These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8315#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1218 fasta sequence [CCAAATTCGTTTTCTACTGATTCTGCTGGTTAAATGCTTCTTTTTCACCGGCCGTTCTTTATCGCCTTTATTTATTGACCGTGGTTTTCTCTTCTGTCTTGCAGGGTGATTTCGTGATTTATGGATCGGATTCCCGTTTTCACACGGCTCGCGCCCTCACCGGCTGCCCTACCGTACGGTACGCAGCAGCGAAATCTCCAGAGCCTTTTCTTATTTCTCGATCGATGTCTTCGCCGTGTCACTATGGGCAGTGGCCGCTCGAATGCAACGCCTCCAGTAGTGCTCCCACGGTGTGCTCCAGGTCATCGAAGACTATCATCCTCAGCTCGCCGCCCCAAAAACGCTG-CCTCGAAGCTACGGGAGGTCAGTTGAGAACGTACAGCCCGACAACAACGACAC-TTTTTGTAACACACTTGAGGCGTCGAAACCCCGATCGCAACCTGTCACTGAGCACTGAGTGTCAAACGTCGTGCGCGCTCTGCAAGAAGCGTCCAGAGATTTAGATGGTC------GTGTATCAATCGATGGGAATTCAGTAGCGATGAAAACCAA--CTTTTAATTAGCCTTATCAGCTACAGTTACTTGGCTGCAGCTGCTACTGCTGCAAGCA-TCACGCACTGCCACAGCATCCAAGCACGACCTTTAGAATCTTTCGCATGGGCCTTTCAAGACGATCTTTCGCTCAGCTTTTTTGTTT-TGTTTTTGTTTTT-GGTTTTCG-TTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTCTTAATATTTGTCTGCCTGCTTTCTGCTTTCCAGCTCCAGTTGTTCACAAGCGGTGCTTGCTGCTCTCATTTATTCCACTCTGCTGCAGCGGCGTGTGTTGTAGTTGTTTTATTTGTTTTTTTTTTTGCGCCCTTCCTTCGGTTTTGTTTTAAATATTTCGTGTGTGCTGCTCGCTTTTTGGGCGCTTGTTTTAGTTTTCGTTTTCTCGTAGTCTCTCTGCCTGCCGGTTTTTTGTTTCTTTTTGCTTGGTTTTAGCTTTCTGGTGACCACGATCGATTGGAGACAAT-CTTTCGGCTTCGGCCGTTCGCGCTTTATCCCCCCTCTTACTCAGTGTGTTTTTCTTCTGCGTTTTATTGCATCGATTTCATTCCCGTTCTTTTAAGTGCTTTTCGCCATTCGAACCATTCGGTGCCTGTCGTGCACGATATGGGATTTTCGCAAGGGTTCGCAAATATGTTGGTTTCCTATCTTTTTTTTTTCT] [+] EMBL CNS08YCJ [CCAAATTCGTTTTCTACTGATTCTGCTGGTTAAATGCTTCTTTTTCACCGGCCGTTCTTTATCGCCTTTATTTATTGACCGTGGTTTTCTCTTCTGTCTTGCAGGGTGATTTCGTGATTTATGGATCGGATTCCCGTTTTCACACGGCTCGCGCCCTCACCGGCTGCCCTACCGTACGGTACGCAGCAGCGAAATCTCCAGAGCCTTTTCTTATTTCTCGATCGATGTCTTCGCCGTGTCACTATGGGCAGTGGCCGCTCGAATGCAACGCCTCCAGTAGTGCTCCCACGGTGTGCTCCAGGTCATCGAAGACTATCATCCTCAGCTCGCCGCCCCAAAAACGCTG CCTCGAAGCTACGGGAGGTCAGTTGAGAACGTACAGCCCGACAACAACGACAC TTTTTGTAACACACTTGAGGCGTCGAAACCCCGATCGCAACCTGTCACTGAGCACTGAGTGTCAAACGTCGTGCGCGCTCTGCAAGAAGCGTCCAGAGATTTAGATGGTC GTGTATCAATCGATGGGAATTCAATAGCGATGAAAACCAA CTTTTAATTAGCCTTATCAGCTACAGTTACTTGGCTGCAGCTGCTACTGCTGCAAGCA TCACGCACTGCCACAGCATCCAAGCACGACCTTTAGAATCTTTCGCATGGGCCTTTCAAGACGATCTTTCGCTCAGCTTTTTTGTTT TGTTTTTGTTTTT GGTTTTCGCTTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTCTTAATATTTGTCTGCCTGCTTTCTGCTTTCCAGCTCCAGTTGTTCACAAGCGGTGCTTGCTGCTCTCATTTATTCCACTCTGCTGCAGCGGCGTGTGTTGTAGTTGTTTTATTTGTTTTTTTTTTTGCGCCCTTCCTTCGGTTTTGTTTTAAATATTTCGTGTGTCCTGCTCGCTTTTTGGGCGCTTGTTTTAGTTTTCGTTTTCTCGTAGTCTCT ] [+] EMBL CNS08JND [ gtTTCGTTTTCTACTGATTCTGCTGGTTAAATGCTTCTTTTTCACCGGCCGTTCTTTATCGCCTTTATTTATTGACCGTGGTTTTCTCTTCTGTCTTGCAGGGTGATTTCGTGATTTATGGATCGGATTCCCGTTTTCACACGGCTCGCGCCCTCACCGGCTGCCCTACCGTACGGTACGCAGCAGCGAAATCTCCAGAGCCTTTTCTTATTTCTCGATCGATGTCTTCGCCGTGTCACTATGGGCAGTGGCCGCTCGAATGCAACGCCTCCAGTAGTGCTCCCACGGTGTGCTCCAGGTCATCGAAGACTATCATCCTCAGCTCGCCGCCCCAAAAACGCTG CCTCGAAGCTACGGGAGGTCAGTTGAGAACGTACAGCCCGACAACAACGACAC TTTTTGTAACACACTTGAGGCGTCGAAACCCCGATCGCAACCTGTCACTGAGCACTGAGTGTCAAACGTCGTGCGCGCTCTGCAAGAAGCGTCCAGAGATTTAGATGGTC GTGTATCAATCGATGGGAATTCAGTAGCGATGAAAACCAA CTTTTAATTAGCCTTATCAGCTACAGTTACTTGGCTGCAGCTGCTACTGCTGCAAGCATTCACGCACTGCCACAGCATCCAAGCACGACCTTTAGAATCTTTCGCATGGGCCTTTCAAGACGATCTTTCGCTCAGCTTTTTTGTTT TTTTTTTGTTTTT GGTTTTCG TTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTCTAAATATTTGTCTGCCTGCTTTCTGCTTTCCAGCTCCAGTTGTTCACAAGCGGTGCTTGCTGCTCTCATTTATTCCACTCTGCTGCAGCGGCGTGTGTGGTAGTTGTTTTATTTGTTTTTTTTTTTGCGCCCTTCCTTCGGTTTTGTTTTAAATATTTCGTGTGTGCTGCTCGCTTTTTGGGCGCTTGTTTTAGTTTT ] [+] EMBL CNS08CKG [ ACTGATTCTGCTGGTTAAATGCTTCTTTTTCACCGGCCGTTCTTTATCGCCTTTATTTATTGACCGTGGTTTTCTCTTCTGTCTTGCAGGGTGATTTCGTGATTTATGGATCGGATTCCCGTTTTCACACGGCTCGCGCCCTCACCGGCTGCCCTACCGTACGGTACGCAGCAGCGAAATCTCCAGAGCCTTTTCTTATTTCTCGATCGATGTCTTCGCCGTGTCACTATGGGCAGTGGCCGCTCGAATGCAACGCCTCCAGTAGTGCTCCCACGGTGTGCTCCAGGTCATCGAAGACTATTATCCTCAGCTCGCCGCCCCAAAAACGCTG CCTCGAAGCTACGGGAGGTCAGTTGAGAACGTACAGCCCGACAACAACGACAC TTTTTGTAACACACTTGAGGCGTCGAAACCCCGATCGCAACCTGTCACTGAGCACTGAGTGTCAAACGTCGTGCGCCCTCTGCAAGAAGCGTCCAGAGATTTAGATGGTC GTGTATAAAAAGATGGGAATTCAGTAGCGATGAAAACGGG CTTTTAATTAGCCTTATCAGCTACAGTTACTTGGCTGCAGCTGCTACTGC ] [+] EMBL AGA280907 [ CTGGTTCTGCTGGTTAAATGCTTCTTTTTCGCCGGCCGTTCTTTATCGCCTTTATTTATTGGCCGTGGTTTTCTCTTCTGTCTTGCAGGGTGATTTCGTGATTTATGGATCGGATTCCCGTTTTCACACGGCTCGCACCCTCACCGGCTGCCCTACGGTACGGTACGCAGCAGCGAAATCTCCAGAGCCTTTTCTTATTTCTCGATCGATGTCTTCGCCGTGTCACTATGGGCAGTGGCCGCTCGAATGCAACGCCTCCAGTAGTGCTCCCACGGTGTGCTCCAGGTCATCGAAGACTATCATCCTCAGCTCGCCGCCCCAAAAACGCTGCCCTCGAAGCTACGGGAGGTCAGTTGAGAACGTACAGCCCGACGACAACGACACTTTTTTGT ACACACT ] [-] EMBL BX627589 [ TTATTTATNGACCGTGG TTTCTCTTCTGTCTTGCAGGGTGATTTCGTGATTTATGGATCGGATTCCCGTTTTCACACGGCTCGCGCCCTCACCGGCTGCCCTACGGTACGGTACGCAGCAGCGAAATCTCCAGAGCCTTTTCTTATTTCTCGATCGATGTCTTCGCCGTGTCACTATGGGCAGTGGCCGCTCGAATGCAACGCCTCCAGTAGTGCTCCCACGGTGTGCTCCAGGTCATCGAAGACTATCATCCTCAGCTCGCCGCCCCAAAAACGCTG CCTTGAAGCTACGGGAGGTCAGTTGAGAACGTACAGCCCGACGACAACGACAC TTTTTGTAACACACTTGAGGCGTCGAAACCCCGATCGCAACCTGTCACTGAGCACTGAGTGTCAAACGTCGTGCGCGCTCTGCAAGAAGCGTCCAGAGATTTAGATGGTCGTCCTGGTGTATCAATCGATGGGAATTCAGTAGCGATGAAAACCAAACCTTTTAATTAGCCTTATCAGCTACAGTTACTTGGCTGCAGCTGCTACTGCTGCAAGCA TCACACACTTCCGCAGCATCCAAGCACGACCTTTAGAATCTTTCGCATGGGCCTTTCAAGACGATCTTTCGCTCAGCTTTTTTGTTT TGTTTTTGTTTTT GGTTTTCG TTG GTGTGTGTGTTTGTGTC ] [+] EMBL CNS090GB [ CCGTGTCACTATGGGCAGTGGCCGCTCGAATGCAACGCCTCCAGTAGTGCTCCCACGGTGTGCTCCAGGTCATCGAAGACTATCATCCTCAGCTCGCCGCCCCAAAAACGCTG CCTCGAAGCTACGGGAGGTCAGTTGAGAACGTACAGCCCGACAACAACGACAC TTTTTGTAACACACTTGAGGCGTCGAAACCCCGATCGCAACCTGTCACTGAGCACTGAGTGTCAAACGTCGTGCGCGCTCTGCAAGAAGCGTCCAGAGATTTAGATGGTC GTGCCTCAATCGATGGGAATTCAGTAGCGATGAAAACCAA CTTTTAATTAGCCTTATCAGCTACAGTTACTTGGCTGCAGCTGCTACTGCTGCAAGCA TCACGCACTGCCACAGCATCCAAGCACGACCTTTAGAATCTTTCGCATGGGCCTTTCAAGACGATCTTTCGCTCAGCTTTTTTGTTTATGTTTTTGTTTTT GGTTTTCG TTGGGGTGTGTGTGTTTGTGTCTTAATATTTGTCTGCCTGCTTTCTGCTTTCCAGCTCCAGTTGTTCACAAGCGGTGCTTGCTGCTCTCATTTATTCCACTCTGCTGCAGCGGCGTGTGTTGTAGTTGTTTTATTTGTTTTTTTTTTTGCGCCCTTCCTTCGGTTTTGTTTTAAATATTTCGTGTGTTCTGCTCGCTTTTTGGGCGCTTGTTTTAGTTTTCGTTTTCTCGTAGTCTCTCTGC ] [-] EMBL CNS08CKF [ CTTTCATCCTCAGCTCGCCGCCCCAAAAAGGCTG CCTCGAAGCTACGGGAGGTCAGTTGAGAACGTACAGCCCCACAACAACGACAC TTTTTGTAAAAAACTTGAGGCGTCGAAACCCCGATCGCAACCTGTCACTGAGCACTGAGTGTCAAACGTCGTGCGCGCTCTGCAAGAAGCGTCCAGAGATTTAGATGGTC GTGTATCAATCGATGGGAATTCAGTAGCGATGAAAACCAA CTTTTAATTAGCCTTATCAGCTAAAGTTACTTGGCTGCAGCTGCTACTGCTGCAAGCA TAACGAACTGCCACAGCATCCAAGCACGACCTTTAGAATCTTTCGCATGGGCCTTTCAAGACGATCTTTCGCTCAGCTTTTTTGTTT TGTTTTTGTTTTT GGTCCCCG TTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTCTTAATTTTTGTCTTCCTGCTTTCTGCTTTCCAGCTCCAGTTGTTCACAAGCGGTGCTTGCTGCTCTCATTTATTCCACTCTGCTGCAGCGGCGTGTGTTGTAGTTGTTTTATTTGTTTTTTTTTTTGCGCCCTT CTTCGGTTTTGTTTTAAATATTTCGTGTGTGCTGCTCGCTTTTTGGGCGCTTGTTTTAGTTTTCGTTTTCTCGTAGTCTCTCTGCCTGCCGGTTTTTTGTTTCTTTTTGCTTGGTTTTAGCTTTCTGGTGACCACGATCGATTGGAGACAAT CTTTCGGCTTCGGCCGTTCGCGCTTTATCCCCCCTCTTACTCAGTGTGTTTTTCTTCTGCGTTTTATTGCATCGATTTCATTCCCGTTCTTTTAAGTGCTTTTCGCCATTCGAACCATTCGGTGCCTGTCGTGCACGATATGGGATTTTCGCAAGGGTTCGCAAATATGTTGGTTTCC ] [-] EMBL CNS08JMS [ G CCTCGAAGCTACGGGAGGTCAGTTGAGAACGTACAGCCCGACAACAACGACAC TTTTTGTAACACACTTGAGGCGTCGAAACCCCGATCGCAACCTGTCACTGAGCACTGAGTGTCAAACGTCGTGCGCGCTCTGCAAGAAGCGTCCAGAGATTTAGATGGTC GTGTATCAATCGATGGGAATTCAGTAGCGATGAAAACCAA CTTTTAATTAGCCTTATCAGCTACAGTTACTTGGCTGCAGCTGCTACTGCTGCAAGCA TCACGCACTGCCACAGCATCCAAGCACGACCTTTAGAATCTTTCGCATGGGCCTTTCAAGACGATCTTTCGCTCAGCTTTTTTGTTT TGTTTTTGTTTTT GGTTTTCG TTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTCTTAATATTTGTCTGCCTGCTTTCTGCTTTCCAGCTCCAGTTGTTCACAAGCGGTGCTTGCTGCTCTCATTTATTCCACTCTGCTGCAGCGGCGTGTGTTGTAGTTGTTTTATTTGTTTTTTTTTTTGCGCCCTT CTTCGGTTTTGTTTTAAATATTTCGTGTGTGCTGCTCGCTTTTTGGGCGCTTGTTTTAGTTTTCGTTTTCTCGTAGTCTCTCTGCCTGCCGGTTTTTTGTTTCTTTTTGCTTGGTTTTAGCTTTCTGGTGACCACGATCGATTGGAGACAAT CTTTCGGCTTCGGCCGTTCGCGCTTTATCCCCCCTCTTACTCAGTGTGTTTTTCTTCTGCGTTTTATTGCATCGATTTCATTCCCGTTCTTTTAAGTGCTTTTCGCCATTCGAACCATTCGGTGCCTGTCGTGCACGATATGGGATTTTCGCAAGGGTTCGCAAATATGTTGGTTTCC ] [-] EMBL CNS08YCI [ caTTTTTTGTTT TGTTTTTGTTTTT GGTTTTCG TTGGTTTGTGTGTGTTTGTGTCTTAATATTTGTCTGCCTGCTTTCTGCTTTCCAGCTCCAGTTGTTCACAAGCGGTGCTTGCTGCTCTCATTTATTCCACTCTGCTGCAGCGGCGTGTGTTGTAGTTGTTTTATTTGTTTTTTTTTTTGCGCCCTT CTTCGGTTTTGTTTTAAATATTTCGTGTGTGCTGCTCGCTTTTTGGGCGCTTGTTTTAGTTTTCGTTTTCTCGTAGTCTCTCTGCCTGCCGGTTTTTTGTTTCTTTTTGCTTGGTTTTAGCTTTCTGGTGACCACGATCGATTGGAGACAATGCTTTCGGCTTCGGCCGTTCGCGCTTTATCCCCCCTCTTACTCAGTGTGTTTTTCTTCTACGTTTTATTGCATCGATTTCATTCCCGTTCTTTTAAGTGCTTTTCGCCATTCGAACCATTCGGTGCCTGTCGTGCACGATATGGGATTTTCGCAAGGGTTCGCAAATATGTTGGTTTCC ] [-] EMBL CNS090GA [ TGTTT TGTTTTTGTTTTTGGGTTTTCG TTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTCTTAATATTTGTCTGCCTGCTTTCTGCTTTCCAGCTCCAGTTGTTCACAAGCGGTGCTTGCTGCTCTCATTTATTCCACTCTGCTGCAGCGGCGTGTGTTGTAGTTGTTTTATTTGTTTTTTTTTTTGCGCCC TCCTTCGGTTTTGTTTTAAATATTTCGTGTGTGCTGCTCGCTTTTTGGGCGCTTGTTTTAGTTTTCGTTTTCTCGTAGTCTCTCTGCCTGCCGGTTTTTTGTTTCTTTTTGCTTGGTTTTAGCTTTCTGGTGACCACGATCGATTGGAGACAAT CTTTCGGCTTCGGCCGTTCGCGCTTTATCCCCCCTCTTACTCAGTGTGTTTTTCTTCTGCGTTTTATTGCATCGATTTCATTCCCGTTCTTTTAAGTGCTTTTCGCCATTCGAACCATTCGGTGCCTGTCGTGCACGATATGGGATTTTCGCAAGGGTTCGCAAATATGTTGGTTTCCTATCTTTTTTTTTTCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||