Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1781 cluster # 1781       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1781#0 length = 927 sequences # 2  

consensusID : consensus_1781#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 927
fasta sequence
                              [TTCTCTGTAGATCTGTAGATCGCTGTGTCATTCGCTCCGGTACTAGGTAACCGGAAATAGGAAAGCCTATTTTTGCATTGCGTGATTAAAGGCAGAAAACGTGTTTAGAATCAATTCCCATTCAACTGATATCTATTCGGATGAAGTCTTATGTAAGACTGATGGGACGATGCAAGGACGATTCGCGGGATGTTCTGCCATTTTGTGTTTCCATTATTGATGCTCGCGTGATCAAATTATTTGAAATTATTTTCACTTTAATCGCGTTCCGTTATTTCTTTTATTTCTACTTTCCTATATTACGTAACGTAATATACATAAGATTGATGAAATAGAATCAAAAATAGATAGATTAAAATAAATAATCTATTCAATGAATCTATCGTTGAGTATGGTTTACTTTATATATAATTTATTAATATTGCAATTAACACTTTTCTAATAAGCGTGAATGCAACATTAACATGTTGATATATTATATAGTTTATCAGATTATTTTAATAATTTAAAAAAATTTCAGTTTTATTAATTAAGAATCTTGAAATCAAAAACTAAGAAAAGGAAAAAATCAAAGTAATAATATTAACAGAATTTTGAACGTATTTTAAGAAAAAGTGCTAAATTCCACTAATATTATTTATAAAACAATTTATCAGAAATATATGCATCTTAAAATAATTAATAAAACAAGTAATTCTATTGTAAAATTTCCTCATAATGATTATCGACCTCGTAACAATTGATATCCAATGCAAAATAGCAAAGAACATCGAGCAATTGAACTTGAATCGTCTTGATATTGTAACGATATTGCTTCGATCGCGTTTGTAAGAGCACACTTAATCAAAAGTCATTACTTTCATTTATAAAATTAAAACGCTCGAATCACTCGAATTTCAAAAACTTTTCAAATCAATTCCCATAAAA]

[+] EMBL BI514791             [TTCTCTGTAGATCTGTAGATCGCTGTGTCATTCGCTCCGGTACTAGGTAACCGGAAATAGGAAAGCCTATTTTTGCATTGCGTGATTAAAGGCAGAAAACGTGTTTAGAATCAATTCCCATTCAACTGATATCTATTCGGATGAAGTCTTATGTAAGACTGATGGGACGATGCAAGGACGATTCGCGGGATGTTCTGCCATTTTGTGTTTCCATTATTGATGCTCGCGTGATCAAATTATTTGAAATTATTTTCACTTTAATCGCGTTCCGTTATTTCTTTTATTTCTACTTTCCTATATTACGTAACGTAATATACATAAGATTGATGAAATAGAATCAAAAATAGATAGATTAAAATAAATAATCTATTCAATGAATCTATCGTTGAGTATGGTTTATTTTATATATAATTTATTAATATTGCAATTAACACTTTTCTAATAAGCGTGAATGCAACATTAACATGTTGATATATTATATAGTTTATCAGATTATTTTAATAATTTAAAAAAATTTCAGTTTTATTAATTAAGAATCTTGAAATCAAAAACTAAAAAAAa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI509439             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CCTATATTACGTAACGTAATATACATAAGATTGATGAAATAGAATCAAAAATAGATAGATTAATATAAATAATCTATTCAATGAATCTATTGTTAAGTATGGTTTACTTTATATATAATTTATTAATATTGCAATTAACACTTTTCTAATAAGCATGAATGCAACATTAACATGTTGATATATTATATAGTTTATCAGATTATTTTAATAATTTAAAAAAATTTCAGTTTTATTAATTAAGAATCTTGAAATCAAAAACTAAGAAAAGGAAAAAATCAAAGTAATAATATTAACAGAATTTTGAACGTATTTTAAGAAAAAGTGCTAAATTCCACTAATATTATTTATAAAACAATTTATCAGAAATATATGCATCTTAAAATAATTAATAAAACAAGTAATTCTATTGTAAAATTTCCTCATAATGATTATCGACCTCGTAACAATTGATATCCAATGCAAAATAGCAAAGAACATCGAGCAATTGAACTTGAATCGTCTTGATATTGTAACGATATTGCTTCGATCGCGTTTGTAAGAGCACACTTAATCAAAAGTCATTACTTTCATTTATAAAATTAAAACGCTCGAATCACTCGAATTTCAAAAACTTTTCAAATCAATTCCCATAAAA]


>consensus_1781#0 TTCTCTGTAGATCTGTAGATCGCTGTGTCATTCGCTCCGGTACTAGGTAACCGGAAATAG GAAAGCCTATTTTTGCATTGCGTGATTAAAGGCAGAAAACGTGTTTAGAATCAATTCCCA TTCAACTGATATCTATTCGGATGAAGTCTTATGTAAGACTGATGGGACGATGCAAGGACG ATTCGCGGGATGTTCTGCCATTTTGTGTTTCCATTATTGATGCTCGCGTGATCAAATTAT TTGAAATTATTTTCACTTTAATCGCGTTCCGTTATTTCTTTTATTTCTACTTTCCTATAT TACGTAACGTAATATACATAAGATTGATGAAATAGAATCAAAAATAGATAGATTAAAATA AATAATCTATTCAATGAATCTATCGTTGAGTATGGTTTACTTTATATATAATTTATTAAT ATTGCAATTAACACTTTTCTAATAAGCGTGAATGCAACATTAACATGTTGATATATTATA TAGTTTATCAGATTATTTTAATAATTTAAAAAAATTTCAGTTTTATTAATTAAGAATCTT GAAATCAAAAACTAAGAAAAGGAAAAAATCAAAGTAATAATATTAACAGAATTTTGAACG TATTTTAAGAAAAAGTGCTAAATTCCACTAATATTATTTATAAAACAATTTATCAGAAAT ATATGCATCTTAAAATAATTAATAAAACAAGTAATTCTATTGTAAAATTTCCTCATAATG ATTATCGACCTCGTAACAATTGATATCCAATGCAAAATAGCAAAGAACATCGAGCAATTG AACTTGAATCGTCTTGATATTGTAACGATATTGCTTCGATCGCGTTTGTAAGAGCACACT TAATCAAAAGTCATTACTTTCATTTATAAAATTAAAACGCTCGAATCACTCGAATTTCAA AAACTTTTCAAATCAATTCCCATAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)