Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 845 cluster # 845       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_845#0 length = 685 sequences # 2  

consensusID : consensus_845#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 685
fasta sequence
                              [GGGGGGGAAAGCTGCGGAATTCCTCGAGGACTGTTGGCCTACTGGTGATGTAATGCTTAAAAATTTAAGCGTTTTGTGCAATTGTTACTAGATAGTAGATACTTTAATTAATTTACTATGTGGAGTACAATACATTGATGTGCAATTGATGTAAAATGGAACAAATTAAAGCAAATTTTATTTGAGAATAATCATCATTTTTTAAGTGCAATATTCGAAACGAAAAACTTTTTCAATTGTTCCAATTGTGTTTGGGTAACAAAATTTGAAAAAAAAAAAACTACTCGTAGCCAGAAAAAGTCTTTTTTTTAAAGCATATCCCTTGTATTTTCTGTAACGAATGAGAAGTGTAATATAAATACTTGTGAATTATACCTTTAAAGAGCTCTACATGCTGCAACTTAACTCTATAAATTATGAAAAAAAAACAAAGAGGTGCCAACGTAGCAGAACTCCAACTGCAATCAATTGTACAAAGCGGCTGAAAA-GCACCGGCAAAGAGGATTTGCAATCAAACCGATTTTTGTATTATTCAGCACAAAACTTTAGGCTTTGAAGTAAACGTCGCGCCTTAGCGTTCGGTATAGATTTAACGCCAGTCCGTCATCGAACAGGAGCACAAAAGCACTCACCCACTCACCAAGCGCAACAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCCCGAGCCGCCGC]

[-] EMBL CNS08HNN             [GGGGGGGAAAGCTGCGGAATTCCTCGAGGACTGTTGGCCTACTGGTGATGTAATGCTTAAAAATTTAAGCGTTTTGTGCAATTGTTACTAGATAGTAGATACTTTAATTAATTTACTATGTGGAGTACAATACATTGATGTGCAATTGATGTAAAATGGAACAAATTAAAGCAAATTTTATTTGAGAATAATCATCATTTTTTAAGTGCAATATTCGAAACGAAAAACTTTTTCAATTGTTCCAATTGTGTTTGGGTAACAAAATTTGAAAAAAAAAAAACTACTCGTAGCCAGAAAAAGTCTTTTTTTTAAAGCATATCCCTTGTATTTTCTGTAACGAATGAGAAGTGTAATATAAATACTTGTGAATTATACCTTTAAAGAGCTCTACATGCTGCAACTTAACTCTATAAATTATGAAAAAAAAACAAAGAGGTGCCAACGTAGCAGAACTCCAACTGCAATCAATTGTACAAAGCGGCTGAAAA GCACCGGCAAAGAGGATTTGCAATCAAACCGATTTTTGTATTATTCAGCACAAAACTTTAGGCTTTGAAGTAAACGTCGCGCCTTAGCGTTCGGTATAGATTTAACGC                                                                                         ]
[+] EMBL CNS08HNM             [                                                           AAAATTTAAGCGTTTTGTGCAATTGTTACTAGATAGTAGATACTTTAATTAATTTACTATGTGGAGTACAATACATTGATGTGCAATTGATGTAAAATGGAACAAATTAAAGCAAATTTTATTTGAGAATAATCATCATTTTTTAAGTGCAATATTCGAAACGAAAAACTTTTTCAATTGTTCCAATTGTGTTTGGGTAACAAAATTTGAAAAAAAAAAAACTACTCGTAGCCAGAAAAAGTCTTTTTTTTAAAGCATATCCCTTGTATTTTCTGTAACGAATGAGAAGTGTAATATAAATACTTGTGAATTATACCTTTAAAGAGCTCTACATGCTGCAACTTAACTCTATAAATTATGAAAAAAAAACAAAGAGGTGCCAACGTAGCAGAACTCCAACTGCAATCAATTGTACAAAGCGGCTGAAAACGCACCGGCAAAGAGGATTTGCAATCAAACCGATTTTTGTATTATTCAGCACAAAACTTTAGGCTTTGAAGTAAACGTCGCGCCTTAGCGTTCGGTATAGATTTAACGCCAGTCCGTCATCGAACAGGAGCACAAAAGCACTCACCCACTCACCAAGCGCAACAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCCCGAGCCGCCGC]


>consensus_845#0 GGGGGGGAAAGCTGCGGAATTCCTCGAGGACTGTTGGCCTACTGGTGATGTAATGCTTAA AAATTTAAGCGTTTTGTGCAATTGTTACTAGATAGTAGATACTTTAATTAATTTACTATG TGGAGTACAATACATTGATGTGCAATTGATGTAAAATGGAACAAATTAAAGCAAATTTTA TTTGAGAATAATCATCATTTTTTAAGTGCAATATTCGAAACGAAAAACTTTTTCAATTGT TCCAATTGTGTTTGGGTAACAAAATTTGAAAAAAAAAAAACTACTCGTAGCCAGAAAAAG TCTTTTTTTTAAAGCATATCCCTTGTATTTTCTGTAACGAATGAGAAGTGTAATATAAAT ACTTGTGAATTATACCTTTAAAGAGCTCTACATGCTGCAACTTAACTCTATAAATTATGA AAAAAAAACAAAGAGGTGCCAACGTAGCAGAACTCCAACTGCAATCAATTGTACAAAGCG GCTGAAAAGCACCGGCAAAGAGGATTTGCAATCAAACCGATTTTTGTATTATTCAGCACA AAACTTTAGGCTTTGAAGTAAACGTCGCGCCTTAGCGTTCGGTATAGATTTAACGCCAGT CCGTCATCGAACAGGAGCACAAAAGCACTCACCCACTCACCAAGCGCAACAAAAAAAAAA AGGCCACATGTGCCCGAGCCGCCGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)