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consensusID : consensus_201#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 735 fasta sequence
[CTTTCTTTTCTTCTTCTTTTTCACGCGGCGACCGATCGATGCAGAAGTCTTTCTCTAGCCGAATGTTCAGTATAATAATGCCCGAATCTCCTCTTTTTTTTGTTTTCCTCAATCATCGTATTGAATGACGTCGGTTTACAAATAC-TTTTTAATTAATTTTACAAATATGTATTTTACTGCAGGAATTTCCATCACCCGTTTTAATTTATAACCCATCGTTTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTCCTCCCCTCTCTATCCTCTCTTCCCGCTTTCGCCTCTCTCTCTTTCCCTTCCTCCCTCTCTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTTCCTCCCCTTCACTTTCCCGTTCCCTCGCCTTTAGACAATGCTATTAATCGAAAGTTAAGCCTAAAAAGTGGACGCCTGAAGTAAAGTCGGATGAGGAGATGACAGGGGCCTATGGTATCTGTTGCCTGTTGGAATCGAAAAACCAAGT-GGCGGAGTTCCCGTAAACGAGACGAGTTATATGCAGAACGGATACGTCGATGGTAACGAAACATAACCGGACACACTTGGAAAAGTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAATTATTTATTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATTATTATTCACATTAGTATTAATATCATCGTTATTATCGTTAATCAATGATTGACGATCACTTATTTTTGAGTCCTCGCCCGGAGCCATATTGAGAATAAAAAAAA]
[+] EMBL BI504434 [CTTTCTTTTCTTCTTCTTTTTCACGCGGCGACCGATCGATGCAGAAGTCTTTCTCTAGCCGAATGTTCAGTATAATAATGCCCGAATCTCCTCTTTTTTTTGTTTTCCTCAATCATCGTATTGAATGACGTCGGTTTACAAATAC TTTTTAATTAATTTTACAAATATGTATTTTACTGCAGGAATTTCCATCACCCGTTTTAATTTATAACCCATCG TTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTCCTCCCCTCTCTATCCTCTCTTCCCGCTTTCGCCTCTCTCTCTTTCCCTTCCTCCCTCTCTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTTCCTCCCC CTCTTTCCCGTTCCCTCGCCTTTAGACAATGCTATTAATCGAAAGTTAAGCCTAAAAAGTGGACGCCTGAAGTAAAGTCGGATGAGGAGATGACAGGGGCCTATGGTATCTGTTGCCTGTTGGAATCGAAAAACCAAGT GGCGGAGTTCCCGTAAACGAGACGAGTTATATGCAGAACGGATACGTCGATGGTAACGAAACATAACCGGACACACTTGGAAAAGTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAATTAATTAT ]
[+] EMBL BI505691 [ TTTCTTCTTCTTTTTCACGCGGCGACCGATCGATGCAGAAGTCTTTCTCTAGCCGAATGTTCAGTATAATAATGCCCGAATCTCCTCTTTTTTTTGTTTTCCTCAATCATCGTATTGAATGACGTCGGTTTACAAATAC TTTTTAATTAATTTTACAAATATGTATTTTACTGCAGGAATTTCCATCACCCGTTTTAATTTATAACCCATCGTTTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTCCTCCCCTCTCTATCCTCTCTTCCCGCTTTCGCCTCTCTCTCTTTCCCTTCCTCCCTCTCTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTTCCTCCCCTTCACTTTCCCGTTCCCTCGCCTTTAGACAATGCTATTAATCGAAAGTTAAGCCTAAAAAGTGGACGCCTGAAGTAAAGTCGGATGAGGAGATGACAGGGGCCTATGGTATCTGTTGCCTGTTGGAATCGAAAAACCAAGTNNNCGGAGTTCCCGTAAACGAGACGAGTTATATGCAGAACGGATACGTCGATGGTAACGAAACATAACCGGACACACTTGGAAAAGTATTTATTTATTTATT ]
[+] EMBL BI505889 [ GCAGAAGTCTTTCTCTAGCCGAATGTTCAGTATAATAATGCCCGAATCTCCTCTTTTTTTTGTTTTCCTCAATCATCGTATTGAATGACGTCGGTTTACAAATACTTTTTTAATTAATTTTACAAATATGTATTTTACTGCAGGAATTTCCATCACCCGTTTTAATTTATAACCCATCGTTTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTCCTCCCCCCTCTATCCTCTCTTCCCGCTTTCGCCTCTCTCTC TCTCTCCCTCCCTCTCTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTTCCTCCCCTTCACTTTCCCGTTCCCTCGCCTTTAGACAATGCTATTAATCGAAAGTTAAGCCTAAAAAGTGGACGCCTGAAGTAAAGTCGGATGAGGAGATGACAGGGGCCTATGGTATCTGTTGCCTGTTGGAATCGAAAAACCAAGT GGCGGAGTTCCCGTAAACGAGACGAGTTATATGCAGAACGGATACGTCGATGGTAACGAAACATAACCGGACACACTTAGNAAAGTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAATTAT ]
[+] EMBL BI516015 [ GCAGAAGTCTTTCTCTAGCCGAATGTTCAGTATAATAATGCCCGAATCTCCTCTTTTTTTTGTTTTCCTCAATCATCGTATTGAATGACGTCGGGTTACAAATAC TTTTTAATTAATTTTACAAATATGTATTTTACTGCAGGAATTTCCATCACCCGTTTTAATTTATAACCCATC NNNTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTCCTCCCCTCTCTATCCTCTCTTCCCGCTTTCGCCTCTCTCTCTTTCCCTTCCTCCCTCTCTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTTCCTCCCCTTCACTTTCCCGTTCCCTCGCCTTTAGACAATGCTATTAATCGAAAGTTAAGCCTAAAAAGTGGACGCCTGAAGTAAAGTCGGATGAGGAGATGACAGGGGCCTATGGTATCTGTTGCCTGTTGGAATCGAAAAACCAAGT GGCGGAGTTCCCGTAAACGAGACGAGTTATATGCAGAACGGATACGTCGATGGTAA ]
[+] EMBL BI505945 [ AGACAATGCTATTAATCGAAAGTTAAGCCTAAAAAGTGGACGCCTGAAGTAAAGTCGGATGAGGAGATGACAGGGGCCTATGGTATCTGTTGCCTGTTGGAATCGAAAAACCAAGT GGCGGAGTTCCCGTAAACGAGACGAGTTATATGCAGAACGGATACGTCGATGGTAACGAAACATAACCGGACACACTTGGAAAAGTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAATTATTTATTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATTATTATTCACATTAGTATTAATATCATCGTTATTATCGTTAATCAATGATTGACGATCACTTATTTTTGAGTCCTCGCCCGGAGCCATATTGAGAATAAAAAAAA]
consensusID : consensus_201#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 465 fasta sequence
[TCCCGCTTTCGCCTCTCTCTCTTTCCCTTCCTCCCTCTCTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTTCCTCCCCTTCACTTTCCCGTTCCCTCGCCTTTAGACAATGCTATTAATCGAAAGTTAAGCCTAAAAAGTGGACGCCTGAAGTAAAGTCGGATGAGGAGATGACAGGGGCCTATGGTATCTGTTGCCTGTTGGAATCGAAAAACCAAGTGGCGGAGTTCCCGTAAACGAGACGAGTTATATGCAGAACGGATACGTCGATGGTAACGAAACATAACCGGACACACTTGGAAAAGTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAATTATTTATTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATTATTATTATTTCTATTATTATTATTGCTATTATTATCTATTTTTATTATTATCTATTATTATTATGATTATTATTATATTGAAAGAGGAATAAAAACTT]
[+] EMBL BI507576 [TCCCGCTTTCGCCTCTCTCTCTTTCCCTTCCTCCCTCTCTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTTCCTCCCCTTCACTTTCCCGTTCCCTCGCCTTTAGACAATGCTATTAATCGAAAGTTAAGCCTAAAAAGTGGACGCCTGAAGTAAAGTCGGATGAGGAGATGACAGGGGCCTATGGTATCTGTTGCCTGTTGGAATCGAAAAACCAAGTGGCGGAGTTCCCGTAAACGAGACGAGTTATATGCAGAACGGATACGTCGATGGTAACGAAACATAACCGGACACACTTGGAAAAGTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAATTATTTATTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATTATTATTATTTCTATTATTATTATTGCTATTATTATCTATTTTTATTATTATCTATTATTATTATGATTATTATTATATTGAAAGAGGAATAAAAACTT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_201#0 CTTTCTTTTCTTCTTCTTTTTCACGCGGCGACCGATCGATGCAGAAGTCTTTCTCTAGCC 60
consensus_201#1 ------------------------------------------------------------
consensus_201#0 GAATGTTCAGTATAATAATGCCCGAATCTCCTCTTTTTTTTGTTTTCCTCAATCATCGTA 120
consensus_201#1 ------------------------------------------------------------
consensus_201#0 TTGAATGACGTCGGTTTACAAATACTTTTTAATTAATTTTACAAATATGTATTTTACTGC 180
consensus_201#1 ------------------------------------------------------------
consensus_201#0 AGGAATTTCCATCACCCGTTTTAATTTATAACCCATCGTTTTTTTTTTTTCTTCTTTTTT 240
consensus_201#1 ------------------------------------------------------------
consensus_201#0 TTTCCTCCCCTCTCTATCCTCTCTTCCCGCTTTCGCCTCTCTCTCTTTCCCTTCCTCCCT 300
consensus_201#1 ------------------------TCCCGCTTTCGCCTCTCTCTCTTTCCCTTCCTCCCT 36
************************************
consensus_201#0 CTCTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTTCCTCCCCTTCACTTTCCCGTTCCCTCGCCTTTAGAC 360
consensus_201#1 CTCTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTTCCTCCCCTTCACTTTCCCGTTCCCTCGCCTTTAGAC 96
************************************************************
consensus_201#0 AATGCTATTAATCGAAAGTTAAGCCTAAAAAGTGGACGCCTGAAGTAAAGTCGGATGAGG 420
consensus_201#1 AATGCTATTAATCGAAAGTTAAGCCTAAAAAGTGGACGCCTGAAGTAAAGTCGGATGAGG 156
************************************************************
consensus_201#0 AGATGACAGGGGCCTATGGTATCTGTTGCCTGTTGGAATCGAAAAACCAAGTGGCGGAGT 480
consensus_201#1 AGATGACAGGGGCCTATGGTATCTGTTGCCTGTTGGAATCGAAAAACCAAGTGGCGGAGT 216
************************************************************
consensus_201#0 TCCCGTAAACGAGACGAGTTATATGCAGAACGGATACGTCGATGGTAACGAAACATAACC 540
consensus_201#1 TCCCGTAAACGAGACGAGTTATATGCAGAACGGATACGTCGATGGTAACGAAACATAACC 276
************************************************************
consensus_201#0 GGACACACTTGGAAAAGTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAATTATTTAT 600
consensus_201#1 GGACACACTTGGAAAAGTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAATTATTTAT 336
************************************************************
consensus_201#0 TATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATTATTATTCACATTAGTATTAATATCATCGT 660
consensus_201#1 TATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATTATTATT---ATTTCTATTATTATTATTGC 393
************************************* *** ***** *** ** *
consensus_201#0 TATTATCGTTAATCAATGATTGACGATCACTTATTTTTGAGTCCTCGCCCGGAGCCATAT 720
consensus_201#1 TATTATTATCTATT-----TTTATTATTATCTATTATTA---TTATGATTATTATTATAT 445
****** * ** ** * ** * **** ** * ****
consensus_201#0 TGAGAATAAAAAAAA----- 735
consensus_201#1 TGAAAGAGGAATAAAAACTT 465
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| Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |