Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1592 cluster # 1592       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1592#0 length = 546 sequences # 2  
consensusID : consensus_1592#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 546
fasta sequence 
                              [CAATGCTATGCAATTTTATATTGGAGGAGTTTCNNNNTCCATTTCATTTCTTATGTAATCCCAAAGATTTAGATCATGGAGTTTTAATTGTGGGATATGGCATTAGTAAATATCCTCTCTTTCATAAAAAATTACCATACTGGATAATAAAGAATAGTTGGGGCTCACGATGGGGCGAGAATGGTTATTACAGAGTTTATAGAGGAGATGGTACCTGCGGAGTTAACGCGATGGCTTCAAGTGCAATAGTTGCATAACAAATATATTTAAGAAATTAATGCCTTTAATAATATTTAACTTCTTCGAAATAAAATTATATA-TTTTTTTTTTGTACTGTAATGAGAATAAAAATTATATTAATGTATGAATGAAATTAGTCGCTTGCACTCTAAAAATTTAACGTAACATATTTTAATGATAAAACATCATAAACGTTATGTTTCATAATTAAAATTGCAAATAATAAATACTAATACTAATAATGATATGAAATTTTTACAATTATACATTAATAATTATAATTATTAAGAATCAATGTTTTTATAA]

[+] EMBL BI505712             [CAATGCTATGCAATTTTATATTGGAGGAGTTTCNNNNTCCATTTCATTTCTTATGTAATCCCAAAGATTTAGATCATGGAGTTTTAATTGTGGGATATGGCATTAGTAAATATCCTCTCTTTCATAAAAAATTACCATACTGGATAATAAAGAATAGTTGGGGCTCACGATGGGGCGAGAATGGTTATTACAGAGTTTATAGAGGAGATGGTACCTGCGGAGTTAACGCGATGGCTTCAAGTGCAATAGTTGCATAACAAATATATTTAAGAAATTAATGCCTTTAATAATATTTAACTTCTTCGAAATAAAATTATATATTTTTTTTTTTGTACTGTAATGAGAATAAAAATTATATTAATGTATGAATGAAATTAGTCGCTTGCACTCTAAAAATTTAACGTAACATATTTTAATGATAAAACATCATAAACGTTATGTTTCATAATTAAAATTGCAAATAATAAATACTAATACTAATAATGATATGAAATTTTTACAATTATACATTAATAATTATAATTATTAAGAATCAATGTTTTTATAA]
[-] EMBL BI507507             [                                                                             ttttTTTTAATTGTGGGATATGGCATTAGTAAATATCCTCTCTTTCATAAAAAATTACCATACTGGATAATAAAGAATAGTTGGGGCTCACGATGGGGCGAGAATGGTTATTACAGAGTTTATAGAGGAGATGGTACCTGCGGAGTTAACGCGATGGCTTCAAGTGCAATAGTTGCATAACAAATATATTTAAGAAATTAATGCCTTTAATAATATTTAACTTCTTCGAAATAAAATTATATA TTTTTTTTTTGTACT                                                                                                                                                                                                                   ]




>consensus_1592#0
CAATGCTATGCAATTTTATATTGGAGGAGTTTCNNNNTCCATTTCATTTCTTATGTAATC
CCAAAGATTTAGATCATGGAGTTTTAATTGTGGGATATGGCATTAGTAAATATCCTCTCT
TTCATAAAAAATTACCATACTGGATAATAAAGAATAGTTGGGGCTCACGATGGGGCGAGA
ATGGTTATTACAGAGTTTATAGAGGAGATGGTACCTGCGGAGTTAACGCGATGGCTTCAA
GTGCAATAGTTGCATAACAAATATATTTAAGAAATTAATGCCTTTAATAATATTTAACTT
CTTCGAAATAAAATTATATATTTTTTTTTTGTACTGTAATGAGAATAAAAATTATATTAA
TGTATGAATGAAATTAGTCGCTTGCACTCTAAAAATTTAACGTAACATATTTTAATGATA
AAACATCATAAACGTTATGTTTCATAATTAAAATTGCAAATAATAAATACTAATACTAAT
AATGATATGAAATTTTTACAATTATACATTAATAATTATAATTATTAAGAATCAATGTTT
TTATAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)