACGTTTTACCGCACTGTTCACACCGCAACGACTCTTTGTGTGCATTCAGATGCTTTTTGGCCTTGCCAGGGCTTAGCACCTCCTTGCAGGTGGGACACCTGCACGGTAAAGCCTTTGCGGTGTGCCTTCTTAAACCTCGCTCATTGACGAACGATTTGTCGCACTTTTCACACTGGTACGGACCGTTGTGGGCCTCTAGATGTTGTTTTGCCTTTCGGGGATTTAACACTTTCTTGCAGATGGGACACTGGCAAGGTATAGCCTTCTTGAGGTGCCCTCTCAGCGTTTTCTTGGAGGTGAACGTTTGCTTGCACTTGTCACACCGGAACCGACCGTCCTGTGTCTCGGGACGTTTTTTGCTCCCTTCGGGTTCCATCGCTTCGTGCCAAGCAATGTGCTGCTTCATCTTTGCGACTCCTATCATTTGATCGCAGAGCGTGCACTTTGTTCGGTGCATCTTCTGTCGGTGTGCGATCAGCATCTTCCCATTCGGAAAGCTGCGGTTACACTCCGCACACGCAAACGTGTCATGGATAAAATGTCGG]

[+] EMBL CNS08LTU             [TTTTTCTGTAAAA  TTTGGCTAGTTTATGTTTCTTAACATGTACAAACATACTTAAAATTTAGTACAATATTGATAAAGGTTACATTTCCTGCACTTCAACTTTACACCTTCAACGCGTAATCCTTGGATTGAGACTTGCAGGGCACATCTCTTTGAACATGCTGCTGCCAGTGGTATCGGTTGTGGAACGCTTTCCCACACTTGTCACACCGGAATGCACGTTTGTGTGAGGCCAGAGGGGCTATTGCCCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTGCAGAAGGGACACTTGCAAGGTGTACTACTATCCCTGTCCCTCTGTAAAAACACCTCATTTGCAAACGATTTGCCACACGTCTTACACCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CNS08LXA             [ TTTTCTGT CAACGCCTGGCTAGTTTATGTTTCTTAACATGTACAAACATACTTAAAATTTAGTACAATATTGATAAAGGTTACATTTCCTGCACTTCAACTTTA ACCTTCAACGCGTAATCCTTGGATTGAGACTTGCAGGGCACATCTCTTTGAACATGCTGCTGCCAGTTGTATCGGTTGTGGAACGCTTTCCCACACTTGTCACACCGGAATGCACGTTTGTGTGATGCCAGATGGGCTATTG CCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTGCAGATGGGACACTTGCAAGGTGTACTACTATCCCTGTGCCTCTGTAAAAGCACCTCATTTGCAAACGATTTGCCACACGTCTTACACCGGAACCGAGGCACGCTTGGAGTAGCATCTCCGGCTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CNS08ZNO             [       GTAAAAAGTTTTGCTAGTTTATGTTTCTTAACATGTACAAACATACTTAAAATTTAGTACAATATTGATAAAGGTTACATTTCCTGCACTTCAACTTTA ACCTTCAACGCGTAATCCTTGGATTGAGACTTGCAGGGCACATCTCTTTGAACATGCTGCTGCCAGTTGTATCGGTTGTGGAACGCTTTCCCACACTTGTCACACCGGAATGCACGTTTGTGTGATGCCAGATGGGCTATTGCCCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTGCAGATGGGACACTTGCAAGTTGTACTACTATCCCTGTGCCTCTGTAAAAGCACCTCATTTGCAAACGATTTGCCACACGTCTTACACCGGAACCGAGGCACGCTTGGAGTAGCATCTCCGGCTTCTCTCCCCTTGCAAATCTTCTCGCAGTGTCTCTTGAAGTTCGATTTGGTGGTAAACGTTTTACCGCACTGTTCACACCGCAACGACTCTTTGTGTGCATTCAGATGCTTTTTGGCCTTGCCAGGGCTTAGCACCTCCTTGCAGGTGGGACA CTG ACGGTAAAGCCTTTGCGGTGTGCCTTCTTAAACCTCGCTCATTGGCGAACGATTTGTCGCACTTTTCACACTGGTACGGACCGTTGTGGGCCTCTAGATGTTGTTTTGCCTTTCGGGGATTTAACACTTTCTTGCAGATGGGACACTGGCAAGGTATAGCCTTCTTGAGGTGCCCTCTCAGCGTTTTCTTGGAGGTGAACGTTTGCTTGCACTTGTCACACCGGAACCGACCGTCCTGTGTCTCGGGACGTTTTTTGCTCCCTTCGGGTTCCATCGCTT                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL BX607736             [               TTTGGCTAGTTTATGTTTCTTAACATGTACAAACATACTTAAAATTTAGTACAATATTGATAAAGGTTACATTTCCTGCACTTCAACTTTA ACCTTCAACGCGTAATCCTTGGATTGAGACTTGCAGGGCACATCTCTTTGAACATGCTGCTGCCAGTTGTATCGGTTGTGGAACGCTTTCCCACACTTGTCACACCGGAATGCACGTTTGTGTGATGCCAGATGGGCTATTGCCCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTGCAGATGGGACACTTGCAAGGTGTACTACTATCCCTGTGCCTCTGTAAAAGCACCTCATTTGCAAACGATTTGCCACACGTCTTACACCGGAACCGAGGCACGCTTGGAGTAGCATCTCCGGCTTCTCTCCCCTTGCAAATCTTCTCGCAGTGTCTCTTGAAGTTCGATTTGGTGGTAAACGTTTTACCGCACTGTTCACACCGCAACGACTCTTTGTGTGCATTCAGATGCTTTTTGGCCTTGCCAGGGCTTAGCACCTCCTTGCAGGTGGGACACCTGCACGGTAAAGCCTTTGCGGTGTGCCTTCTTAAACCTCGCTCATTGACGAACGATTTGTCGCACTTTTCACACTGGTACGGACCGTTGTGGGCCTCTAGATGTTGTTTTGCCTTTCGGGGATTTAACACTTTCTTGCAGATGGGACACTGGCAAGGTATAGCCTTCTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CNS08P1O             [                                       ATGTAC AACATACTTAAAATTTAGTACAATATTGATAAAGGTTACATTTCCTGCACTTCAACTTTA ACCTTCAACGCGTAATCCTTGGATTGAGACTTGCAGGGCACATCTCTTTGAACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL BX604429             [                                                                                                                                                                  GCTGCTGCCAGTTGTATCGGTTGTGGAACGCTTTCCCACACTTGTCACACCGGAATGCACGTTTGTGTGATGCCAGATGGGCTATTGCCCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTGCAGATGGGACACTTGCAAGGTGTACTACTATCCCTGTGCCTCTGTAAAAGCACCTCATTTGCAAACGATTTGCCACACGTCTTACACCGGAACCGAGGCACGCTTGGAGTAGCATCTCCGGCTTCTCTCCCCTTGCAAATCTTCTCGCAGTGTCTCTTGAAGTTCGATTTGGTGGTAAACGTTTTACCGCACTGTTCACACCGCAACGACTCTTTGTGTGCATTCAGATGCTTTTTGGCCTTGCCAGGGCTTAGCACCTCCTTGCAGGTGGGACACCTGCACGGTAAAGCCTTTGCGGTGTGCCTTCTTAAACCTCGCTCATTGACGAACGATTTGTCGCACTTTTCACACTGGTACGGACCGTTGTGGGCCTCTAGATGTTGTTTTGCCTTTCGGGGATTTAACACTTTCTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CNS08LWS             [                                                                                                                                                                                                                              GTTTGTGTGATGCCAGAAGGGCTATTG CCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTTCAGATGGGACACTTGCAAGGTTTACTACTATCCCTGTGCCTCTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL BM609753             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACGATTTGCCACACGTCTTACACCGGAACCGAGGCACGCTTGGAGTAGCATCTCCGGCTTCTCTCCCCTTGCAAATCTTCTCGCAGTGTCTCTTGCAGTTCGACTTGGTGGTAAACGTTTTACCGCACTGTTCACACCGCAACGACTCTTTGTGTGCATTCAGATGCTTTTTGGCCTTGCCAGGGCTTAGCACCTCCTTGCAGGTGGGACACCTGCACGGTAAAGCCTTTGCGGTGTGCCTTCTTAAACCTCGCTCATTGACGAACGATTTGTCGCACTTTTCACACTGGTACGGACCGTTGTGGGCCTCTAGATGTTGTTTTGCCTTTCGGGGATTTAACACTTTCTTGCAGATGGGACACTGGCAAGGTATAGCCTTCTTGAGGTGCCCTCTCAGCGTTTTCTTGGAGGTGAACGTTTGCTTGCACTTGTCACACCGGAACCGACCGTCCTGTGTCTCCGGACGTTTTTTGCTCCCTTCGGGTTCCATCGCTTCGTGCCAAGCAATGTGCTGCTTCATCTTTGCGACTCCTATCATTTGATCGCAGAGCGTGCACTTTGTTCGGTGCATCTTCTGTCGGTGTGCGATCAGCATCTTCCCATTCGGAAAGCTGCGGTTACACTCCGCACACGCAAACGTGTCATGGATAAAATGTCGG]


>consensus_7797#0 TTTTTCTGTAAAACGTTTGGCTAGTTTATGTTTCTTAACATGTACAAACATACTTAAAAT TTAGTACAATATTGATAAAGGTTACATTTCCTGCACTTCAACTTTAACCTTCAACGCGTA ATCCTTGGATTGAGACTTGCAGGGCACATCTCTTTGAACATGCTGCTGCCAGTTGTATCG GTTGTGGAACGCTTTCCCACACTTGTCACACCGGAATGCACGTTTGTGTGATGCCAGATG GGCTATTGCCCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTGCAGATGGGACACTTGCAAGGTGTACT ACTATCCCTGTGCCTCTGTAAAAGCACCTCATTTGCAAACGATTTGCCACACGTCTTACA CCGGAACCGAGGCACGCTTGGAGTAGCATCTCCGGCTTCTCTCCCCTTGCAAATCTTCTC GCAGTGTCTCTTGAAGTTCGATTTGGTGGTAAACGTTTTACCGCACTGTTCACACCGCAA CGACTCTTTGTGTGCATTCAGATGCTTTTTGGCCTTGCCAGGGCTTAGCACCTCCTTGCA GGTGGGACACCTGCACGGTAAAGCCTTTGCGGTGTGCCTTCTTAAACCTCGCTCATTGAC GAACGATTTGTCGCACTTTTCACACTGGTACGGACCGTTGTGGGCCTCTAGATGTTGTTT TGCCTTTCGGGGATTTAACACTTTCTTGCAGATGGGACACTGGCAAGGTATAGCCTTCTT GAGGTGCCCTCTCAGCGTTTTCTTGGAGGTGAACGTTTGCTTGCACTTGTCACACCGGAA CCGACCGTCCTGTGTCTCGGGACGTTTTTTGCTCCCTTCGGGTTCCATCGCTTCGTGCCA AGCAATGTGCTGCTTCATCTTTGCGACTCCTATCATTTGATCGCAGAGCGTGCACTTTGT TCGGTGCATCTTCTGTCGGTGTGCGATCAGCATCTTCCCATTCGGAAAGCTGCGGTTACA CTCCGCACACGCAAACGTGTCATGGATAAAATGTCGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)