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Anopheles gambiae
cluster # 8091 cluster # 8091       Sequences # 9       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8091#0 length = 1269 sequences # 5  
consensus_8091#1 length = 1198 sequences # 4  

consensusID : consensus_8091#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1269
fasta sequence
                              [CATTTTCCCAAATTCGCGTGTATGTCGGTAAGTGTACTCTTCTTCTCCCTGGCTCTGTGGCTCTTTGCGTATTTACTTGGTAATACTTCCGCTTCCTATGCAACAACTAGGAACCCGCGTCGACGGCGGCTTCGTGCCACAATTTCTCAGTGTTCTTACGCTATACACACCCACACACCCTTCACATATCTCTTTCTACGCCTTTTCGCCATAAGTCTGACAATTGATTATTTTGTATATCCTAATATGCTAAAGTGTGTTTGTTTTTTTTTTGTATCGTTATCGGGGTTTTTTTTAATTCGTGTCGGAGCCCTGTGCTCAAATTCCTTTAGTTGATGTGTGGCAGCTTACACTGACTGCCCTCCTGGGCCTTACCATAAAGTATAAGATACGTGGATTCTTCGCAATGCGAATCTTCCTCCTTTTGTTCCCCCCTGTCTCTTCCGTTTGTTGGTTTGTAGTTTAAATATGTTTCCAAGTTTCGTTACTTTCTTCGCGTGCATTATCCTAATGTACAATTTGAAGAAGAGCGAGTACAAACGAGCGTCAAATAGCGTACACCTTGAGAGTGGCGAATTAAAATAAATCTTGAATTGTGTTGTACCACGTGCTTTTGTCTGGATATTTTGAAAGCGTTCTTCTTCCACTGCAAGGAAAAGAGCTTATTCCTTTTAATGCAAAAAAGAACTAACGAAAACAAGGTTTGATGTATAAATTACAGGATATCAAATAAAGCATGTAAAAAAATCCAAACTTATCTGTGAATACGGCCAGCTATTGAGATTAATTGTACCATTCTTTACACTGTGCATTCCCCTGCCTGCGGCCGTTTCTAATGTAATTCTAATTGGTTTTTGCTTTCTAACTGGTTTTGTAGTGTCTTCACCTTCTCTAATGAGTTAGTTTGTTGCTGTTTGTGTCGCGATTTGTGGGATTTTGGGAGGGAAAAATCGTTTCTTTAGAAATGGAGAGTTGTAGCTTTCTTTTTCTTCTTTTGTATCTGTTACAAGGGTTTGTTGCCTATGGTTTTTGTTTCTTCCTGTTGTTTCTATCGTCCTTCCTGAGATCAGTAGAGTATAATTGCATTCGACACTCATGCTCCCCCCCATTCTGGTTTTGTATTGGTTAGTAAACTTTTCCCGTTGTTTCGCTTATTCGATCACACTTATCGGCCCCCCAAAAACGCGTTAAAAATTATTCCAAAGTTTAGTTAAACAAATAAACTACATCCCCATCAACCATCAACCATCCACGCGCAAACACGATGTG]

[+] EMBL CNS09QXM             [CATTTTCCCAAATTCGCGTGTATGTCGGTAAGTGTACTCTTCTTCTCCCTGGCTCTGTGGCTCTTTGCGTATTTACTTGGTAATACTTCCGCTTCCTATGCAACAACTAGGAACCCGCGTCGACGGCGGCTTCGTGCCACAATTTCTCAGTGTTCTTACGCTATACACACCCACACACCCTTCACATATCTCTTTCTACGCCTTTTCGCCATAAGTCTGACAATTGATTATTTTGTATATCCTAATATGCTAAAGTGTGTTTGTTTTTTTTTTGTATCGTTATCGGGGTTTTTTTTAATTCGTGTCGGAGCCCTGTGCTCAAATTCCTTTAGTTGATGTGTGGCAGCTTACACTGACTGCCCTCCTGGGCCTTACCATAAAGTATAAGATACGTGGATTCTTCGCAATGCGAATCTTCCTCCTTTTGTTCCCCCCTGTCTCTTCCGTTTGTTGGTTTGTAGTTTAAATATGTTTCCAAGTTTCGTTACTTTCTTCGCGTGCATTATCCTAATGTACAATTTGAAGAAGAGCGAGTACAAACGAGCGTCAAATAGCGTACACCTTGAGAGTGGCGAATTAAAATAAATCTTGAATTGTGTTGTACCACGTGCTTTTGTCTGGATATTTTGAAAGCGTTCTTCTTCCACTGCAAGGAAAAGAGCTTATTCCTTTTAATGCAAAAAAGAACTAACGAAAACAAGGTTTGATGTATAAATTACAGGATATCAAATAAAGCATGTAAAAAAATCCAAACTTATCTGTGAATACGGCCAGCTATTGAGATTAATTGTACCATTCTTTACACTGTGCATTCCCCTGCCTGGGGCGGTTTCTAATGTAATTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CNS09KW6             [      tCCAAATTCGCGTGTATGTCGGTAAGTGTACTCTTCTTCTCCCTGGCTCTGTGGCTCTTTGCGTATTTACTTGGTAATACTTCCGCTTCCTATGCAACAACTAGGAACCCGCGTCGACGGCGGCTTCGTGCCACAATTTCTCAGTGTTCTTACGCTATACACACCCACACACCCTTCACATATCTCTTTCTACGCCTTTTCGCCATAAGTCTGACAATTGATTATTTTGTATATCCTAATATGCTAAAGTGTGTTTGTTTTTTTTTTGTATCGTTATCGGGGTTTTTTTTAATTCGTGTCGGAGCCCTGTGCTCAAATTCCTTTAGTTGATGTGTGGCAGCTTACACTGACTGCCCTCCTGGGCCTTACCATAAAGTATATGATACGTGGATTCTTCGCAATGCGAATCTTCCTCCTTTTGTTCCCCCCTGTCTCTTCCGTTTGTTGGTTTGTAGTTTAAATATGTTTCCAAGTTTCGTTACTTTCTTCGCGTGCATTATCCTAATGTACAATTTGAAGAAGAGCGAGTACAAACGAGCGTCAAATAGCGTACACCTTGAGAGTAGCGAATTAAAATAAATCTTGAATTGTGTTGTACCACGTGCTTTTGTCTGGATATTTTGAAAGCGTTCTTCTTCCACTGCAAGGAAAAGAGCTTATTCCTTTTAATGCAAAAAAGAACTAACGAAAACAAGGTTTGATGTATAAATTACAGGATATCAAATAAAGCATGTAAAAAAATCCAAACTTATCTGTGAATACGGCCAGCTATTGAGATTAATTGTACCATTCTTTACACTGTGCATTCCCCTGCCTGCGGCCGTTTCTAATGTAATTCTAATTGGTTTTTGCTTTCTAACTGGTTTTGTAGTGTCTTCACCTTCTCTAATGAGTTAGTTTGTTGCTGTTTGTGTCGCGATTTGTGGGATTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CNS09C73             [                 GTGTATGTCGGT AGTGTA TCTTCTTCT CCTGGCTCTGTGGCTCTTTGCGTATTTACTTGGTAATACTTCCGCTTCCTATGCAACAACTAGGAACCCGCGTCGACGGCGGCTTCGTGCCACAATTTCTCAGTGTTCTTACGCTATACACACCCACACACCCTTCACATATCTCTTTCTACGCCTTTTCGCCATAAGTCTGACAATTGATTATATTGTATATCCTAATATGCTAAAGTGTGTTTGTATTTATTTTGTATCGTTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CNS09KW5             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CGAATCTTCCTCCTTTTGTTCCCCCCTGTGTCTTCCGTTTGTTGGTTTGTAGTTTAAATATGTTTCCAAGTTTCGTTACTTTCTTCGCGTGCATTATCCTAATGTACAATTTGAAGAAGAGCGAGTACAAACGAGCGTCAAATAGCGTACACCTTGAGAGTAGCGAATTAAAATAAATCTTGAATTGTGTTGTACCACGTGCTTTTGTCTGGATATTTTGAAAGCGTTCTTCTTCCACTGCAAGGAAAAGAGCTTATTCCTTTTAATGCAAAAAAGAACTAACGAAAACAAGGTTTGATGTATAAATTACAGGATATCAAATAAAGCATGTAAAAAAATCCAAACTTATCTGTGAATACGGCCAGCTATTGAGATTAATTGTACCATTCTTTACACTGTGCATTCCCCT  CTGCGGCCGTTTCTAATGTAATTCTAATTGGTTTTTGCTTTCTAACTGGTTTTGTAGTGTCTTCACCTTCTCTAATGAGTTAGTTTGTTGCTGTTTGTGTCGCGATTTGTGGGATTTTGGGAGGGAAAAATCGTTTCTTTAGAAATGGAGAGTTGTAGCTTTCTTTTTCTTCTTTTGTATCTGTTACAAGGGTTTGTTGCCTATGGTTTTTGTTTCTTCCTGTTGTTTCTATCGTCCTTCCTGAGATCAGTAGAGTATAATTGCATTCGACACTCATGCTCCCCCCCATTCTGGTTTTGTATTGGTTAGTAAACTTTTCCCGTTGTTTCGCTTATTCGATCACACTTATCGGCCCCCCAAAAACGCGTTAAAAATTATTCCAAAGTTTAGTTAAACAAATAAACTACATCCCCATCAACCATCAACCATCCACGCGCAAACACGATGTG]
[-] EMBL CNS09QXL             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTTTCTTCCGTTTGTTGGTTTGTAGTTTAAATATGTTTCCAAGTTTCGTTACTTTCTTCGCGTGCATTATCCTAATGTACAATTTGAAGAAGAGCGAGTACAAACGAGCGTCAAATAGCGTACACCTTGAGAGTGGCGAATTAAAATAAATCTTGAATTGTGTTGTACCACGTGCTTTTGTCTGGATATTTTGAAAGCGTTCTTCTTCCACTGCAAGGAAAAGAGCTTATTCCTTTTAATGCAAAAAAGAACTAACGAAAACAAGGTTTGATGTATAAATTACAGGATATCAAATAAAGCATGTAAAAAAATCCAAACTTATCTGTGAATACGGCCAGCTATTGAGATTAATTGTACCATTCTTTACACTGTGCATTCCCCT  CTGCGGCCGTTTCTAATGTAATTCTAATTGGTTTTTGCTTTCTAACTGGTTTTGTAGTGTCTTCACCTTCTCTAATGAGTTAGTTTGTTGCTGTTTGTGTCGCGATTTGTGTGATTTTGGGAGGGAAAAATCGTTTCTTTAGAAATGGAGAGTTGTAGCTTTCTTTTTCTTCTTTTGTATCTGTTACAAGGGTTTGTTGCCTATGGTTTTTGTTTCTTCCTGTTGTTTCTATCGTCCTTCCTGAGATCAGTAGAGTATAATTGCATTCGACACTCATGCTCCCCCCCATTCTGGTTTTGTATTGGTTAGTAAACTTTTCCCGTTGTTTCGCTTATTCGATCACACTTATCGGCCCCCCAAAAACGCGTTAAAAATTATTCCAAAGTTTAGTTAAACAAATAAACTACATCCCCATCAACCATCAACCATCCACGCGCAAACACGATGTG]


>consensus_8091#0 CATTTTCCCAAATTCGCGTGTATGTCGGTAAGTGTACTCTTCTTCTCCCTGGCTCTGTGG CTCTTTGCGTATTTACTTGGTAATACTTCCGCTTCCTATGCAACAACTAGGAACCCGCGT CGACGGCGGCTTCGTGCCACAATTTCTCAGTGTTCTTACGCTATACACACCCACACACCC TTCACATATCTCTTTCTACGCCTTTTCGCCATAAGTCTGACAATTGATTATTTTGTATAT CCTAATATGCTAAAGTGTGTTTGTTTTTTTTTTGTATCGTTATCGGGGTTTTTTTTAATT CGTGTCGGAGCCCTGTGCTCAAATTCCTTTAGTTGATGTGTGGCAGCTTACACTGACTGC CCTCCTGGGCCTTACCATAAAGTATAAGATACGTGGATTCTTCGCAATGCGAATCTTCCT CCTTTTGTTCCCCCCTGTCTCTTCCGTTTGTTGGTTTGTAGTTTAAATATGTTTCCAAGT TTCGTTACTTTCTTCGCGTGCATTATCCTAATGTACAATTTGAAGAAGAGCGAGTACAAA CGAGCGTCAAATAGCGTACACCTTGAGAGTGGCGAATTAAAATAAATCTTGAATTGTGTT GTACCACGTGCTTTTGTCTGGATATTTTGAAAGCGTTCTTCTTCCACTGCAAGGAAAAGA GCTTATTCCTTTTAATGCAAAAAAGAACTAACGAAAACAAGGTTTGATGTATAAATTACA GGATATCAAATAAAGCATGTAAAAAAATCCAAACTTATCTGTGAATACGGCCAGCTATTG AGATTAATTGTACCATTCTTTACACTGTGCATTCCCCTGCCTGCGGCCGTTTCTAATGTA ATTCTAATTGGTTTTTGCTTTCTAACTGGTTTTGTAGTGTCTTCACCTTCTCTAATGAGT TAGTTTGTTGCTGTTTGTGTCGCGATTTGTGGGATTTTGGGAGGGAAAAATCGTTTCTTT AGAAATGGAGAGTTGTAGCTTTCTTTTTCTTCTTTTGTATCTGTTACAAGGGTTTGTTGC CTATGGTTTTTGTTTCTTCCTGTTGTTTCTATCGTCCTTCCTGAGATCAGTAGAGTATAA TTGCATTCGACACTCATGCTCCCCCCCATTCTGGTTTTGTATTGGTTAGTAAACTTTTCC CGTTGTTTCGCTTATTCGATCACACTTATCGGCCCCCCAAAAACGCGTTAAAAATTATTC CAAAGTTTAGTTAAACAAATAAACTACATCCCCATCAACCATCAACCATCCACGCGCAAA CACGATGTG



consensusID : consensus_8091#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1198
fasta sequence
                              [TTCGCATATATATCGGTATGTGTACTCTTCGTCGCCCTTGCTCTTGTGTCTCTTTGCGTATTTACTTGGTAATACTTCCTCTCTTCCTTTGCAACAAGTAGGACCCCGCGTCGACGGCGGCTTCTTGTCACAATTTCTTAGTGTTTACACGCTATACACACCCACCACACACAGTTCACATAGCTCTTTCTACGCCTTTTCGCCATAAGTGTGACAATTGGTTATTTTGTATATCCTAATATGCTAAAGTGTGTTTGTTTTTTTTTTTTGTTGTATCGTTATCGGGTTTTTTTTAATTCATGTCGGAACCCTGTGCTCAAATCCCTTTAGTTGGTGGCAGCTTACACTGACTGCCCTCCTGGGCCTTACCATATAGTATATGATACGTGGATTCTTCGCAATGCGAATCATCCTTCTTTTGCTCCCTCCCCTGTCTCTTCCGTTTGTTGGTTTGTTGTTTAAATATGTTTCCAAGTTTCGTTACTTTCTTCTCGTGCATTATCCTAATGTACAATTTGAAGAATAGCGAGTACAAACGAGTGTCAAATAGCGTACACCTTACCTTGAGAGTAGCGAATTAAAATAAATCTTCAATAGTGTTGTACCACGTGCTTTTGTCCGGATATTTTGAGAACGTTCTTC-TTCCACTGCAAGGAAAAAAGCTTATTCCTTTAATGCAAAAACGAGCTAACGAAAACAAAAGTTTGATGTATAAATTACAGGATATCAATTAAAGAATGTAAAAAAAAACCAAACTTGTCTGTGCATCACTTACGGCCAGCTATTGAGATTAATTGTACCATCCTTTACACTGTGCATTCCCCTGCCTGTGGCCGATTTTAATGTAATTCTAATTAGTTTTTGCATTCTAACTGGTTTTGTAGTGTCTTCATTTTCTCTAATGAGTAAATTTGTTGCTGTTTGTGTCACGATTTGTGGGATTTTAGGAGGGAAAAAATCGTTTCTTTGAAATGGAGAGTTGTAGCTTCCTTTTTCATCTTTTGTATCTGTTTACAAGGGTTTGTTGCCTATGGTTTTTTTTTCTTCCTGTTGTTTCTATCGTCCTTCCTGAGATCAGTAGAGTATAATTGCATTCGACACTCATGCTCCCCCCATTCTGATTTTGTATTGGTTTGTAAGCTTTTCCCGTTGTTTCGCTTATTCGATCACACCACTTATCGCCCTCCCAAAAAACCGG]

[+] EMBL CNS09GD7             [TTCGCATATATATCGGTATGTGTACTCTTCGTCGCCCTTGCTCTTGTGTCTCTTTGCGTATTTACTTGGTAATACTTCCTCTCTTCCTTTGCAACAAGTAGGACCCCGCGTCGACGGCGGCTTCTTGTCACAATTTCTTAGTGTTTACACGCTATACACACCCACCACACACAGTTCACATAGCTCTTTCTACGCCTTTTCGCCATAAGTGTGACAATTGGTTATTTTGTATATCCTAATATGCTAAAGTGTGTTTGTTTTTTTTTTTTGTTGTATCGTTATCGGGTTTTTTTTAATTCATGTCGGAACCCTGTTCTCAAATCCCTTTAGTTGGTGGCAGCTTACACTGACTGCCCTCCTGGGCCTTACCATATAGTATATGATACGTGGATTCTTCGCAATGCGAATCATCCTTCTTTTGCTCCCTCCCCTGTCTCTTCCGTTTGTTGGTTTGTTGTTTAAATATGTTTCCAAGTTTCGTTACTTTCTTCTCGTGCATTATCCTAATGTACAATTTGAAGAATAGCGAGTACAAACGAGTTTTAAATAGCGTACACCTTACCTTGAGAGTAGCGAATTAAAATAAATCTTCAATAGTTTTGTACCACGTGCTTTTGTCCGGATATTTTGAGAACGTTCTTC TTCCACTGCAAGGAAAAAAGCTTATTCCTTTAATGCAAAAACGAGCTAACGAAAACAAAAGTTTGATGTATAAATTACAGGATATCAATTAAAGAATGTAAAAAAAAACCAAACTTGTTTTTTCATCACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL BM620698             [                                                                           TTCCTCTCTTCCTTTGCAACAAGTAGGACCCCGCGTCGACGGCGGCTCCTTGTCACAATTTCTTAGTGTTTACACGCTATACACACCCACCACACACAGTTCACATAGCTCTTTCTACGCCTTTTCGCCATAAGTGTGACAATTGGTTATTTTGTATATCCTAATATGCTAAAGTGTGTTTGTTTTTTTTTTTTGTTGTATCGTTATCGGGTTTTTTTTAATTCATGTCGGAACCCTGTGCTCAAATTCCTTTAGTTGGTGGCAGCTTACACTGACTGCCCTCCTGGGCCTTACCATATAGTATATGATACGTGGATTCTTCGCAATGCGAATCATCCTTCTTTTGCTCCCTCCCCTGTCTCTTCCGTTTGTTGGTTTGTTGTTTAAATATGTTTCCAAGTTTCGTTACTTTCTTCTCGTGCATTATCCTAATGTACAATTTGAAGAATAGCGAGTACAAACGAGTGTCAAATAGCGTACACCTTACCTTGAGAGTAGCGAATTAAAATAAATCTTCAATAGTGTTGTACCACGTGCTTTTGTCCGGATATTTTGAAAACGTTCTTC TTCCACTGCAAGGAAAAAAGCTTATTCCTTTAATGCAAAAACGAGCTAACGAAAACAAAAGTTTGATGTATAAATTcgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CNS09GD6             [                                                                                                                                                                                                 GCCTTTTCGCCATAAGTGTGACAATTGGTTATTTTGTATATCCTAATATGCTAAAGTGTGTTTGTTTTTTTTTTTTGTTGTATCGTTATCGGGTTTTTTTTAATTCATGTCGGAACCCTGTGCTCAAATCCCTTTAGTTGGTGGCAGCTTACACTGACTGCCCTCCTGGGCCTTACCATATAGTATATGATACGTGGATTCTTCGCAATGCGAATCATCCTTCTTTTGCTCCCTCCCCTGTCTCTTCCGTTTGTTGGTTTGTTGTTTAAATATGTTTCCAAGTTTCGTTACTTTCTTCTCGTGCATTATCCTAATGTACAATTTGAAGAATAGCGAGTACAAACGAGTGTCAAATAGCGTACACCTTACCTTGAGAGTAGCGAATTAAAATAAATCTTCAATAGTGTTGTACCACGTGCTTTTGTCCGGATATTTTGAGAACGTTCTTC TTCCACTGCAAGGAAAAAAGCTTATTCCTTTAATGCAAAAACGAGCTAACGAAAACAAAAGTTTGATGTATAAATTACAGGATATCAATTAAAGAATGTAAAAAAAAACCAAACTTGTCTGTGCATCACTTACGGCCAGCTATTGAGATTAATTGTACCATCCTTTACACTGTGCATTCCCCTGCCTGTGGCCGATTTTAATGTAATTCTAATTAGTTTTTGCATTCTAACTGGTTTTGTAGTGTCTTCATTTTCTCTAATGAGTAAATTTGTTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL BM581449             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCACGTGCTTTTGTCCGGATATTTTGAAAACGTTCTTCTTTCCACTGCAAGGAAAAAAGCTTATTCCTTTAATGCAAAAACGAGCTAACGAAAACAAAAGTTTGATGTATAAATTACAGGATATCAATTAAAGAATGTAAAAAAAAACCAAACTTGTCTGTGCATCACTTACGGCCAGCTATTGAGATTAATTGTACCATCCTTTACACTGTGCATTCCCCTGCCTGTGGCCGATTTTAATGTAATTCTAATTAGTTTTTGCATTCTAACTGGTTTTGTAGTGTCTTCACCTTCTCTAATGAGTTAGTTTGTTGCTGTTTGTGTCACGATTTGTGGGATTTTAGGAGGGAAAAAATCGTTTCTTTGAAATGGAGAGTTGTAGCTTCCTTTTTCATCTTTTGTATCTGTTTACAAGGGTTTGTTGCCTATGGTTTTTTTTTCTTCCTGTTGTTTCTATCGTCCTTCCTGAGATCAGTAGAGTATAATTGCATTCGACACTCATGCTCCCCCCATTCTGATTTTGTATTGGTTTGTAAGCTTTTCCCGTTGTTTCGCTTATTCGATCACACCACTTATCGCCCTCCCAAAAAACCGG]


>consensus_8091#1 TTCGCATATATATCGGTATGTGTACTCTTCGTCGCCCTTGCTCTTGTGTCTCTTTGCGTA TTTACTTGGTAATACTTCCTCTCTTCCTTTGCAACAAGTAGGACCCCGCGTCGACGGCGG CTTCTTGTCACAATTTCTTAGTGTTTACACGCTATACACACCCACCACACACAGTTCACA TAGCTCTTTCTACGCCTTTTCGCCATAAGTGTGACAATTGGTTATTTTGTATATCCTAAT ATGCTAAAGTGTGTTTGTTTTTTTTTTTTGTTGTATCGTTATCGGGTTTTTTTTAATTCA TGTCGGAACCCTGTGCTCAAATCCCTTTAGTTGGTGGCAGCTTACACTGACTGCCCTCCT GGGCCTTACCATATAGTATATGATACGTGGATTCTTCGCAATGCGAATCATCCTTCTTTT GCTCCCTCCCCTGTCTCTTCCGTTTGTTGGTTTGTTGTTTAAATATGTTTCCAAGTTTCG TTACTTTCTTCTCGTGCATTATCCTAATGTACAATTTGAAGAATAGCGAGTACAAACGAG TGTCAAATAGCGTACACCTTACCTTGAGAGTAGCGAATTAAAATAAATCTTCAATAGTGT TGTACCACGTGCTTTTGTCCGGATATTTTGAGAACGTTCTTCTTCCACTGCAAGGAAAAA AGCTTATTCCTTTAATGCAAAAACGAGCTAACGAAAACAAAAGTTTGATGTATAAATTAC AGGATATCAATTAAAGAATGTAAAAAAAAACCAAACTTGTCTGTGCATCACTTACGGCCA GCTATTGAGATTAATTGTACCATCCTTTACACTGTGCATTCCCCTGCCTGTGGCCGATTT TAATGTAATTCTAATTAGTTTTTGCATTCTAACTGGTTTTGTAGTGTCTTCATTTTCTCT AATGAGTAAATTTGTTGCTGTTTGTGTCACGATTTGTGGGATTTTAGGAGGGAAAAAATC GTTTCTTTGAAATGGAGAGTTGTAGCTTCCTTTTTCATCTTTTGTATCTGTTTACAAGGG TTTGTTGCCTATGGTTTTTTTTTCTTCCTGTTGTTTCTATCGTCCTTCCTGAGATCAGTA GAGTATAATTGCATTCGACACTCATGCTCCCCCCATTCTGATTTTGTATTGGTTTGTAAG CTTTTCCCGTTGTTTCGCTTATTCGATCACACCACTTATCGCCCTCCCAAAAAACCGG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8091#0      CATTTTCCCAAATTCGCGTGTATGTCGGTAAGTGTACTCTTCTTCTCCCTGGCTCT-GTG 59
consensus_8091#1      ------------TTCGCATATATATCGGTATGTGTACTCTTCGTCGCCCTTGCTCTTGTG 48
                                  ***** * *** ****** *********** ** **** ***** ***

consensus_8091#0      GCTCTTTGCGTATTTACTTGGTAATACTTCCGCT--TCCTATGCAACAACTAGGAACCCG 117
consensus_8091#1      TCTCTTTGCGTATTTACTTGGTAATACTTCCTCTCTTCCTTTGCAACAAGTAGGACCCCG 108
                       ****************************** **  **** ******** ***** ****

consensus_8091#0      CGTCGACGGCGGCTTCGTGCCACAATTTCTCAGTGTTCTTACGCTATACACACCCAC--- 174
consensus_8091#1      CGTCGACGGCGGCTTCTTGTCACAATTTCTTAGTGTTTACACGCTATACACACCCACCAC 168
                      **************** ** ********** ******   *****************   

consensus_8091#0      ACACCCTTCACATATCTCTTTCTACGCCTTTTCGCCATAAGTCTGACAATTGATTATTTT 234
consensus_8091#1      ACACAGTTCACATAGCTCTTTCTACGCCTTTTCGCCATAAGTGTGACAATTGGTTATTTT 228
                      ****  ******** *************************** ********* *******

consensus_8091#0      GTATATCCTAATATGCTAAAGTGTGTTTGTTTTTTTTTT-----GTATCGTTATCGGGGT 289
consensus_8091#1      GTATATCCTAATATGCTAAAGTGTGTTTGTTTTTTTTTTTTGTTGTATCGTTATCGGG-T 287
                      ***************************************     ************** *

consensus_8091#0      TTTTTTTAATTCGTGTCGGAGCCCTGTGCTCAAATTCCTTTAGTTGATGTGTGGCAGCTT 349
consensus_8091#1      TTTTTTTAATTCATGTCGGAACCCTGTGCTCAAATCCCTTTAGTTG----GTGGCAGCTT 343
                      ************ ******* ************** **********    **********

consensus_8091#0      ACACTGACTGCCCTCCTGGGCCTTACCATAAAGTATAAGATACGTGGATTCTTCGCAATG 409
consensus_8091#1      ACACTGACTGCCCTCCTGGGCCTTACCATATAGTATATGATACGTGGATTCTTCGCAATG 403
                      ****************************** ****** **********************

consensus_8091#0      CGAATCTTCCTCCTTTTGTTCCC--CCCTGTCTCTTCCGTTTGTTGGTTTGTAGTTTAAA 467
consensus_8091#1      CGAATCATCCTTCTTTTGCTCCCTCCCCTGTCTCTTCCGTTTGTTGGTTTGTTGTTTAAA 463
                      ****** **** ****** ****  *************************** *******

consensus_8091#0      TATGTTTCCAAGTTTCGTTACTTTCTTCGCGTGCATTATCCTAATGTACAATTTGAAGAA 527
consensus_8091#1      TATGTTTCCAAGTTTCGTTACTTTCTTCTCGTGCATTATCCTAATGTACAATTTGAAGAA 523
                      **************************** *******************************

consensus_8091#0      GAGCGAGTACAAACGAGCGTCAAATAGCGTACACCTT-----GAGAGTGGCGAATTAAAA 582
consensus_8091#1      TAGCGAGTACAAACGAGTGTCAAATAGCGTACACCTTACCTTGAGAGTAGCGAATTAAAA 583
                       **************** *******************     ****** ***********

consensus_8091#0      TAAATCTTGAATTGTGTTGTACCACGTGCTTTTGTCTGGATATTTTGAAAGCGTTCTTCT 642
consensus_8091#1      TAAATCTTCAATAGTGTTGTACCACGTGCTTTTGTCCGGATATTTTGAGAACGTTCTTCT 643
                      ******** *** *********************** *********** * *********

consensus_8091#0      TCCACTGCAAGGAAAAGAGCTTATTCCTTTTAATGCAAAAAAGAACTAACGAAAACAAG- 701
consensus_8091#1      TCCACTGCAAGGAAAAAAGCTTATTCCTTT-AATGCAAAAACGAGCTAACGAAAACAAAA 702
                      **************** ************* ********** ** *************  

consensus_8091#0      GTTTGATGTATAAATTACAGGATATCAAATAAAGCATGTAAAAAAAT-CCAAACTTATCT 760
consensus_8091#1      GTTTGATGTATAAATTACAGGATATCAATTAAAGAATGTAAAAAAAAACCAAACTTGTCT 762
                      **************************** ***** ***********  ******** ***

consensus_8091#0      GTGAAT-----ACGGCCAGCTATTGAGATTAATTGTACCATTCTTTACACTGTGCATTCC 815
consensus_8091#1      GTGCATCACTTACGGCCAGCTATTGAGATTAATTGTACCATCCTTTACACTGTGCATTCC 822
                      *** **     ****************************** ******************

consensus_8091#0      CCTGCCTGCGGCCGTTTCTAATGTAATTCTAATTGGTTTTTGCTTTCTAACTGGTTTTGT 875
consensus_8091#1      CCTGCCTGTGGCCGATTTTAATGTAATTCTAATTAGTTTTTGCATTCTAACTGGTTTTGT 882
                      ******** ***** ** **************** ******** ****************

consensus_8091#0      AGTGTCTTCACCTTCTCTAATGAGTTAGTTTGTTGCTGTTTGTGTCGCGATTTGTGGGAT 935
consensus_8091#1      AGTGTCTTCATTTTCTCTAATGAGTAAATTTGTTGCTGTTTGTGTCACGATTTGTGGGAT 942
                      **********  ************* * ****************** *************

consensus_8091#0      TTTGGGAGGGAAAAA-TCGTTTCTTTAGAAATGGAGAGTTGTAGCTTTCTTTTTCTTCTT 994
consensus_8091#1      TTTAGGAGGGAAAAAATCGTTTCTTT-GAAATGGAGAGTTGTAGCTTCCTTTTTCATCTT 1001
                      *** *********** ********** ******************** ******* ****

consensus_8091#0      TTGTATCTGTT-ACAAGGGTTTGTTGCCTATGGTTTTTGTTTCTTCCTGTTGTTTCTATC 1053
consensus_8091#1      TTGTATCTGTTTACAAGGGTTTGTTGCCTATGGTTTTTTTTTCTTCCTGTTGTTTCTATC 1061
                      *********** ************************** *********************

consensus_8091#0      GTCCTTCCTGAGATCAGTAGAGTATAATTGCATTCGACACTCATGCTCCCCCCCATTCTG 1113
consensus_8091#1      GTCCTTCCTGAGATCAGTAGAGTATAATTGCATTCGACACTCATGCTCCCCCC-ATTCTG 1120
                      ***************************************************** ******

consensus_8091#0      GTTTTGTATTGGTTAGTAAACTTTTCCCGTTGTTTCGCTTATTCGATCACAC---TTATC 1170
consensus_8091#1      ATTTTGTATTGGTTTGTAAGCTTTTCCCGTTGTTTCGCTTATTCGATCACACCACTTATC 1180
                       ************* **** ********************************   *****

consensus_8091#0      GGCCCCCCAAAAACGCGTTAAAAATTATTCCAAAGTTTAGTTAAACAAATAAACTACATC 1230
consensus_8091#1      GCCCTCCCAAAAAACCGG------------------------------------------ 1198
                      * ** ********  **                                           

consensus_8091#0      CCCATCAACCATCAACCATCCACGCGCAAACACGATGTG 1269
consensus_8091#1      ---------------------------------------
                                                             




Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)