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Anopheles gambiae
cluster # 9422 cluster # 9422       Sequences # 16       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9422#0 length = 569 sequences # 16  

consensusID : consensus_9422#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 16
consensus length = 569
fasta sequence
                              [CCGACCACACGTTCCG-TATTTTTTATAGTTTTAGTAATTTATAAT-GAAATAATAA-TTGTAATTATAGTGTATTAGAATTTGAAAAGAATATTGAAATA-ATTTGAGAAATTTTTAGTTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTAGCACGGTGTATTACATGGTAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAGTGTAAATATGTAATTAGAAATGAAATGATAATCGATTTGAAATACATCTAGTTTTTTAAC-AAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTAAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAGGATGAACTTTTATATTTTTTATAATT-TTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCTATTATTAATACATTTGTTATAATTTATGTTTTATAAAAAATTATTTAATTTAAATTAAATTATTTATTAAAATTTAAATTTTAATAATAAAAATTTAGTAATTATGATAAAATTAGTGTATAAA]

[+] EMBL BM598177             [CCGCCCACACGATCCG TATTTTTTATAGTTTTAGTAATTTATAAT GAAATAATAA TTGTAATTATAGTGTATTAGTATTTGAAAAGAATATTGAAATA ATTTGAGAAATTTTTAGTTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTAGCACGGTGTATTACATGATAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTATTGTAAATATGTAATTAGAAATGAAATGTTAATCGTTTTGAAATATATCTAGTTTTTTAAC AAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAGGATAAAATTTTATATTTTTTATAATT TTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCTATTATTAATAAATTTGTTATAATTTATTTTTTATAAAAAATTATTTAATTTAAATTAAATTATTTATTAAAATTTAAATTTTAATAATAAAAATTTAGTAATTATGATAAAATTAGTGTATAAA]
[+] EMBL BM638041             [CCGACCACGCGTACCGTTATTTTTTATAGTATTAGTAATTTATAAT GAAATAATAA TTGTAATTATAGTGTATTAGAATTTGAAAAGAATATTGAAATA ATTTGAGAAATTTTTAGTTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTAGCACGGTGTATTACATGATAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGAGTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAGTGTAAATACGAAATTAGAAATGAAATGATAATCGTTTTGAAATACATCTAGTTTTTTAAC AAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTAAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAGGATGAAATTTTATATTTTTTATAATT TTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCCATTATTAATACATTTGTTATAATTTATGT                                                                                               ]
[+] EMBL BM583614             [CCGACCACTCGTTCC   ATTTTTTATAGTTTTAGTAATTTATAAT GAAATAATAA TTGTAATTATAGTGTATTAGAATTTGAATAGAATATTGAAATA ATTTGAGAAATTTTTAGTTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTAGCACGGTGTATTACATGGTAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAGTGTAAATATGTAATTAGAAATGAAATGATAATCGATTTGAAATATATCTAGTTTTTTTACGAAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTAAATTATTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAGGATAAACTTTTATATTTTTTATAATT TTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCTATTATTAATACATTTGTTATAATTTATGT                                                                                               ]
[+] EMBL BM588560             [             CCG  ATTTTTCATAGGTTTAGTAATTTATAAT GAAATAATAA TTGTAATTATAGTGTATTAGAATTTGAAAAGAATATTGAAATA ATTTGAGAAATTTTTAGTTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTAGCACGGTGTATTACATGATAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAGTGTAAATATGAAATTAGAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BM656446             [                        TATAGTTTTAGTAATTTATAATAGAAATAATAA TTGTAATTATAGTGTATTAGAATTTGAAAAGAATATTGAAATA ATTTGAGAAATTTTTAGTTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTAGCACGGTGTATTACATGGTAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAGTGTAAATACGTAATTAGAAATGAAATGTTAATCGATTTGAAATACATCTAGTTTTTTAAC AAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTCTTAAGTAAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTGGGATAAACTTTTATATTTTTTATAATTCTTTAAA                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BM641812             [                          TAGTATTAGTAATTTATAAT GAAATAATAATTTGTAATTATAGTGTATTAGAATTTGAAAAGAATATTGAAATA ATTTGAGAAATTTTTAGTTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTAGCACGGTGTGTTACATGGTAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGCGTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAGTGGAAATACGTAATTAGAAATGAAATGATAATCGATTTGAAATACATCTAGTTTTTTATC AAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTCTTAAGTAAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTGGGATGAACTTTTATATTTTTTATAATT TTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCCATTATTAATACATTTGTTATAATTTATGTTTTATAAAAA                                                                                     ]
[+] EMBL BM611523             [                                       TTATAAT GAAATAATAA TTGTAATTATAGTGTATTAGTATTTGAAAAGAATATTGAAATA ATTTGAGAAATTTTTAGTTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTAGCACGGTGTGTTACATGGTAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAGTGTAAATATGAAATTAGAAATGAAATGATAATCGATTTGAAATACATCTAGTTTTTTAAC AAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTATCTTAAGTAAATTATTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAGGATGAGCTTT                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BM598937             [                                                AAATAATAA TTGTAATTATAGTGTATTAGTATTTGAAAAGAATATTGAAATA ATTTGAGAAATTTTTAATTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTAGCACGGTGTATTACATAATAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGAGTTAATTATATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BM598122             [                                                  ccgaccA TTCTACCTATAGTGTATTAGAATTTGAAAAGAATATTGAAATAGATTTGAAAAATTTTTAGTTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTATCACGGTGTATTACATGGTAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTATTGTAAATATGTAATTAGAAATGAAATGTTAATCGTTTTGAAATATATCTAGTTTTTTAAC AAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAGGATAAAATTTTATATTTTTTATAATT TTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCTATTATTAATAAATTTGTTAT                                                                                                        ]
[+] EMBL BM608554             [                                                                                             TTGAAATA ATTTGAGAAATTTTTAGTTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTAGCACGGTGTGTTACATGGTAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAGTGTAAATACGTAATTAGAAATGAAATGTTAATCGATTTGAAATACATCTAGTTTTTTAAC AAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAGGATAAACTTTTATATTTTTTATAA                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BM638807             [                                                                                                                TTTTTAGTTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTAGCACGGTGTGTTACATGGTAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAGTGTAAATATGAAATTAGAAATGAAATGATAATCGATTTGAAATATGTCTAGTTTTTTAAC AAATGAATTTAGATTAGCTTATTTATTATCTTAAGTAAATTATTTAGTTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTGGGATGAGCTTTTATATTTTTTATAA                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BM591195             [                                                                                                                                                                    TTACATGGTAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTATCGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAGTGGAAATATGAAATTAGAAATGAAATGATAATCGATTTGAAATACGTCTAGTTTTTTATC AAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTAAATTATTTAGTTTAATAATTAAATAAAGAAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAGGATGAACTTTTATATTTTTTATAATT TTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCTATTATTAATACATTTGTTATAATTTATGTTTTATAAAAAATTATTTAATTT                                                                         ]
[+] EMBL BM606297             [                                                                                                                                                                           GTAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTATCGAGTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAGTGTAAATATGAAATTAGAAATGAAATGTTAATCGATTTGAAATACATCTAGTTTTTTATC AAGTGAATTTAATTTAGCTTATTTATTATATTAAGTAAATTATTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAGGATGAGATTTTATATTTTTTATAATT TTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCTATTATTAATACATTTGTTATAATTTATGTTTTATAAAAAATTATTTAATTTAAATTAAAT                                                                ]
[+] EMBL BM616602             [                                                                                                                                                                            TAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGAGTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAGTGGAAATATGAAATTAGAAATGAAATGATAATCGATTTGAAATACATCTAGTTTTTTATC AAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTAAATTATTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTGGGATGAGATTTTATATTTTTTATAATT TTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCTATTA                                                                                                                        ]
[+] EMBL BM584119             [                                                                                                                                                                            TAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAACGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAGTGGAAATACGTAATTAGAAATGAAATGTTAATCGTTTTGAAATACATCTAGTTTTTTATC AAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTAAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAATTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAGGATGAAATTTTATATTTTTTATAATT TTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCCATTATTAATACATTTGTTATAATTTATGTTTTATAAAAAATTATTTAAT                                                                           ]
[+] EMBL BM598965             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTAAATTATTTAGTTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTGGGATGAGCTTTTATATTTTTTATAATA TTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCCATTATTAATACATTTGTTATAATTTATGTTTTATAAAAAATTATTTAATTTAAATTAAATTAT                                                             ]


>consensus_9422#0 CCGACCACACGTTCCGTATTTTTTATAGTTTTAGTAATTTATAATGAAATAATAATTGTA ATTATAGTGTATTAGAATTTGAAAAGAATATTGAAATAATTTGAGAAATTTTTAGTTTTT AAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTAGCACGGTGTATTACATGGTAAATTATTATA ATAATTTTTCTCGAATTTTAACGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTAG TGTAAATATGTAATTAGAAATGAAATGATAATCGATTTGAAATACATCTAGTTTTTTAAC AAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTAAATTTTTTAATTTAATAATTAAA TAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAGGATGAACTTTTATATTTTTTATAATTTTTA AATAAATATAAGCTTAAAAATAGCTATTATTAATACATTTGTTATAATTTATGTTTTATA AAAAATTATTTAATTTAAATTAAATTATTTATTAAAATTTAAATTTTAATAATAAAAATT TAGTAATTATGATAAAATTAGTGTATAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)