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Apis mellifera
cluster # 1736 cluster # 1736       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1736#0 length = 612 sequences # 2  

consensusID : consensus_1736#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 612
fasta sequence
                              [TCATATTTAATGGTTGTTTAGTTAAAAAAAAAATTACATGTTCTGCCAAATGTTTATACATATCAGTTTGTATACTTTTTGGTGCAGATAATATAATTGGTTTTCCACTATTACAACTATTCATAATAAGTTCTGATAAAGGAAAAGTTTGTAAAATTTGCACACCAAGTTCTTCTGCAATCATTCGAGTTCCATCATTATAAAGAATTATTTCATTATTGCATTGTGGGCATATAACACTGCTCATATTTTCCACAATTCCAATAATTGGAATATTTAGATGTTTAAATATGTTAGCTCCTCTTCTAGTCACTTCTAAAGCTGTTGTTTGAGGTGTAGTTATTAATAATACACCAGCAACTGGAAGATTTTGTACAATTGAAAGATGTGTGTCTCCTGTTCCGGGTGGGGTATCTACGACAAGATAATCCAACGGACCCCATGCTACTTGATATAATAACTTATCAATAGCATTCATTACCATTAATCCTCTCCAAATTACAGAAGACTTATTATCAATTAAAAAGCCCATAGACATGCATTTTACACCATAATTTACAAGANNTTCTATAAGATTTGCATTATTAATCATGGGATTCTGTCGTATATTCA]

[+] EMBL BI505202             [TCATATTTAATGGTTGTTTAGTTAAAAAAAAAATTACATGTTCTGCCAAATGTTTATACATATCAGTTTGTATACTTTTTGGTGCAGATAATATAATTGGTTTTCCACTATTACAACTATTCATAATAAGTTCTGATAAAGGAAAAGTTTGTAAAATTTGCACACCAAGTTCTTCTGCAATCATTCGAGTTCCATCATTATAAAGAATTATTTCATTATTGCATTGTGGGCATATAACACTGCTCATATTTTCCACAATTCCAATAATTGGAATATTTAGATGTTTAAATATGTTAGCTCCTCTTCTAGTCACTTCTAAAGCTGTTGTTTGAGGTGTAGTTATTAATAATACACCAGCAACTGGAAGATTTTGTACAATTGAAAGATGTGTGTCTCCTGTTCCGGGTGGGGTATCTACGACAAGATAATCCAACGGACCCCATGCTACTTGATATAATAACTTATCAATAGCATTCATTACCATTAATCCTCTCCAAATTACAGAAGACTTATTATCAATTAAAAAGCCCATAGACATGCATTTTACACCATAATTTACAAGAGGTTCTATAAGATTTGCATTATTAATCATGGGATTCTGTCGTA      ]
[+] EMBL BI510258             [                             AAAATTACATGTTCTGCCAAATGTTTATACATATCAGTTTGTATACTTTTTGGTGCAGATAATATAATTGGTTTTCCACTATTACAACTATTCATAATAAGTTCTGATAAAGGAAAAGTTTGTAAAATTTGCACACCAAGTTCTTCTGCAATCATTCGAGTTCCATCATTATAAAGAATTATTTCATTATTGCATTGTGGGCATATAACACTGCTCATATTTTCCACAATTCCAATAATTGGAATATTTAGATGTTTAAATATGTTAGCTCCTCTTCTAGTCACTTCTAAAGCTGTTGTTTGAGGTGTAGTTATTAATAATACACCAGCAACTGGAAGATTTTGTACAATTGAAAGATGTGTGTCTCCTGTTCCGGGTGGGGTATCTACGACAAGATAATCCAACGGACCCCATGCTACTTGATATAATAACTTATCAATAGCATTCATTACCATTAATCCTCTCCAAATTACAGAAGACTTATTATCAATTAAAAAGCCCATAGACATGCATTTTACACCATAATTTACAAGANNTTCTATAAGATTTGCATTATTAATCATGGGATTCTGTCGTATATTCA]


>consensus_1736#0 TCATATTTAATGGTTGTTTAGTTAAAAAAAAAATTACATGTTCTGCCAAATGTTTATACA TATCAGTTTGTATACTTTTTGGTGCAGATAATATAATTGGTTTTCCACTATTACAACTAT TCATAATAAGTTCTGATAAAGGAAAAGTTTGTAAAATTTGCACACCAAGTTCTTCTGCAA TCATTCGAGTTCCATCATTATAAAGAATTATTTCATTATTGCATTGTGGGCATATAACAC TGCTCATATTTTCCACAATTCCAATAATTGGAATATTTAGATGTTTAAATATGTTAGCTC CTCTTCTAGTCACTTCTAAAGCTGTTGTTTGAGGTGTAGTTATTAATAATACACCAGCAA CTGGAAGATTTTGTACAATTGAAAGATGTGTGTCTCCTGTTCCGGGTGGGGTATCTACGA CAAGATAATCCAACGGACCCCATGCTACTTGATATAATAACTTATCAATAGCATTCATTA CCATTAATCCTCTCCAAATTACAGAAGACTTATTATCAATTAAAAAGCCCATAGACATGC ATTTTACACCATAATTTACAAGANNTTCTATAAGATTTGCATTATTAATCATGGGATTCT GTCGTATATTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)