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Apis mellifera
cluster # 1198 cluster # 1198       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1198#0 length = 865 sequences # 3  

consensusID : consensus_1198#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 865
fasta sequence
                              [ACTTTAGAAGCTGATCTTGTAGTAATAGGTGGTGGGCCTGGTGGATATGTTGCATCAATTAAAGCAGCACAATTGGGAATGAAAACAGTTTGTATAGAAAAAGATGAAACTTTAGGTGGAACTTGTCTTAATGTTGGATGCATTCCATCAAAATCTTTATTAAATAATTCACATTATTATCATATGACACATGGAGATTTACAAAATCGTGGCATTATAGTTGAAAATGTTAAACTTAATCTTGATAAAGTGATGGAACAAAAACGGAATGTAATAAAAGCTTTAACAGGTGGTATTGCTGGATTATTTAAAAAGAATAAAATAGAGTGGGTAAAAGGTCATGGAAAAATTACTGGTCCAAATCAAGTGGTTGCACTTAGTCCAGATGGTTCAGTAGTAAGCACAATTAATACTAAAAATATTATAATTGCCACTGGCAGTGAAGTTACACCATTTCCGGGTATAGAATTCGATGAAAAACAAATTCTTTCATCTACCGGAGCTTTATCATTAGATACAATACCTAAAAAATTTATAGTAATTGGTGCTGGTGTCATTGGATTGGAATTAGGCTCAGTTTGGCAGNNNTTTGGTTCACAAGTAACAGCAATTGAATATTCACCATTTATTGGTGGGGTAGCTATCGATAGTGAAGTTAGTCAAACATTACAAAAAATTTTAAGTAAACAAGGCTTAAACTTTAAATTGGGAACAAAAGTCACTGGTGCAAAAAAAACAGGCAATGAAATTATTGTTTCTGTTGAAGATGCAAAAGATCCTAGCAAGAAAGAGGATATTTCTTGCAATGTACTTTTAATTTGTATTGGCAGAAGGCCATATACATGGAATTTAGGATTAGAAGATA]

[+] EMBL BI510137             [ACTTTAGAAGCTGATCTTGTAGTAATAGGTGGTGGGCCTGGTGGATATGTTGCATCAATTAAAGCAGCACAATTGGGAATGAAAACAGTTTGTATAGAAAAAGATGAAACTTTAGGTGGAACTTGTCTTAATGTTGGATGCATTCCATCAAAATCTTTATTAAATAATTCACATTATTATCATATGACACATGGAGATTTACAAAATCGTGGCATTATAGTTGAAAATGTTAAACTTAATCTTGATAAAGTGATGGAACAAAAACGGAATGTAATAAAAGCTTTAACAGGTGGTATTGCTGGATTATTTAAAAAGAATAAAATAGAGTGGGTAAAAGGTCATGGAAAAATTACTGGTCCAAATCAAGTGGTTGCACTTAGTCCAGATGGTTCAGTAGTAAGCACAATTAATACTAAAAATATTATAATTGCCACTGGCAGTGAAGTTACACCATTTCCGGGTATAGAATTCGATGAAAAACAAATTCTTTCATCTACCGGAGCTTTATCATTAGATACAATACCTAAAAAATTTATAGTAATTGGTGCTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI515642             [                                                                                                                                                                                                                GTGGCATTATAGTTGAAAATGTTAAACTTAATCTTGATAAAGTGATGGAACAAAAACGGAATGTAATAAAAGCTTTAACAGGTGGTATTGCTGGATTATTTAAAAAGAATAAAATAGAGTGGGTAAAAGGTCATGGAAAAATTACTGGTCCAAATCAAGTGGTTGCACTTAGTCCAGATGGTTCAGTAGTAAGCACAATTAATACTAAAAATATTATAATTGCCACTGGCAGTGAAGTTACACCATTTCCGGGTATAGAATTCGATGAAAAACAAATTCTTTCATCTACCGGAGCTTTATCATTAGATACAATACCTAAAAAATTTATAGTAATTGGTGCTGGTGTCATTGGATTGGAATTAGGCTCAGTTTGGCAGNNNTTTGGTTCACAAGTAACAGCAATTGAATATTCACCATTTATTGGTGGGGTAGCTATCGATAGTGAAGTTAGTCAAACATTACAA                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI506548             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGAAAAATTACTGGTCCAAATCAAGTGGTTGCACTTAGTCCAGATGGTTCAGTAGTAAGCACAATTAATACTAAAAATATTATAATTGCCACTGGCAGTGAAGTTACACCATTTCCGGGTATAGAATTCGATGAAAAACAAATTCTTTCATCTACCGGAGCTTTATCATTAGATACAATACCTAAAAAATTTATAGTAATTGGTGCTGGTGTCATTGGATTGGAATTAGGCTCAGTTTGGCAGAGGTTTGGTTCACAAGTAACAGCAATTGAATATTCACCATTTATTGGTGGGGTAGCTATCGATAGTGAAGTTAGTCAAACATTACAAAAAATTTTAAGTAAACAAGGCTTAAACTTTAAATTGGGAACAAAAGTCACTGGTGCAAAAAAAACAGGCAATGAAATTATTGTTTCTGTTGAAGATGCAAAAGATCCTAGCAAGAAAGAGGATATTTCTTGCAATGTACTTTTAATTTGTATTGGCAGAAGGCCATATACATGGAATTTAGGATTAGAAGATA]


>consensus_1198#0 ACTTTAGAAGCTGATCTTGTAGTAATAGGTGGTGGGCCTGGTGGATATGTTGCATCAATT AAAGCAGCACAATTGGGAATGAAAACAGTTTGTATAGAAAAAGATGAAACTTTAGGTGGA ACTTGTCTTAATGTTGGATGCATTCCATCAAAATCTTTATTAAATAATTCACATTATTAT CATATGACACATGGAGATTTACAAAATCGTGGCATTATAGTTGAAAATGTTAAACTTAAT CTTGATAAAGTGATGGAACAAAAACGGAATGTAATAAAAGCTTTAACAGGTGGTATTGCT GGATTATTTAAAAAGAATAAAATAGAGTGGGTAAAAGGTCATGGAAAAATTACTGGTCCA AATCAAGTGGTTGCACTTAGTCCAGATGGTTCAGTAGTAAGCACAATTAATACTAAAAAT ATTATAATTGCCACTGGCAGTGAAGTTACACCATTTCCGGGTATAGAATTCGATGAAAAA CAAATTCTTTCATCTACCGGAGCTTTATCATTAGATACAATACCTAAAAAATTTATAGTA ATTGGTGCTGGTGTCATTGGATTGGAATTAGGCTCAGTTTGGCAGNNNTTTGGTTCACAA GTAACAGCAATTGAATATTCACCATTTATTGGTGGGGTAGCTATCGATAGTGAAGTTAGT CAAACATTACAAAAAATTTTAAGTAAACAAGGCTTAAACTTTAAATTGGGAACAAAAGTC ACTGGTGCAAAAAAAACAGGCAATGAAATTATTGTTTCTGTTGAAGATGCAAAAGATCCT AGCAAGAAAGAGGATATTTCTTGCAATGTACTTTTAATTTGTATTGGCAGAAGGCCATAT ACATGGAATTTAGGATTAGAAGATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)