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Anopheles gambiae
cluster # 7814 cluster # 7814       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7814#0 length = 1943 sequences # 8  

consensusID : consensus_7814#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1943
fasta sequence
                              [CGAGCAGATCGCGCNGAGGTTACGATAATAGCGGTTGAGTCGGAACTAGTATCCCCGCGAACGGTCATGCAGTGAACATGCAATAAAGCGATACAAGAAAGGCAAGCTGATTGGCATGTAAAGGGCATACACACGCACTATTAAATGTACAAAAAATCTAATCCAAGCTAAGTAGTATCATCGATCATTGGCAAGCGACTTACGAGGTTGTTCCGTAA--AGA-TAAATG-CAGAAACTTGAGGAAA-AAGTAACAAAA-TTTTAA-CATTTACAGAACAAGCAAAAATCAAGAAACCCGAGAATTCTAGAGTGGAACGAACTAGCACCACTCGCGACGCTTGAACTAAACTTACTATGTAAATATAGTTCACAAT-GGCATTCGATTCCACTTGAAGATGTTCGTACAAATTACACATAGTAAGT-AGCT-AGTTTCTGTTTAATCCCA-GTCAACGCGCATGATAACACGGGCAGTCCAGAAGCGTACGAGAAGCAGTAGTTACTTACT-GCTGCTCCTTGTACTTTCAAACAATGTCCATTAAAACGTGATCCGTCGTCAGCAAGCGAAACTATGGAGCAACTTTGAATGATAAATGGTTGATAATGGTGTGTTTCATTTAAGGTGATTAATAATTTATTGAAAGCTTTACTCTTGCTCTTCTTTTAATTTGTCGCACTAGTGCAATTTATGAACAAGATAATTGAAACGTTAACGTTCGTGTACTACAGCATGAGCACGTATTGTACTTTAGCGTTTGCTTTTACGATATTTTTATTTGTCTGCTACCGCTTAGGGGAGTGTGTGCTCACATGCTCTGCAATAGTTTATGTCGGTTTATAATTGTTAACAGAAATGTGCATTGCCATTATTAGTAACAGCTCGTAACAGCTAATGTTGCGTCCTAGCACGGCAGATGTTTAAAAATATCTCAACCTTATGAATGTCGAAAATCAGTACAGAGAAGGAAAAACAAAAAGCTTAAATGATTGGCATAACGATAGTATGCTTTGTGATAAAATGGAAACAAACAGTTGAAACAAGTTTGTAGAGTAGTAGTTTACTCCAAACAAGAACTTTCTTCAGCATTTGTTCCATTAATCCTCTCCTAATCAATCTTCCTAGCATTGCATTTTGTTGCAATCAATTGTTATCAGCAAAAGCACTGTCTTAGCGCATACTCAACTTGGTTTGCAAGGCTCCTCATAGAGATGTCAGCAGAGTTTGCACGACATCCACTGCAATTCTATGATTCACTAGCCATACAATTGATATCTTCACTCAATACTTCACTTTTGGTTATTTGTTTTTTTTTTTGCACTAAACTGCTCACCTAATTCAGTGGTGCAGATGTGTGTGTGTGTGGTACATGTACAAACGTAACAGCACACAACAACAGCGTCCATCGACAATTTGCAACATTCGTGTGCAGATTACTCTTTGCTGCACAAACCACAATTCTGTGTACAGCAGAACAATGTTCAGAGGTTCAGATGAAAAGATTTATTATACAACAAAGTAGATGCGTAATGGTGTTTCCCTCCTAGTAGTTAGAGTACGTACGAGATTTTGCAATTTACAAATACTACAAAAATCTTCCAAATGAAGAAAAAATATTTTTTTCTGCCACTATACCTATTAATAAATAAGATACAATAAAAAAATCTTCCCAACAAACGAAGTTAGTGGTAGGGTGGTATGCTAGACAGAGAAATACCGCGCTTCTATCCCGTGCGCTAATAACTACGTTTGAGGGTAAGCGCAAAACACAACAAAGCGTGTTTTGCACTATCCAAACTGTGCTATTTGGCCGTTTGTTCTTCGTTGTTTTGTTTAAAGTTTTAAGTACCAGTAGAACTATCAACAATTGTGTACAGCGAAATATATGGAGATACAGGAATTCCGACTTATGTCCAAAAGTAGAGTGGATGTTAGGTTTTACGAATAAATTAA]

[+] EMBL AL697257             [CGAGCAGATCGCGCNGAGGTTACGATAATAGCGGTTGAGTCGGAACTAGTATCCCCGCGAACGGTCATGCAGTGAACATGCAATAAAGCGATACAAGAAAGGCAAGCTGATTGGCATGTAAAGGGCATACACACGCACTATTAAATGTACAAAAAATCTAATCCAAGCTAAGTAGTATCATCGATCATTGGCAAGCGACTTACGAGGTTGTTTTGTAAACAGATTAAATGCCAGAAACTTGAGGAAACAAGTAACAAAATTTTTAACCATTTACAGAACAAGCAAAAATCAAGAAACCCGAGAATTCTAGAGTGGAACGAACTAGCACCACTCGCGACGCTTGAACTAAACTTACTATGTAAATATAGTTCACAATGGGCATTCGATTCCACTTGAAGATGTTCGTACAAATTACACATAGTAAGTAAGCTAAGTTTCTGTTTAATCCCAGGTCAACGCGCATGATAACACGGGCAGTCCAGAAGCGTACGAGAAGCAGTAGTTACTTACTGGTTGGTCCTTGTACTTTCAAACAATGTCCATTAAAACGTGATCCGTCGTCAGCAAGCGAAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BM655435             [                                                                                                                                                                                                                    CCGTAA  AGA TAAATG CAGAAACTTGAGGAAA AAGTAACAAAA TTTTAA CATTTACAGAACAAGCAAAAATCAAGAAACCCGAGAATTCTAGAGTGGAACGAACTAGCACCACTCGCGACGCTTGAACTAAACTTACTATGTAAATATAGTTCACAAT GGCATTCGATTCCACTTGAAGATGTTCGTACAAATTACACATAGTAAGT AGCT AGTTTCTGTTTAATCCCA GTCAACGCGCATGATAACACGGGCAGCCCAGAAGCGTACGAGAAGCAGTAGTTACTTACT GCTGCTCCTTGTACTTTCAAACAATGCCCATTAAAACGTGATCCGTCGTCAGCAAGCGAAACTATGGAGCAACTTTGAATGATAAATGGTTGATAATGGTGTGTTTCATTTAAGGTGATTAATAATTTATTGAAAGCTTTACTCTTGCTCTTCTTTTAATTTGTCGCACTAGTGCAATTTATGAACAAGATAATTGAAACGTTAACGTTCGTGTACTACAGCATGAGCACGTATTGTACTTTAGCGTTTGCTTTTACGATATTTTTATTTGTCTGCTACCGCTTAGGGGAGTGTGTGCTCACATGCTCTGCAATAGTTTATGTCGGTTTATAATTGTTAACAGAAATGTGCATTGCCATTATTAGTAACAGCTCGTAACAGCTAATGTTGCGTCCTAGCACGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BM578830             [                                                                                                                                                                                                                    CCGTAA  AGA TAAATG CAGAAACTTGAGGAAA AAGTAACAAAA TTTTAA CATTTACAGAACAAGCAAAAATCAAGAAACCCGAGAATTCTAGAGTGGAACGAACTAGCACCACTCGCGACGCTTGAACTAAACTTACTATGTAAATATAGTTCACAAT GGCATTCGATTCCACTTGAAGATGTTCGTACAAATTACACATAGTAAGT AGCT AGTTTCTGTTTAATCCCA GTCAACGCGCATGATAACACGGGCAGCCCAGAAGCGTACGAGAAGCAGTAGTTACTTACT GCTGCTCCTTGTACTTTCAAACAATGCCCATTAAAACGTGATCCGTCGTCAGCAAGCGAAACTATGGAGCAACTTTGAATGATAAATGGTTGATAATGGTGTGTTTCATTTAAGGTGATTAATAATTTATTGAAAGCTTTACTCTTGCTCTTCTTTTAATTTGTCGCACTAGTGCAATTTATGAACAAGATAATTGAAACGTTAACGTTCGTGTACTACAGCATGAGCACGTATTGTACTTTAGCGTTTGCTTTTACGATATTTTTATTTGTCTGCTACCGCTTAGGGGAGTGTGTGCTCACATGCTCTGCAATAGTTTATGTCGGGTTATAATTGTTAACAGAAATGTGCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BX625944             [                                                                                                                                                                                                                                                            AACAAAA TTTTAA CATTTACAGAACAAGCAAAAATCAAGAAACCCGAGAATTCTAGAGTGGAACGAACTAGCACCACTCGCGACGCTTGAACTAAACTTACTATGTAAATATAGTTCACAAT GGCATTCGATTCCACTTGAAGATGTTCGTACAAATTACACATAGTAAGT AGCT AGTTTCTGTTTAATCCCA GTCAACGCGCATGATAACACGGGCAGTCCAGAAGCGTACGAGAAGCAGTAGTTACTTACT GCTGCTCCTTGTACTTTCAAACAATGTCCATTAAAACGTGATCCGTCGTCAGCAAGCGAAACTATGGAGCAACTTTGAATGATAAATGGTTGATAATGGTGTGTTTCTTTTAAGGTGATTAATAATTTATTGAAAGCTTTACT TTGCTCTTCTTTTAATTTGTCGCACTAGTGCAATTTATGAACAAGGTAATTGAAACGTTAACGTTCGTGTACTACAGCATGAGCACGTATTGTACTTTAGCGTTTGCTTTTACGATATTTTTATTTGTCTGCTACCGCTTAGGGGAGTGTGTGCTCACATGCTCTGCAATAGTTTATGTCGGTTTATAATTGTTAACAGAAATGTGCATTGCCATTATTAGTAACAGCTCGTAACAGCTAATGTTGCGTCCTAGCACGGCAGATGTTTAAAAATATCCCAAGCTTATGAATGTTGAAAATCAGTACAGAGAAGGAAAAACAAAAGGCTTAAATGATTGGCATAACGATAGTATGCTTTGTGATAAAATGGAAACAAACAGTTGAAACAAGTTTGTAGAGTAGTAGTTTACTCCNAACNAGAACTTTCTTTAGCATTTGGTNCATTAGTCCTCTCCTAATC ATCTTCCTAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BX616213             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTTCGTGTACTACAGCGTGAGCACGTATTGTACTTTAGCGTTTGCTTTTACGATATTTTTATTTGTCTGCTACCGCTTAGGGGAGTGTGTGCTCACATGCTCTGCAATAGTTTATGTCGGTTTATAATTGTTAACAGAAATGTGCATTGCCATTATTAGTAACAGCTCGTAACAGCTAATGTTGCGTCCTAGCACGGCAGATGTTTAAAAATATCTCAACCTTATGAATGTCGAAAATCAGTACAGAGAAGGAAAAACAAAAAGCTTAAATGATTGGCATAACGATAGTATGCTTTGTGATAAAATGGAAACAAACAGTTGAAACAAGTTTGTAGAGTAGTAGTTTACTCCAAACAAGAACTTTCTTCAGCATTTGTTCCATTAATCCTCTCCTAATCAATCTTCCTGGCATTGCATTTTGTTGCAATCAATTGTTATCAGCAAAAGCACTGTCTTAGCGCATACTCAACTTGGTTTGCAAGGCTCCTCATAGAGATGTCAGCAGAGTTTGCACGACATCCACTGCAATTCTATGATTCACTAGCCATACAATTGATATCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BX611382             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGCACGGCAGATGTTTAAAAATATCTCAACCTTATGAATGTCGAAAATCAGTACAGAGAAGGAAAAACAAAAAGCTTAAATGATTGGCATAACGATAGTATGCTTTGTGATAAAATGGAAACAAACAGTTGAAACAAGTTTGTAGAGTAGTAGTTTACTCCAAACAAGAACTTTCTTCAGCATTTGTTCCATTAATCCTCTCCTAATCAATCTTCCTGGCATTGCATTTTGTTGCAATCAATTGTTATCAGCAAAAGCACTGTCTTAGCGCATACTCAACTTGGTTTGCAAGGCTCCTCATAGAGATGTCAGCAGAGTTTGCACGACATCCACTGCAATTCTATGATTCACTAGCCATACAATTGATATCTTCACTCAATACTTCACTTTTGGTTATTTGTTTTTTTTTTTGCACTAAACTGCTCACCTAATTCAGTGGTGCAGATGTGTGTGTGTGTGGTACATGTACAAACGTAACAGCACACAACAACAGCGTCCATCGACAATTTGCAACATTCGTGTGCAGATTACTCTTTGCTGCACAAACCACAATTCTGTGTACAGCAGAACAATGTTCAGAGGTTCAGATGAAAAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BM588125             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ccgGTAGTTTACTCCAAACAAGAACTTTCTTCAGCATTTGTTCCATTAATCCTCTCCTAATCAATCTTCCTAGCATTGCATTTTGTTGCAATCAATTGTTATCAGCAAAAGCACTGTCTTAGCGCATACTCAACTTGGTTTGCAAGGCTCCTCATAGAGATGTCAGCAGAGTTTGCACGACATCAACTGCAATTTTATGATTCACTGGCCATACAATTGATATCTTCACTCAATACTTCACTTTTGGTTATTTG   GCTTTTTTGCACTAAACTGCTCACCTAATTCAGTGGTACAG  GTGTGTGTGTGTGGTACATGTACAAACGTAACAGCACACAACAACAGCGTCCATCGACAATTTGCAACATTCGTGTGCAGATTACTCTTTGCTGCACAAACCACAATTCTGTGTACAGCAGAACAATGTTCAGAGGTTCAGATGAAAAGATTTATTATACAACAAAGTAGATGCGTAATGGTGTTTCCCTCCTAGTAGTTAGAGTACGTACGAGATTTTGCAATTTACAAATACTACAAAAATCTTCCAAATGAAGAAAAAATATTTTTTTCTGCCACTATACCTATTAATAAATAAGATACAATAAAAAAATCTTCCCAACAAACGAAGTTAGTGGTAGGGTGGTATGCT                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BX615833             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATTCGTGTGCAGATTACTCTTTGCTGCACAAACCACAATTCTGTGTACAGCAGAACAATGTTCAGAGGTTCAGATGAAAAGATTTATTATACAACAAAGTAGATGCGTAATGGTGTTTCCCTCCTAGTAGTTAGAGTACGTACGAGATTTTGCAATTTACAAATACTACAAAAATCTTCCAAATGAAGAAAAAATATTTTTTTCTGCCACTATACCTATTAATAAATAAGATACAATAAAAAAATCTTCCCAACAAACGAAGTTAGTGGTAGGGTGGTATGCTAGACAGAGAAATACCGCGCTTCTATCCCGTGCGCTAATAACTACGTTTGAGGGTAAGCGCAAAACACAACAAAGCGTGTTTTGCACTATCCAAACTGTGCTATTTGGCCGTTTGTTCTTCGTTGTTTTGTTTAAAGTTTTAAGTACCAGTAGAACTATCAACAATTGTGTACAGCGAAATATATGGAGATACAGGAATTCCGACTTATGTCCAAAAGTAGAGTGGATGTTAGGTTTTACGAATAAATTAA]


>consensus_7814#0 CGAGCAGATCGCGCNGAGGTTACGATAATAGCGGTTGAGTCGGAACTAGTATCCCCGCGA ACGGTCATGCAGTGAACATGCAATAAAGCGATACAAGAAAGGCAAGCTGATTGGCATGTA AAGGGCATACACACGCACTATTAAATGTACAAAAAATCTAATCCAAGCTAAGTAGTATCA TCGATCATTGGCAAGCGACTTACGAGGTTGTTCCGTAAAGATAAATGCAGAAACTTGAGG AAAAAGTAACAAAATTTTAACATTTACAGAACAAGCAAAAATCAAGAAACCCGAGAATTC TAGAGTGGAACGAACTAGCACCACTCGCGACGCTTGAACTAAACTTACTATGTAAATATA GTTCACAATGGCATTCGATTCCACTTGAAGATGTTCGTACAAATTACACATAGTAAGTAG CTAGTTTCTGTTTAATCCCAGTCAACGCGCATGATAACACGGGCAGTCCAGAAGCGTACG AGAAGCAGTAGTTACTTACTGCTGCTCCTTGTACTTTCAAACAATGTCCATTAAAACGTG ATCCGTCGTCAGCAAGCGAAACTATGGAGCAACTTTGAATGATAAATGGTTGATAATGGT GTGTTTCATTTAAGGTGATTAATAATTTATTGAAAGCTTTACTCTTGCTCTTCTTTTAAT TTGTCGCACTAGTGCAATTTATGAACAAGATAATTGAAACGTTAACGTTCGTGTACTACA GCATGAGCACGTATTGTACTTTAGCGTTTGCTTTTACGATATTTTTATTTGTCTGCTACC GCTTAGGGGAGTGTGTGCTCACATGCTCTGCAATAGTTTATGTCGGTTTATAATTGTTAA CAGAAATGTGCATTGCCATTATTAGTAACAGCTCGTAACAGCTAATGTTGCGTCCTAGCA CGGCAGATGTTTAAAAATATCTCAACCTTATGAATGTCGAAAATCAGTACAGAGAAGGAA AAACAAAAAGCTTAAATGATTGGCATAACGATAGTATGCTTTGTGATAAAATGGAAACAA ACAGTTGAAACAAGTTTGTAGAGTAGTAGTTTACTCCAAACAAGAACTTTCTTCAGCATT TGTTCCATTAATCCTCTCCTAATCAATCTTCCTAGCATTGCATTTTGTTGCAATCAATTG TTATCAGCAAAAGCACTGTCTTAGCGCATACTCAACTTGGTTTGCAAGGCTCCTCATAGA GATGTCAGCAGAGTTTGCACGACATCCACTGCAATTCTATGATTCACTAGCCATACAATT GATATCTTCACTCAATACTTCACTTTTGGTTATTTGTTTTTTTTTTTGCACTAAACTGCT CACCTAATTCAGTGGTGCAGATGTGTGTGTGTGTGGTACATGTACAAACGTAACAGCACA CAACAACAGCGTCCATCGACAATTTGCAACATTCGTGTGCAGATTACTCTTTGCTGCACA AACCACAATTCTGTGTACAGCAGAACAATGTTCAGAGGTTCAGATGAAAAGATTTATTAT ACAACAAAGTAGATGCGTAATGGTGTTTCCCTCCTAGTAGTTAGAGTACGTACGAGATTT TGCAATTTACAAATACTACAAAAATCTTCCAAATGAAGAAAAAATATTTTTTTCTGCCAC TATACCTATTAATAAATAAGATACAATAAAAAAATCTTCCCAACAAACGAAGTTAGTGGT AGGGTGGTATGCTAGACAGAGAAATACCGCGCTTCTATCCCGTGCGCTAATAACTACGTT TGAGGGTAAGCGCAAAACACAACAAAGCGTGTTTTGCACTATCCAAACTGTGCTATTTGG CCGTTTGTTCTTCGTTGTTTTGTTTAAAGTTTTAAGTACCAGTAGAACTATCAACAATTG TGTACAGCGAAATATATGGAGATACAGGAATTCCGACTTATGTCCAAAAGTAGAGTGGAT GTTAGGTTTTACGAATAAATTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)