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Apis mellifera
cluster # 240 cluster # 240       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_240#0 length = 978 sequences # 5  
consensusID : consensus_240#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 978
fasta sequence 
                              [TAGCTATCTTGTACTTGAAACTTTGCCTGCTGAGTATGATGCAAGAGTAAAAGCTATGGAAGTAGACGAAAGACCCACAGAACAATATTCAGATATTGGTGGTTTGGATAAACAAATTCAAGAATTAATAGAAGCTGTAGTTTTACCTATGACACATAAAGAAAAATTTGAGAATCTTGGTATTCAACCTCCCAAGGGTGTATTATTATATGGACCACCAGGAACTGGAAAAACTTTATTAGCTAGAGCTTGTGCTGCACAAACAAAATCTACTTTCTTAAAATTGGCAGGACCCCAACTTGTTCAAATGTTTATTGGAGATGGTGCCAAATTAGTGAGAGATGCATTTTCACTTGCAAAAGAGAAAGCACCTGCAATTATTTTCATAGATGAATTAGATGCAATTGGAACAAAACGATTTGATTCTGAAAAAGCTGGAGATAGAGAAGTGCAACGTACTATGTTGGAATTATTAAATCAATTAGATGGATTTAGTTCAACCGCTGATATTAAAGTAATAGCAGCTACAAATAGAGTAGATATCTTAGATCCAGCTTTATTGAGATCTGGTCGTTTGGATAGGAAAATAGAATTTCCGCATCCAAATGAAGAAGCTAGAGCTCGTATAATGCAAATTCATTCGCGAAAAATGAATATGTCTCCGGATGTTAATTTTGAAGAATTATCAAGATCTACCGATGATTTCAATGGCGCTCAATGTAAAGCTGTTTGTGTGGAAGCGGGAATGATAGCATTGAGACGCAATGCAACAGCAGTTACACATGAAGATTTAATGGAAGCTATTAATGAAGTTCAAGCGAAAAAGAAAGCTAATCTTAACTATTATGCCTAATGTGCTTTTGATTTATTTATTAAAATATATTTTATAATAAATAAAGATAGAAATTGTAATAATTGTAAACAAAATTAAATTTCAAGAAAGTAATCTTATTTGTAAAATAAACAGCTCAATATGAG]

[+] EMBL BI509603             [TAGCTATCTTGTACTTGAAACTTTGCCTGCTGAGTATGATGCAAGAGTAAAAGCTATGGAAGTAGACGAAAGACCCACAGAACAATATTCAGATATTGGTGGTTTGGATAAACAAATTCAAGAATTAATAGAAGCTGTAGTTTTACCTATGACACATAAAGAAAAATTTGAGAATCTTGGTATTCAACCTCCCAAGGGTGTATTATTATATGGACCACCAGGAACTGGAAAAACTTTATTAGCTAGAGCTTGTGCTGCACAAACAAAATCTACTTTCTTAAAATTGGCAGGACCCCAACTTGTTCAAATGTTTATTGGAGATGGTGCCAAATTAGTGAGAGATGCATTTTCACTTGCAAAAGAGAAAGCACCTGCAATTATTTTCATAGATGAATTAGATGCAATTGGAACAAAACGATTTGATTCTGAAAAAGCTGGAGATAGAGAAGTGCAACGTACTATGTTGGAATTATTAAATCAATTAGATGGATTTAGTTCAACCGCTGATATT  ATTAATAGCAGCTACAAATAGAGTAGATATCTTAGATCCAGCTTTATTGAGATCTGGTCGTTTGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI507586             [                                                                                                                                                                                                               ATATGGACCACCAGGAACTGGAAAAACTTTATTAGCTAGAGCTTGTGCTGCACAAACAAAATCTACTTTCTTAAAATTGGCAGGACCCCAACTTGTTCAAATGTTTATTGGAGATGGTGCCAAATTAGTGAGAGATGCATTTTCACTTGCAAAAGAGAAAGCACCTGCAATTATTTTCATAGATGAATTAGATGCAATTGGAACAAAACGATTTGATTCTGAAAAAGCTGGAGATAGAGAAGTGCAACGTACTATGTTGGAATTATTAAATCAATTAGATGGATTTAGTTCAACCGCTGATATTAAAGTAATAGCAGCTACAAATAGAGTAGATATCTTAGATCCAGCTTTATTGAGATCTGGTCGTTTGGATAGGAAAATAGAATTTCCGCATCCAAATGAAGAAGCTAGAGCTCGTATAATGCAAATTCATTCGCGAAAAATGAATATGTCTCCGGATGTTAATTTTGAAGAATTATCAAGATCTACCGATGATTTCAATGGCGCTCAATGTAAAGCTGTTTGTGTGGAAGCGGGAATGATAGCATTGAGACGCAATGCAACAGCAGTTACACATGAAGATTTAATGGAAGCTATTAATG                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI506653             [                                                                                                                                                                                                                                CTGGAAAAACTTTATTAGCTAGAGCTTGTGCTGCACAAACAAAATCTACTTTCTTAAAATTGGCAGGACCCCAACTTGTTCAAATGTTTATTGGAGATGGTGCCAAATTAGTGAGAGATGCATTTTCACTTGCAAAAGAGAAAGCACCTGCAATTATTTTCATAGATGAATTAGATGCAATTGGAACAAAACGATTTGATTCTGAAAAAGCTGGAGATAGAGAAGTGCAACGTACTATGTTGGAATTATTAAATCAATTAGATGGATTTAGTTCAACCGCTGATATTAAAGTAATAGCAGCTACAAATAGAGTAGATATCTTAGATCCAGCTTTATTGAGATCTGGTCGTTTGGATAGGAAAATAGAATTTCCGCATCCAAATGAAGAAGCTAGAGCTCGTATAATGCAAATTCATTCGCGAAAAATGAATATGTCTCCGGATGTTAATTTTGAAGAATTATCAAGATCTACCGATGATTTCAATGGCGCTCAATGTAAAGCTGTTTGTGTGGAAGCGGGAATGATAGCATTGAGACGCAATGCAACAGCAGTTACACATGAAGATTTAATGGAAGCTATTAATGAAGTTCAAGCGAAAAAGAAAGCTAATCTTAACTATTATGCCTAATGTGCTTTTGATTTATTTATTAAAATATATTTTATAAT                                                                                       ]
[+] EMBL BI510050             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTGGAGATGGTGCCAAATTAGTGAGAGATGCATTTTCACTTGCAAAAGAGAAAGCACCTGCAATTATTTTCATAGATGAATTAGATGCAATTGGAACAAAACGATTTGATTCTGAAAAAGCTGGAGATAGAGAAGTGCAACGTACTATGTTGGAATTATTAAATCAATTAGATGGATTTAGTTCAACCGCTGATATTAAAGTAATAGCAGCTACAAATAGAGTAGATATCTTAGATCCAGCTTTATTGAGATCTGGTCGTTTGGATAGGAAAATAGAATTTCCGCATCCAAATGAAGAAGCTAGAGCTCGTATAATGCAAATTCATTCGCGAAAAATGAATATGTCTCCGGATGTTAATTTTGAAGAATTATCAAGATCTACCGATGATTTCAATGGCGCTCAATGTAAAGCTGTTTGTGTGGAAGCGGGAATGATAGCATTGAGACGCAATGCAACAGCAGTTACACATGAAGATTTAATGGAAGCTATTAATGAAGTTCAAGCGAAAAAGAAAGCTAATCTTAACTATTATGCCTAATGTGCTTTTGATTTATTTATTAAAATATATTTTATAATAAA                                                                                    ]
[-] EMBL BI517212             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGATGGATTTAGTTCAACCGCTGATATTAAAGTAATAGCAGCTACAAATAGAGTAGATATCTTAGATCCAGCTTTATTGAGATCTGGTCGTTTGGATAGGAAAATAGAATTTCCGCATCCAAATGAAGAAGCTAGAGCTCGTATAATGCAAATTCATTCGCGAAAAATGAATATGTCTCCGGATGTTAATTTTGAAGAATTATCAAGATCTACCGATGATTTCAATGGCGCTCAATGTAAAGCTGTTTGTGTGGAAGCGGGAATGATAGCATTGAGACGCAATGCAACAGCAGTTACACATGAAGATTTAATGGAAGCTATTAATGAAGTTCAAGCGAAAAAGAAAGCTAATCTTAACTATTATGCCTAATGTGCTTTTGATTTATTTATTAAAATATATTTTATAATAAATAAAGATAGAAATTGTAATAATTGTAAACAAAATTAAATTTCAAGAAAGTAATCTTATTTGTAAAATAAACAGCTCAATATGAG]




>consensus_240#0
TAGCTATCTTGTACTTGAAACTTTGCCTGCTGAGTATGATGCAAGAGTAAAAGCTATGGA
AGTAGACGAAAGACCCACAGAACAATATTCAGATATTGGTGGTTTGGATAAACAAATTCA
AGAATTAATAGAAGCTGTAGTTTTACCTATGACACATAAAGAAAAATTTGAGAATCTTGG
TATTCAACCTCCCAAGGGTGTATTATTATATGGACCACCAGGAACTGGAAAAACTTTATT
AGCTAGAGCTTGTGCTGCACAAACAAAATCTACTTTCTTAAAATTGGCAGGACCCCAACT
TGTTCAAATGTTTATTGGAGATGGTGCCAAATTAGTGAGAGATGCATTTTCACTTGCAAA
AGAGAAAGCACCTGCAATTATTTTCATAGATGAATTAGATGCAATTGGAACAAAACGATT
TGATTCTGAAAAAGCTGGAGATAGAGAAGTGCAACGTACTATGTTGGAATTATTAAATCA
ATTAGATGGATTTAGTTCAACCGCTGATATTAAAGTAATAGCAGCTACAAATAGAGTAGA
TATCTTAGATCCAGCTTTATTGAGATCTGGTCGTTTGGATAGGAAAATAGAATTTCCGCA
TCCAAATGAAGAAGCTAGAGCTCGTATAATGCAAATTCATTCGCGAAAAATGAATATGTC
TCCGGATGTTAATTTTGAAGAATTATCAAGATCTACCGATGATTTCAATGGCGCTCAATG
TAAAGCTGTTTGTGTGGAAGCGGGAATGATAGCATTGAGACGCAATGCAACAGCAGTTAC
ACATGAAGATTTAATGGAAGCTATTAATGAAGTTCAAGCGAAAAAGAAAGCTAATCTTAA
CTATTATGCCTAATGTGCTTTTGATTTATTTATTAAAATATATTTTATAATAAATAAAGA
TAGAAATTGTAATAATTGTAAACAAAATTAAATTTCAAGAAAGTAATCTTATTTGTAAAA
TAAACAGCTCAATATGAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)