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Anopheles gambiae
cluster # 7820 cluster # 7820       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7820#0 length = 738 sequences # 8  

consensusID : consensus_7820#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 738
fasta sequence
                              [CGCAATCGTGCTCGTCGTGAGCGTAGGCGTCGAGCTGACGAAGTGATTCAGGTTCAACAGCTCCGGAAAAGTCACTTTGTCGTTCAGCTTGATGCGGTGAAACGATTGGTAGTCGAAATCGAACCGCTTCAGGTGCAGCGTCAGGATGTACGGGAACTTGGTGAACTTGAGCCCCTTGTGCGCGTCGCACTTCTTGTTGCACGTGTCGCAGAAGTACTGGTTGCTTTCGTTCAGTATCTCCGGCTTGACGAAGCCCTGCAGCGCGTCCTCGACGCACTCGTTCGCGACGGTACTGCCGAACGGGCGGACCGGCAGCGGTATGTCCAGGAACTTGTCCTCCCGCTGCTTCTCCGTGTTGCACTCCAGGCACCGGACGTAGTCGATCATGTGCCCCTGGTACAGCCGGTTGATCAGGTCCGCCTCCTCGGTGCGCTTGAACTTGTGCTCGAGCGCGTCGAACATGACGCGGCACAGCTCCTGGATGTCGTGCTGCTGCCAGCCCTCGGCCGAATCCCACCCGAAGCTGCGCGTCAGATCCGTCGTCTCAACGGCCGACTTGGGCGACGTTTGCAGGTTCACGAACAGCTTCTGCAGCTGGTACGGTATGGACTTGGCCTCGTCCTCCCCGTCAAACTCCCAGTTGTACAGCGCGTTCCGGAACTCGGGCGTCATGTACAGGCCCTGCAGCAAGCTGTTCAGATAGCAGGTCATCGCCTGATTCACCAGCCCCCTGGGCGG]

[+] EMBL AGA280356            [CGCAATCGTGCTCGTCGTGAGCGTAGGCGTCGAGCTGACGAAGTGATTCAGGTTCAACAGCTCCGGAAAAGTCACTTTGTCGTTCAGCTTGATGCGGTGAAACGATTGGTAGTCGAAATCGAACCGCTTCAGGTGCAGCGTCAGGATGTACGGGAACTTGGTGAACTTGAGCCCCTTGTGCGCGTCGCACTTCTTGTTGCACGTGTCGCAGAAGTACTGGTTGCTTTCGTTCAGTATCTCCGGCTTGACGAAGCCCTGCAGCGCGTCCTCGACGCACTCGTTCGCGACGGTACTGCCGAACGGGCGGACCGGCAGCGGTATGTCCAGGAACTTGTCCTCCCGCTGCTTCTCCGTGTTGCACTCCAGGCACCGGACGTAGTCGATCATGTGCCCCTGGTACAGCCGGTTGATCAGGTCCGCCTCCTCGGTGCGCTTGAACTTGTGCTCGAGCGCGTCGAACATGACGCGGCA                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AGA280403            [CGCAATCGTGCTCGTCGTGAGCGTAGGCGTCGAGCTGACGAAGTGATTCAGGTTCAACAGCTCCGGAAAAGTCACTTTGTCGTTCAGCTTGATGCGGTGAAACGATTGGTAGTCGAAATCGAACCGCTTCAGGTGCAGCGTCAGGATGTACGGGAACTTGGTGAACTTGAGCCCCTTGTGCGCGTCGCACTTCTTGTTGCACGTGTCGCAGAAGTACTGGTTGCTTTCGTTCAGTATCTCCGGCTTGACGAAGCCCTGCAGCGCGTCCTCGACGCACTCGTTCGCGACGGTACTGCCGAACGGGCGGACCGGCAGCGGTATGTCCAGGAACTTGTCCTCCCGCTGCTTCTCCGTGTTGCACTCCAGGCACCGGACGTAGTCGATCATGTGCCCCTGGTACAGCCGGTTGATCAGGTCCGCCTCCTCGGTGCGCTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AGA280677            [CGCAATCGTGCTCGTCGTGAGCGTAGGCGTCGAGCTGACGAAGTGATTCAGGTTCAACAGCTCCGGAAAAGTCACTTTGTCGTTCAGCTTGATGCGGTGAAACGATTGGTAGTCGAAATCGAACCGCTTCAGGTGCAGCGTCAGGATGTACGGGAACTTGGTGAACTTGAGCCCCTTGTGCGCGTCGCACTTCTTGTTGCACGTGTCGCAGAAGTACTGGTTGCTTTCGTTCAGTATCTCCGGCTTGACGAAGCCCTGCAGCGCGTCCTCGACGCACTCGTTCGCGACGGTACTGCCGAACGGGCGGACCGGCAGCGGTATGTCCAGGAACTTGTCCTCCCGCTGCTTCTCCGTGTTGCACTCCAGGCACCGGACGTAGTCGATCATGTGCCCCTGGTACAGCCGGTTGATCAGGTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AGA280625            [CGCAATCGTGCTCGTCGTGAGCGTAGGCGTCGAGCTGACGAAGTGATTCAGGTTCAACAGCTCCGGAAAAGTCACTTTGTCGTTCAGCTTGATGCGGTGAAACGATTGGTAGTCGAAATCGAACCGCTTCAGGTGCAGCGTCAGGATGTACGGGAACTTGGTGAACTTGAGCCCCTTGTGCGCGTCGCACTTCTTGTTGCACGTGTCGCAGAAGTACTGGTTGCTTTCGTTCAGTATCTCCGGCTTGACGAAGCCCTGCAGCGCGTCCTCGACGCACTCGTTCGCGACGGTACTGCCGAACGGGCGGACCGGCAGCGGTATGTCCAGGAACTTGTCCTCCCGCTGCTTCTCCGTGTTGCACTCCAGGCACCGGACGTAGTCGATCATGTGCCCCTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL AGA282057            [                                                                                                                                                                                                                                             CTCCGGCTTGACGAAGCCCTGCAGCGCGTCCTGGACGCACTCGTTCGCGACGGTACTGCCGAACGGGCGGACCGGCAGCGGTATGTCCAGGAACTTGTCCTCCCGCTGCTTCTCCGTGTTGCACTCCAGGCACCGGACGTAGTCGATCATGTGCCCCTGGTACAGCCGGTTGATCAGGTCCGCCTCCTCGGTGCGCTTGAACTTGTGCTCGAGCGCGTCGAACATGACGCGGCACAGCTCCTGGATGTCGTGCTGCTGCCAGCCCTCGGCCGAATCCCACCCGAAGCTGCGCGTCAGATCCGTCGTCTCAACGGCCGACTTGGGCGACGTTTGCAGGTTCACGAACAGCTTCTGCAGCTGGTACGGTATGGACTTGGCCTCGTCCTCCCCGTCAAACTCCCAGTTGTACAGCGCGTTCCGGAACTCGGGCGTCATGTACAGGCCCTGCAGCAAGCTGT                                           ]
[-] EMBL AGA282299            [                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCGCGACGGTACTGCCGAACGGGCGGACCGGCAGCGGTATGTCCAGGAACTTGTCCTCCCGCTGCTTNTCCGTGTTGCACTCCAGGCACCGGACGTAGTCGATCATGTGCCCTTGGTACAGCCGGTTGATCAGGTCCGCCTCCTCGGTGCGCTTGAACTTGTGCTCGAGCGCGTCGAACATGACGCGGCACAGCTCCTGGATGTCGTGCTGCTGCCAGCCCTCGGCCGAATCCCACCCGAAGCTGCGCGTCAGATCCGTCGTCTCAACGGCCGACTTGGGCGACGTTTGCAGGTTCACGAACAGCTTCTGCAGCTGGTACGGTATGGACTTGGCCTCGTCCTCCCCGTCAAACTCCCAGTTGTACAGCGCGTTCCGGAACTCGGGCGTCATGTACAGGCCCTGCAGCAAGCTGTTCAGATAGCAGGTCATCGCCTGATTCACCAGCCCCC       ]
[-] EMBL BM627115             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CGGCAGCGGTATGTCCAGGAACTTGTCCTCCCGCTGCTTCTCCGTGTTGCACTCCAGGCACCGGACGTAGTCGATCATGTGCCCCTGGTACAGCCGGTTGATCAGGTCCGCCTCCTCGGTGCGCTTGAACTTGTGCTCGAGCGCGTCGAACATGACGCGGCACAGCTCCTGGATATCGTGCTGCTGCCAGCCCTCGGCCGAATCCCACCCGAAGTTGCGCGTCAGATCCGTCGTCTCGACCGCCGACTTGGGCGACGTTTGCAGGTTCACGAACAGCTTCTGCAGCTGGTACGGTATGGATTTGGCCTCATCCTCCCCGTCAAACTCCCAGTTGTACAGCGAGTTCCGGAACTCGGGCGTCATGTACAGGCCCTGCAGCAAGCTGTTCAGATAGCAGGTCATCGCCTGATTCACCGGACGAGTGGGCGG]
[-] EMBL AGA282106            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGCGCTTGAACTTGTGCTCGAGCGCGTCGAACATGACGCGGCACAGCTCCTGGATGTCGTGCTGCTGCCAGCCCTCGGCCGAATCCCACCCGAAGCTGCGCGTCAGATCCGTCGTCTCAACGGCCGACTTGGGCGACGTTTGCAGGTTCACGAACAGCTTCTGCAGCTGGTACGGTATGGACTTGGCCTCGTCCTCCCCGTCAAACTCCCAGTTGTACAGCGCGTTCCGGAACTCGGGCGTCATGTACAGGCCCTGCAGCAAGCTGTTCAGATAGCAGGTCATCGCCTGATTCACCAGCC          ]


>consensus_7820#0 CGCAATCGTGCTCGTCGTGAGCGTAGGCGTCGAGCTGACGAAGTGATTCAGGTTCAACAG CTCCGGAAAAGTCACTTTGTCGTTCAGCTTGATGCGGTGAAACGATTGGTAGTCGAAATC GAACCGCTTCAGGTGCAGCGTCAGGATGTACGGGAACTTGGTGAACTTGAGCCCCTTGTG CGCGTCGCACTTCTTGTTGCACGTGTCGCAGAAGTACTGGTTGCTTTCGTTCAGTATCTC CGGCTTGACGAAGCCCTGCAGCGCGTCCTCGACGCACTCGTTCGCGACGGTACTGCCGAA CGGGCGGACCGGCAGCGGTATGTCCAGGAACTTGTCCTCCCGCTGCTTCTCCGTGTTGCA CTCCAGGCACCGGACGTAGTCGATCATGTGCCCCTGGTACAGCCGGTTGATCAGGTCCGC CTCCTCGGTGCGCTTGAACTTGTGCTCGAGCGCGTCGAACATGACGCGGCACAGCTCCTG GATGTCGTGCTGCTGCCAGCCCTCGGCCGAATCCCACCCGAAGCTGCGCGTCAGATCCGT CGTCTCAACGGCCGACTTGGGCGACGTTTGCAGGTTCACGAACAGCTTCTGCAGCTGGTA CGGTATGGACTTGGCCTCGTCCTCCCCGTCAAACTCCCAGTTGTACAGCGCGTTCCGGAA CTCGGGCGTCATGTACAGGCCCTGCAGCAAGCTGTTCAGATAGCAGGTCATCGCCTGATT CACCAGCCCCCTGGGCGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)