Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 231 cluster # 231       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_231#0 length = 573 sequences # 5  
consensusID : consensus_231#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 573
fasta sequence 
                              [AAAAAATTATTATCCCGATACTCCCTTTAACATACATACGCACGTATGCATGCATTTATACATATTGGTATATATGTATGTGCGTGAATGTATGCGTGTATATATATTATATATATATGATATTCAGTTTTTGTAGGCATGATCGATCTCACGAAAATTGTCGATATAGAATTTGAAGAATTTTATTCGTTACGTCTTGCAAATTTTGCAAATTTATATAATAATAACTTTTCAGAATATCTATCTAAGATGCGGTGCATAATTTAAATGAATTCGGTTTCACGAAAAAGATCATGCATATATTGTCTTTGAATTTTCATTCGTTTTTTAAAAAGCTCCGTTGTAAATCTTTTGATCGATCGATCACGTATACCATATAAAAAAAAGTTCTCGAGAAGAAGATTTTCATTCTGATATATCTGGTGGTGACAGATTTAAAAATGGCGGATCAGNGACGTGTAACGGTCTGTGATCGGCTCGACCGAAACCTCGATAAAAAGGGACGAACGTTTTCCATTTTTTAAAAATGGGAAAAAGTCGAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTAA]

[+] EMBL BI511118             [AAAAAATTATTATCCCGATACTCCCTTTAACATACATACGCACGTATGCATGCATTTATACATATTGGTATATATGTATGTGCGTGAATGTATGCGTGTATATATATTATATATATATGATATTCAGTTTTTGTAGGCATGATCGATCTCACGAAAATTGTCGATATAGAATTTGAAGAATTTTATTCGTTACGTCTTGCAAATTTTGCAAATTTATATAATAATAACTTTTCAGAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI516407             [                                TACATACGCACGTATGCATGCATTTATACATATTGGTATATATGTATGTGCGTGAATGTATGCGTGTATATATATTATATATATATGATATTCAGTTTTTGTAGGCATGATCGATCTCACGAAAATTGTCGATATAGAATTTGAAGAATTTTATTCGTTACGTCTTGCAAATTTTGCAAATTTATATAATAATAACTTTTCAGAATATCTATCTAAGATGCGGTGCATAATTTAAATGAATTCGGTTTCACGAAAAAGATCATGCATATATTGTCTTTGAATTTTCATTCGTTTTTTAAAAAGCTCCGTTGTAAATCTTTTGATCGATCGATCACGTATACCATATAAAAAAAAGTTCTCGAGAAGAAGATTTTCATTCTGATATATCTGNNNGTGACAGATTTAAAAATGGCGGATCAGNGACGTGTAACGGTCTGTGATCGGCTCGACCGAAACCTCGATAAAAAGGGACGAACGTTTTCCATTTTTTAAAAATGGGAAAAAGTCGAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTAA]
[+] EMBL BI516232             [                                TACATACGCACGTATGCATGCATTTATACATATTGGTATATATGTATGTGCGTGAATGTATGCGTGTATATATATTATATATATATGATATTCAGTTTTTGTAGGCATGATCGATCTCACGAAAATTGTCGATATAGAATTTGAAGAATTTTATTCGTTACGTCTTGCAAATTTTGCAAATTTATATAATAATAACTTTTCAGAATATCTATCTAAGATGCGGTGCATAATTTAAATGAATTCGGTTTCACGAAAAAGATCATGCATATATTGTCTTTGAATTTTCATTCGTTTTTTAAAAAGCTCCGTTGTAAATCTTTTGATCGATCGATCACGTATACCATATAAAAAAAAGTTCTCGAGAAGAAGATTTTCATTCTGATATATCTGGTGGTGACAGATTTAAAAATGGCGGATCAGNNNCGTGTAACGGTCTGTGATCGGCTCGACCGAAACCTCGATAAAAAGGGACGAACGTTTTCCATTTTTTAAAAATGGGAAAAAGTCGAATAATAATAATAATAATAATAATA        ]
[+] EMBL BI511491             [                                TACATACGCACGTATGCATGCATTTATACATATTGGTATATATGTATGTGCGTGAATGTATGCGTGTATATATATTATATATATATGATATTCAGTTTTTGTAGGCATGATCGATCTCACGAAAATTGTCGATATAGAATTTGAAGAATTTTATTCGTTACGTCTTGCAAATTTTGCAAATTTATATAATAATAACTTTTCAGAATATCTATCTAAGATGCGGTGCATAATTTAAATGAATTCGGTTTCACGAAAAAGATCATGCATATATTGTCTTTGAATTTTCATTCGTTTTTTAAAAAGCTCCGTTGTAAATCTTTT                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI512346             [                                                                                            TGCGTGTATATATATTATATATATATGATATTCAGTTTTTGTAGGCATGATCGATCTCACGAAAATTGTCGATATAGAATTTGAAGAATTTTATTCGTTACGTCTTGCAAATTTTGCAAATTTATATAATAATAACTTTTCAGAATATCTATCTAAGATGCGGTGCATAATTTAAATGAATTCGGTTTCACGAAAAAGATCATGCATATATTGTCTTTGAATTTTCATTCGTTTTTTAAAAAGCTCCGTTGTAAATCTTTTGATCGATCGATCACGTATACCATATAAAAAAAAGTTCTCGAGAAGAAGATTTTCATTCTGATATATCTGGTGGTGACAGATTTAAAAATGGCGGATCAGAGACGTGTAACGGTCTGTGATCGGCTCGACCGAAACCTCGATAAAAAGGGACGAACGTTTTCCATTTTT                                                    ]




>consensus_231#0
AAAAAATTATTATCCCGATACTCCCTTTAACATACATACGCACGTATGCATGCATTTATA
CATATTGGTATATATGTATGTGCGTGAATGTATGCGTGTATATATATTATATATATATGA
TATTCAGTTTTTGTAGGCATGATCGATCTCACGAAAATTGTCGATATAGAATTTGAAGAA
TTTTATTCGTTACGTCTTGCAAATTTTGCAAATTTATATAATAATAACTTTTCAGAATAT
CTATCTAAGATGCGGTGCATAATTTAAATGAATTCGGTTTCACGAAAAAGATCATGCATA
TATTGTCTTTGAATTTTCATTCGTTTTTTAAAAAGCTCCGTTGTAAATCTTTTGATCGAT
CGATCACGTATACCATATAAAAAAAAGTTCTCGAGAAGAAGATTTTCATTCTGATATATC
TGGTGGTGACAGATTTAAAAATGGCGGATCAGNGACGTGTAACGGTCTGTGATCGGCTCG
ACCGAAACCTCGATAAAAAGGGACGAACGTTTTCCATTTTTTAAAAATGGGAAAAAGTCG
AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)