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Anopheles gambiae
cluster # 8910 cluster # 8910       Sequences # 13       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8910#0 length = 972 sequences # 3  
consensus_8910#1 length = 822 sequences # 10  

consensusID : consensus_8910#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 972
fasta sequence
                              [CCCCCGGGCACATGTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCC-GACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTTGTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGCACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCCGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTACAAGCAGTTCCAGAACAAGCAGGCTTAATAAGAACACTTTCCTCATTTTCTACAATTATTTCCACTGGCACATAGAACAAGGAACGTCTGCACGTACGCGATCTCGTGGATGTGGCTTTACGAGCCACACGATCAATCCAGTAGGCCAACAGTGCCCG]

[-] EMBL CNS096ST             [CCCCCGGGCACATGTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCC GACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTTGTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGCACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCCGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTA                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CNS097VV             [                                    tgAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGATTGGTGCCCGTTCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCC GACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAAATTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTTGTGCTCCTTATGATAGTAATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTGGTCTTGGAGCCCTTTTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTTTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTGGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTTTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTTATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTACAAGCAGTTCCAGAACAAGCAGGCTTAATAAGAACACTTTCCTCATTTTCTACAATTATTTCCACTGGCACATAGAACAAGGAACGT                                                                       ]
[+] EMBL CNS096SU             [                                          CTTATAAAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCAGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTTGTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGCACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCCGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTACAAGCAGTGCCAGAGCAAGCAGGCTTAATAAGAACACTTTCCTCATTTTCTACAATTATTTCCACTGGCACATAGAACAAGGAACGTCTGCACGTACGCGATCTCGTGGATGTGGCTTTACGAGCCACACGATCAATCCAGTAGGCCAACAGTGCCCG]


>consensus_8910#0 CCCCCGGGCACATGTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGTAGAATTTT ATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTAC GCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCA TGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGC GACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCC GTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTT TTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGG CCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTTGTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGAT TTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTA CCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGG CTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTG CTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGCACCCCTTATCACCTTTGTCG CCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCCGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTT TCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTACAAGCAGTTCCAGAACAAGCAGGCTT AATAAGAACACTTTCCTCATTTTCTACAATTATTTCCACTGGCACATAGAACAAGGAACG TCTGCACGTACGCGATCTCGTGGATGTGGCTTTACGAGCCACACGATCAATCCAGTAGGC CAACAGTGCCCG



consensusID : consensus_8910#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 822
fasta sequence
                              [CACATGTGGCC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTT-GTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTA]

[-] EMBL CNS08ED9             [CACATGTGGCC  TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTT GTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGGTGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTA]
[-] EMBL CNS095X4             [       GGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTT GTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTA]
[-] EMBL CNS08I5H             [             ccTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCG TGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTTGGTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTA]
[-] EMBL CNS097VU             [            catgtggccTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCAACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCAACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTT GTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTACCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTaa]
[+] EMBL CNS09FOV             [                                   TTTTGACTTTGAAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CNS08I5I             [                                                    TTATTCAATAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCAAAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAACCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTTTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGAGGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTT GTGCCCCTTATGAAAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTGGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTTTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTAATGACCGGCACCGT                                                                  ]
[+] EMBL CNS095X5             [                                                                  TTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCAAAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CNS08EDA             [                                                                                                                                                                                                          CAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGGGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CNS09FOU             [                                                                                                                                                                                                               TTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTT GTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTA]
[-] EMBL BM616369             [                                                                                                                                                                                                                                                                              TTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTT GTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCcgg                                                           ]


>consensus_8910#1 CACATGTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGT AGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGAT TTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCT TGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCG AAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTC CCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGC CCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCT TATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTTGTGCTCCTTATGATAGTCATCTT TGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCC CCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCT CGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCT TGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCAC CTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAA AAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8910#0      --------CCCCCGGGCACATGTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGT 52
consensus_8910#1      CACATGTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGT 60
                               **         * *    *********************************

consensus_8910#0      AGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGAT 112
consensus_8910#1      AGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGAT 120
                      ************************************************************

consensus_8910#0      TTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCT 172
consensus_8910#1      TTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCT 180
                      ************************************************************

consensus_8910#0      TGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCG 232
consensus_8910#1      TGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCG 240
                      ************************************************************

consensus_8910#0      AAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTC 292
consensus_8910#1      AAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTC 300
                      ************************************************************

consensus_8910#0      CCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGC 352
consensus_8910#1      CCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGC 360
                      ************************************************************

consensus_8910#0      CCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCT 412
consensus_8910#1      CCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCT 420
                      ************************************************************

consensus_8910#0      TATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTTGTGCTCCTTATGATAGTCATCTT 472
consensus_8910#1      TATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTTGTGCTCCTTATGATAGTCATCTT 480
                      ************************************************************

consensus_8910#0      TGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCC 532
consensus_8910#1      TGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCC 540
                      ************************************************************

consensus_8910#0      CCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCT 592
consensus_8910#1      CCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCT 600
                      ************************************************************

consensus_8910#0      CGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCT 652
consensus_8910#1      CGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCT 660
                      ************************************************************

consensus_8910#0      TGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGCACCCCTTATCAC 712
consensus_8910#1      TGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCAC 720
                      *********************************************** ************

consensus_8910#0      CTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCCGCCACCGCTTTCCTCAA 772
consensus_8910#1      CTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAA 780
                      ****************************************** *****************

consensus_8910#0      AAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTACAAGCAGTTCCAGAACAA 832
consensus_8910#1      AAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTA------------------ 822
                      ******************************************                  

consensus_8910#0      GCAGGCTTAATAAGAACACTTTCCTCATTTTCTACAATTATTTCCACTGGCACATAGAAC 892
consensus_8910#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8910#0      AAGGAACGTCTGCACGTACGCGATCTCGTGGATGTGGCTTTACGAGCCACACGATCAATC 952
consensus_8910#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8910#0      CAGTAGGCCAACAGTGCCCG 972
consensus_8910#1      --------------------
                                          




Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)