These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_1355#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 595 fasta sequence [GGAAAGTTCAGAGTACGACCAAGTTCAGGAATTTTATTACCTCAAGAACAACGCTCAATTTCAGTTGTTGTACAACAAGAACATAATGTACGTGCTCTTTTACATGTTGATAAATTTTTAGTTATGTGCCTTCCATTAAAAGATCCGAATACATCAGCTCAAGAATTAGCAGTTCTATGGAAGTCTGAAAAACCAGCAGAAGAACATAAATTAAAATGTTGTTATGGTGGAATTATGAATAATGAAGTATTAAAATTAAATTCCATATCTGGAATATCAGAAAATAGTCAAATAGATACACTTTCTCGTAAGATAGCACATTTGAAAGAAAGTAATACAAAGATGCACAGTGAAGTTGTATTTCTAAAGCATTTACTATTACTTTCTATGATAGTTACAATTACAGTGGCCATAATAATTGTTTATATTTTAAAAATTGATATTAAAAATTCTATGGATCAACATTCTAGAATGGATCAAGCTTGTGACATTCACCATGAGATATAGGTTAATGAAATAGTTATTTATTTGATTTATACTTATAAATAATAAAACTTTTAATTGTTACATATTTATGTTCATGCAACGATTACAA] [+] EMBL BI506942 [GGAAAGTTCAGAGTACGACCAAGTTCAGGAATTTTATTACCTCAAGAACAACGCTCAATTTCAGTTGTTGTACAACAAGAACATAATGTACGTGCTCTTTTACATGTTGATAAATTTTTAGTTATGTGCCTTCCATTAAAAGATCCGAATACATCAGCTCAAGAATTAGCAGTTCTATGGAAGTCTGAAAAACCAGCAGAAGAACATAAATTAAAATGTTGTTATGGTGGAATTATGAATAATGAAGTATTAAAATTAAATTCCATATCTGGAATATCAGAAAATAGTCAAATAGATACACTTTCTCGTAAGATAGCACATTTGAAAGAAAGTAATACAAAGATGCACAGTGAAGTTGTATTTCTAAAGCATTTACTATTACTTTCTATGATAGTTACAATTACAGTGGCCATAATAATTGTTTATATTTTAAAAATTGATATTAAAAATTCTATGGATCAACATTCTAGAATGGATCAAGCTTGTGACATTCACCATGAGATATAGGTTAATGAAATAGTTATTTATTTGATTTATACTTATAAATAATAAAACTTTTAATTGTTACATATTTATGTTCATGCAACGATTACAA] consensusID : consensus_1355#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 244 fasta sequence [GAATACATCAGCTCAAGAATTAGCAGTTCTATGGAAGGTAAAAAAAAAATCTATGTAAGTTAATTATATGAACATTCATGCATGATTAAACTATAAAATTTTCTTATTCAGTCTGAAAAACCAGCAGAAGAACATAAATTAAAATGTTGTTATGGTGGAATTATGAATAATGNAGTATTAAAATTAAATTCCATATCTGGAATATCAGAAAATAGTCAAATAGATACACTTTCTCGTAAGGTAA] [-] EMBL BI509449 [GAATACATCAGCTCAAGAATTAGCAGTTCTATGGAAGGTAAAAAAAAAATCTATGTAAGTTAATTATATGAACATTCATGCATGATTAAACTATAAAATTTTCTTATTCAGTCTGAAAAACCAGCAGAAGAACATAAATTAAAATGTTGTTATGGTGGAATTATGAATAATGNAGTATTAAAATTAAATTCCATATCTGGAATATCAGAAAATAGTCAAATAGATACACTTTCTCGTAAGGTAA] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_1355#0 GGAAAGTTCAGAGTACGACCAAGTTCAGGAATTTTATTACCTCAAGAACAACGCTCAATT 60 consensus_1355#1 ------------------------------------------------------------ consensus_1355#0 TCAGTTGTTGTACAACAAGAACATAATGTACGTGCTCTTTTACATGTTGATAAATT-TTT 119 consensus_1355#1 -------GAATACATCAGCTCAAGAATTAGCA-GTTCTATGGAAGGTAAAAAAAAAATCT 52 **** ** * *** * * *** * * ** * *** * * consensus_1355#0 AGTTATGTGCCTTCCATTAAAAGATCCGAATACATCAGCTCAAGAATTAGCAGTTCTATG 179 consensus_1355#1 ATGTAAGTTAATTATATGAACATTCATGCATGATTAAACTATAAAATT-----TTCTTAT 107 * ** ** ** ** ** * * ** * * ** * **** **** consensus_1355#0 GAAGTCTGAAAAACCAGCAGAAGAACATAAATTAAAATGTTGTTATGGTGGAATTATGAA 239 consensus_1355#1 TCAGTCTGAAAAACCAGCAGAAGAACATAAATTAAAATGTTGTTATGGTGGAATTATGAA 167 ********************************************************** consensus_1355#0 TAATGAAGTATTAAAATTAAATTCCATATCTGGAATATCAGAAAATAGTCAAATAGATAC 299 consensus_1355#1 TAATGNAGTATTAAAATTAAATTCCATATCTGGAATATCAGAAAATAGTCAAATAGATAC 227 ***** ****************************************************** consensus_1355#0 ACTTTCTCGTAAGATAGCACATTTGAAAGAAAGTAATACAAAGATGCACAGTGAAGTTGT 359 consensus_1355#1 ACTTTCTCGTAAGGTAA------------------------------------------- 244 ************* ** consensus_1355#0 ATTTCTAAAGCATTTACTATTACTTTCTATGATAGTTACAATTACAGTGGCCATAATAAT 419 consensus_1355#1 ------------------------------------------------------------ consensus_1355#0 TGTTTATATTTTAAAAATTGATATTAAAAATTCTATGGATCAACATTCTAGAATGGATCA 479 consensus_1355#1 ------------------------------------------------------------ consensus_1355#0 AGCTTGTGACATTCACCATGAGATATAGGTTAATGAAATAGTTATTTATTTGATTTATAC 539 consensus_1355#1 ------------------------------------------------------------ consensus_1355#0 TTATAAATAATAAAACTTTTAATTGTTACATATTTATGTTCATGCAACGATTACAA 595 consensus_1355#1 -------------------------------------------------------- |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |