cluster # 911

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Anopheles gambiae
cluster # 911 cluster # 911 Sequences # 2 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_911#0 length = 227 sequences # 1

consensus_911#1 length = 127 sequences # 1

consensusID : consensus_911#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 227
fasta sequence

                              [GTCGCGTGCCCGCTTGTTCCGTTAATTTTTATGCTGCTGGTTGTGGGGCGGTTGCGCCGCTTCCGCCTGTTTGTGGTGCGTCGTGCGTTTGGTCCTGGCATGCTTGTTCTCCAGCACGTGCATGTTTTGGTCTCTGGTCGTCGTCGTTTGTGGGCAGTGTTCTGTTTCCATGGGTGCTGGTGCTTGCTTGTGCTGGGTGGCCGGTGGCTGCGCCATTGCGGCATATG]

[+] EMBL CNS090D0             [GTCGCGTGCCCGCTTGTTCCGTTAATTTTTATGCTGCTGGTTGTGGGGCGGTTGCGCCGCTTCCGCCTGTTTGTGGTGCGTCGTGCGTTTGGTCCTGGCATGCTTGTTCTCCAGCACGTGCATGTTTTGGTCTCTGGTCGTCGTCGTTTGTGGGCAGTGTTCTGTTTCCATGGGTGCTGGTGCTTGCTTGTGCTGGGTGGCCGGTGGCTGCGCCATTGCGGCATATG]




>consensus_911#0
GTCGCGTGCCCGCTTGTTCCGTTAATTTTTATGCTGCTGGTTGTGGGGCGGTTGCGCCGC
TTCCGCCTGTTTGTGGTGCGTCGTGCGTTTGGTCCTGGCATGCTTGTTCTCCAGCACGTG
CATGTTTTGGTCTCTGGTCGTCGTCGTTTGTGGGCAGTGTTCTGTTTCCATGGGTGCTGG
TGCTTGCTTGTGCTGGGTGGCCGGTGGCTGCGCCATTGCGGCATATG

consensusID : consensus_911#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 127
fasta sequence

                              [TAAGCTGCTGGTTGTGGGGCGGTTGCGGCGCTTCCGCCTGTTTGTGGTGCGTCGTGCGATTGGTCCTGGCAATGTTTGTTCTCCCGCACGTGCAAGTTTTGGTCTCTGGTCGTCGTCGATTGTGAGC]

[+] EMBL CNS08JYG             [TAAGCTGCTGGTTGTGGGGCGGTTGCGGCGCTTCCGCCTGTTTGTGGTGCGTCGTGCGATTGGTCCTGGCAATGTTTGTTCTCCCGCACGTGCAAGTTTTGGTCTCTGGTCGTCGTCGATTGTGAGC]




>consensus_911#1
TAAGCTGCTGGTTGTGGGGCGGTTGCGGCGCTTCCGCCTGTTTGTGGTGCGTCGTGCGAT
TGGTCCTGGCAATGTTTGTTCTCCCGCACGTGCAAGTTTTGGTCTCTGGTCGTCGTCGAT
TGTGAGC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_911#0      GTCGCGTGCCCGCTTGTTCCGTTAATTTTTATGCTGCTGGTTGTGGGGCGGTTGCGCCGC 60
consensus_911#1      -----------------------------TAAGCTGCTGGTTGTGGGGCGGTTGCGGCGC 31
                                                  ** ************************ ***

consensus_911#0      TTCCGCCTGTTTGTGGTGCGTCGTGCGTTTGGTCCTGGCA-TGCTTGTTCTCCAGCACGT 119
consensus_911#1      TTCCGCCTGTTTGTGGTGCGTCGTGCGATTGGTCCTGGCAATGTTTGTTCTCCCGCACGT 91
                     *************************** ************ ** ********* ******

consensus_911#0      GCATGTTTTGGTCTCTGGTCGTCGTCGTTTGTGGGCAGTGTTCTGTTTCCATGGGTGCTG 179
consensus_911#1      GCAAGTTTTGGTCTCTGGTCGTCGTCGATTGTGAGC------------------------ 127
                     *** *********************** ***** **                        

consensus_911#0      GTGCTTGCTTGTGCTGGGTGGCCGGTGGCTGCGCCATTGCGGCATATG 227
consensus_911#1      ------------------------------------------------