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Apis mellifera
cluster # 1885 cluster # 1885       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1885#0 length = 836 sequences # 2  

consensusID : consensus_1885#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 836
fasta sequence
                              [TATGCTTCAAAATTGCTCTTTATTTATATTATATTATTTATATTAAATGTTATATTTAGATTTGGTAAAACTTTTGGTGCTGATACTAAAGATGCAAAAAGGTGGCTTCGTGCTGATTTCTCTCCAATATGATATATAATGAAATAGTTCTAAATGAAAAATATTTAATAGTACGATAAAAAAAATAACAATGGTTTTACTAATTTTATTCGTGATGTAAACTTATGTAAAGTTATGTATTGTATTTGATAATAAAATTGAAAAAAAATTTTTAATACAATCTTAAATGTATATGTGGTATGAAATTGTAGTAAACTAATGATTACTAATTAAAATCCCTTTTAATCCCAAAAAAAGAAACAAAAGAAAATATGAATAGTATTATTCATATTATTCTTGAGATTTCCATTTCATTAAAATTTCAGCTGCTTTCTTCAAATTTTCATCTTTTTTTATAAAACAGTATCGCACATTATCTTCACCTAAATATTTATGTTCGGAACTGTAAAAAGCAGNTGGCGGAATTCCTTGAACACCAACGTTTTTCGTCATCCATTTTGTAAAACGATAATCTCTATGCTCATCCGTTTCTTCTTCTAAATTAACTTTGTCTTTTAAAGCTGTCCAATTAGCTATCATAAAGTATCCACCTTCGGGAATTGTTGGAGACATTCCTACATCGCTAAGAAATTTAGCCATATAATCTCGTTTTGATGTTAATTCTTTAGCTAAACTAACAAAATAACAATCAGGTTGATCGAATCTTTCTAATTCTTGTTCGAATCCAATAGCTACAGCTTCTTGAATCGGTGTATTACATGTATATACACTATTTT]

[+] EMBL BI508952             [TATGCTTCAAAATTGCTCTTTATTTATATTATATTATTTATATTAAATGTTATATTTAGATTTGGTAAAACTTTTGGTGCTGATACTAAAGATGCAAAAAGGTGGCTTCGTGCTGATTTCTCTCCAATATGATATATAATGAAATAGTTCTAAATGAAAAATATTTAATAGTACGATAAAAAAAATAACAATGGTTTTACTAATTTTATTCGTGATGTAAACTTATGTAAAGTTATGTATTGTATTTGATAATAAAATTGAAAAAAAATTTTTAATACAATCTTAAATGTATATGTGGTATGAAATTGTAGTAAACTAATGATTACTAATTAAAATCCCTTTTAATCCCAAAAAAAGAAACAAAAGAAAATATGAATAGTATTATTCATATTATTCTTGAGATTTCCATTTCATTAAAATTTCAGCTGCTTTCTTCAAATTTTCATCTTTTTTTATAAAACAGTATCGCACATTATCTTCACCTAAATATTTATGTTCGGAACTGTAAAAAGCAGNTGGCGGAATTCCTTGAACACCAACGTTTTTCGTCATCCATTTTGTAAAACGAT                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL BI508567             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGTATGAAATTGTAGTAAATTAATGATTACTAATTAAAATCCCTTTTAATCCC AAAAAAGAAACAAAAGAAAATATGAATAGTATTATTCATATTATTCTTGAGATTTCCATTTCATTAAAATTTCAGCTGCTTTCTTCAAATTTTCATCTTTTTTTATAAAACAGTATCGCACATTATCTTCACCTAAATATTTATGTTCGGAACTGTAAAAAGCAGATGGCGGAATTCCTTGAACACCAACGTTTTTCGTCATCCATTTTGTAAAACGATAATCTCTATGCTCATCCGTTTCTTCTTCTAAATTAACTTTGTCTTTTAAAGCTGTCCAATTAGCTATCATAAAGTATCCACCTTCGGGAATTGTTGGAGACATTCCTACATCGCTAAGAAATTTAGCCATATAATCTCGTTTTGATGTTAATTCTTTAGCTAAACTAACAAAATAACAATCAGGTTGATCGAATCTTTCTAATTCTTGTTCGAATCCAATAGCTACAGCTTCTTGAATCGGTGTATTACATGTATATACACTATTTT]


>consensus_1885#0 TATGCTTCAAAATTGCTCTTTATTTATATTATATTATTTATATTAAATGTTATATTTAGA TTTGGTAAAACTTTTGGTGCTGATACTAAAGATGCAAAAAGGTGGCTTCGTGCTGATTTC TCTCCAATATGATATATAATGAAATAGTTCTAAATGAAAAATATTTAATAGTACGATAAA AAAAATAACAATGGTTTTACTAATTTTATTCGTGATGTAAACTTATGTAAAGTTATGTAT TGTATTTGATAATAAAATTGAAAAAAAATTTTTAATACAATCTTAAATGTATATGTGGTA TGAAATTGTAGTAAACTAATGATTACTAATTAAAATCCCTTTTAATCCCAAAAAAAGAAA CAAAAGAAAATATGAATAGTATTATTCATATTATTCTTGAGATTTCCATTTCATTAAAAT TTCAGCTGCTTTCTTCAAATTTTCATCTTTTTTTATAAAACAGTATCGCACATTATCTTC ACCTAAATATTTATGTTCGGAACTGTAAAAAGCAGNTGGCGGAATTCCTTGAACACCAAC GTTTTTCGTCATCCATTTTGTAAAACGATAATCTCTATGCTCATCCGTTTCTTCTTCTAA ATTAACTTTGTCTTTTAAAGCTGTCCAATTAGCTATCATAAAGTATCCACCTTCGGGAAT TGTTGGAGACATTCCTACATCGCTAAGAAATTTAGCCATATAATCTCGTTTTGATGTTAA TTCTTTAGCTAAACTAACAAAATAACAATCAGGTTGATCGAATCTTTCTAATTCTTGTTC GAATCCAATAGCTACAGCTTCTTGAATCGGTGTATTACATGTATATACACTATTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)