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Apis mellifera
cluster # 128 cluster # 128       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_128#0 length = 1283 sequences # 7  

consensusID : consensus_128#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1283
fasta sequence
                              [TTGATTGGGCTCTTGGAGAAGCTATGGCTTTTGGTTCCTTACTTAAAGAGGGCATTCATGTTAGATTGTCAGGTCAAGATGTAGAAAGAGGAACTTTTTCACATAGACATCATGTTCTTCATCATCAAACTGTAGATAAAGCTACTTATAGACCGTTATGTTATCTTTATCCAGATCAAGCTCCATACACTGTGTGCAATAGTTCTTTATCAGAGTTTGGTGTTCTTGGATTTGAATTAGGTTATTCTATGACAAATCCTAATGCATTAGTATGCTGGGAAGCGCAATTTGGTGATTTCAATAATACAGCACAATGCATTATCGATCAATTTATTAGCAGTGGTCAAGCTAAATGGGTACGTCAATCTGGTCTTGTTATGCTGCAACCTCATGGTCTCGAAGGAATGGGACCTGAGCATTCCAGTGCTCGTTTGGAACGTTTTTTACAAATGTCGGCTGATGATCCAGATTATTTTCCTCCTGAAAATGAAGAATTTGCTGTACGCCAATTGCATGATATCAACTGGATTGTAGCTAATTGCAGTACACCAGCAAATTATTTTCATATTTTAAGAAGACAAATTGCATTGCCATTTAGAAAACCTTTGATTTTAATGACACCAAAATCATTACTTCGTCATCCAGAAGCGAAATCTAATTTCGATTTAATGCTAGAAAATATAGAGTTTCTTAGAGTAATACCAGAAGAAGGTGTAGCTTCTCAGAATCCTAATAATGTTAAAAGAGTGCTTTTTTGTTCTGGTAAGATTTACTATGATCTAAAAAAAGCACGCGCAGAGAAAAATTTGGATGATAAAGTTGCTATTATAAGAATTGAACAGATTTCACCTTTCCCATATGATTTAGTTAAAAAAGAAGCTGTTAAATATTCCAATGCAGATTTAGTATGGGCTCAAGAAGAACATAAAAATCAAGGTGCATGGACATATATTCAGCCTAGATTCCATACAGCTCTTAATGGAACTCGTTCTGTATCCAGCGGAAATACATCATACGACAGTAAGGATAGCAGAGGGTGGTNNNAGTGGTTGGTTTTCAACTAAACCAACAATTGTGTCCGAGCCACTGTCAAAAGAATCTAATAAATCCAAACAGAGAACATTAAGATATGTTGGTCGACCAACGGGAGCTTCACCCGCAACAGGAAGTAAAATGCAGCATCTCAAAGAATTGAAACAATTACTTGATGACTCCTTCAATCTTTAATTATTCTTCGTAGCACTATGTATAACACATTTTATTTATTTTCTTCATTATACTTG]

[+] EMBL BI514315             [TTGATTGGGCTCTTGGAGAAGCTATGGCTTTTGGTTCCTTACTTAAAGAGGGCATTCATGTTAGATTGTCAGGTCAAGATGTAGAAAGAGGAACTTTTTCACATAGACATCATGTTCTTCATCATCAAACTGTAGATAAAGCTACTTATAGACCGTTATGTTATCTTTATCCAGATCAAGCTCCATACACTGTGTGCAATAGTTCTTTATCAGAGTTTGGTGTTCTTGGATTTGAATTAGGTTATTCTATGACAAATCCTAATGCATTAGTATGCTGGGAAGCGCAATTTGGTGATTTCAATAATACAGCACAATGCATTATCGATCAATTTATTAGCAGTGGTCAAGCTAAATGGGTACGTCAATCTGGTCTTGTTATGCTGCAACCTCATGGTCTCGAAGGAATGGGACCTGAGCATTCCAGTGCTCGTTTGGAACGTTTTTTACAAATGTCGGCTGATGATCCNNNTTATTTTCCTCCTGAAAATGAAGAATTTGCTGTACGCCAATTGCATGATATCAACTGGATTGTAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI512600             [                                                                                                                                                                                       CATACACTGTGTGCAATAGTTCTTTATCAGAGTTTGGTGTTCTTGGATTTGAATTAGGTTATTCTATGACAAATCCTAATGCATTAGTATGCTGGGAAGCGCAATTTGGTGATTTCAATAATACAGCACAATGCATTATCGATCAATTTATTAGCAGTGGTCAAGCTAAATGGGTACGTCAATCTGGTCTTGTTATGCTGCAACCTCATGGTCTCGAAGGAATGGGACCTGAGCATTCCAGTGCTCGTTTGGAACGTTTTTTACAAATGTCGGCTGATGATCCAGATTATTTTCCTCCTGAAAATGAAGAATTTGCTGTACGCCAATTGCATGATATCAACTGGATTGTAGCTAATTGCAGTACACCAGCAAATTATTTTCATATTTTAAGAAGACAAATTGCATTGCCATTTAGAAAACCTTTGATTTTAATGACACCAAAATCATTACTTCGTCATCCAGAAGCGAAATCTAATTTCGATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI509257             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTCTTGTTATGCTGCAACCTCATGGTCTCGAAGGAATGGGACCTGAGCATTCCAGTGCTCGTTTGGAACGTTTTTTACAAATGTCGGCTGATGATCCAGATTATTTTCCTCCTGAAAATGAAGAATTTGCTGTACGCCAATTGCATGATATCAACTGGATTGTAGCTAATTGCAGTACACCAGCAAATTATTTTCATATTTTAAGAAGACAAATTGCATTGCCATTTAGAAAACCTTTGATTTTAATGACACCAAAATCATTACTTCGTCATCCAGAAGCGAAATCTAATTTCGATTTAATGCTAGAAAATATAGAGTTTCTTAGAGTAATACCAGAAGAAGGTGTAGCTTCTCAGAATCCTAATAATGTTAAAAGAGTGCTTTTTTGTTCTGGTAAGATTTACTATGATCTAAAAAAAGCACGCGCAGAGAAAAATTTGGATGATAAAGTTGCTATTATAAGAATTGAACAGATTTCACCTTTCCCATATGATTTAGTTAAAAAAGAAGCTGTTAAATATTCCAATGCAGATTTAGTATGGGCTCAAGAAGAACATAAAAATCAAGGTGCATGGACATATATTCAGCCTAGATTCCATACAGCTCTTAATGGAACTCGTTCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI504784             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTCTTGTTATGCTGCAACCTCATGGTCTCGAAGGAATGGGACCTGAGCATTCCAGTGCTCGTTTGGAACGTTTTTTACAAATGTCGGCTGATGATCCAGATTATTTTCCTCCTGAAAATGAAGAATTTGCTGTACGCCAATTGCATGATATCAACTGGATTGTAGCTAATTGCAGTACACCAGCAAATTATTTTCATATTTTAAGAAGACAAATTGCATTGCCATTTAGAAAACCTTTGATTTTAATGACACCAAAATCATTACTTCGTCATCCAGAAGCGAAATCTAATTTCGATTTAATGCTAGAAAATATAGAGTTTCTTAGAGTAATACCAGAAGAAGGTGTAGCTTCTCAGAATCCTAATAATGTTAAAAGAGTGCTTTTTTGTTCTGGTAAGATTTACTATGATCTAAAAAAAGCACGCGCAGAGAAAAATTTGGATGATAAAGTTGCTATTATAAGAATTGAACAGATTTCACCTTTCCCATATGATTTAGTTAAAAAAGAAGCTGTTAAATATTCCAATGCAGATTTAGTATGGGCTCAAGAAGAACATAAAAATCAAGNNGCATGGACATATATTCAGCCTAGATTCCATACAGCTCTTAATGGAACTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI505870             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CCAGTGCTCGTTTGGAACGTTTTTTACAAATGTCGGCTGATGATCCAGATTATTTTCCTCCTGAAAATGAAGAATTTGCTGTACGCCAATTGCATGATATCAACTGGATTGTAGCTAATTGCAGTACACCAGCAAATTATTTTCATATTTTAAGAAGACAAATTGCATTGCCATTTAGAAAAaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI505597             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttttttTTTTTTTTATATTTTAAGAAGACAAATTGCATTGCCATTTAGAAAACCTTTGATTTTAATGACACCAAAATCATTACTTCGTCATCCAGAAGCGAAATCTAATTTCGATTTAATGCTAGAAAATACAGAGTTTCTTAGAGTAATACCAGAAGAAGGTGTAGCTTCTCAGAATCCTAATAATGTTAAAAGAGTGCTTTTTTGTTCTGGTAAGATTTACTATGATCTAAAAAAAGCACGCGCAGAGAAAAATTTGGATGATAAAGTTGCTATTATAAGAATTGAACAGATTTCACCTTTCCCATATGATTTAGTTAAAAAAGAAGCTGTTAAATATTCCAATGCAGATTTAGTATGGGCTCAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI504393             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTTTTTTCTGGTAAGATTTACTATGATCTAAAAAAAGCACGCGCAGAGAAAAATTTGGATGATAAAGTTGCTATTATAAGAATTGAACAGATTTCACCTTTCCCATATGATTTAGTTAAAAAAGAAGCTGTTAAATATTCCAATGCAGATTTAGTATGGGCTCAAGAAGAACATAAAAATCAAGGTGCATGGACATATATTCAGCCTAGATTCCATACAGCTCTTAATGGAACTCGTTCTGTATCCAGCGGAAATACATCATACGACAGTAAGGATAGCAGAGGGTGGTNNNAGTGGTTGGTTTTCAACTAAACCAACAATTGTGTCCGAGCCACTGTCAAAAGAATCTAATAAATCCAAACAGAGAACATTAAGATATGTTGGTCGACCAACGGGAGCTTCACCCGCAACAGGAAGTAAAATGCAGCATCTCAAAGAATTGAAACAATTACTTGATGACTCCTTCAATCTTTAATTATTCTTCGTAGCACTATGTATAACACATTTTATTTATTTTCTTCATTATACTTG]


>consensus_128#0 TTGATTGGGCTCTTGGAGAAGCTATGGCTTTTGGTTCCTTACTTAAAGAGGGCATTCATG TTAGATTGTCAGGTCAAGATGTAGAAAGAGGAACTTTTTCACATAGACATCATGTTCTTC ATCATCAAACTGTAGATAAAGCTACTTATAGACCGTTATGTTATCTTTATCCAGATCAAG CTCCATACACTGTGTGCAATAGTTCTTTATCAGAGTTTGGTGTTCTTGGATTTGAATTAG GTTATTCTATGACAAATCCTAATGCATTAGTATGCTGGGAAGCGCAATTTGGTGATTTCA ATAATACAGCACAATGCATTATCGATCAATTTATTAGCAGTGGTCAAGCTAAATGGGTAC GTCAATCTGGTCTTGTTATGCTGCAACCTCATGGTCTCGAAGGAATGGGACCTGAGCATT CCAGTGCTCGTTTGGAACGTTTTTTACAAATGTCGGCTGATGATCCAGATTATTTTCCTC CTGAAAATGAAGAATTTGCTGTACGCCAATTGCATGATATCAACTGGATTGTAGCTAATT GCAGTACACCAGCAAATTATTTTCATATTTTAAGAAGACAAATTGCATTGCCATTTAGAA AACCTTTGATTTTAATGACACCAAAATCATTACTTCGTCATCCAGAAGCGAAATCTAATT TCGATTTAATGCTAGAAAATATAGAGTTTCTTAGAGTAATACCAGAAGAAGGTGTAGCTT CTCAGAATCCTAATAATGTTAAAAGAGTGCTTTTTTGTTCTGGTAAGATTTACTATGATC TAAAAAAAGCACGCGCAGAGAAAAATTTGGATGATAAAGTTGCTATTATAAGAATTGAAC AGATTTCACCTTTCCCATATGATTTAGTTAAAAAAGAAGCTGTTAAATATTCCAATGCAG ATTTAGTATGGGCTCAAGAAGAACATAAAAATCAAGGTGCATGGACATATATTCAGCCTA GATTCCATACAGCTCTTAATGGAACTCGTTCTGTATCCAGCGGAAATACATCATACGACA GTAAGGATAGCAGAGGGTGGTNNNAGTGGTTGGTTTTCAACTAAACCAACAATTGTGTCC GAGCCACTGTCAAAAGAATCTAATAAATCCAAACAGAGAACATTAAGATATGTTGGTCGA CCAACGGGAGCTTCACCCGCAACAGGAAGTAAAATGCAGCATCTCAAAGAATTGAAACAA TTACTTGATGACTCCTTCAATCTTTAATTATTCTTCGTAGCACTATGTATAACACATTTT ATTTATTTTCTTCATTATACTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)