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Apis mellifera
cluster # 2384 cluster # 2384       Sequences # 2       consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2384#0 length = 589 sequences # 1  
 consensus_2384#1 length = 527 sequences # 1  
consensusID : consensus_2384#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 589
fasta sequence 
                              [AAAACATGTTTCCGGCTTATTCATATTTATCAGCTTATGATAGACATAAAAAACTTATTAATGACTATTTTACGTTGTATGGAGGTTCGGTATCATCTTTAGAACGAGACACCTCTTGACGTTTCGGCCTGTGTTTCGAGGTCCCGAGACAAGACAGACTATGATGTTATTAAAGAAAACCATAGATTTTTATGGGATCAGGATAAAGATGAACCAAATACATGGGGTGCTCGTTTGGCAAAGAAATATTATGATAAATTGTTTAAAGAATATTGTATAGCAGATTTAACATACTATAAGCAAAACAAGGTTGCTTTAAGATGGAGAATAGAAAAAGAAGTTATCATTGGTAAAGGACAATTTGAATGTGGAAATAAAAAATGTAAAAATAAGGAACAACTTAAGTCTTGGGAAGTAAATTTTGGTTATATAGAGCATGGTCAAAAAAAGAACGCTCTTGTCAAATTAAGATTGTGTCCTGAATGTTCCATAAAGTTGAATTATAGATCTCAAAAAAGAGAAGCAAAAAAACATAAAATATTAAAAAGATTAGGAACAAATATAGAAACATTTAATAATACACCTAGTA]

[+] EMBL BI503440             [AAAACATGTTTCCGGCTTATTCATATTTATCAGCTTATGATAGACATAAAAAACTTATTAATGACTATTTTACGTTGTATGGAGGTTCGGTATCATCTTTAGAACGAGACACCTCTTGACGTTTCGGCCTGTGTTTCGAGGTCCCGAGACAAGACAGACTATGATGTTATTAAAGAAAACCATAGATTTTTATGGGATCAGGATAAAGATGAACCAAATACATGGGGTGCTCGTTTGGCAAAGAAATATTATGATAAATTGTTTAAAGAATATTGTATAGCAGATTTAACATACTATAAGCAAAACAAGGTTGCTTTAAGATGGAGAATAGAAAAAGAAGTTATCATTGGTAAAGGACAATTTGAATGTGGAAATAAAAAATGTAAAAATAAGGAACAACTTAAGTCTTGGGAAGTAAATTTTGGTTATATAGAGCATGGTCAAAAAAAGAACGCTCTTGTCAAATTAAGATTGTGTCCTGAATGTTCCATAAAGTTGAATTATAGATCTCAAAAAAGAGAAGCAAAAAAACATAAAATATTAAAAAGATTAGGAACAAATATAGAAACATTTAATAATACACCTAGTA]




>consensus_2384#0
AAAACATGTTTCCGGCTTATTCATATTTATCAGCTTATGATAGACATAAAAAACTTATTA
ATGACTATTTTACGTTGTATGGAGGTTCGGTATCATCTTTAGAACGAGACACCTCTTGAC
GTTTCGGCCTGTGTTTCGAGGTCCCGAGACAAGACAGACTATGATGTTATTAAAGAAAAC
CATAGATTTTTATGGGATCAGGATAAAGATGAACCAAATACATGGGGTGCTCGTTTGGCA
AAGAAATATTATGATAAATTGTTTAAAGAATATTGTATAGCAGATTTAACATACTATAAG
CAAAACAAGGTTGCTTTAAGATGGAGAATAGAAAAAGAAGTTATCATTGGTAAAGGACAA
TTTGAATGTGGAAATAAAAAATGTAAAAATAAGGAACAACTTAAGTCTTGGGAAGTAAAT
TTTGGTTATATAGAGCATGGTCAAAAAAAGAACGCTCTTGTCAAATTAAGATTGTGTCCT
GAATGTTCCATAAAGTTGAATTATAGATCTCAAAAAAGAGAAGCAAAAAAACATAAAATA
TTAAAAAGATTAGGAACAAATATAGAAACATTTAATAATACACCTAGTA

consensusID : consensus_2384#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 527
fasta sequence 
                              [ATATATATTTTAATTAATATTTCAACGTTACATCTTGAATTTAAAATAAAAGCAGTTTTATAAGAAGAAAACATGTTTCCGGCTTATTCATATTTATCAGCTTATGATAGACATAAAAAACTTATTAATGACTATTTTACGTTGTATGGAGGTTCGGTATCATCTTTAGAACGAGACACGTATGTTAAATTTTTTAATTTGATTTCACATATTTTTATATCATTATTTAAATCATAACCATATTGTATAATTTGCATATAAATTAATATTTTTTTATCTATATTGATTCAAAATATAAAAATTTAATAAAAAATATATTCAAATATTAAAAAAATACATATAATATAAAAATAAACGATAAAGAAATGACAGCTTTGTAAACTCTAAAACAAGCAGCTCTTGACGTTTCGGCCTGTGTTTCGAGGTCCCGAGACAAGACAGACTATGATGTTATTAAAGAAAACCATAGATTTTTATGGGATCAGGATAAAGATGAACCAAATACATGGGGTGCTCGTTTGGCAAAG]

[+] EMBL BI510433             [ATATATATTTTAATTAATATTTCAACGTTACATCTTGAATTTAAAATAAAAGCAGTTTTATAAGAAGAAAACATGTTTCCGGCTTATTCATATTTATCAGCTTATGATAGACATAAAAAACTTATTAATGACTATTTTACGTTGTATGGAGGTTCGGTATCATCTTTAGAACGAGACACGTATGTTAAATTTTTTAATTTGATTTCACATATTTTTATATCATTATTTAAATCATAACCATATTGTATAATTTGCATATAAATTAATATTTTTTTATCTATATTGATTCAAAATATAAAAATTTAATAAAAAATATATTCAAATATTAAAAAAATACATATAATATAAAAATAAACGATAAAGAAATGACAGCTTTGTAAACTCTAAAACAAGCAGCTCTTGACGTTTCGGCCTGTGTTTCGAGGTCCCGAGACAAGACAGACTATGATGTTATTAAAGAAAACCATAGATTTTTATGGGATCAGGATAAAGATGAACCAAATACATGGGGTGCTCGTTTGGCAAAG]




>consensus_2384#1
ATATATATTTTAATTAATATTTCAACGTTACATCTTGAATTTAAAATAAAAGCAGTTTTA
TAAGAAGAAAACATGTTTCCGGCTTATTCATATTTATCAGCTTATGATAGACATAAAAAA
CTTATTAATGACTATTTTACGTTGTATGGAGGTTCGGTATCATCTTTAGAACGAGACACG
TATGTTAAATTTTTTAATTTGATTTCACATATTTTTATATCATTATTTAAATCATAACCA
TATTGTATAATTTGCATATAAATTAATATTTTTTTATCTATATTGATTCAAAATATAAAA
ATTTAATAAAAAATATATTCAAATATTAAAAAAATACATATAATATAAAAATAAACGATA
AAGAAATGACAGCTTTGTAAACTCTAAAACAAGCAGCTCTTGACGTTTCGGCCTGTGTTT
CGAGGTCCCGAGACAAGACAGACTATGATGTTATTAAAGAAAACCATAGATTTTTATGGG
ATCAGGATAAAGATGAACCAAATACATGGGGTGCTCGTTTGGCAAAG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_2384#0      ------------------------------------------------------------
consensus_2384#1      ATATATATTTTAATTAATATTTCAACGTTACATCTTGAATTTAAAATAAAAGCAGTTTTA 60
                                                                                  

consensus_2384#0      -------AAAACATGTTTCCGGCTTATTCATATTTATCAGCTTATGATAGACATAAAAAA 53
consensus_2384#1      TAAGAAGAAAACATGTTTCCGGCTTATTCATATTTATCAGCTTATGATAGACATAAAAAA 120
                             *****************************************************

consensus_2384#0      CTTATTAATGACTATTTTACGTTGTATGGAGGTTCGGTATCATCTTTAGAACGAGACACC 113
consensus_2384#1      CTTATTAATGACTATTTTACGTTGTATGGAGGTTCGGTATCATCTTTAGAACGAGACACG 180
                      *********************************************************** 

consensus_2384#0      TCTTGACGTTTCGGCCTGTGTTTCGAGGTCCCGAGACAAGACAGACTATGATGTTATTAA 173
consensus_2384#1      T----ATGTTAAATTTTTTAATTTGATTTC----------ACATATTTTTATATCATTAT 226
                      *    * ***      * *  ** **  **          *** * * * ** * **** 

consensus_2384#0      AGAAAACCATAGATTTTTATGGGATCAGGATAAAGATGAACCAAATACATGGGGTGCTCG 233
consensus_2384#1      TTAAATCATAACCATATTGTATAATTTGCATATAAATTAATATTTTTTTATCTATATTGA 286
                        *** *   *   * ** *   **  * *** * ** **     *        *  *  

consensus_2384#0      TTTGGCAAAGAAATATT--ATGATAAAT-TGTTTAAAGAATATTGTATAGCAGATTTAAC 290
consensus_2384#1      TTCAAAATATAAAAATTTAATAAAAAATATATTCAAATATTA--AAAAAATACATATAAT 344
                      **    * * *** ***  ** * **** * ** *** * **    * *  * ** *** 

consensus_2384#0      ATACTA-TAAGCAAAACAAGGTTGCTTTAAGATGGAGAATAGAAAAAGAAGTTATCATTG 349
consensus_2384#1      ATAAAAATAAACGATAAAGAAATGA--CAGCTTTGTAAACTCTAAAACAAGCAGCTCTTG 402
                      ***  * *** * * * *    **    *   * *  **    **** ***      ***

consensus_2384#0      GTAAAGGACAATTTGAATGTGGAAATAAAAAATGTAAAAATAAGGAACAACTTAAGTCTT 409
consensus_2384#1      -------ACGTTTCGGCC--TGTGTTTCGAGGTCCCGAGACAAGACAGACTATGATGTTA 453
                             **  ** *      *   *   *  *    * * ***  * *   * *   * 

consensus_2384#0      GGGAAGTAAATTTTGGTTATATAGAGCATGGTCAAAAAAAGAACGCTCTTGTCAAATTAA 469
consensus_2384#1      TTAAAGAAAACCATAGATTTTTATGG---GATCAGGATAAAGATGA----ACCAAAT--A 504
                         *** ***   * * * * **  *   * ***  * **  * *       *****  *

consensus_2384#0      GATTGTGTCCTGAATGTTCCATAAAGTTGAATTATAGATCTCAAAAAAGAGAAGCAAAAA 529
consensus_2384#1      CATGGGGTGCT---CGTTTGGCAAAG---------------------------------- 527
                       ** * ** **    ***    ****                                  

consensus_2384#0      AACATAAAATATTAAAAAGATTAGGAACAAATATAGAAACATTTAATAATACACCTAGTA 589
consensus_2384#1      ------------------------------------------------------------


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)