Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 206 cluster # 206       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_206#0 length = 697 sequences # 6  

consensusID : consensus_206#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 697
fasta sequence
                              [AATGGAAACATATGATGATATAGTGGTACCTACCACGACGACATTACCAGTGGCCCTTTCTGCAGAACTACCAGAAATTAAATTATTTGGTCGCTGGAATTGTGATGATGTACAAGTGAATGATATGTCTTTACAAGATTATATTGCCGTTAAAGAGAAAAATGCAAAATATTTACCACATTCTGCTGGACGTTATGCCGCAAAAAGATTTCGGAAAG-CGCAATGTCCTATAGTCGAACGTTTGACAAACTCTTTAATGATGCATGGTAGAAATAATGGGAAAAAGTTAATGGCAGTAAGAATTGTAAAACATGCCTTTGAAATAATTCACCTGCTCACGGGTGATAATCCTTTACAGGTTCTTGTGACTGCTATCATCAATTCTGGACCTAGAGAAGATTCTACGCGTATCGGTCGAGCCGGTACAGTTAGGAGACAGGCGGTGGATGTTTCTCCGTTGCGACGAGTAAATCAGGCTATTTGGTTGTTATGTACAGGTGCTAGGGAAGCCGCGTTCCGTAATATTAAAACCATCGCCGAATGTTTAGCCGATGAACTCATTAATGCTGCCAAAGGTTCGTCTAACTCTTACGCGATTAAAAAGAAAGACGAACTCGAACGTGTTGCTAAATCTAATCGATAAATATGTTCATTCGTATAAAAACATAAAAATAAATGATCTATCTTTAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI511313             [AATGGAAACATATGATGATATAGTGGTACCTACCACGACGACATTACCAGTGGCCCTTTCTGCAGAACTACCAGAAATTAAATTATTTGGTCGCTGGAATTGTGATGATGTACAAGTGAATGATATGTCTTTACAAGATTATATTGCCGTTAAAGAGAAAAATGCAAAATATTTACCACATTCTGCTGGACGTTATGCCGCAAAAAGATTTCGGAAAG CGCAATGTCCTATAGTCGAACGTTTGACAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BG101562             [                                           TACCCAGTGGCCCTTTCTGCAGAACTACCAGAAATTAAATTATTTGGTCGCTGGAATTGTGATGATGTACAAGTGAATGATATGTCTTTACAAGATTATATTGCCGTTAAAGAGAAAAATGCAAAATATTTACCACATTCTGCTGGACGTTATGCCGCAAAAAGATTTCGGAAAGCCGCAATGTCCTATAGTCGAACGTTTGACAAACTCTTTAATGATGCATGGTAGAAATAATGGGAAAAAGTTAATGGCAGTAAGAATTGTAAAACATGCCTTTGAAATAATTCACCTGCTCACGGGTGATAATCCTTTACAGGTTCTTGTGACTGCTATCATCAATTCTGGACCTAGAGAAGATTCTACGCGTATCGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BG101545             [                                            TACCAGTGGCCCTTTCTGCAGAACTACCAGAAATTAAATTATTTGGTCGCTGGAATTGTGATGATGTACAAGTGAATGATATGTCTTTACAAGATTATATTGCCGTTAAAGAGAAAAATGCAAAATATTTACCACATTCTGCTGGACGTTATGCCGCAAAAAGATTTCGGAAAG CGCAATGTCCTATAGTCGAACGTTTGACAAACTCTTTAATGATGCATGGTAGAAATAATGGGAAAAAGTTAATGGCAGTAAGAATTGTAAAACATGCCTTTGAAATAATTCACCTGCTCACGGGTGATAATCCTTTACAGGTTCTTGTGACTGCTATCATCAATTCTGGACCTAGAGAAGATTCTACGCGTATCG                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI511760             [                                                                                            GCTGGAATTGTGATGATGTACAAGTGAATGATATGTCTTTACAAGATTATATTGCCGTTAAAGAGAAAAATGCAAAATATTTACCACATTCTGCTGGACGTTATGCCGCAAAAAGATTTCGGAAAG CGCAATGTCCTATAGTCGAACGTTTGACAAACTCTTTAATGATGCATGGTAGAAATAATGGGAAAAAGTTAATGGCAGTAAGAATTGTAAAACATGCCTTTGAAATAATTCACCTGCTCACGGGTGATAATCCTTTACAGGTTCTTGTGACTGCTATCATCAATTCTGGACCTAGAGAAGATTCTACGCGTATCGGTCGAGCCGGTACAGTTAGGAGACAGGCGGTGGATGTTTCTCCGTTGCGACGAGTAAATCAGGCTATTTGGTTGTTATGTACAGGTGCTAGGGAAGCCGCGTTCCGTAATATTAAAACCATCGCCGAATGTTTAGCCGATGAACTCATTAATGCTGCCAAAGGTTCGTCTAACTCTTACGCGATTAAAAAGAAAGACGAACTCGAACGTGTTGCTAAATCTAATCGATAAATATGTTCATTCGTATAAAAACATAAAAATAAATGATCTATCTTTAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI506056             [                                                                                                            TGTACAAGTGAATGATATGTCTTTACAAGATTATATTGCCGTTAAAGAGAAAAATGCAAAATATTTACCACATTCTGCTGGACGTTATGCCGCAAAAAGATTTCGGAAAG CGCAATGTCCTATAGTCGAACGTTTGACAAACTCTTTAATGATGCATGGTAGAAATAATGGGAAAAAGTTAATGGCAGTAAGAATTGTAAAACATGCCTTTGAAATAATTCACCTGCTCACGGGTGATAATCCTTTACAGGTTCTTGTGACTGCTATCATCAATTCTGGACCTAGAGAAGATTCTACGCGTATCGGTCGAGCCGGTACAGTTAGGAGACAGGCGGTGGATGTTTCTCCGTTGCGACGAGTAAATCAGGCTATTTGGTTGTTATGTACAGGTGCTAGGGAAGCCGCGTTCCGTAATATTAAAACCATCGCCGAATGTTTAGCCGATGAACTCATTAATGCTGCCAAAGGTTCGTCTAACTCTTACGCGATTAAAAAGAAAGACGAACTCGAACGTGTTGCTAAATCTAATCGATAAATATGTTCATTCGTATAAAAACATAAAAAT                        ]
[+] EMBL BG101538             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAGGTTCTTGTATCTGCTATCATCAATTCTGGACCTAGAGAAGATTCTACGCGTATCGGTCGAGCCGGTACAGTTAGGAGACAGGCGGTGGATGTTTCTCCGTTGCGACGAGTAAATCAGGCTATTTGGTTGTTATGTACAGGTGCTAGGGAAGCCGCGTTCCGTAATATTAAAACCATCGCCGAATGTTTAGCCGATGAACTCATTAATGCTGCCAAAGGTTCGTCTAACTCTTACGCGATTAAAAAGAAAGACGAACTCGAACGTGTTGCTAAATCTAATCGATAAATATGTTCATTCGTATAAAAACATAAAAATA                       ]


>consensus_206#0 AATGGAAACATATGATGATATAGTGGTACCTACCACGACGACATTACCAGTGGCCCTTTC TGCAGAACTACCAGAAATTAAATTATTTGGTCGCTGGAATTGTGATGATGTACAAGTGAA TGATATGTCTTTACAAGATTATATTGCCGTTAAAGAGAAAAATGCAAAATATTTACCACA TTCTGCTGGACGTTATGCCGCAAAAAGATTTCGGAAAGCGCAATGTCCTATAGTCGAACG TTTGACAAACTCTTTAATGATGCATGGTAGAAATAATGGGAAAAAGTTAATGGCAGTAAG AATTGTAAAACATGCCTTTGAAATAATTCACCTGCTCACGGGTGATAATCCTTTACAGGT TCTTGTGACTGCTATCATCAATTCTGGACCTAGAGAAGATTCTACGCGTATCGGTCGAGC CGGTACAGTTAGGAGACAGGCGGTGGATGTTTCTCCGTTGCGACGAGTAAATCAGGCTAT TTGGTTGTTATGTACAGGTGCTAGGGAAGCCGCGTTCCGTAATATTAAAACCATCGCCGA ATGTTTAGCCGATGAACTCATTAATGCTGCCAAAGGTTCGTCTAACTCTTACGCGATTAA AAAGAAAGACGAACTCGAACGTGTTGCTAAATCTAATCGATAAATATGTTCATTCGTATA AAAACATAAAAATAAATGATCTATCTTTAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)