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Apis mellifera
cluster # 160 cluster # 160       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_160#0 length = 1128 sequences # 6  
consensusID : consensus_160#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1128
fasta sequence 
                              [ACTTTTTTGGCTTATGCGTGGTCAGGTTATGGAGCTGGTTTATTATCGAATTTAAAAGATGCTGTATTAGCAGCAGAAACGGTATTTCAAGATTTATTCCAAAATGCGATTACTGTTGCTAGAAAAATCAGAGATATCCACGAAGTATTTGATGCAGCAGTGGAAGAAAATTGTATCTTTCAATGTCCAGGAGGTATGACACCGAAAGCAGATTGGAATCATAAACCGCAAAGTAACGGATGTGGTTCTCTAGGAATCGAAATAAACCAAGAGTATCTACCGCTTACAGAAATGACGAAATGTTGTGATGCGCATGACATTTGTTACGATTCTTGTAATTCGGATAAGGAAAAATGTGATTTGGAATTTAAGAGATGTCTATATAAATATTGCGATGGATATCAATCGTCTGCGATAATAAATACATGCAAAGCTGCAGCAAAAATGCTTTTCACTGGTACAACTGCTTTGGGATGCAAGAGTTATATAGATGCACAAAAAGAAGCTTGCTATTGTGGAGAGAAGTGGAATAAGAATAAGAAACCCAAAAAGGCTGCTCAAGCAGGTGGAGAATTGTGAAAAAATGGC--GTAAATGTGCCAATTAAATGAAACGTATTATAACGTTTCGTTTATGAATCTTTAGTAATAATTATATGATTTTGTATTTATTTTTATATTACATATGTGACAAATATTAATTTATCGAAAATTGTACGATACGAATATTTTAACATTCAATAATAATATACAAGATTATATTATTTAATTATATATAATATTAATATTATATAATATTTATATAATATTTATATTATATGATTTAATTAATAAATATAAGTTTATATCGTATAATCATTCATTTCTCTCTTAACCTTTTCTATTTCTTCTTGGAGAGAATAACCAAATTTGAAAAATTGATTTATAAAAAATTCAAATTTTTATTTACTCGTTTGGCTTGGAAAAACAAGGGAAGGGACGTTTTTCATTGACAATGGCACTTCAATTTCAAAGTTTTTGAGAAAAGTTTTTGCAAAAAATTGTCAAGTAATGCGNNNTACAACAAGAATTTGTTAAACAATTACGACAGAGTTTCGAGGAGGATGGGAAATACCGGATCCGTACAGTCAT]

[+] EMBL BI512036             [ACTTTTTTGGCTTATGCGTGGTCAGGTTATGGAGCTGGTTTATTATCGAATTTAAAAGATGCTGTATTAGCAGCAGAAACGGTATTTCAAGATTTATTCCAAAATGCGATTACTGTTGCTAGAAAAATCAGAGATATCCACGAAGTATTTGATGCAGCAGTGGAAGAAAATTGTATCTTTCAATGTCCAGGAGGTATGACACCGAAAGCAGATTGGAATCATAAACCGCAAAGTAACGGATGTGGTTCTCTAGGAATCGAAATAAACCAAGAGTATCTACCGCTTACAGAAATGACGAAATGTTGTGATGCGCATGACATTTGTTACGATTCTTGTAATTCGGATAAGGAAAAATGTGATTTGGAATTTAAGAGATGTCTATATAAATATTGCGATGGATATCAATCGTCTGCGATAATAAATACATGCAAAGCTGCAGCAAAAATGCTTTTCACTGGTACAACTGCTTTGGGATGCAAGAGTTATATAGATGCACAAAAAGAAGCTTGCTATTGTGGAGAGAAGTGGAATAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI508688             [                                                                                                                               TCAGAGATATCCACGAAGTATTTGATGCAGCAGTGGAAGAAAATTGTATCTTTCAATGTCCAGGAGGTATGATACCGAAAGCAGATTGGAATCATAAACCGCAAAGTAACGGATGTGGTTCTCTAGGAATCGAAATAAACCAAGAGTATCTACCGCTTACAGAAATGACGAAATGTTGTGATGCGCATGACATTTGTTACGATTCTTGTAATTCGGATAAGGAAAAATGTGATTTGGAATTTAAGAGATGTCTATATAAATATTGTGATGGATATCAATCGTCTGCGATAATAAATACATGCAAAGCTGCAGCAAAAATGCTTTTCACTGGTACAACTGCTTTGGGATGCAAGAGTTATATAGATGCACAAAAAGAAGCTTGCTATTGTGGAGAGAAGTGGAATAAGAATAAGAAACCCAAAAAGGCTGCTCAAGCAGGTGGAGAATTGTGAAAAAATGGCGTGTAAATGTGCCAATTAAATGAAACGTATTATAACGTTTCGTTTATGAATCTTTAGTAATAATTATATGATTTTGTATTTATTTTTATATTACATATGTGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI505126             [                                                                                                                               TCAGAGATATCCACGAAGTATTTGATGCAGCAGTGGAAGAAAATTGTATCTTTCAATGTCCAGGAGGTATGACACCGAAAGCAGATTGGAATCATAAACCGCAAAGTAACGGATGTGGTTCTCTAGGAATCGAAATAAACCAAGAGTATCTACCGCTTACAGAAATGACGAAATGTTGTGATGCGCATGACATTTGTTACGATTCTTGTAATTCGGATAAGGAAAAATGTGATTTGGAATTTAAGAGATGTCTATATAAATATTGCGATGGATATCAATCGTCTGCGATAATAAATACATGCAAAGCTGCAGCAAAAATGCTTTTCACTGGTACAACTGCTTTGGGATGCAAGAGTTATATAGATGCACAAAAAGAAGCTTGCTATTGTGGAGAGAAGTGGAATAAGAATAAGAAACCCAAAAAGGCTGCTCAAGCAGNTGGAGAATTGTGAAAAAATGGC  GTAAATGTGCCAATTAAATGAAACGTATTATAACGTTTCGTTTATGAATCTTTAGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI505092             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAGAGATGTCTATATAAATATTGCGATGGATATCAATCGTCTGCGATAATAAATACATGCAAAGCTGCAGCAAAAATGCTTTTCACTGGTACAACTGCTTTGGGATGCAAGAGTTATATAGATGCACAAAAAGAAGCTTGCTATTGTGGAGAGAAGTGGAATAAGAATAAGAAACCCAAAAAGGCTGCTCAAGCAGGTGGAGAATTGTGAAAAAATGGC  GTAAATGTGCCAATTAAATGAAACGTATTATAACGTTTCGTTTATGAATCTTTAGTAATAATTATATGATTTTGTATTTATTTTTATATTACATATGTGACAAATATTAATTTATCGAAAATTGTACGATACGAATATTTTAACATTCAATAATAATATACAAGATTATATTATTTAATTATATATAATATTAATATTATATAATATTTATATAATATTTATATTATATGATTTAATTAATAAATATAAGTTTATATCGTATAATCATTCATTTCTCTCTTAACCTTTTCTATTTCTTCTTGGAGAGAATAACCAAATTTGAAAAATTGATTTATAAAAAATTCAAATTTTTAT                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI503099             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTTTTTTATATTACATATGTGACAAATATTAATTTATCGAAAATTGTACGATACGAATATTTTAACATTCAATAATAATATACAAGATTATATTATTTAATTATATATAATATTAATATTATATAATATTTATATAATATTTATATTATATGATTTAATTAATAAATATAAGTTTATATCGTATAATCATTCATTTCTCTCTTAACCTTTTCTATTTCTTCTTGGAGAGAATAACCAAATTTGAAAAATTGATTTATAAAAAATTCAAATTTTTATTTACTCGTTTGTCTTGGAAAAACAAGGGAAGGTACGTTTTTCATTGACAATGTCACTTCAATTTCAAAGTTTTTGAGAAAAGTTTTTGCAAAAAATTGTCAAGTAATGCGNNNTACAACAAGAATTTGTTAAACAATTACGACAGAGTTTCGAGGAGGATGGGAAATACCGGATCCGTACAGTCAT]
[+] EMBL BI508662             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTTATATTACATATGGGACAAATATTAATTTATCGAAAATTGTACGATACGAATATTTTAACATTCAATAATAATATACAAGATTATATTATTTAATTATATATAATATTAATATTATATAATATTTATATAATATTTATATTATATGATTTAATTAATAAATATAAGTTTATATCGTATAATCATTCATTTCTCTCTTAACCTTTTCTATTTCTTCTTGGAGAGAATAACCAAATTTGAAAAATTGATTTATAAAAAATTCAAATTTTTATTTACTCGTTTGGCTTGGAAAAACAAGGGAAGGGACGTTTTTCATTGACAATGGCACTTCA                                                                                                                              ]




>consensus_160#0
ACTTTTTTGGCTTATGCGTGGTCAGGTTATGGAGCTGGTTTATTATCGAATTTAAAAGAT
GCTGTATTAGCAGCAGAAACGGTATTTCAAGATTTATTCCAAAATGCGATTACTGTTGCT
AGAAAAATCAGAGATATCCACGAAGTATTTGATGCAGCAGTGGAAGAAAATTGTATCTTT
CAATGTCCAGGAGGTATGACACCGAAAGCAGATTGGAATCATAAACCGCAAAGTAACGGA
TGTGGTTCTCTAGGAATCGAAATAAACCAAGAGTATCTACCGCTTACAGAAATGACGAAA
TGTTGTGATGCGCATGACATTTGTTACGATTCTTGTAATTCGGATAAGGAAAAATGTGAT
TTGGAATTTAAGAGATGTCTATATAAATATTGCGATGGATATCAATCGTCTGCGATAATA
AATACATGCAAAGCTGCAGCAAAAATGCTTTTCACTGGTACAACTGCTTTGGGATGCAAG
AGTTATATAGATGCACAAAAAGAAGCTTGCTATTGTGGAGAGAAGTGGAATAAGAATAAG
AAACCCAAAAAGGCTGCTCAAGCAGGTGGAGAATTGTGAAAAAATGGCGTAAATGTGCCA
ATTAAATGAAACGTATTATAACGTTTCGTTTATGAATCTTTAGTAATAATTATATGATTT
TGTATTTATTTTTATATTACATATGTGACAAATATTAATTTATCGAAAATTGTACGATAC
GAATATTTTAACATTCAATAATAATATACAAGATTATATTATTTAATTATATATAATATT
AATATTATATAATATTTATATAATATTTATATTATATGATTTAATTAATAAATATAAGTT
TATATCGTATAATCATTCATTTCTCTCTTAACCTTTTCTATTTCTTCTTGGAGAGAATAA
CCAAATTTGAAAAATTGATTTATAAAAAATTCAAATTTTTATTTACTCGTTTGGCTTGGA
AAAACAAGGGAAGGGACGTTTTTCATTGACAATGGCACTTCAATTTCAAAGTTTTTGAGA
AAAGTTTTTGCAAAAAATTGTCAAGTAATGCGNNNTACAACAAGAATTTGTTAAACAATT
ACGACAGAGTTTCGAGGAGGATGGGAAATACCGGATCCGTACAGTCAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)