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Apis mellifera
cluster # 139 cluster # 139       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_139#0 length = 925 sequences # 7  
consensusID : consensus_139#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 925
fasta sequence 
                              [ATTGTTGAAGGTCGAAAGAATATTTTCAAAATTTGTTTCAGATTTGCAAGTAACTTGCAAATTTATTACTATTAATAGTTTACTTGTATCAATATACTCTAAGGCCATGGGTCGTAAATTTTTTGTTGGTGGTAATTGGAAAATGAATGGTACCAAAAGTGAAATAAATGATA-TTGTTGGC-TTTTTAAAAAAAGGTCCACTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCCGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTAGAAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTAGAAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTAGACAGACAAAAGCTATTGCAAATAAAATCAATTCATGGGATAATGTAGTTGTTGCTTATGAACCAGTTTGGGCAATTGGAACGGGTAAAACAGCCACACCACAACAAGCTCAAGANNTTCATGAAAAATTAAGAAATTGGTTTTCTAAAAATGTTAATCAAACTGTCGCAGAAACTGTTAGAATTATTTATGGAGGTTCAGTAACAGCAGGAAATGCAAAAGATTTAGCAAAAGAGAAAGATATTGATGGATTTTTAGTTGGTGGAGCATCTCTAAAACCTGATTTTGTACAGATCGTTAACGCTAAGCAGTGAGATGAAATATTCTTTATATAAGAATATTATTCCTTAAATTAATATACACTCTAGAATGTGTATATTATAATAAGT]

[+] EMBL BI511970             [ATTGTTGAAGGTCGAAAGAATATTTTCAAAATTTGTTTCAGATTTGCAAGTAACTTGCAAATTTATTACTATTAATAGTTTACTTGTATCAATATACTCTAAGGCCATGGGTCGTAAATTTTTTGTTGGTGGTAATTGGAAAATGAATGGTACCAAAAGTGAAATAAATGATA TTGTTGGC TTTTTAAAAAAAGGTCCACTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCCGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI509972             [                                                                                          AATATACTCTAAGGCCATGGGTCGTAAATTTTTTGTTGGTGGTAATTGGAAAATGAATGGTACCAAAAGTGAAATAAATGATANNNGTTGGCNTTTTTAAAAAAAGGTCCACTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCCGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTAGAAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTAGAAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTAGACAGACAAAAGCTATTGCAAATAAAATCAATTCATGGGATAATGTAGTTGTTGCTTATGAACCAGTTTGGGCAATTGGAACGGGTAAAACAGCCACAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI509036             [                                                                                                                         TTTGTTGGTGGTAATTGGAAAATGAATGGTACCAAAAGTGAAATAAATGATA TTGTTGGC TTTTTAAAAAAAGGTCCACTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCCGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTAGAAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTAGAAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTAGACAGACAAAAGCTATTGCAAATAAAATCAATTCATGGGATAATGTAGTTGTTGCTTATGAACCAGTTTGGGCAATTGGAACGGGTAAAACAGCCACACCACAACAAGCTCAAGANNTTCATGAAAAATTAAGAAATTGGTTTTCTAAAAATGT                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI511723             [                                                                                                                                       TTGGAAAATGAATGGTACCAAAAGTGAAATAAATGATA TTGTTGGC TTTTTAAAAAAAGGTCCACTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCCGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTNNNAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTATAAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTNNNCAGACAAAAGCTATTGCAAATAAAATCAATTCATGGGATAATGTNGTTGTTGCTTATGAACCAGTTTGGGCAATTGGAACGGGTAAAACAGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI517266             [                                                                                                                                                       ACCAAAAGTGAAATAAATGATA TTGTTGGC TTTTTAAAAAAAGGTCCACTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCTGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTAGAAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTNNNAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTAGACAGACAAAAGCTATTGCAAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI516689             [                                                                                                                                                                                                         CTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCCGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTNGAAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTAGAAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTAGACAGACAAAAGCTATTGCAAATAAAATCAATTCATGGGATAATGTAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI511024             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTAGAAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTAGAAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTAGACAGACAAAAGCTATTGCAAATAAAATCAATTCATGGGATAATGTAGTTGTTGCTTATGAACCAGTTTGGGCAATTGGAACGGGTAAAACAGCCACACCACAACAAGCTCAAGAGGTTCATGAAAAATTAAGAAATTGGTTTTCTAAAAATGTTAATCAAACTGTCGCAGAAACTGTTAGAATTATTTATGGAGGTTCAGTAACAGCAGGAAATGCAAAAGATTTAGCAAAAGAGAAAGATATTGATGGATTTTTAGTTGGTGGAGCATCTCTAAAACCTGATTTTGTACAGATCGTTAACGCTAAGCAGTGAGATGAAATATTCTTTATATAAGAATATTATTCCTTAAATTAATATACACTCTAGAATGTGTATATTATAATAAGT]




>consensus_139#0
ATTGTTGAAGGTCGAAAGAATATTTTCAAAATTTGTTTCAGATTTGCAAGTAACTTGCAA
ATTTATTACTATTAATAGTTTACTTGTATCAATATACTCTAAGGCCATGGGTCGTAAATT
TTTTGTTGGTGGTAATTGGAAAATGAATGGTACCAAAAGTGAAATAAATGATATTGTTGG
CTTTTTAAAAAAAGGTCCACTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTAT
ATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATAC
ATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAA
TGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCCGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGA
TGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTAGAAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATG
TATTGGAGAAAAATTAGAAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTAGACA
GACAAAAGCTATTGCAAATAAAATCAATTCATGGGATAATGTAGTTGTTGCTTATGAACC
AGTTTGGGCAATTGGAACGGGTAAAACAGCCACACCACAACAAGCTCAAGANNTTCATGA
AAAATTAAGAAATTGGTTTTCTAAAAATGTTAATCAAACTGTCGCAGAAACTGTTAGAAT
TATTTATGGAGGTTCAGTAACAGCAGGAAATGCAAAAGATTTAGCAAAAGAGAAAGATAT
TGATGGATTTTTAGTTGGTGGAGCATCTCTAAAACCTGATTTTGTACAGATCGTTAACGC
TAAGCAGTGAGATGAAATATTCTTTATATAAGAATATTATTCCTTAAATTAATATACACT
CTAGAATGTGTATATTATAATAAGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)