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Apis mellifera
cluster # 148 cluster # 148       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_148#0 length = 737 sequences # 6  
consensusID : consensus_148#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 737
fasta sequence 
                              [TTTTGAATTCTATGAAAATTGTTATGCATCGATTTTTGGCTTAATTAATAATATTTGATTATATAGTTTTTATTTTGTGCGAATATTATTTTTTTTTCTGTAATCTTTTTGAGAGAGAAAAAATGAAAATATGAAATTTTGCGTTACTAAAGATTCGAAAATTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAA-GTTTAAAAAGATCGTAT-CAACTTTCCTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACG-TTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCAGTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTATCATTATTCTATCTATATTATTGTTTTGCTATCATAAACATTCCATTCTATTTTCTCAATTAGACAAACACGATCAAATTATTGAATTATTGAATA-CTATGAAGTATAATTTTAATTTTATTATTCTTTTTTTTCCCCTTTTCTTTTAATATTTATCATACAAAAGTTTTTTCTTTCTTCATCATCTTATTTCAGATATTTCCATTTATATTTTAAAACACTTTTTTATAAACAGTTTGTAAAAAAATTTAAAAAACATTGCTCA]

[+] EMBL BI946523             [TTTTGAATTCTATGAAAATTGTTATGCATCGATTTTTGGCTTAATTAATAATATTTGATTATATAGTTTTTATTTTGTGCGAATATTATTTTTTTTTCTGTAATCTTTTTGAAAGAGAAAAAATGAAAATATGAAATTTTGCGTTATTAAAGATTCGAAAATTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAA GTTTAAAAAGATCGTAT CAACTTTCCTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACG TTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCAGTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTATCATTATTCTATCTATATTATTGTTTTGCTATCATAAACATTCCATTCTATTTTCTCAATTAGACAAACACGATCAAATTATTGAATTATTGAATACCTATGAAGGATAAATTTAAATTTATTAAT TCTTTTTTCCCCTTT  CTTTAATATTTATCA ATACAAAGTTTTTCTTTCTTCATCATCTTA TTCAGATATTTCCAT                                                            ]
[+] EMBL BI511001             [                 ATTGTTATGCATCGATTTTTGGCTTAATTAATAATATTTGATTATATAGTTTTTATTTTGTGCGAATATTATTTTTTTTTCTGTAATCTTTTTGAAAGAGAAAAAATGAAAATATGAAATTTTGCGTTATTAAAGATTCGAAAATTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAA GTTTAAAAAGATCGTAT CAACTTTCCTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACG TTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCAGTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTATCATT                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BI509178             [                                            TTAATAATATTTGATTATATAGTTTTTATTTTGTGTGAATATTATTTTTTTTTCTGTAATCTTTTTGAGAGAGAAAAAATGAAAATATGAAATTTTGCATTACTAAAGATTCGAAAACTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAA GTTTAAAAAGATCGTAT CAACTTTCCTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACG TTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCAGTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTATCATTATTCTATCTATATTATTGTTTTGCTATCATAAACATTCCATTCTATTTTCTCAATTAGACAAACACGATCAAATTATTGAATTATTGAATA CTATGAAGTATAATTTTAATTTTATTATTCTTTTTTTTCCCCTTTTCTTTTAATATTTATCATACAAAAGTTTTTTCTTTCT                                                                                       ]
[+] EMBL BI512175             [                                            TTAATAATATTTGATTATATAGTTTTTATTTTGTGTGAATATTATTTTTTTTTCTGTAATCTTTTTGAGAGAGAAAAAATGAAAATATGAAATTTTGCATTACTAAAGATTCGAAAACTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAA GTTTAAAAAGATCGTAT CAACTTTCCTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACG TTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCNNTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTA                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI506316             [                                                                                               TTCTGTAATCTTTTTGAGAGAGAAAAAATGAAAATATGAAATTTTGCATTACTAAAGATTCGAAAATTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAA GTTTAAAAAGATCGTAT CAACTTTCTTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACGTTTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCAGTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTATCATTATTCTATCTATATTATTGTTTTGCTATCATAAACATTCCATTCTATTTTCTCAATTAGACAAACACGATCAAATTATTGAATTATTGAATA CTATGAAGTATAATTTTAATTTTATTATTCTTTTTTTTCCCCTTTTCTTTTAATATTTATCATACAAAAGTTTTTTCTTTCTTCATCATCTTATTTCAGATATTTCCATTTATATTTTAAAACACTT                                          ]
[-] EMBL BI946522             [                                                                                                                                            cgGTTATTAAAGATTCGAAAATTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAAGGTTTAAAAAGATCGTATCCAACTTTCCTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACG TTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCAGTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTATCATTATTCTATCTATATTATTGTTTTGCTATCATAAACATTCCATTCTATTTTCTCAATTAGACAAACACGATCAAATTATTGAATTATTGAATA CTATGAAGTATAATTTTAATTTTATTATTCTTTTTTTTCCCCTTTTCTTTTAATATTTATCATACAAAAGTTTTTTCTTTCTTCATCATCTTATTTCAGATATTTCCATTTATATTTTAAAACACTTTTTTATAAACAGTTTGTAAAAAAATTTAAAAAACATTGCTCA]




>consensus_148#0
TTTTGAATTCTATGAAAATTGTTATGCATCGATTTTTGGCTTAATTAATAATATTTGATT
ATATAGTTTTTATTTTGTGCGAATATTATTTTTTTTTCTGTAATCTTTTTGAGAGAGAAA
AAATGAAAATATGAAATTTTGCGTTACTAAAGATTCGAAAATTAAAGTAGATTAAAAGAT
TTTAAGTTTCAAGAAATTTTAAGTTTAAAAAGATCGTATCAACTTTCCTTTTTCTCTTCG
TGTTTAAATATTTATAATCGAATACGTTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAA
GCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTAT
TAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTT
GTTCAGTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTATCATTATT
CTATCTATATTATTGTTTTGCTATCATAAACATTCCATTCTATTTTCTCAATTAGACAAA
CACGATCAAATTATTGAATTATTGAATACTATGAAGTATAATTTTAATTTTATTATTCTT
TTTTTTCCCCTTTTCTTTTAATATTTATCATACAAAAGTTTTTTCTTTCTTCATCATCTT
ATTTCAGATATTTCCATTTATATTTTAAAACACTTTTTTATAAACAGTTTGTAAAAAAAT
TTAAAAAACATTGCTCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)