Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1703 cluster # 1703       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1703#0 length = 810 sequences # 2  

consensusID : consensus_1703#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 810
fasta sequence
                              [CCCTGTCCGTAGCTCAGTTAGAGCTCGGTGGAAATCCGAACGCCTTGGCTTTGCGTAGGCCATTTGATCCTGTGGCACATGATCTCGATGCGACCTTCCGCCTTACGCGGTTCGCCGACCTAAAAGGATGAGGGACTACAGGCCGACGATGGTAGCGCACAAGATCATGAACATGCCCATTTTATGCACATGGCCATTCCACGCATCGGCATTGGTATGGATTCCTCCGTGACTCCACTGAGACATGGAGGGCTTAGTTTGGTACAAACAACAGATTTCTTTTATCCATTAGTGGAGGA-CCCTATAAGAGGTAAAATTGCATGTGCAAATGTTATCAGTGATCTATATGCTATGGGTGTTACTGAATGTGATAATATGCTGATGTTATTGGGAGTCAGTACAAAAATGACTGAAAAGGAACGAGATGTTGTTGTTCCTTTGATTATGAGAGGATTCAAGGATTCTGCTCTGGAAGCTGGCACAACAGTAACAGGTGGTCAGACAGTTGTTAATCCTTGGTGTACAATAGGTGGAGTGGCTTCTACTGTTTGTCAACCAAATGAATACATTGTTCCAGATAATGCAGTAGTAGGTGATGTTCTTGTTCTGACAAAACCACTTGGAACTCAAGTTGCTGTGAATGCTCATCAATGGTTAGATCAGCCAGATCGCTGGAACAGAATCAAACTTGTAGTCAGTGAAGATGATGTAAGGAAAGCTTATCAAAGAGCAATGGATAGCATGGCTAGGCTTAACAGAATAGCGGCTAGATTAATGCATAAATATAATGCACATGGAGCAACAGATGTA]

[+] EMBL BI506785             [CCCTGTCCGTAGCTCAGTTAGAGCTCGGTGGAAATCCGAACGCCTTGGCTTTGCGTAGGCCATTTGATCCTGTGGCACATGATCTCGATGCGACCTTCCGCCTTACGCGGTTCGCCGACCTAAAAGGATGAGGGACTACAGGCCGACGATGGTAGCGCACAAGATCATGAACATGCCCATTTTATGCACATGGCCATTCCACGCATCGGCATTGGTATGGATTCCTCCGTGACTCCACTGAGACATGGAGGGCTTAGTTTGGTACAAACAACAGATTTCTTTTATCCATTAGTTGATGATCCTTATATGATGTAAAATTGCATGTGCAAATGTTATCAGTGATCTATATGCTATGGGTGTTACTGAATGTGATAATATGCTGATGTTATTGGGAGTCAGTACAAAAATGACTGAAAAGGAACGAGATGTTGTTGTTCCTTTGATTATGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI505321             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATTGGAGTA   CTTTTACAGGTAAAATTGCATGTGCAAATGTTATCAGTGATCTATATGCTATGGGTGTTACTGAATGTGATAATATGCTGATGTTATTGGGAGTCAGTACAAAAATGACTGAAAAGGAACGAGATGTTGTTGTTCCTTTGATTATGAGAGGATTCAAGGATTCTGCTCTGGAAGCTGGCACAACAGTAACAGGTGGTCAGACAGTTGTTAATCCTTGGTGTACAATAGGTGGAGTGGCTTCTACTGTTTGTCAACCAAATGAATACATTGTTCCAGATAATGCAGTAGTAGGTGATGTTCTTGTTCTGACAAAACCACTTGGAACTCAAGTTGCTGTGAATGCTCATCAATGGTTAGATCAGCCAGATCGCTGGAACAGAATCAAACTTGTAGTCAGTGAAGATGATGTAAGGAAAGCTTATCAAAGAGCAATGGATAGCATGGCTAGGCTTAACAGAATAGCGGCTAGATTAATGCATAAATATAATGCACATGGAGCAACAGATGTA]


>consensus_1703#0 CCCTGTCCGTAGCTCAGTTAGAGCTCGGTGGAAATCCGAACGCCTTGGCTTTGCGTAGGC CATTTGATCCTGTGGCACATGATCTCGATGCGACCTTCCGCCTTACGCGGTTCGCCGACC TAAAAGGATGAGGGACTACAGGCCGACGATGGTAGCGCACAAGATCATGAACATGCCCAT TTTATGCACATGGCCATTCCACGCATCGGCATTGGTATGGATTCCTCCGTGACTCCACTG AGACATGGAGGGCTTAGTTTGGTACAAACAACAGATTTCTTTTATCCATTAGTGGAGGAC CCTATAAGAGGTAAAATTGCATGTGCAAATGTTATCAGTGATCTATATGCTATGGGTGTT ACTGAATGTGATAATATGCTGATGTTATTGGGAGTCAGTACAAAAATGACTGAAAAGGAA CGAGATGTTGTTGTTCCTTTGATTATGAGAGGATTCAAGGATTCTGCTCTGGAAGCTGGC ACAACAGTAACAGGTGGTCAGACAGTTGTTAATCCTTGGTGTACAATAGGTGGAGTGGCT TCTACTGTTTGTCAACCAAATGAATACATTGTTCCAGATAATGCAGTAGTAGGTGATGTT CTTGTTCTGACAAAACCACTTGGAACTCAAGTTGCTGTGAATGCTCATCAATGGTTAGAT CAGCCAGATCGCTGGAACAGAATCAAACTTGTAGTCAGTGAAGATGATGTAAGGAAAGCT TATCAAAGAGCAATGGATAGCATGGCTAGGCTTAACAGAATAGCGGCTAGATTAATGCAT AAATATAATGCACATGGAGCAACAGATGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)