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Apis mellifera
cluster # 2053 cluster # 2053       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2053#0 length = 1046 sequences # 2  

consensusID : consensus_2053#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1046
fasta sequence
                              [AAAAGGAAAAGCTAATGAAATTGCTATAAATATAGGAGGAGAAAAATTATCTAACCAAGATCATTTTGATTACTATTTATGGAATATTCAAAATAAATATTACAAAGCACAGGTATTGATATGTGTTATAGAAAATTCTTCTCAAGATATTTCAATCAATGATGTGGAAGCATTGATTGTACATCATGATCCACAGACAGAAAATGCAGATCAGAATTTAAAGGAATGGTCATCTTTGATTGCTTCTTTAGCAGAAGTAGAAGTATTACTGTTTTCTTGTAATTTTATAGTAGATACTGTTATTAGAAACAAAGTGATAAAATGGTGTTTACAAAATAGATTTGAGTTAATTGAATTAAATAGACCTGATATAGATGCTTCAGAAGCTGATTCAGAAAATAACAAATATGGTATTGAGAGAATTATTGAAGCTTTACATGCTCATATGTGGCCAAATATGACACTTAAAGGAAAACCATCAGATATGGAAGAGCGAAATCCTGACATGAATAAAGTTGAAGAACAATTTGGAAAAATTGAATTAAATCAAGATTCTACAGAAACATTGCCAATAGAAAATATGTTAGATGGAATTATGGGTGAAGAAAATACAGATTTTGGAGAATTGTTTAGTCAATTAAAAGCTATGAAAGAACATGCAGCATTACTGCCAACTAATCAAAGACGTATAGCAGCTGAACAATTAGTCACTGCTTTCTGGAAAGCAATGGGTGGTGATCCATCAGAAATGGAAGATTAATCTACATATTTATTTTATAATGCATACAAATTCATATTAGAAACATTGCTATCTTAGTACTTTTATTTGGATTTGATATGTTAATTTTCAAGAACAAAACAGCAAAAATATTGTTAGATAATTATAAAATCTTAAAAGTTGCTTAAATGAAAAATGAACATAAAATAAAAATTAACGTAAAATTATAATTAAGTAAAAATTAACGTAATTATGATAAAAATAAAATTAAAGTTATAATATGGCATGTGTATAAGATATACAGTTAATTATAATGTATGTTTTGTAG]

[+] EMBL BI514420             [AAAAGGAAAAGCTAATGAAATTGCTATAAATATAGGAGGAGAAAAATTATCTAACCAAGATCATTTTGATTACTATTTATGGAATATTCAAAATAAATATTACAAAGCACAGGTATTGATATGTGTTATAGAAAATTCTTCTCAAGATATTTCAATCAATGATGTGGAAGCATTGATTGTACATCATGATCCACAGACAGAAAATGCAGATCAGAATTTAAAGGAATGGTCATCTTTGATTGCTTCTTTAGCAGAAGTAGAAGTATTACTGTTTTCTTGTAATTTTATAGTAGATACTGTTATTAGAAACAAAGTGATAAAATGGTGTTTACAAAATAGATTTGAGTTAATTGAATTAAATAGACCTGATATAGATGCTTCAGAAGCTGATTCAGAAAATAACAAATATGGTATTGAGAGAATTATTGAAGCTTTACATGCTCATATGTGGCCAAATATGACACTTAAAGGAAAACCATCAGATATGGAAGAGCGAAATCCTGACATGAATAAAGTTGAAGAACAATTTGGAAAAATTGAATTAAATCAAGATTCTACAGAAACATTGCCAATAGAAAATATGTTAGATGGAATTATGGGTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL BQ103834             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTATTGAGAGAATTATTGAAGCTTTACATGCTCATATGTGGCCAAATATGACACTTAAAGGAAAACCATCAGATATGGAAGAGCGAAATCCTGACATGAATAAAGTTGAAGAACAATTTGGAAAAATTGAATTAAATCAAGATTCTACAGAAACATTGCCAATAGAAAATATGTTAGATGGAATTATGGGTGAAGAAAATACAGATTTTGGAGAATTGTTTAGTCAATTAAAAGCTATGAAAGAACATGCAGCATTACTGCCAACTAATCAAAGACGTATAGCAGCTGAACAATTAGTCACTGCTTTCTGGAAAGCAATGGGTGGTGATCCATCAGAAATGGAAGATTAATCTACATATTTATTTTATAATGCATACAAATTCATATTAGAAACATTGCTATCTTAGTACTTTTATTTGGATTTGATATGTTAATTTTCAAGAACAAAACAGCAAAAATATTGTTAGATAATTATAAAATCTTAAAAGTTGCTTAAATGAAAAATGAACATAAAATAAAAATTAACGTAAAATTATAATTAAGTAAAAATTAACGTAATTATGATAAAAATAAAATTAAAGTTATAATATGGCATGTGTATAAGATATACAGTTAATTATAATGTATGTTTTGTAG]


>consensus_2053#0 AAAAGGAAAAGCTAATGAAATTGCTATAAATATAGGAGGAGAAAAATTATCTAACCAAGA TCATTTTGATTACTATTTATGGAATATTCAAAATAAATATTACAAAGCACAGGTATTGAT ATGTGTTATAGAAAATTCTTCTCAAGATATTTCAATCAATGATGTGGAAGCATTGATTGT ACATCATGATCCACAGACAGAAAATGCAGATCAGAATTTAAAGGAATGGTCATCTTTGAT TGCTTCTTTAGCAGAAGTAGAAGTATTACTGTTTTCTTGTAATTTTATAGTAGATACTGT TATTAGAAACAAAGTGATAAAATGGTGTTTACAAAATAGATTTGAGTTAATTGAATTAAA TAGACCTGATATAGATGCTTCAGAAGCTGATTCAGAAAATAACAAATATGGTATTGAGAG AATTATTGAAGCTTTACATGCTCATATGTGGCCAAATATGACACTTAAAGGAAAACCATC AGATATGGAAGAGCGAAATCCTGACATGAATAAAGTTGAAGAACAATTTGGAAAAATTGA ATTAAATCAAGATTCTACAGAAACATTGCCAATAGAAAATATGTTAGATGGAATTATGGG TGAAGAAAATACAGATTTTGGAGAATTGTTTAGTCAATTAAAAGCTATGAAAGAACATGC AGCATTACTGCCAACTAATCAAAGACGTATAGCAGCTGAACAATTAGTCACTGCTTTCTG GAAAGCAATGGGTGGTGATCCATCAGAAATGGAAGATTAATCTACATATTTATTTTATAA TGCATACAAATTCATATTAGAAACATTGCTATCTTAGTACTTTTATTTGGATTTGATATG TTAATTTTCAAGAACAAAACAGCAAAAATATTGTTAGATAATTATAAAATCTTAAAAGTT GCTTAAATGAAAAATGAACATAAAATAAAAATTAACGTAAAATTATAATTAAGTAAAAAT TAACGTAATTATGATAAAAATAAAATTAAAGTTATAATATGGCATGTGTATAAGATATAC AGTTAATTATAATGTATGTTTTGTAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)