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Apis mellifera
cluster # 1817 cluster # 1817       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1817#0 length = 549 sequences # 2  

consensusID : consensus_1817#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 549
fasta sequence
                              [TTTCTTTCATTATTAATATATAATAAAATATACATTATATAATTATAATTACACATAATAGTGTAATAAATACACATTAATAGTGTATTAAGTTATACACATTAATACTTTCGTATGAATATTATAAGTTATAGATTTTCAATTATATGTAGAAATAAATATTAATGTTTACAAATATAGTTATTTGTTGCATTATTTATCATCAGTTCAAAAGAATTAAACTAGTTATATTAATATATTTTTTAAGCTTCCTTTTGTCATTAATTAACTCAGAAAAGAAACTAAAATGTTTATAATAAATATTTTACTTTGATTAGACATCATTTGTTATCTATTTATCATTTTTTATATTCAAGTAAAACTATTTCGTAACGAGTGAGAAACTTATACCGTACAGGGTTATCGTTAAAAATCTTGAATACGTTTTAAACCACAGTGCTCTTGATTTTCGACTGACACATTCAACGATTATCACCAAGCTACGAAAGGAACGGATTCGCTG-AGTAGTTGTATTCGCTGCCCAAGGATCTTGTCGAATCTGATTAATTG]

[+] EMBL BI514399             [TTTCTTTCATTATTAATATATAATAAAATATACATTATATAATTATAATTACACATAATAGTGTAATAAATACACATTAATAGTGTATTAAGTTATACACATTAATACTTTCGTATGAATATTATAAGTTATAGATTTTCAATTATATGTAGAAATAAATATTAATGTTTACAAATATAGTTATTTGTTGCATTATTTATCATCAGTTCAAAAGAATTAAACTAGTTATATTAATATATTTTTTAAGCTTCCTTTTGTCATTAATTAACTCAGAAAAGAAACTAAAATGTTTATAATAAATATTTTACTTTGATTAGACATCATTTGTTATCTATTTATCATTTTTTATATTCAAGTAAAACTATTTCGTAACGAGTGAGAAACTTATACCGTACAGGGTTATCGTTAAAAATCTTGAATACGTTTTAAACCACAGTGCTCTTGATTTTCGACTGACACATTCAACGATTATCACCAAGCTACGAAAGGAACGGATTCGCTGTAGTAGTTGTATTCGCTGCCCAAGGATCTTG                 ]
[+] EMBL BI511873             [                                                                                                                                                 TATGTAGAAATAAATATTAATGTTTACAAATATAGTTATTTGTTGCATTATTTATCATCAGTTCAAAAGAATTAAACTAGTTATATTAATATATTTTTTAAGCTTCCTTTTGTCATTAATTAACTCAGAAAAGAAACTAAAATGTTTATAATAAATATTTTACTTTGATTAGACATCATTTGTTATCTATTTATCATTTTTTATATTCAAGTAAAACTATTTCGTAACGAGTGAGAAACTTATACCGTACAGGGTTATCGTTAAAAATCTTGAATACGTTTTAAACCACAGTGCTCTTGATTTTCGACTGACACATTCAACGATTATCACCAAGCTACGAAAGGAACGGATTCGCT   GTAGTTGTATTCGCTGCCCAAGGATCTTGTCGAATCTGATTAATTG]


>consensus_1817#0 TTTCTTTCATTATTAATATATAATAAAATATACATTATATAATTATAATTACACATAATA GTGTAATAAATACACATTAATAGTGTATTAAGTTATACACATTAATACTTTCGTATGAAT ATTATAAGTTATAGATTTTCAATTATATGTAGAAATAAATATTAATGTTTACAAATATAG TTATTTGTTGCATTATTTATCATCAGTTCAAAAGAATTAAACTAGTTATATTAATATATT TTTTAAGCTTCCTTTTGTCATTAATTAACTCAGAAAAGAAACTAAAATGTTTATAATAAA TATTTTACTTTGATTAGACATCATTTGTTATCTATTTATCATTTTTTATATTCAAGTAAA ACTATTTCGTAACGAGTGAGAAACTTATACCGTACAGGGTTATCGTTAAAAATCTTGAAT ACGTTTTAAACCACAGTGCTCTTGATTTTCGACTGACACATTCAACGATTATCACCAAGC TACGAAAGGAACGGATTCGCTGAGTAGTTGTATTCGCTGCCCAAGGATCTTGTCGAATCT GATTAATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)