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Apis mellifera
cluster # 1873 cluster # 1873       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1873#0 length = 814 sequences # 2  

consensusID : consensus_1873#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 814
fasta sequence
                              [TTATTTGAAATTATTGTCTGTTTTGTCAAAGTGTATGTCAATGATAATTGTAAGCCATTCCTCGAGTTAGCCATAAGCTAATTGAAAATAAAATGTACAATTCGATGATTAGAAATTTTGACGTGGTACCTGATCTGTTTGACCAACCGTGTATAACTACATTGCGATTGTTTCTCATACGTATCTATTCTGCAGAATTTCTAGGTATTTCATAAGTTAATAATATATCCTATAATTTCTAACAACAATTCATATTACAATATTCTCCTTATGCAATACCTAGAATACATTGAATTGTACATTTTATTTTGTTAATATGCAATAATTTAATTAAATCGATGTACGTATTAATATACAATATATAAGATTAAGAATTTGATGCTTTTATCAGACTGGTTTTAGAATCTTCCGCGCGGGCAAGTTTTTCGAGAAGATTTTTAAAAGGAGTTNNTTAATTATCTCGTTATATCGAAGAATTGTCAATGAATTCTGCTTTTCTATATTTTCATAGTTTATAAAATAGTAGTGAATAAAACAAAAAAAAAAAAAGAGAGAAAAGAAAAAATTAAGATCAACGAAAATGAAAAAGCTAGAAAATAAAAGAGAAATTTTAAAATTTTTAATAAAAATTCAATTATTGATGAAATTAAAATGAAAATTACACTATACTATCGAAATTCTTGCTTGCTCCGATACTTTACGAGAAGTTTTATGAGGAACATTATTTCTTCGACGGCAAGTAAACATTGTACTTTTATAAATATGAATGTACTTATATTTTGTACTGACAGTACCTTGCAAAAGTATACATGTA]

[+] EMBL BI514796             [TTATTTGAAATTATTGTCTGTTTTGTCAAAGTGTATGTCAATGATAATTGTAAGCCATTCCTCGAGTTAGCCATAAGCTAATTGAAAATAAAATGTACAATTCGATGATTAGAAATTTTGACGTGGTACCTGATCTGTTTGACCAACCGTGTATAACTACATTGCGATTGTTTCTCATACGTATCTATTCTGCAGAATTTCTAGGTATTTCATAAGTTAATAATATATCCTATAATTTCTAACAACAATTCATATTACAATATTCTCCTTATGCAATACCTAGAATACATTGAATTGTACATTTTATTTTGTTAATATGCAATAATTTAATTAAATCGATGTACGTATTAATATACAATATATAAGATTAAGAATTTGATGCTTTTATCAGACTGGTTTTAGAATCTTCCGCGCGGGCAAGTTTTTCGAGAAGATTTTTAAAAGGAGTTNNTTAATTATCTCGTTATATCGAAGAATTGTCAATGAATTCTGCTTTTCTATATTTTCATAGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI509186             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTTTAATATGCAATAATTTAATTAAATCGATGTACGTATTAATATACAATATATAAGATTAAGAATTTGATGCTTTTATCAGACTGGTTTTAGAATCTTCCGCGCGGGCAAGTTTTTCGAGAAGATTTTTAAAAGGAGTTGTTTAATTATCTCGTTATATCGAAGAATTGTCAATGAATTCTGCTTTTCTATATTTTCATAGTTTATAAAATAGTAGTGAATAAAACAAAAAAAAAAAAAGAGAGAAAAGAAAAAATTAAGATCAACGAAAATGAAAAAGCTAGAAAATAAAAGAGAAATTTTAAAATTTTTAATAAAAATTCAATTATTGATGAAATTAAAATGAAAATTACACTATACTATCGAAATTCTTGCTTGCTCCGATACTTTACGAGAAGTTTTATGAGGAACATTATTTCTTCGACGGCAAGTAAACATTGTACTTTTATAAATATGAATGTACTTATATTTTGTACTGACAGTACCTTGCAAAAGTATACATGTA]


>consensus_1873#0 TTATTTGAAATTATTGTCTGTTTTGTCAAAGTGTATGTCAATGATAATTGTAAGCCATTC CTCGAGTTAGCCATAAGCTAATTGAAAATAAAATGTACAATTCGATGATTAGAAATTTTG ACGTGGTACCTGATCTGTTTGACCAACCGTGTATAACTACATTGCGATTGTTTCTCATAC GTATCTATTCTGCAGAATTTCTAGGTATTTCATAAGTTAATAATATATCCTATAATTTCT AACAACAATTCATATTACAATATTCTCCTTATGCAATACCTAGAATACATTGAATTGTAC ATTTTATTTTGTTAATATGCAATAATTTAATTAAATCGATGTACGTATTAATATACAATA TATAAGATTAAGAATTTGATGCTTTTATCAGACTGGTTTTAGAATCTTCCGCGCGGGCAA GTTTTTCGAGAAGATTTTTAAAAGGAGTTNNTTAATTATCTCGTTATATCGAAGAATTGT CAATGAATTCTGCTTTTCTATATTTTCATAGTTTATAAAATAGTAGTGAATAAAACAAAA AAAAAAAAAGAGAGAAAAGAAAAAATTAAGATCAACGAAAATGAAAAAGCTAGAAAATAA AAGAGAAATTTTAAAATTTTTAATAAAAATTCAATTATTGATGAAATTAAAATGAAAATT ACACTATACTATCGAAATTCTTGCTTGCTCCGATACTTTACGAGAAGTTTTATGAGGAAC ATTATTTCTTCGACGGCAAGTAAACATTGTACTTTTATAAATATGAATGTACTTATATTT TGTACTGACAGTACCTTGCAAAAGTATACATGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)