Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1058 cluster # 1058       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1058#0 length = 733 sequences # 3  
consensusID : consensus_1058#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 733
fasta sequence 
                              [GTAGTTCATCGTTTGCTTCTAACTTCCTCTTACAAAAATTACATTTCTATTATTTAAAACGTCACAGCACTTTTTTATTTGGTTAATTATTTGATGTATATATAATAGAAGTCGATATGTTGATTAATATGAAACGCATCTAATGTATTTCTTCTCTTTTGATTTTAATTGGAGCATGTACCAGACTTTATGGATTACAGTCATAGCGTTTGTATTTATAAATGCTGAAAAATGCCACCAAAACAAAGAAAAATAGCTATTATGGGTTATAGATCCGTAGGCAAGTCATCACTGAGTATACAATTCGTCGAGGGACAGTTCGTGGATTCATATGATCCTACTATAGAAAATACATTTACAAAAAGTACTCGAGTAAATAGTCAAGATTATGAAGTTAAATTGGTAGACACAGCAGGTCAAGATGAATATAGTATATTTCCAACACAGTATTCTATGGACATTCATGGTTATGTCCTAGTATATAGCATAACCAGTGCTAAGAGTTTTGAAGTTGTACAAATTATTTATGACAAGTTATTGGATATAACAGGAAAAGTCCATGTTCCAATTGTATTAGTAGGAAATAAAACAGATTTATATGTTGACCGAATGATAACAACAGAACAAGGTAAGCGATTGGCAGACTCTTGGCATGCAGCTTTTCTAGAAACAAGTGCAAAACAAAACGAGTCTGTTGCAGATATTTTTCATACACTATTAATTGAAATTGAAA]

[+] EMBL BI514317             [GTAGTTCATCGTTTGCTTCTAACTTCCTCTTACAAAAATTACATTTCTATTATTTAAAACGTCACAGCACTTTTTTATTTGGTTAATTATTTGATGTATATATAATAGAAGTCGATATGTTGATTAATATGAAACGCATCTAATGTATTTCTTCTCTTTTGATTTTAATTGGAGCATGTACCAGACTTTATGGATTACAGTCATAGCGTTTGTATTTATAAATGCTGAAAAATGCCACCAAAACAAAGAAAAATAGCTATTATGGGTTATAGATCCGTAGGCAAGTCATCACTGAGTATACAATTCGTCGAGGGACAGTTCGTGGATTCATATGATCCTACTATAGAAAATACATTTACAAAAAGTACTCGAGTAAATAGTCAAGATTATGAAGTTAAATTGGTAGACACAGCAGGTCAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI512609             [                                                                                                                                                              TTGATTTTAATTGGAGCATGTACCAGACTTTATGGATTACAGTCATAGCGTTTGTATTTATAAATGCTGAAAAATGCCACCAAAACAAAGAAAAATAGCTATTATGGGTTATAGATCCGTAGGCAAGTCATCACTGAGTATACAATTCGTCGAGGGACAGTTCGTGGATTCATATGATCCTACTATAGAAAATACATTTACAAAAAGTACTCGAGTAAATAGTCAAGATTATGAAGTTAAATTGGTAGACACAGCAGGTCAAGATGAATATAGTATATTTCCAACACAGTATTCTATGGATATTCATGGTTATGTCCTAGTATATAGCATAACCAGTGCTAAGAGTTTTGAAGTTGTACAAATTATTTATGACAAGTTATTGGATATAACAGGAAAAGTCCATGTTCCAATTGTATTAGTAGGAAATAAAACAGATTTATATGTTGACCGAATGATAACAACAGAACAAGGTAAGCGATTGGCAGACTCTTGGCATGCAGCTTTTCTAGAAACAAGTGCA                                                       ]
[+] EMBL BI510753             [                                                                                                                                                                                                                                                    AAAGAAAAATAGCTATTATGGGTTATAGATCCGTAGGCAAGTCATCACTGAGTATACAATTCGTCGAGGGACAGTTCGTGGATTCATATGATCCTACTATAGAAAATACATTTACAAAAAGTACTCGAGTAAATAGTCAAGATTATGAAGTTAAATTGGTAGACACAGCAGGTCAAGATGAATATAGTATATTTCCAACACAGTATTCTATGGACATTCATGGTTATGTCCTAGTATATAGCATAACCAGTGCTAAGAGTTTTGAAGTTGTACAAATTATTTATGACAAGTTATTGGATATAACAGGAAAAGTCCATGTTCCAATTGTATTAGTAGGAAATAAAACAGATTTATATGTTGACCGAATGATAACAACAGAACAAGGTAAGCGATTGGCAGACTCTTGGCATGCAGCTTTTCTAGAAACAAGTGCAAAACAAAACGAGTCTGTTGCAGATATTTTTCATACACTATTAATTGAAATTGAAA]




>consensus_1058#0
GTAGTTCATCGTTTGCTTCTAACTTCCTCTTACAAAAATTACATTTCTATTATTTAAAAC
GTCACAGCACTTTTTTATTTGGTTAATTATTTGATGTATATATAATAGAAGTCGATATGT
TGATTAATATGAAACGCATCTAATGTATTTCTTCTCTTTTGATTTTAATTGGAGCATGTA
CCAGACTTTATGGATTACAGTCATAGCGTTTGTATTTATAAATGCTGAAAAATGCCACCA
AAACAAAGAAAAATAGCTATTATGGGTTATAGATCCGTAGGCAAGTCATCACTGAGTATA
CAATTCGTCGAGGGACAGTTCGTGGATTCATATGATCCTACTATAGAAAATACATTTACA
AAAAGTACTCGAGTAAATAGTCAAGATTATGAAGTTAAATTGGTAGACACAGCAGGTCAA
GATGAATATAGTATATTTCCAACACAGTATTCTATGGACATTCATGGTTATGTCCTAGTA
TATAGCATAACCAGTGCTAAGAGTTTTGAAGTTGTACAAATTATTTATGACAAGTTATTG
GATATAACAGGAAAAGTCCATGTTCCAATTGTATTAGTAGGAAATAAAACAGATTTATAT
GTTGACCGAATGATAACAACAGAACAAGGTAAGCGATTGGCAGACTCTTGGCATGCAGCT
TTTCTAGAAACAAGTGCAAAACAAAACGAGTCTGTTGCAGATATTTTTCATACACTATTA
ATTGAAATTGAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)