Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 122 cluster # 122       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_122#0 length = 656 sequences # 7  

consensusID : consensus_122#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 656
fasta sequence
                              [GGGGGTGTCTGGGCTCCAGGGACAGGGACCAACTATAG-CCCGCATTTGCAACTCTTACTAATTAACTAACAGGCTAACAATAACAACGAGTCAACACTCAAAATGTGTGCTGTATGTGTTCATGCATTTGTAAACGCTGCGTACACTTTACACATCCTAAATCAATCCGTGACTATCATTATCAAATTCTGTAGTCAGTCGTTCTAGAAACAAACTTCTCTGCGATGTGGTAAGAACCACGCGATATATAAACGCAACATAAAAATTTTGAAAGTAAAATTTAAGATAAAAATACAAACGAAACATATAAGATATATCTTTCTTCCTAAACGTTTTTTGCTCGCCCGTACATATCCAACGGTCCTTTGTTCGATTTTTTTTTAATAATATTTAATAATTAATAATAATAAT-ATAATAA-TAATAATAATAATAATATTAATAATAATATTAATAATAATAATAATAATAATATTAATAATAATATAATAA-TAATAATAATAAT--TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGATACCACTGTGAGTGTAATTATAATTGATCAATAGTAATAACGAATACCGGATGCATATTTGATATTTGTGTGCCTGTATCCTTTTGTATGCTAACGAGATAGAACGAAAAATAAAACTA]

[+] EMBL BI505878             [GGGGGTGTCTGGGCTCCAGGGACAGGGACCAACTATAG CCCGCATTTGCAACTCTTACTAATTAACTAACAGGCTAACAATAACAACGAGTCAACACTCAAAATGTGTGCTGTATGTGTTCATGCATTTGTAAACGCTGCGTACACTTTACACATCCTAAATCAATCCGTGACTATCATTATCAAATTCTGTAGTCAGTCGTTCTAGAAACAAACTTCTCTGCGATGTGGTAAGAACCACGCGATATATAAACGCAACATAAAAATTTTGAAAGTAAAATTTAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI506968             [                   GGACAGGGACCAACTATAG CCCGCATTTGCAACTCTTACTAATTAACTAACAGGCTAACAATAACAACGAGTCAACACTCAAAATGTGTGCTGTATGTGTTCATGCATTTGTAAACGCTGCGTACACTTTACACATCCTAAATCAATCCGTGACTATCATTATCAAATTCTGTAGTCAGTCGTTCTAGAAACAAACTTCTCTGCGATGTGGTAAGAACCACGCGATATATAAACGCNNNATAAAAAAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI510445             [                               ACTATAGNNNCGCATTTGCAACTCTTACTAATTAACTAACAGGCTAACAATAACAACGAGTCAACACTCAAAATGTGTGCTGTATGTGTTCATGCATTTGTAAACGCTGCNNACACTTTACACATCCTAAATCAATCCGTGACTATCATTATCAAATTCTGTAGTCAGTCGTTCTAGAAACAAACTTCTCTGCGATGTGGTAAGAACCACGCGATATATAAACGCAACATAAAAATTTTGAAAGTAAAATTTAAGATAAAAATACAAACGAAACATATAAGATATATCTTTCTTCCTAAACGTTTTTTGCTCGCCCGTACATATCCAACGGTCCTTTGTTCGATTTTTTTTTAATAATATTTAATAATTAATAATAATAATAATAATAATTAATAATAATAATAATATTAATAATAATATTAATAATAATAATAATAATAATATTAATAATAATATAATAA TAATAATAATAAT  TAATAATAATAATAATAATAAT                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI504900             [                                       CCCGCATTTGCAACTCTTACTAATTAACTAACAGGCTAACAATAACAACGAGTCAACACTCAAAATGTGTGCTGTATGTGTTCATGCATTTGTAAACGCTGCGTACACTTTACACATCCTAAATCAATCCGTGACTATCATTATCAAATTCTGTAGTCAGTCGTTCTAGAAACAAACTTCTCTGCGATGTGGTAAGAACCACGCGATATATAAACGCAACATAAAAATTTTGAAAGTAAAATTTAAGATAAAAATACAAACGAAACATATAAGATATATCTTTCTTCCTAAACGTTTTTTGCTCGCCCGTACATATCCAACGGTCCTTTGTTCGA TTTTTTTTAATAATATTTAATAATTAATAATAATAAT  TAATAA TAATAATAATAATAATATTAATAATAATAATAATAATAATATTAATAATAATATTAATAATAATATAATAATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATTATAATAATAATAATAAAAAGATACCACTGTGAGTGTAATTATAATTGATCAATAGTAATAACGAATACCGGATGCATATTTGATATTTGTGTGCCTGTATCCTTTTGTATGCTAACGAGATAGAACGAAAAATAAAACTA]
[+] EMBL BI510211             [                                       CCCGCATTTGCAACTCTTACTAATTAACTAACAGGCTAACAATAACAACGAGTCAACACTCAAAATGTGTGCTGTATGTGTTCATGCATTTGTAAACGCTGCGTACACTTTACACATCCTAAATCAATCCGTGACTATCATTATCAAATTCTGTAGTCAGTCGTTCTAGAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI504261             [                                                  AACTCTTACTAATTAACTAACAGGCTAACAATAACAACGAGTCAACACTCAAAATGTGTGCTGTATGTGTTCATGCATTTGTAAACGCTGCGTACACTTTACACATCCTAAATCAATCCGTGACTATCATTATCAAATTCTGTAGTCAGTCGTTCTAGAAACAAACTTCTCTGCGATGTGGTAAGAACCACGCGATATATAAACGCAACATAAAAATTTTGAAAGTAAAATTTAAGATAAAAATACAAACGAAACATATAAGATATATCTTTCTTCCTAAACGTTTTTTGCTCGCCCGTACATATCCAACGGTCCTTTGTTCGATTTTTTTTTAATAATATTTAATAATTAATAATAAAAAA A                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI504454             [                                                                                           TCAACACTCAAAATGTGTGCTGTATGTGTTCATGCATTTGTAAACGCTGCGTACACTTTACACATCCTAAATCAATCCGTGACTATCATTATCAAATTCTGTAGTCAGTCGTTCTAGAAACAAACTTCTCTGCGATGTGGTAAGAACCACGCGATATATAAACGCAACATAAAAATTTTGAAAGTAAAATTTAAGATAAAAATACAAACGAAACATATAAGATATATCTTTCTTCCTAAACGTTTTTTGCTCGCCCGTACATATCCAACGGTCCTTTGTTCGATTTTTTTTTAATAATATTTAATAATTAATAATAATA   ATAATAA TAAT  TAATAATAATATTAATAATAATATTAATAATAATAATAATAATAATATTAATAATAATATAATAA TAATAATAATAAT  TAATAATAATAAAAAAAAa                                                                                                                                       ]


>consensus_122#0 GGGGGTGTCTGGGCTCCAGGGACAGGGACCAACTATAGCCCGCATTTGCAACTCTTACTA ATTAACTAACAGGCTAACAATAACAACGAGTCAACACTCAAAATGTGTGCTGTATGTGTT CATGCATTTGTAAACGCTGCGTACACTTTACACATCCTAAATCAATCCGTGACTATCATT ATCAAATTCTGTAGTCAGTCGTTCTAGAAACAAACTTCTCTGCGATGTGGTAAGAACCAC GCGATATATAAACGCAACATAAAAATTTTGAAAGTAAAATTTAAGATAAAAATACAAACG AAACATATAAGATATATCTTTCTTCCTAAACGTTTTTTGCTCGCCCGTACATATCCAACG GTCCTTTGTTCGATTTTTTTTTAATAATATTTAATAATTAATAATAATAATATAATAATA ATAATAATAATAATATTAATAATAATATTAATAATAATAATAATAATAATATTAATAATA ATATAATAATAATAATAATAATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGATAC CACTGTGAGTGTAATTATAATTGATCAATAGTAATAACGAATACCGGATGCATATTTGAT ATTTGTGTGCCTGTATCCTTTTGTATGCTAACGAGATAGAACGAAAAATAAAACTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)