Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 2003 cluster # 2003       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2003#0 length = 739 sequences # 2  
consensusID : consensus_2003#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 739
fasta sequence 
                              [ATTAATTTCGAAGCTTTCTGGTGATATAAACAATTATGTTGTAACGAAGATTTTCTTCAGTGAAATCGCATATGTATTATGTCCTCGTTCGAAGAGTGCTCGTTTTTTTGTTGCGCATGCGCCGATCGCGCACTCTGTGATTTTGAAAAGTTTATATGCGCCAAGCAGAATAACGTACACGTATAAATTGAGAACATCAATTTTTTATCGTGTTATGATTGCTAAGGCACGCACGACCATGAAACATAGAAATCACGATGGATCTCTTACGATATTACGCTTTATTTTTTATTGTGTCTATATGAATGTCCGATGTACCTTGATATTTCATAATCCAATCGAAGTTATTATTCGAAGACGAAAAGAATTAGAGCAATTTTATTAGAAGTTGAATTTGATTAAACGAATTAATAAGAAGTTATAAAAATATAGATAACATTAATATCAGATGCATTTATTATAGAAATTTATAGATATAAATAATATATAAGAAACTTATAAGTTTCAGATCGATTAAAATATTTGATTAAATTTTTATATGAAGAATAAGAATTAATGGAGGATTCATTATGAATGGAGTAACGCAAATATAAATACGAGTGGAATATTATTCTATTAAAATTATATTTAAAGTTATAAAAATCTAGATAGTATACAATAATTAACCAAAAATTTTTCATCACTTTATCAAATTCTCTTTTATAATGGTATAGAAATTAAGTGCATACTTAATGTGCGA]

[+] EMBL BI504387             [ATTAATTTCGAAGCTTTCTGGTGATATAAACAATTATGTTGTAACGAAGATTTTCTTCAGTGAAATCGCATATGTATTATGTCCTCGTTCGAAGAGTGCTCGTTTTTTTGTTGCGCATGCGCCGATCGCGCACTCTGTGATTTTGAAAAGTTTATATGCGCCAAGCAGAATAACGTACACGTATAAATTGAGAACATCAATTTTTTATCGTGTTATGATTGCTAAGGCACGCACGACCATGAAACATAGAAATCACGATGGATCTCTTACGATATTACGCTTTATTTTTTATTGTGTCTATATGAATGTCCGATGTACCTTGATATTTCATAATCCAATCGAAGTTATTATTCGAAGACGAAAAGAATTAGAGCAATTTTATTAGAAGTTGAATTTGATTAAACGAATTAATAAGAAGTTATAAAAATATAGATAACATTAATATCAGATGCATTTATTATAGAAATTTATAGA                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL BI510796             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          TATTTTTTATTGTGTCTATATGAATGTCCGATGTACCTTGATATTTCATAATCCAATCGAAGTTATTATTCGAAGACGAAAAGAATTAGAGCAATTTTATTAGAAGTTGAATTTGATTAAACGAATTAATAAGAAGTTATAAAAATATAGATAACATTAATATCAGATGCATTTATTATAGAAATTTATAGATATAAATAATATATAAGAAACTTATAAGTTTCAGATCGATTAAAATATTTGATTAAATTTTTATATGAAGAATAAGAATTAATGGAGGATTCATTATGAATGGAGTAACGCAAATATAAATACGAGTGGAATATTATTCTATTAAAATTATATTTAAAGTTATAAAAATCTAGATAGTATACAATAATTAACCAAAAATTTTTCATCACTTTATCAAATTCTCTTTTATAATGGTATAGAAATTAAGTGCATACTTAATGTGCGA]




>consensus_2003#0
ATTAATTTCGAAGCTTTCTGGTGATATAAACAATTATGTTGTAACGAAGATTTTCTTCAG
TGAAATCGCATATGTATTATGTCCTCGTTCGAAGAGTGCTCGTTTTTTTGTTGCGCATGC
GCCGATCGCGCACTCTGTGATTTTGAAAAGTTTATATGCGCCAAGCAGAATAACGTACAC
GTATAAATTGAGAACATCAATTTTTTATCGTGTTATGATTGCTAAGGCACGCACGACCAT
GAAACATAGAAATCACGATGGATCTCTTACGATATTACGCTTTATTTTTTATTGTGTCTA
TATGAATGTCCGATGTACCTTGATATTTCATAATCCAATCGAAGTTATTATTCGAAGACG
AAAAGAATTAGAGCAATTTTATTAGAAGTTGAATTTGATTAAACGAATTAATAAGAAGTT
ATAAAAATATAGATAACATTAATATCAGATGCATTTATTATAGAAATTTATAGATATAAA
TAATATATAAGAAACTTATAAGTTTCAGATCGATTAAAATATTTGATTAAATTTTTATAT
GAAGAATAAGAATTAATGGAGGATTCATTATGAATGGAGTAACGCAAATATAAATACGAG
TGGAATATTATTCTATTAAAATTATATTTAAAGTTATAAAAATCTAGATAGTATACAATA
ATTAACCAAAAATTTTTCATCACTTTATCAAATTCTCTTTTATAATGGTATAGAAATTAA
GTGCATACTTAATGTGCGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)