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Apis mellifera
cluster # 1179 cluster # 1179       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1179#0 length = 469 sequences # 3  
consensusID : consensus_1179#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 469
fasta sequence 
                              [AGATGTTTATGTCGCTTTTTTTAACCCCTATCTGGGTTTTACGTTATTCATTTTCCTCCTTCGTCTTTTAATTTGCTCTCGCAGAGTTGGAACGACCGCGTCATAATCATCGTGTCCTCGAGCTTGC---AAAAAAAAGACGCGCGAGCGCGTGTCCTTTCCTCGTTTGTTACTTTCGACAATAACGCTTGGATATGTATGTGTAACTTTGAAAAATATTAATTAGCGGTTCGAACGGTACCATGACTGGTGTGGTGTGGTGTATAATCGACTGCTATTGTATTACGTCGTACGTTATTACCAAAGAAACAACGCGACATGATTCCTCCCCGCTCTGTGTACGTTTTCAACAAACTCGTACGCAGCAACTCCTTCATGCAACCAGCCTTAAAAGGACGATGGTTTTTGATACGTTTTAGAATTTAGCGTTACCGTTTTTCTACAACGTAAAAAAACCTCCAATGCCACACAA]

[+] EMBL BI504504             [AGATGTTTATGTCGCTTTTTTTAACCCCTATCTGGGTTTTACGTTATTCATTTTCCTCCTTCGTCTTTTAATTTGCTCTCGCAGAGTTGGAACGACCGCGTCATAATCATCGTGTCCTCGAGCTTGCAAAAAAAAAAAGACGCGCGAGCGCGTGTCCTTTCCTCGTTTCTTACTTTCGACAATAACGCTTGGATATGTATGTGTAACTTTGAAAAATATTAATTAGCGGTTCGAACGGTACCATGACTGGTGTGGCGTGGTGTATAATCGACTGCTATTGTATTACGTCGTACGTTATTACCAAAGAAACAACGCGACATGNNTCCTCCCCGCTCTGTGTACGTTTTCAACAAACTCGTACGCAGCAACTCCTTCATGCAACCAGCCTTAAAAGGACGATGGTTTTTGATACGTTTTAGAATTTAGCGTTACCGTTTTTCTACCAAGTTCGCGCGCCTCCAATGCCACACAA]
[+] EMBL BI508218             [                                                CATTTTCCTCCTTCGTCTTTTAATTTGCTCTCGCAGAGTTGGAACGACCGCGTCATAATCATCGTGTCCTCGAGCTTGC   AAAAAAAAGACGCGCGAGCGCGTGTCCTTTCCTCGTTTGTTACTTTCGACAATAACGCTTGGATATGTATGTGTAACTTTGAAAAATATTAATTAGCGGTTCGAACGGTACCATGACTGGTGTGGTGTGGTGTATAATCGACTGCTATTGTATTACGTCGTACGTTATTACCAAAGAAACAACGCGACATGATTCCTCCCCGCTCTGTGTACGTTTTCAACAAACTCGTACGCAGCAACTCCTTCATGCAACCAGCCTTAAAAGGACGATGGTTTTTGATACGTTTTAGAATTTAGCGTTACCGTTTTTCTACAACGTAAAAAAA                 ]
[+] EMBL BI508812             [                                                CATTTTCCTCCTTCGTCTTTTAATTTGCTCTCGCAGAGTTGGAACGACCGCGTCATAATCATCGTGTCCTCGAGCTTGC   AAAAAAAAGACGCGCGAGCGCGTGTCCTTTCCTCGTTTGTTACTTTCGACAATAACGCTTGGATATGTATGTGTAACTTTGAAAAATATTAATTAGCGGTTCGAACGGTACCATGACTGGTGTGGTGTGGTGTATAATCGACTGCTATTGTATTACGTCGTACGTTATTACCAAAGAAACAACGCGACATGATTCCTCCCCGCTCTGTGTACGTTTTCAACAAACTCGTACGCAGCAACTCCTTCATGCAACCAGCCTTAAAAGGACGATGGTTTTTGATACGTTTTAGAATTTAGCGTTACCGTTTTTCTACAACGTAAAAAAA                 ]




>consensus_1179#0
AGATGTTTATGTCGCTTTTTTTAACCCCTATCTGGGTTTTACGTTATTCATTTTCCTCCT
TCGTCTTTTAATTTGCTCTCGCAGAGTTGGAACGACCGCGTCATAATCATCGTGTCCTCG
AGCTTGCAAAAAAAAGACGCGCGAGCGCGTGTCCTTTCCTCGTTTGTTACTTTCGACAAT
AACGCTTGGATATGTATGTGTAACTTTGAAAAATATTAATTAGCGGTTCGAACGGTACCA
TGACTGGTGTGGTGTGGTGTATAATCGACTGCTATTGTATTACGTCGTACGTTATTACCA
AAGAAACAACGCGACATGATTCCTCCCCGCTCTGTGTACGTTTTCAACAAACTCGTACGC
AGCAACTCCTTCATGCAACCAGCCTTAAAAGGACGATGGTTTTTGATACGTTTTAGAATT
TAGCGTTACCGTTTTTCTACAACGTAAAAAAACCTCCAATGCCACACAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)