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Apis mellifera
cluster # 1186 cluster # 1186       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1186#0 length = 959 sequences # 3  
consensusID : consensus_1186#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 959
fasta sequence 
                              [GTATTCTGTATCTCGTATGTGTAGAAATTATATTTGTTACCTTTGGATAATTATTAAATATATTCTAATTATTATTTATATTATAATACTATTACCTTTGGATAATCATTAAATTATTCTTTATTATATATAAAAAAAATTAATTCATTTGCAAAATAATTCTTCTGTAGAAAAATACGAAAATTTCTAGTAATTATATACAAAATTATTCATTACACATTTCCATTAAACAAAACAATACAACGTTTTTATTATTTAATCAATTGTGTCACCTGAACATACGAATCAGTTAAAACGTAGTTTTTTGTCAAAATACAGGAAATATGTTTATTGATTTCGTAATTTCATACTTAATTTGAACGTAGAGATATAAATATTTAGAGTAAACAAATTATTATGATCAGAAAAAATATAATTTATGCGAAAATTCGTGATTTTTTAAATTAATGTACATATTACTTACTATTTGTTAACTGTTTTTGTTCGGATATATTTATTTAATTTAAATCAAATTTGCTATGTGCTAACGCTTTCTTTCTTAAATAGTCTTTTTAATCAATTGATAACAAAAAATATATGTAGCAATCCTTGTCGCAGTTCAA-CAACAGATTAAAATGCCAACGCTCGGAAGATTGCAACATTAGCATGCCTTTACAAGTAGAAGTTCCGAAGTGTTACTTTCATTTTTTATGAGCCATTGCACAGAGGTAGAACTTAAAAACTAAAACTAATGATAACTAATTTTATGGAAATTAATGTGTTTAATAGTTTATGAAATATTTAATATTAAAGAGAAGAAAAAAGAGAGAAAAAGGCAGAGAGAATATTCCTGATATATAAAGCAAGACTTCATTTATAAAAAGATATTCACTTATACATAAGCAAGCACTTAACGACTGTTGCTACACTATGCAGTACCATTACTAAAATCTAAAAAATTATTTCCTTTCAAAAAAAAA]

[+] EMBL BE844432             [GTATTCTGTATCTCGTATGTGTAGAAATTATATTTGTTACCTTTGGATAATTATTAAATATATTCTAATTATTATTTATATTATAATACTATTACCTTTGGATAATCATTAAATTATTCTTTATTATATATAAAAAAAATTAATTCATTTGCAAAATAATTCTTCTGTAGAAAAATACGAAAATTTCTAGTAATTATATACAAAATTATTCATTACACATTTCCATTAAACAAAACAATACAACGTTTTTATTATTTAATCAATTGTGTCACCTGAACATACGAATCAGTTAAAACGTAGTTTTTTGTCAAAATACAGGAAATATGTTTATTGATTTCGTAATTTCATACTTAATTTGAACGTAGAGATATAAATATTTAGAGTAAACAAATTATTATGATCAGAAAAAATATAATTTATGCGAAAATTCGTGATTTTTTAAATTAATGTACATATTACTTACTATTTGTTAACTGTTTTTGTTCGGATATATTTATTTAATTTAAATCAAATTTGCTATGTGCTAACGCTTTCTTTCTTAAATAGTCTTTTTAATCAATTGATAACAAAAAATATATGTAGCAATCCTTGTCGCAGTTCAACCAACAGATTAAAATGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI503565             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGTTAAAACGTAGTTTTTTGTCAAAATACAGGAAATATGTTTATTGATTTCGTAATTTCATACTTAATTTGAACGTAGAGATATAAATATTTAGAGTAAACAAATTATTATGATCAGAAAAAATATAATTTATGCGAAAATTCGTGATTTTTTAAATTAATGTACATATTACTTACTATTTGTTAACTGTTTTTGTTCGGATATATTTATTTAATTTAAATCAAATTTGCTATGTGCTAACGCTTTCTTTCTTAAATAGTCTTTTTAATCAATTGATAACAAAAAATATATGTAGCAATCCTTGTCGCAGTTCAA CAACAGATTAAAATGCCAACGCTCGGAAGATTGCAACATTAGCATGCCTTTACAAGTAGAAGTTCCGAAGTGTTACTTTCATTTTTTATGAGCCATTGCACAGAGGTAGAACTTAAAAACTAAAACTAATGATAACTAATTTTATGGAAATTAATGTGTTTAATA                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL BI513527             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGAACGTAGAGATATAAATATTTAGAGTAAACAAATTATTATGATCAGAAAAAATATAATTTATGCGAAAATTCGTGATTTTTTAAATTAATGTACATATTACTTACTATTTGTTAACTGTTTTTGTTCGGATATATTTATTTAATTTAAATCAAATTTGCTATGTGCTAACGCTTTCTTTCTTAAATAGTCTTTTTAATCAATTGATAACAAAAAATATATGTAGCAATCCTTGTCGCAGTTCAA CAACAGATTAAAATGCCAACGCTCGGAAGATTGCAACATTAGCATGCCTTTACAAGTAGAAGTTCCGAAGTGTTACTTTCATTTTTTATGAGCCATTGCACAGAGGTAGAACTTAAAAACTAAAACTAATGATAACTAATTTTATGGAAATTAATGTGTTTAATAGTTTATGAAATATTTAATATTAAAGAGAAGAAAAAAGAGAGAAAAAGGCAGAGAGAATATTCCTGATATATAAAGCAAGACTTCATTTATAAAAAGATATTCACTTATACATAAGCAAGCACTTAACGACTGTTGCTACACTATGCAGTACCATTACTAAAATCTAAAAAATTATTTCCTTTCAAAAAAAAA]




>consensus_1186#0
GTATTCTGTATCTCGTATGTGTAGAAATTATATTTGTTACCTTTGGATAATTATTAAATA
TATTCTAATTATTATTTATATTATAATACTATTACCTTTGGATAATCATTAAATTATTCT
TTATTATATATAAAAAAAATTAATTCATTTGCAAAATAATTCTTCTGTAGAAAAATACGA
AAATTTCTAGTAATTATATACAAAATTATTCATTACACATTTCCATTAAACAAAACAATA
CAACGTTTTTATTATTTAATCAATTGTGTCACCTGAACATACGAATCAGTTAAAACGTAG
TTTTTTGTCAAAATACAGGAAATATGTTTATTGATTTCGTAATTTCATACTTAATTTGAA
CGTAGAGATATAAATATTTAGAGTAAACAAATTATTATGATCAGAAAAAATATAATTTAT
GCGAAAATTCGTGATTTTTTAAATTAATGTACATATTACTTACTATTTGTTAACTGTTTT
TGTTCGGATATATTTATTTAATTTAAATCAAATTTGCTATGTGCTAACGCTTTCTTTCTT
AAATAGTCTTTTTAATCAATTGATAACAAAAAATATATGTAGCAATCCTTGTCGCAGTTC
AACAACAGATTAAAATGCCAACGCTCGGAAGATTGCAACATTAGCATGCCTTTACAAGTA
GAAGTTCCGAAGTGTTACTTTCATTTTTTATGAGCCATTGCACAGAGGTAGAACTTAAAA
ACTAAAACTAATGATAACTAATTTTATGGAAATTAATGTGTTTAATAGTTTATGAAATAT
TTAATATTAAAGAGAAGAAAAAAGAGAGAAAAAGGCAGAGAGAATATTCCTGATATATAA
AGCAAGACTTCATTTATAAAAAGATATTCACTTATACATAAGCAAGCACTTAACGACTGT
TGCTACACTATGCAGTACCATTACTAAAATCTAAAAAATTATTTCCTTTCAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)