Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 2033 cluster # 2033       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2033#0 length = 763 sequences # 2  

consensusID : consensus_2033#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 763
fasta sequence
                              [TTTTTTTATCTCCTAATCCCATTAATATTATGTTCCTATAATTATATAGTAAAATTTGTGATATTTGTAGACATGTAAAGATATTGAATGAAATTATTGAAACACATATTTGTGGATACATTAAATTTGTTTAGCATTGTCAGGAATAGTTTTTCCATAATTATGAAATAATAAAAAGCGACAAAATCATGTTTATTAGACTTATAACGTATATATTTATTTATAATTATTTTACAGTCTCACACTCTATATTTCTTGACGCAATCTCATTCATACGTTCCTACGTTCGTTCTTCCAACTTTTTTACTTTTAACTCGTATTCTCAAAAATCTCATCCACACCAGGGAAACATCGACCGATTTTAATCGTCGTCAAATACATATATATCGTACGTAAAAGAATTTCACGCCGTTTTAATACGTAAAAAAATATTTGTTTCGTAGAAATTATTGTTTAGTCGATCCTTCCCTTTGTGTGCATGCAGCTATTAGCACACAAAATATATAAGTAGCTATAGAATTAAAAATACATAATCGTCGGACCGCTCGATTTTTCGGCAGGTCAAGACATTAAACATACAAAATGAAAAAACATAACAATATAGTACGATTATAACAATAATAACAATTATGAATTTTCCAAGAAAGAAAGCACGACAGCGTTGATAATTTAATAATTCGTGCACGATTGAATCACAACTACTGTAAACTAATCGACTCGACATTCTTGTATTTACAGAAAAAACTTTGGCAATTGCTACACT]

[+] EMBL BI516632             [TTTTTTTATCTCCTAATCCCATTAATATTATGTTCCTATAATTATATAGTAAAATTTGTGATATTTGTAGACATGTAAAGATATTGAATGAAATTATTGAAACACATATTTGTGGATACATTAAATTTGTTTAGCATTGTCAGGAATAGTTTTTCCATAATTATGAAATAATAAAAAGCGACAAAATCATGTTTATTAGACTTATAACGTATATATTTATTTATAATTATTTTACAGTCTCACACTCTATATTTCTTGACGCAATCTCATTCATACGTTCCTACGTTCGTTCTTCCAACTTTTTTACTTTTAACTCGTATTCTCAAAAATCTCATCCACACCAGGGAAACATCGACCGATTTTAATCGTCGTCAAATACATATATATCGTACGTAAAAGAATTTCACGCCGTTTTAATACGTAAAAAAATATTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI504309             [                                                                                                                                                                                                                   TATATTTATTTATAATTATTTTACAGTCTCACACTCTATATTTCTTGACGCAATCTCATTCATACGTTCCTACGTTCGTTCTTCCAACTTTTTTACTTTTAACTCGTATTCTCAAAAATCTCATCCACACCAGGGAAACATCGACCGATTTTAATCGTCGTCAAATACATATATATCGTACGTAAAAGAATTTCACGCCGTTTTAATACGTAAAAAAATATTTGTTTCGTAGAAATTATTGTTTAGTCGATCCTTCCCTTTGTGTGCATGCAGCTATTAGCACACAAAATATATAAGTAGCTATAGAATTAAAAATACATAATCGTCGGACCGCTCGATTTTTCGGCAGGTCAAGACATTAAACATACAAAATGAAAAAACATAACAATATAGTACGATTATAACAATAATAACAATTATGAATTTTCCAAGAAAGAAAGCACGACAGCGTTGATAATTTAATAATTCGTGCACGATTGAATCACAACTACTGTAAACTAATCGACTCGACATTCTTGTATTTACAGAAAAAACTTTGGCAATTGCTACACT]


>consensus_2033#0 TTTTTTTATCTCCTAATCCCATTAATATTATGTTCCTATAATTATATAGTAAAATTTGTG ATATTTGTAGACATGTAAAGATATTGAATGAAATTATTGAAACACATATTTGTGGATACA TTAAATTTGTTTAGCATTGTCAGGAATAGTTTTTCCATAATTATGAAATAATAAAAAGCG ACAAAATCATGTTTATTAGACTTATAACGTATATATTTATTTATAATTATTTTACAGTCT CACACTCTATATTTCTTGACGCAATCTCATTCATACGTTCCTACGTTCGTTCTTCCAACT TTTTTACTTTTAACTCGTATTCTCAAAAATCTCATCCACACCAGGGAAACATCGACCGAT TTTAATCGTCGTCAAATACATATATATCGTACGTAAAAGAATTTCACGCCGTTTTAATAC GTAAAAAAATATTTGTTTCGTAGAAATTATTGTTTAGTCGATCCTTCCCTTTGTGTGCAT GCAGCTATTAGCACACAAAATATATAAGTAGCTATAGAATTAAAAATACATAATCGTCGG ACCGCTCGATTTTTCGGCAGGTCAAGACATTAAACATACAAAATGAAAAAACATAACAAT ATAGTACGATTATAACAATAATAACAATTATGAATTTTCCAAGAAAGAAAGCACGACAGC GTTGATAATTTAATAATTCGTGCACGATTGAATCACAACTACTGTAAACTAATCGACTCG ACATTCTTGTATTTACAGAAAAAACTTTGGCAATTGCTACACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)