These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_253#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 655 fasta sequence [GATTGTTGTGATGATCTGCTTGATTAAACGTGAACAATGTCCAATCTTTTACGAAGTCTGGTTTTCGGAGTATTCCTTAGCCTCGCGAATACCAGCGTGTCTCACCCATGGTACGAAACTTTACCCGCGGTGGCCTTAGATTACAAAGTTCATATTGATG-CCGGAAAAGAAGATTGTTA-CTTTCAATATGTTAATGCTGGAGCTAC-TTTCTATGTAAATTTTCAGGTAGTA-CGTGGTGGAGATGGAAAAGCTGGTTTTGCAGTAAGAAATCCAGATGGAATAATAGTTCATCCTTACCAATGGGTT-CCTAATTCAGATTATCAAGATACTGTGAAAAATGCTGGTTATTACAGTATTTGTATAGATAATCAATTTTCCAGATTTGCTTCAAAATTAATTAATTTATATATCACAGTGATTAGATACGATGAAT-GGGACAAATATACAAGAGAATTGGAAGAATTAAATCTCTCTGTGGAAAACTTCACGTCTGCAATAACAAATGTGGAGA-GAAATATTAATGAAATGCTCCAAACTCAACATTTGAGCAGAAGTAAAGAAGCCAGANACTTAANTTTGTTATTAGANAACAATTNTTNTGTTCAAACGGGGGCCAATTGCANAAATAATTGTCATATTGGTAACAACAACAGTA] [+] EMBL BI505188 [GATTGTTGTGATGATCTGCTTGATTAAACGTGAACAATGTCCAATCTTTTACGAAGTCTGGTTTTCGGAGTATTCCTTAGCCTCGCGAATACCAGCGTGTCTCACCCATGGTACGAAACTTTACCCGCGGTGGCCTTAGATTACAAAGTTCATATTGATG CCGGAAAAGAAGATTGTTA CTTTCAATATGTTAATGCTGGAGCTAC TTTCTATGTAAATTTTCAGGTAGTA CGTGGTGGAGATGGAAAAGCTGGTTTTGCAGTAAGAAATCCAGATGGAATAATAGTTCATCCTTACCAATGGGTT CCTAATTCAGATTATCAAGATACTGTGAAAAATGCTGGTTATTACAGTATTTGTATAGATAATCAATTTTCCAGATTTGCTTCAAAATTAATTAATTTATATATCACAGTGATTAGATACGATGAAT GGGACAAATATACAAGAGAATTGGAAGAATTAAATCTCTCTGTGGAAAACTTCACGTCTGCAATAACAAATGTGGAGA GAAATATTAATGAAATGCTCCAAACTCAACATTTGAGCAGAAGTAAAGAAGC ] [+] EMBL BG101595 [ ATGATCTGCTTGATTAAACGTG ACAATGTCCAATCCTTTACGAAGTCTGGTTTTCGGAGTATTCCTTAGCCTCGCGAATACCAGCGTGTCTCACCCATGGTACGAAACTTTACCCGCGGGGGCCTTAGATTACAAAGTTCATATTGATGCCCGGAAAAGAAGATTGTTACCTTTCAATATGTTAATGCTGGAGCTACTTTTCTATGTAAATTTTCAGGTAGTACCGTGGNGGAGATGGAAAAGCTGGTTTTGCAGTAAGAAATCCAGATGGAATAATAGTTCATCCTTACCAATGGGTTCCCTAATTCAGATTATCAAGATACTGTGAAAAATGCTGGTTATTACAGTATTTGTATAGATAATCAATTTACCAGATTTGCTTCAAAATTAATTAATTTATNTNTCACAGTGATTAGATACGATGAATGGGGACAAATACNCANGAG ATTGGGAGAATT AATCTCTNTGTGGGAAACTTTACGTCTGCAATAACAAATGNGGGGAGGAAATATTAATG AATGCCCCCTACTC ACCNTTGNGCCGNAGNAAAGAAGCCAGANACTTAANTTTGTT TTAGANAACAATTNTTNTGTTTAAACGGGGGCCAATTGCCNAAATAATTG ] [+] EMBL BI516346 [ ATCTGCTTGATTAAACGTGAACAATGTCCAATCTTTTACGAAGTCTGGTTTTCGGAGTATTCCTTAGCCTCGCGAATACCAGCGTGTCTCACCCATGGTACGAAACTTTACCCGCGGTGGCCTTAGATTACAAAGTTCATATTGATG CCGGAAAAGAAGATTGTTA CTTTCAATATGTTAATGCTGGAGCTAC TTTCTATGTAAATTTTCAGGTAGTA CGTGGTGGAGATGGAAAAGCTGGTTTTGCAGTAAGAAATCCAGATGGAATAATAGTTCATCCTTACCAATGGGTT CCTAATTCAGATTATCAAGATACTGTGAAAAATGCTGGTTATTACAGTATTTGTATAGATAATCAATTTTCCAGATTTGCTTCAAAATTAATTAATTTATATATCACAGTGATTAGATACGATGAAT GGGACAAATATACAAGAGAATTGGAAGAATTAAATCTCTCTGTGGAAAACTTCACGTCTGCAATAACAAATGTGGAGA GAAATATTAATGAAATGCTCCAAACTCAACATTTGAG ] [+] EMBL BI505675 [ GGAGTATTCCTTAGCCTCGCGAATACCAGCGTGTCTCACCCATGGTACGAAACTTTACCCGCGGTGGCCTTAGATTACAAAGTTCATATTGATG CCGGAAAAGAAGATTGTTA CTTTCAATATGTTAATGCTGGAGCTAC TTTCTATGTAAATTTTCAGGTAGTA CGTGGTGGAGATGGAAAAGCTGGTTTTGCAGTAAGAAATCCAGATGGAATAATAGTTCATCCTTACCAATGGGTT CCTAATTCAGATTATCAAGATACTGTGAAAAATGCTGGTTATTACAGTATTTGTATAGATAATCAATTTTCCAGATTTGCTTCAAAATTAATTAATTTATATATCACAGTGATTAGATACGATGAAT GGGACAAATATACAAGAGAATTGGAAGAATTAAATCTCTCTGTGGAAAACTTCACGTCTGCAATAACAAATGTGGAGA GAAATATTAATGAAATGCTCCAAACTCAACATTTGAGCAGAAGTAAAGAAGCCAGAGACTTAAATTTGTTATTAGATAACAATTCTTATGTTCAAAC GTGGTCAATTGCACAAATAATTGTCATATTGGTAACAACAACAGTA] [+] EMBL BI506300 [ CACCCATGGTACGAAACTTTACCCGCGGTGGCCTTAGNTTACAAAGTTCATATTGATG CCGGAAAAGAAGATTGTTA CTTTCAATATGTTAATGCTGGAGCTAC TTTCTATGTAAATTTTCAGGTNGTA CGTGGTGGAGATGGAAAAGCTGGTTTTGCAGTAAGAAATCCAGATGGAATAATAGTTCATCCTTACCAATGGGTT CCTAATTCNNNTTATCAAGATACTNTGAAAAATGCTGGTTATTACAGTATTTGTATAGATAATCAATTTTCCAGATTTGCTTCAAAATTAATTAATTTATATATCACANNNATTAGATACGATGAAT GGGACAAATATACAAGAGAATTGGAAGAATTAAATCTCTCTGTGGAAAACTTCACGTCTGCAATAACAGNTGTGGAGA GAAATATTAATGAAATGCTCCAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |