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Anopheles gambiae
cluster # 9131 cluster # 9131       Sequences # 14       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9131#0 length = 1302 sequences # 11  
consensus_9131#1 length = 670 sequences # 2  
consensus_9131#2 length = 500 sequences # 1  

consensusID : consensus_9131#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1302
fasta sequence
                              [ATTCGCTTTCCGAAGATTC-GATT-GGCTGGTTTTCTCCGTCAACTTTAAAGGTAGGGCAGGTTTGGCTGCTGTGTATGTATGTGTAATTGTGTGTGTGAGTGTGAGAATGTTGCCGCTTTTGCTGGGTAGTTAATATCTCACATGTCTTGGGCTGGTTTGAGGATTGCTGGCCGCTGTGCTACCGCCGCCGGTGGCCCCTGTCGCCCCGGCCATCCCGCTGGACGCATTGGAGGAGGAAACGTTGGAGGAAGCAGCACCGCCGGTGGCGTTATTATTACTGCTACTGTTACTACTGCCGATCAGCGTGGTCGAGTAGTTGTTGCTGGCTGCCGTCTGCGGACCGCCCTGCAGGCCAATTACCGATTGCTGCTGTTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGC-TGCTGCTGCGCGGCCTGTTGCGTGA-CA-TTTCCTGGTGTAGCGGGGTCAGCACGTACCCGGTGAGCGTCACATCGGCAGTGCCGCCCGATTCCAG-CGGTATCGGGTGCTGCCGGAAGTGCTCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAACCAGAGGTGCTGCACCCG-GCACTGGCCCAGATCGTTCAGCGTCATGCGCA-G-ATGCTTCGCCTTGCCCTGGAAGTTGAACGTGAGCACAAACTCGCCCTTGCGCG-TTTCGCT-CTGCCGCACTA-GGAACACGCCGTGACTAGAGGTGCCCTCGCGCAGCA-CCAGCTGGGCGGCATCGAACCGGGGCAGCGTGCCGTGGAACCACGGGTACTCGTGCATCATCGCGGTCAGGTCGGTGTCGTGCTCGTGCG-ACACGTCCAGATCGTTCTCGGTCAGCTCGAAGTTGCTCGACGACGATATCCGGTCGTCCGGCCGGCGGGGAGGCAGCTCCGGTGCGCTGGCAGCCGTAAGGGAGGAGTTG-T-TCGCGTTCGCTGTCTGGCCGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGTACCGGGTACCGTTCCGCCACCAGCCGCCGTACCGACGTTCCCACTCTGGGCCGTGAGCGATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCACCACCACCA---CCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCGCCAAACGCATGCAGTAGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACTCCAGGTTGTTGCCGCCCACGCGTCCGTAGTTCTAGATCGCGATCTAGAACTAGCGGACGCGTGGGCGG]

[+] EMBL CNS08N5P             [ATTCGCTTTCCGAAGATAC GATT GGCTGGTTTTCTCCGTCAACTTTAAAGGTAGGGCAGGTTTGGCCGCTGTGTATGTATGTGTAATTGTGTGTGTGAGTGTGAGAATGTTGCCGCTTTTGCTGGGTAGTTAATATCTCACATGTCTTGGGCTGGTTTGAGGATTGCTGGCCGCTGTGCTACCGCCGCCGGTGGCCCCTGTCGCCCCGGCCATCCCGCTGGACGCATTGGAGGAGGAAACGTTGGAGGAAGCAGCACCGCCGGTGGCGTTATTATTACTGCTACTGTTACTACTGCCGATCAGCGTGGTCGAGTAGTTGTTGCTGGCTGCCGTCTGCGGACCGCCCTGCAGGCCAATTACCGATTGCTGCTGTTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGC TGCTGCTGCGCGGCCTGTTGCGTGA CA TTTCCTGGTGTAGCGGGGTCAGCACGTACCCGGTGAGCGTCACATCGGCAGTGCCGCCCGATTCCAG CGGTATCGGGTGCTGCCGGAAGTGCTCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAACCAGAGGTGCTGCACCCG GCACTGGCCCAGATCGTTCAGCGTCATGCGCA G ATGCTTCGCCTTGCCCTGGAAGTTGAACGTGAGCACAAACTCGCCCTTGCGCGTTTTCGCTCCTGCCGCACTA TTAACACGCCGTGACTAGAGGTGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CNS08V7N             [   CGCTTTCCGAAGA TC GATT GGCTGGTTTTCTCCGTCAACTTTAAAGGTAGGGCAGGTTTGGCTGCTGTGTATGTATGTGTAATTGTGTGTGTGAGTGTGAGAATGTTGCCGCTTTTGCTGGGTAGTTAATATCTCACATGTCTTGGGCTGGTTTGAGGATTGCTGGCCGCTGTGCTACCGCCGCCGGTGGCCCCTGTCGCCCCGGCCATCCCGCTGGACGCATTGGAGGAGGAAACGTTGGAGGAAGCAGCACCGCCGGTGGCGTTATTATTACTGCTACTGTTACTACTGCCGATCAGCGTGGTCGAGTAGTTGTTGCTGGCTGCCGTCTGCGGACCGCCCTGCAGGCCAATTACCGATTGCTGCTGTTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGC TGCTGCTGCGCGGCCTGTTGCGTGA CATTTTCCTGGTGTAGCGGGGTCAGCACGTACCCGGTGAGCGTCACATCGGCAGTTCCGCCCGATTCCAG CGGTATCGGGTGCTGCCGGAAGTGCTCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAACCAGAGGTGCTGCACCCG GCACTGGCCCAGATCGTTCAGCGTCATGCGCA G ATGCTTCGCCTTGCCCTGGAAGTTGAACGTGAGCCCAAACTCGCCCTTGCGCG TTTCGCT CTGCCGCACTA GGAACACGCCGTTTTTTTTTTTGCCCTCGCGCA CACCCAGCTGGGCGGCATCGAACCGGGGCAGCGTGCCGTGGAACCACGGGTACTCGTGCATCATCGCGGTCAGGTCGGTGTCGTGCTCGTGCG ACACGTCCAGATCGTTCTCGGTCAGCTCGAAGTTGCTCGACGACGATATCCGGTCGTCCGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CNS08DZ6             [          CGAAGATTCAGATTAGGCTGGTTTTCTCCGTCAACTTTAAAGGTAGGGCAGGTTTGGCTGCTGTGTATGTATGTGTAATTGTGTGTGTGAGTGTGAGAATGTTGCCGCTTTTGCTGGGTAGTTAATATCTCACATGTCTTGGGCTGGTTTGAGGATTGCTGGCCGCTGTGCTACCGCCGCCGGTGGCCCCTGTCGCCCCGGCCATCCCGCTGGACGCATTGGAGGAGGAAACGTTGGAGGAAGCAGCACCGCCGGTGGCGTTATTATTACTGCTACTGTTACTACTGCCGATCAGCGTGGTCGAGTAGTTGTTGCTGGCTGCCGTCTGCGGACCGCCCTGCAGGCCAATTACCGATTGCTGCTGTTGCTGTTGCTGCTGCGGGGGC TGCTGCTGCGCGGCCTGTTGCGTGA CA TTTCCTGGTGTAGCGGGGTCAGCACGTACCCGGTGAGCGTCACATCGGCAGTGCCGCCCGATTCCAG CGGTATCGGGTGCTGCCGGAAGTGCTCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAACCAGAGGTGCTGCACCCG GCACTGGCCCAGATCGTTCAGCGTCATGCGCA G ATGCTTCGCCTTGCCCTGGAAGTTGAACGTGAGCACAAACTCGCCCTTGCGCG TTTCGCT CTGCCGCACTATAAAACACGCCGTGACTAGAGGTGCCCTCGCGCA CACCCAGCTGGGCGGCATCGAACCGGGGCAGCGTGCCGTGGAATTTTGGGTACTCGTGCATCATCGCGGTCAGGTCGGTGTCGTGCTCGTGCG ACACGTCCAGATCGTTCTCGGTCAGCTCGAAGTTGCTCGACGACGATATCCGGTTGTCCGGCCGGCGGGGAGGCAGCTCCGGTGCGCTGGCAGCCGTAAGGGAGGAGTTG T TCGCGTTCGCTGTCTGGCCGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGTACCGGGTACGTTTCCGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CNS08P15             [                                                                                                                            TGGGTAGTTAATATCTCACATGTCTTGGGCTGGTTTGAGGATTGCTGGCCGCTGTGCTACCGCCGCCGGTGGCCCCTGTCGCCCCGGCCATCCCGCTGGACGCATTGGAGGAGGAAACGTTGGAGGAAGCAGCACCGCCGGTGGCGTTATTATTACTGCTACTGTTACTACTGCCGATCAGCGTGGTCGAGTAGTTGTTGCTGGCTGCCGTCTGCGGACCGCCCTGCAGGCCAATCACCGATTGCTGCTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGC TGCTGCTGCGCGGCCTGTTGCGTGA CA TTTCCTGGTGTAGCGGGGTCAGCACGTACCCGGTGAGCGTCACATCGGCAGTGCCGCCCGATTCCAG CGGTATCGGGTGCTGCCGGAAGTGCCCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAACCAGAGGTGCTGCACCCGCGCACTGGCCCAGATCGTTCAGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
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[-] EMBL CNS08V7M             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTGCGTGAGCA TTTCCTGGTGTAGCGGGGTCAGCACGTACCCGGTGAGCGTCACATCGGCAGTGCCGCCCAAAAAAAG CGGTATCGGGTGCTGCCGGAAGTGCTCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAACCAGAGGTGCTGCACCCG GAACTGGCCCAGATCGTTCAGCGTCATGCGCA GAATG TTCGCCTTGCCCTGGAAGTTGAACGTGAGCACAAACTCGCCCTTGCGCG TTTCGCT CTGCCGCACTA GGAACACGCCGTGACTAGAGGTGCCCTCGCGCAGCA CCAGCTGGGCGGCATCGAACCGGGGCAGCGTGCCGTGGAACCACGGGTACTCGTGCATCATCGCGGTCAGGTCGGTGTCGTGCTCGTGCG ACACGTCCAGATCGTTCTCGGTCAGCTCGAAGTTGCTCGACGACGATATCCGGTCGTCCGGCCGGCGGGGAGGCAGCTCCGGTGCGCTGGCAGCCGTAAGGGAGGAGTTGTT TCGCGTTCGCTGTCTGGCCGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGTACCGGGTACCGTTCCGCCACCAGCCGCCGTACCGACGTTCCCACTCTGGGCCGTGAGCGATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCACCACCACCA   CCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCcgcta                                                                                                                                           ]
[-] EMBL BX612598             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTACCCGGTGAGCGTCACATCGGCAGTGCCGCCCGATTCCAG CGGTATCGGGTGCTGCCGGAAGTGCTCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAACCAGAGGTGCTGCACCCG GCACTGGCCCAGATCGTTCAGCGTCATGCGCA G ATGCTTCGCCTTGCCCTGGAAGTTGAACGTGAGCACAAACTCGCCCTTGCGCG TTTCGCT CTGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL BX611165             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CGTCACATCGGCAGTGCCGCCCGATCCCAG CGGTATCGGGTGCTGCCGGAAGTGCTCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAACCAGAGGTGCTGCACCCG GCACTGGCCCAGATCGTTCAGCGTCATGCGCA G ATGCTTCGCCTTGCCCTGGAAGTTGAACGTGAGCACAAACTCGCCCTTGCGCG TTTCGCT CTGCCGCACTA GGAACACGCCGTGACTAGAGGTGCCCTCGCGCAGCA CCAGCTGGGCGGCATCGAACCGGGGCAACGTGCCGTGGAACCACGGGTACTCGTGCATCATCGCGGTCAGGTCGGTGTCGTGCTCGTGCG ACACGTCCAGATCGTTCTCGGTCAGCTCGAAGTTGCTCGACGACGATATCCGGTCGTCCGGCCGGCGGGGAGGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CNS08N5O             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCGATTCCAGCCGTTATCGGGTG AACCGAAAGTGCTCGAGAATCTCGGTGATCGAGGGAAACCAGAGGTGCTGCACCCG GCACTGGCCCAGATCGTTCAGCGTCATGCGCA G ATG TTCGCCTTGCCCTGGAAGTTGAACGTGAGCACAAACTCGCCCTTGCGCG TTTCGCT CTGCCGCACTA GGAACACGCCGTGACTAGAGGTGCCCTCGCGCAGCA CCAGCTGGGCGGCATCGAACCGGGGCAGCGTGCCGTGGAACCACGGGTACTCGTGCATCATCGCGGTCAGGTCGGTGTCGTGCTCGTGCG ACACGTCCAGATCGTTCTCGGTCAGCTCGAAGTTGCTCGACGACGATATCCGGTCGTCCGGCCGGCGGGGAGGCAGCTCCGGTGCGCTGGCAGCCGTAAGGGAGGAGTTG TCTCGCGTTCGCTGTCTGGCCGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGTACCGGGTACCGTTCCGCCACTAGCCGCCGTACCGACGTTCCCACTCTGGGCCGTGAGCGATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCACCACCACCA   CCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGAC GTTCCGAGTT                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CNS08P14             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACCACGGGTACTCGTGCATCATCGCGGTCAGGTCGGTGTCGTGCTCGTGCGAACACGTCCAGATCGTTCTCGGTCAGCTCGAAGTTGCTCGACGACGATATCCGGTCGTCCGGCCGGCGGGGAGGCAGCTCCGGTGCGCTGGCAGCCGTAAGGGAGGAGTTGTT TCGCGTTCGCTGTCTGGCCGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGTACCGGGTACCGTTCCGCCACCAGCCGCCGTACCGACGTTCCCACTCTGGGCCGTGAGCGATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCC GTTCCACCACCACCA   CCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGTTACCGAGTTTGGT                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL BM645626             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGCGGTGGTACCGGGTACCGTTCCGCCACCTGCCGCCGTACCGACGTTCCCGCTCTGGGCCGTGAGCGATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCACCACCACCACCGCCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCGTGCTACGCATGCAGTAGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACTCCAGGTTGTTGCCGCCCACGCGTCCGTAGTTCTAGATCGCGATCTAGAACTAGCGGACGCGTGGGCGG]


>consensus_9131#0 ATTCGCTTTCCGAAGATTCGATTGGCTGGTTTTCTCCGTCAACTTTAAAGGTAGGGCAGG TTTGGCTGCTGTGTATGTATGTGTAATTGTGTGTGTGAGTGTGAGAATGTTGCCGCTTTT GCTGGGTAGTTAATATCTCACATGTCTTGGGCTGGTTTGAGGATTGCTGGCCGCTGTGCT ACCGCCGCCGGTGGCCCCTGTCGCCCCGGCCATCCCGCTGGACGCATTGGAGGAGGAAAC GTTGGAGGAAGCAGCACCGCCGGTGGCGTTATTATTACTGCTACTGTTACTACTGCCGAT CAGCGTGGTCGAGTAGTTGTTGCTGGCTGCCGTCTGCGGACCGCCCTGCAGGCCAATTAC CGATTGCTGCTGTTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCGCGGCCTGTTGCGTGAC ATTTCCTGGTGTAGCGGGGTCAGCACGTACCCGGTGAGCGTCACATCGGCAGTGCCGCCC GATTCCAGCGGTATCGGGTGCTGCCGGAAGTGCTCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAAC CAGAGGTGCTGCACCCGGCACTGGCCCAGATCGTTCAGCGTCATGCGCAGATGCTTCGCC TTGCCCTGGAAGTTGAACGTGAGCACAAACTCGCCCTTGCGCGTTTCGCTCTGCCGCACT AGGAACACGCCGTGACTAGAGGTGCCCTCGCGCAGCACCAGCTGGGCGGCATCGAACCGG GGCAGCGTGCCGTGGAACCACGGGTACTCGTGCATCATCGCGGTCAGGTCGGTGTCGTGC TCGTGCGACACGTCCAGATCGTTCTCGGTCAGCTCGAAGTTGCTCGACGACGATATCCGG TCGTCCGGCCGGCGGGGAGGCAGCTCCGGTGCGCTGGCAGCCGTAAGGGAGGAGTTGTTC GCGTTCGCTGTCTGGCCGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGTACCGGGTACCGTTCCGCCA CCAGCCGCCGTACCGACGTTCCCACTCTGGGCCGTGAGCGATTGATTCAGGCTGAGGTTG TTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCACCACCACCACCGCCGCCGCCG CCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGAC GGTTCCGAGTTTGGTTGCGCCAAACGCATGCAGTAGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGC ATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACTCCAGGTTGTTGCCGCCCACGCGTCCG TAGTTCTAGATCGCGATCTAGAACTAGCGGACGCGTGGGCGG



consensusID : consensus_9131#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 670
fasta sequence
                              [CCACCACCCAACCGCCGCCGCCGCCGCCGTGGGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCGTGCTACGCATGCAGTAGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACTCCAGGTTGTTGCCGGCCTTCAGCACGAACGTGTTCTCGTGATCCGGCATCTCGAGCGCCGTCGTTTCGCGGGCCTCCGTTATGAGAAAGCAAAACACACCGCTCCGGGGCTTTTGTGACTTTGGTGGTGAGTAAAATTCCAGCATGTACCCCGACACCGTTTTCACCAGCACCAGCTTACACTTTTCCCACTTCTGCGAACCGGGCTGGTCGAGGTTTTCCGGTGACAGGTAGTTGACGGTGCCCTCCTTCCGGCATTCGACCACGATCTTGGCGAGCTTGGTTTTGCTCGCCCGCCGTTCCGACAGTTCCACCTCGTCGGAGTGTTGCTTGTGGAAAAATGCATGAATCACCTTGCCCTTGCGGAGCCCTTTGAACGACAGTCGGCGGAAGAACGGTTTGTGGTTGGTTTTTGGCGAATCTGTATCCTCGGAGTAGTCGCTTTCCTCCGGTACCGTTGCGGCGGCGTTTCCAGTCTTAGGTTGCGCCGG]

[-] EMBL BM655204             [CCACCACCCAACCGCCGCCGCCGCCGCCGTGGGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCGTGCTACGCATGCAGTAGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACTCCAGGTTGTTGCCGGCCTTCAGCACGAACGTGTTCTCGTGATCCGGCATCTCGAGCGCCGTCGTTTCGCGGGCCTCCGTTATGAGAAAGCAAAACACACCGCTCCGGGGCTTTTGTGACTTTGGTGGTGAGTAAAATTCCAGCATGTACCCCGACACCGTTTTCACCAGCACCAGCTTACACTTTTCCCACTTCTGCGAACCGGGCTGGTCGAGGTTTTCCGGTGACAGGTAGTTGACGGTGCCCTCCTTCCGGCATTCGACCACGATCTTGGCGAGCTTGGTTTTGCTCGCCCGCCGTTCCGACAGTTCCACCTCGTCGGAGTGTTGCTTGTGGAAAAATGCATGAATCACCTTGCCCTTGCGGAGCCCTTTGAACGACAGTCGGCGGAAGAACGGTTTGTGGTTGGTTTTTGGCGAATCTGTATCCTCGGAGTAGTCGCTTTCCTCCGGTACCGTTGCGGCGG                         ]
[-] EMBL BM618481             [                                                                          GCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCGTGCTACGCATGCAGTAGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACTCCAGGTTGTTGCCGGCCTTCAGCACGAACGTGTTCTCGTGATCCGGCATCTCGAGCGCCGTCGTTTCGCGGGCCTCCGTTATGAGAAAGCAAAACACACCGCTCCGGGGCTTTTGTGACTTTGGTGGTGAGTAAAATTCCAGCATGTACCCCGAAACCGTTTTCACCAGCACCAGCTTACACTTTTCCCACTTCTGCGAACCGGGCTGGTCGAGGTTTTCCGGTGACAGGTAGTTGACGGTGCCCTCCTTCCGGCATTCGACCACGATCTTGGCGAGCTTGGTTTTGCTCGCCCGCCGTTCCGACAGTTCCACCTCGTCGGAGTGTTGCTTGTGGAAAAATGCATGAATCACCTTGCCCTTGCGGAGCCCTTTGAACGATAGTCGGCGGAAGAACGGTTTGTGGTTGGTTTTTGGCGAATCTGTATCCTCGGAGTAGTCGCTTTCCTCCGGTACCGTTGCGGACCCGTTTCCAGTCTTAGGTTGCGCCGG]


>consensus_9131#1 CCACCACCCAACCGCCGCCGCCGCCGCCGTGGGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCA AATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCGTGCTACGCATGCAGT AGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACT CCAGGTTGTTGCCGGCCTTCAGCACGAACGTGTTCTCGTGATCCGGCATCTCGAGCGCCG TCGTTTCGCGGGCCTCCGTTATGAGAAAGCAAAACACACCGCTCCGGGGCTTTTGTGACT TTGGTGGTGAGTAAAATTCCAGCATGTACCCCGACACCGTTTTCACCAGCACCAGCTTAC ACTTTTCCCACTTCTGCGAACCGGGCTGGTCGAGGTTTTCCGGTGACAGGTAGTTGACGG TGCCCTCCTTCCGGCATTCGACCACGATCTTGGCGAGCTTGGTTTTGCTCGCCCGCCGTT CCGACAGTTCCACCTCGTCGGAGTGTTGCTTGTGGAAAAATGCATGAATCACCTTGCCCT TGCGGAGCCCTTTGAACGACAGTCGGCGGAAGAACGGTTTGTGGTTGGTTTTTGGCGAAT CTGTATCCTCGGAGTAGTCGCTTTCCTCCGGTACCGTTGCGGCGGCGTTTCCAGTCTTAG GTTGCGCCGG



consensusID : consensus_9131#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 500
fasta sequence
                              [GATATCCGGTCGTCCGGTCCCGTNCNGGGGAGCCAGTGCTTCNCGTTGGCGCTGTCACGCCGTTTAGGGAGGAGCTTGTTTCGCGTTCGCTGGTCTGCCCGTGCTGTGCTTGNTGNCGTGTGGTACCGGGTACCGTTCCGCCACCGTGGCCGCCGTACCGACGTTCCCGCTCTGGCCGTGANCGATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCACCACCACCACCGCCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCGTGCTACGCATGCAGTAGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACTCCAGGTTGTTGCCGGCCTTCAGCACGAACGTGTTCTCGTGATCCGGCATCTCGAGCGCCGTAAACCTCGTGCGATCTGC]

[-] EMBL AL696272             [GATATCCGGTCGTCCGGTCCCGTNCNGGGGAGCCAGTGCTTCNCGTTGGCGCTGTCACGCCGTTTAGGGAGGAGCTTGTTTCGCGTTCGCTGGTCTGCCCGTGCTGTGCTTGNTGNCGTGTGGTACCGGGTACCGTTCCGCCACCGTGGCCGCCGTACCGACGTTCCCGCTCTGGCCGTGANCGATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCACCACCACCACCGCCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCGTGCTACGCATGCAGTAGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACTCCAGGTTGTTGCCGGCCTTCAGCACGAACGTGTTCTCGTGATCCGGCATCTCGAGCGCCGTAAACCTCGTGCGATCTGC]


>consensus_9131#2 GATATCCGGTCGTCCGGTCCCGTNCNGGGGAGCCAGTGCTTCNCGTTGGCGCTGTCACGC CGTTTAGGGAGGAGCTTGTTTCGCGTTCGCTGGTCTGCCCGTGCTGTGCTTGNTGNCGTG TGGTACCGGGTACCGTTCCGCCACCGTGGCCGCCGTACCGACGTTCCCGCTCTGGCCGTG ANCGATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTT CCACCACCACCACCGCCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATC AAATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTTTGGTTGCGTGCTACGCATGCAG TAGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTAC TCCAGGTTGTTGCCGGCCTTCAGCACGAACGTGTTCTCGTGATCCGGCATCTCGAGCGCC GTAAACCTCGTGCGATCTGC



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9131#0      ATTCGCTTTCCGAAGATTCGATTGGCTGGTTTTCTCCGTCAACTTTAAAGGTAGGGCAGG 60
consensus_9131#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9131#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9131#0      TTTGGCTGCTGTGTATGTATGTGTAATTGTGTGTGTGAGTGTGAGAATGTTGCCGCTTTT 120
consensus_9131#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9131#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9131#0      GCTGGGTAGTTAATATCTCACATGTCTTGGGCTGGTTTGAGGATTGCTGGCCGCTGTGCT 180
consensus_9131#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9131#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9131#0      ACCGCCGCCGGTGGCCCCTGTCGCCCCGGCCATCCCGCTGGACGCATTGGAGGAGGAAAC 240
consensus_9131#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9131#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9131#0      GTTGGAGGAAGCAGCACCGCCGGTGGCGTTATTATTACTGCTACTGTTACTACTGCCGAT 300
consensus_9131#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9131#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9131#0      CAGCGTGGTCGAGTAGTTGTTGCTGGCTGCCGTCTGCGGACCGCCCTGCAGGCCAATTAC 360
consensus_9131#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9131#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9131#0      CGATTGCTGCTGTTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCGCGGCCTGTTGCGTGAC 420
consensus_9131#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9131#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9131#0      ATTTCCTGGTGTAGCGGGGTCAGCACGTACCCGGTGAGCGTCACATCGGCAGTGCCGCCC 480
consensus_9131#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9131#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9131#0      GATTCCAGCGGTATCGGGTGCTGCCGGAAGTGCTCGAGCATCTCGGTGATCGAGGGAAAC 540
consensus_9131#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9131#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9131#0      CAGAGGTGCTGCACCCGGCACTGGCCCAGATCGTTCAGCGTCATGCGCAGATGCTTCGCC 600
consensus_9131#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9131#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9131#0      TTGCCCTGGAAGTTGAACGTGAGCACAAACTCGCCCTTGCGCGTTTCGCTCTGCCGCACT 660
consensus_9131#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9131#1      ----------------------CCACCACCCAACCGCCGCCGCCGCCGCCGTGGGACATT 38
                                                                                  

consensus_9131#0      -AGGAACACGCCGTGACTAGAGGTGCCCTCGCGCAGCACCAGCTGGGCGGCATCGAACCG 719
consensus_9131#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9131#1      GAGGTACTGAGTGTGGCGATCAA-ATCCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTCCGAGTT 97
                                                                                  

consensus_9131#0      GGGCAGCGTGCCGTGGAACCACGGGTACTCGTGCATCATCGC-GGTCAGGTCGGTGTCGT 778
consensus_9131#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9131#1      TGGTTGCGTGCTA------CGCATGCAGTAGCGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTC 151
                                                                                  

consensus_9131#0      GCTCGTGCGACACGTCCAGATCGTTCTCGGTCAGCTCGAAGTTGCTCGACGACGATATCC 838
consensus_9131#2      -----------------------------------------------------GATATCC 7
consensus_9131#1      GTCCGTGTCGCGGGCCTCTAT-GACGTACTCCAGGTTGTTGCCGGCCTTCAGCACGAACG 210
                                                                              * * 

consensus_9131#0      GGTCGTC-CGGCC----GGCGGGGAGGCAGC---TCCGGT--GCGCTGGCA-GCCGTA-A 886
consensus_9131#2      GGTCGTC-CGGTCCCGTNCNGGGGAGCCAGTGCTTCNCGTTGGCGCTGTCACGCCGTTTA 66
consensus_9131#1      TGTTCTCGTGATCCGGCATCTCGAGCGCCGTCGTTTCGCGGGCCTCCGTTATGAGAAAGC 270
                       **  **  *  *         *    * *    *        * * *  * *       

consensus_9131#0      GGGAGGAGTTG--TTCGCGTTCGCTGTCTGGCCGGTGGTGGTGGTGGTGGC-G-GTGGTA 942
consensus_9131#2      GGGAGGAGCTTGTTTCGCGTTCGCTGGTCTGCCCGTGCTGTGCTTGNTGNC-GTGTGGTA 125
consensus_9131#1      AAAACACACCG-CTCCGGGGCTTTTGTGACTTTGGTGGTGAGTAAAATTCCAGCATGTAC 329
                         *         * ** *     **        *** **       *  * *  **   

consensus_9131#0      CCGGGTACCGTTCCGCCACCA--GCCGCCGTACCGACGTTCCCACTCTGGGCCGTGAGCG 1000
consensus_9131#2      CCGGGTACCGTTCCGCCACCGTGGCCGCCGTACCGACGTTCCCGCTCTGG-CCGTGANCG 184
consensus_9131#1      CCCGACACCGTTTT--CACCAGCACCAGCTTAC-ACTTTTCCCACTTCTG--CGAACCGG 384
                      ** *  ******    ****    **  * ***     ***** **   *  **     *

consensus_9131#0      ATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCAC 1060
consensus_9131#2      ATTGATTCAGGCTGAGGTTGTTGACGTCCGCGGCCAGGTTCGATGTCAGTCCGGTTCCAC 244
consensus_9131#1      GCTGGTCGAGGTTTT--CCGGTGACAG--GTAGTTGACGGTGCCCTCCTTCCGGCATT-C 439
                        ** *  *** *      * ****    *  *        *   **  *****     *

consensus_9131#0      CACCACCACCGCCGCCGCCGCCG---TGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAAT 1117
consensus_9131#2      CACCACCACCGCCGCCGCCGCCGCCGTGCGACATTGAGGTACTGAGTGTGGCGATCAAAT 304
consensus_9131#1      GACCACGATCTTGGCGAGCTTGGTTTTGCTCGCCCGCCGTTCCGACAGTTCC-ACCTCGT 498
                       ***** * *   **   *   *   ***      *  ** * **  **  * * *   *

consensus_9131#0      CCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTC-CGAGTTTGGTTGCGCCAAACGCATGCAGTAG 1176
consensus_9131#2      CCGAGCCAGCCGCCGCATCCGACGGTTC-CGAGTTTGGTTGCGTGCTACGCATGCAGTAG 363
consensus_9131#1      CGGAGT--GTTGCT-TGTGGAAAAATGCATGAATCACCTTGCCCTTGCGGAGCCCTTTGA 555
                      * ***   *  **    *   *   * *  ** *    ****       *    *  *  

consensus_9131#0      CGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACTCC 1236
consensus_9131#2      CGTATCGTGGCCAGCCAGCTGCGCATGTCGTCCGTGTCGCGGGCCTCTATGACGTACTCC 423
consensus_9131#1      ACGACAGTCGGCGGAAGAACG-GTTTGTGGTTGGTTTTTGGCGAATCTGTATC---CTCG 611
                         *  ** * * *      * *  *** **  ** *   * *  *** *  *   *** 

consensus_9131#0      AGGTTGTTGCCGCCC------ACGCGTCCGTAGTTCTAGATCGCGATCTAGAACTAGCGG 1290
consensus_9131#2      AGGTTGTTGCCGGCCTTCAGCACGAACGTGTTCTCGTGATCCGGCATCTCGAGCGCCGTA 483
consensus_9131#1      GAGTAGTCGCTTTCC----------TCCGGTACCGTTGCGGCGGCGTTTCCAGTCTTAGG 661
                        ** ** **   **              **     *    **   * *  *        

consensus_9131#0      ACGCGTGGGCGG----- 1302
consensus_9131#2      AACCTCGTGCGATCTGC 500
consensus_9131#1      TTGCGCCGG-------- 670
                         *    *        




Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)