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Apis mellifera
cluster # 143 cluster # 143       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_143#0 length = 862 sequences # 7  

consensusID : consensus_143#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 862
fasta sequence
                              [CTTTGTGTTTTCTTTTCTCGTTGTA-CATCACTGTATTTATTTTCCCGTCTTGCAGACGCAACGTGGATAAAAATAACACGACGAAAACAAAATGGCGAAGGAAGGTTATATGATGGGATACGGAACGGAGGATACGCGAGATATGGTCCCTGGCAGTTTTCCGGGCGGCCTCCATTATTAACGATTAATTACATTTTTGTACCTAGCTGCTAGTTTTGTACTAGTTTTGTAACGTACCTCACTACCGGACGTGCTGTTATTGCATATTTTAAGCGGTTGTTAAAATGGAAGGTTGATCGATCACCCACATGGATGCCCGGCGTCCATAACGTGGTTGTGAACGATCGATGATCGTAGCGATGCTAAACCGGCACGGCCTCGTGTGATAAACACGACATTGAAACATTCTCGCGAAAGGAATCATTTTCCTGGCTCAACGATTTTGACAAGTTTAGTTTCGAAAGCAACCGATCGATACGTTCCTTCGTTCATCGAATGGATTTATCCATTGTGTATACAGGAAGGAAGGGATCGATGGAAAAATGGCCCATCGAAAATTGTTTTCTCTCGTCGAAGATCGTTTTTCGAAATTATAATTTCCCTTCCGTTCGAATTCGGTGAAATAAATTGGAATATTTTATCGATTTAATCGATATCGTGATTATCACATCAGNCATACGATACGTAAAGTACAATAGTAATCTCGAGGTTCCACCTGTAAGGTCGAGAGTACTTTCAAAGAGTTATTTCAGCGCTGCAAATAAAACATCTTTAAAAATAAAAATAAAAAAAAAGAGAGAGAAAAAAAGGAAAGGAATCTTGTTAATCAATATCCATTTATTATTACGATAATATATATACA]

[+] EMBL BI502821             [CTTTGTGTTTTCTTTTCTCGTTGTATCATCACTATATTTATTTTCCCGTCTTGCAGACGCAACGTGGATAAAAATAACACGACGAAAACAAAATGGCGAAGGAAGGTTATATGATGGGATACGGAACGGAGGATACGCGAGATATGGTCCCTGGCAGTTTTCCGGGCGGCCTCCATTATTAACGATTAATTACATTTTTGTACCTAGCTGCTAGTTTTGTACTAGTTTTGTAACGTACCTCACTACCGGACGTGCTGTTATTGCATATTTTAAGCGGTTGTTAAAATGGAAGGTTGATCGATCACCCACATGGATGCCCGGCGTCCATAACGTGGTTGTGAACGATCGATGATCGTAGCGATGCTAAACCGGCACGGCCTCGTGTGATAAACACGACATTGAAACATTCTCGCGAAAGGAATCATTTTCCTGGCTCAACGATTTTGACAAGTTTAGTTTCGAAAGCAACCGATCGATACGTTCCTTCGTTCATCGAATGGATTTATCCATTGTGTATACAGGAAGGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI516290             [   TGTGTTTTCTTTTCTCGTTGTA CATCACTGTATTTATTTTCCCGTCTTGCAGACGCAACGTGGATAAAAATAACACGACGAAAACAAAATGGCGAAGGAAGGTTATATGATGGGATACGGAACGGAGGATACGCGAGATATGGTCCCTGGCAGTTTTCCGGGCGGCCTCCATTATTAACGATTAATTACATTTTTGTACCTAGCTGCTAGTTTTGTACTAGTTTTGTAACGTACCTCACCACCGGACGTGCTGTTATTGCATATTTTAAGCGGTTGTTAAAATGGAAGGTTGATCGATCACCCACATGGATGCCCGGCGTCCATAACGTGGTTGTGAACGATCGATGATCGTAGCGATGCTAAACCGGCACGGCCTCGTGTGATAAACACGACATTGAAACATTCTCGCGAAAGGAATCATTTTCCTGACTCAACGATTTTGACAAGTTTAGTTTCGAAAGCAACCGATCGATACGTTCCTTCGTTCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI503980             [                                            CCCGTCTTGCAGACGCAACGTGGATAAAAATAACACGACGAAAACAAAATGGCGAAGGAAGGTTATATGATGGGATACGGAACGGAGGATACGCGAGATATGGTCCCTGGCAGTTTTCCGGGCGGCCTCCATTATTAACGATTAATTACATTTTTGTACCTAGCTGCTAGTTTTGTACTAGTTTTGTAACGTACCTCACTACCGGACGTGCTGTTATTGCATATTTTAAGCGGTTGTTAAAATGGAAGGTTGATCGATCACCCACATGGATGCCCGGCGTCCATAACGTGGTTGTGAACGATCGATGATCGTAGCGATGCTAAACCGGCACGGCCTCGTGTGATAAACACGACATTGAAACATTCTCGCGAAAGGAATCATTTTCCTGGCTCAACGATTTTGACAAGTTTAGTTTCGAAAGCAACCGATCGATACGTTCCTTCGTTCATCGAATGGATTTATCCATTGTGTATACAGGAAGGAAGGGATCGATGGAAAAATGGCCCATCGAAAATTGTTTTCTCTCGTCGAAGATCGTTTTTCGAAATTATAATTTCCCTTCCGTTCGAATTCGGTGAAATAAATTGGAATATTTTATCGATTTAATCGATATCGTGATTATCACATCAGNCATACGATACGTAAAGTA                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI509049             [                                                  TTGCAGACGCAACGTGGATAAAAATAACACGACGAAAACAAAATGGCGAAGGAAGGTTATATGATGGGATACGGAACGGAGGATACGCGAGATATGGTCCCTGGCAGTTTTCCGGGCGGCCTCCATTATTAACGATTAATTACATTTTTGTACCTAGCTGCTAGTTTTGTACTAGTTTTGTAACGTACCTCACTACCGGACGTGCTGTTATTGCATATTTTAAGCGGTTGTTAAAATGGAAGGTTGATCGATCACCCACATGGATGCCCGGCGTCCATAACGTGGTTGTGAACGATCGATGATCGTAGCGATGCTAAACCGGCACGGCCTCGTGTGATAAACACGACATTGAAACATTCTCGCGAAAGGAATCATTTTCCTGGCTCAACGATTTTGACAAGTTTAGTTTCGAAAGCAACCGATCGATACGTTCCTTCGTTCATCGAATGGATTTATCCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI504206             [                                                                  GATAAAAATAACACGACGAAAACAAAATGGCGAAGGAAGGTTATATGATGGGATACGGAACGGAGGATACGCGAGATATGGTCCCTGGCAGTTTTCCGGGCGGCCTCCATTATTAACGATTAATTACATTTTTGTACCTAGCTGCTAGTTTTGTACTAGTTTTGTAACGTACCTCACCACCGGACGTGCTGTTATTGCATATTTTAAGCGGTTGTTAAAATGGAAGGTTGATCGATCACCCACATGGATGCCCGGCGTCCATAACGTGGTTGTGAACGATCGATGATCGTAGCGATGCTAAACCGGCACGGCCTCGTGTGATAAACACGACATTGAAACATTCTCGCGAAAGGAATCATTTTCCTGACTCAACGATTTTGACAAGTTTAGTTTCGAAAGCAACCGATCGATACGTTCCTTCGTTCATCGAATGGATTTATCCATTGTGTATACAGGAAGGAAGGGATCGATGGAAAAATGGCCCATCGAAAATTGTTTTCTCTCGTCGAAGATCGTTTTTCGAAATTATAATTTCCCTTCCGTTCGAATTCGGTGAAATAAATTGGAATATTTTATCGATTTAATCGATATC                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI509085             [                                                                        AATAACACGACGAAAACAAAATGGCGAAGGAAGGTTATATGATGGGATACGGAACGGAGGATACGCGAGATATGGTCCCTGGCAGTTTTCCGGGCGGCCTCCATTATTAACGATTAATTACATTTTTGTACCTAGCTGCTAGTTTTGTACTAGTTTTGTAACGTACCTCACTACCGGACGTGCTGTTATTGCATATTTTAAGCGGTTGTTAAAATGGAAGGTTGATCGATCACCCACATGGATGCCCGGCGTCCATAACGTGGTTGTGAACGATCGATGATCGTAGCGATGCTAAACCGGCACGGCCTCGTGTGATAAACACGACATTGAAACATTCTCGCGAAAGGAATCATTTTCCTGGCTCAACGATTTTGACAAGTTTAGTTTCGAAAGCAACCGATCGATACGTTCCTTCGTTCATCGAATGGATTTATCCATTGTGTATACAGGAAGGAAGGGATCGATGGAAAAATGGCCCATCGAAAATTGTTTTCTCTCGTCGAAGATCGTTTTTCGAAATTATAA                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI510414             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCACCCACATGGATGCCCGGCGTCCATAACGTGGTTGTGAACGATCGATGATCGTAGCGATGCTAAACCGGCACGGCCTCGTGTGATAAACACGACATTGAAACATTCTCGCGAAAGGAATCATTTTCCTGGCTCAACGATTTTGACAAGTTTAGTTTCGAAAGCAACCGATCGATACGTTCCTTCGTTCATCGAATGGATTTATCCATTGTGTATACAGGAAGGAAGGGATCGATGGAAAAATGGCCCATCGAAAATTGTTTTCTCTCGTCGAAGATCGTTTTTCGAAATTATAATTTCCCTTCCGTTCGAATTCGGTGAAATAAATTGGAATATTTTATCGATTTAATCGATATCGTGATTATCACATCAGGCATACGATACGTAAAGTACAATAGTAATCTCGAGGTTCCACCTGTAAGGTCGAGAGTACTTTCAAAGAGTTATTTCAGCGCTGCAAATAAAACATCTTTAAAAATAAAAATAAAAAAAAAGAGAGAGAAAAAAAGGAAAGGAATCTTGTTAATCAATATCCATTTATTATTACGATAATATATATACA]


>consensus_143#0 CTTTGTGTTTTCTTTTCTCGTTGTACATCACTGTATTTATTTTCCCGTCTTGCAGACGCA ACGTGGATAAAAATAACACGACGAAAACAAAATGGCGAAGGAAGGTTATATGATGGGATA CGGAACGGAGGATACGCGAGATATGGTCCCTGGCAGTTTTCCGGGCGGCCTCCATTATTA ACGATTAATTACATTTTTGTACCTAGCTGCTAGTTTTGTACTAGTTTTGTAACGTACCTC ACTACCGGACGTGCTGTTATTGCATATTTTAAGCGGTTGTTAAAATGGAAGGTTGATCGA TCACCCACATGGATGCCCGGCGTCCATAACGTGGTTGTGAACGATCGATGATCGTAGCGA TGCTAAACCGGCACGGCCTCGTGTGATAAACACGACATTGAAACATTCTCGCGAAAGGAA TCATTTTCCTGGCTCAACGATTTTGACAAGTTTAGTTTCGAAAGCAACCGATCGATACGT TCCTTCGTTCATCGAATGGATTTATCCATTGTGTATACAGGAAGGAAGGGATCGATGGAA AAATGGCCCATCGAAAATTGTTTTCTCTCGTCGAAGATCGTTTTTCGAAATTATAATTTC CCTTCCGTTCGAATTCGGTGAAATAAATTGGAATATTTTATCGATTTAATCGATATCGTG ATTATCACATCAGNCATACGATACGTAAAGTACAATAGTAATCTCGAGGTTCCACCTGTA AGGTCGAGAGTACTTTCAAAGAGTTATTTCAGCGCTGCAAATAAAACATCTTTAAAAATA AAAATAAAAAAAAAGAGAGAGAAAAAAAGGAAAGGAATCTTGTTAATCAATATCCATTTA TTATTACGATAATATATATACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)