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Apis mellifera
cluster # 2616 cluster # 2616       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2616#0 length = 1155 sequences # 2  

consensusID : consensus_2616#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1155
fasta sequence
                              [TTCACAGTATGTAATAGTAAATATACATACGGCAAAATGTTAGATATTTATAATCAAGATATAATAACCAGAATAAAATGTAATGAGAATGTCAGCAATTTTTAAGTCCATGTTTTTGAATATACCTTTCCCTAGCTTCTCTTATCATTTTAGCTTTTCTTTCCTGAAAGGAAGAAGATCCTAAATTACTGTTATCTTTAACTGTGCTTTTTTGCAATTGATTTAATGGTGCTGATCGCATAATAGTTTGAGATGAATCTGGAGTATAAGTAACTATGCCATCCAATATATTGGCAATTGTAATATCAACATTGCGTGTTTTCAAAAGATCTTTTAAAATCACATTATGAGGGACTAATGGAAGCACTTCACTGACTTGTCGAACCATTCTTTGTATTTCAATACTATGTATAACTTGTGAATTTGGAGAATTTCTATCAAATCTTCTACTTTGTGTTCTTTCCAGAATATAGCGCTTTTCAAATTCTATTTTATCTGATACAGTATGAGAACTTGTTTGAAGTCCAAGACTAGTTGCTATATCTTTTTCTACTTCTCGTACTAATACTTCACAATCTGGATTTTGCTTGATTTTCAGGTACTTAAATGTGAAGACTGTATAAGGAACAAACATAAACCAAAATACATCTATCCACCATCTAGATGTTAATGAAGTAAGATGGATGGATGTAAATTATGGTCTCCATGCTTTAATTGCAACTGGTTGAACAGATGCTTTTATAGTAAATGGCCAAGAATTAAATTTTAACAAAGCTACACGACTATTGGTTATACCAAATTCAGGTTGAATTGCAATGCTGCAATTTGATATAGAAAGAAATTGTTTCATATTGGCAATTAGAGCTTCTTTGCTACTCATATCCATCACTTGTAAACCTAGTGCATTATTCATGGCAGTAGGTATCTCCCACATAGTAGGAGTTAATGCTTGTGTAGCTTTATACAAAGCAAAATGATCCAAGACAGAAACATTATTACTAATTATAATTCTTGATTGTTTATCTTTTACTTCACCTTCAGGAATCTTCACCAAGATACCAAAGGCAAAACTAAATCCATGACTTAAGAATGTTCGAAGAATATTGCAATCAGGTAATAATATTGCAACAAGCCAAAGTTGTAAAGCAATTAATA]

[+] EMBL BQ103761             [TTCACAGTATGTAATAGTAAATATACATACGGCAAAATGTTAGATATTTATAATCAAGATATAATAACCAGAATAAAATGTAATGAGAATGTCAGCAATTTTTAAGTCCATGTTTTTGAATATACCTTTCCCTAGCTTCTCTTATCATTTTAGCTTTTCTTTCCTGAAAGGAAGAAGATCCTAAATTACTGTTATCTTTAACTGTGCTTTTTTGCAATTGATTTAATGGTGCTGATCGCATAATAGTTTGAGATGAATCTGGAGTATAAGTAACTATGCCATCCAATATATTGGCAATTGTAATATCAACATTGCGTGTTTTCAAAAGATCTTTTAAAATCACATTATGAGGGACTAATGGAAGCACTTCACTGACTTGTCGAACCATTCTTTGTATTTCAATACTATGTATAACTTGTGAATTTGGAGAATTTCTATCAAATCTTCTACTTTGTGTTCTTTCCAGAATATAGCGCTTTTCAAATTCTATTTTATCTGATACAGTATGAGAACTTGTTTGAAGTCCAAGACTAGTTGCTATATCTTTTTCTACTTCTCGTACTAATACTTCACAATCTGGATTTTGCTTGATTTTCAGGTACTTAAATGTGAAGACTGTATAAGGAACAAACATAAACCAAAATACATCTATCCACCATCTAGATGTTAATGAAGTAAGATGGATGGATGTAAATTATGGTCTCCATGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL BI502984             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCTATTTTATCTGATACAGTATGAGAACTTGTTTGAAGTCCAAGACTAGTTGCTATATCTTTTTCTACTTCTCGTACTAATACTTCACAATCTGGATTTTGCTTGATTTTCAGGTACTTAAATGTGAAGACTGTATAAGGAACAAACATAAACCAAAATACATCTATCCACCATCTAGATGTTAATGAAGTAAGATGGATGGATGTAAATTATGGTCTCCATGCTTTAATTGCAACTGGTTGAACAGATGCTTTTATAGTAAATGGCCAAGAATTAAATTTTAACAAAGCTACACGACTATTGGTTATACCAAATTCAGGTTGAATTGCAATGCTGCAATTTGATATAGAAAGAAATTGTTTCATATTGGCAATTAGAGCTTCTTTGCTACTCATATCCATCACTTGTAAACCTAGTGCATTATTCATGGCAGTAGGTATCTCCCACATAGTAGGAGTTAATGCTTGTGTAGCTTTATACAAAGCAAAATGATCCAAGACAGAAACATTATTACTAATTATAATTCTTGATTGTTTATCTTTTACTTCACCTTCAGGAATCTTCACCAAGATACCAAAGGCAAAACTAAATCCATGACTTAAGAATGTTCGAAGAATATTGCAATCAGGTAATAATATTGCAACAAGCCAAAGTTGTAAAGCAATTAATA]


>consensus_2616#0 TTCACAGTATGTAATAGTAAATATACATACGGCAAAATGTTAGATATTTATAATCAAGAT ATAATAACCAGAATAAAATGTAATGAGAATGTCAGCAATTTTTAAGTCCATGTTTTTGAA TATACCTTTCCCTAGCTTCTCTTATCATTTTAGCTTTTCTTTCCTGAAAGGAAGAAGATC CTAAATTACTGTTATCTTTAACTGTGCTTTTTTGCAATTGATTTAATGGTGCTGATCGCA TAATAGTTTGAGATGAATCTGGAGTATAAGTAACTATGCCATCCAATATATTGGCAATTG TAATATCAACATTGCGTGTTTTCAAAAGATCTTTTAAAATCACATTATGAGGGACTAATG GAAGCACTTCACTGACTTGTCGAACCATTCTTTGTATTTCAATACTATGTATAACTTGTG AATTTGGAGAATTTCTATCAAATCTTCTACTTTGTGTTCTTTCCAGAATATAGCGCTTTT CAAATTCTATTTTATCTGATACAGTATGAGAACTTGTTTGAAGTCCAAGACTAGTTGCTA TATCTTTTTCTACTTCTCGTACTAATACTTCACAATCTGGATTTTGCTTGATTTTCAGGT ACTTAAATGTGAAGACTGTATAAGGAACAAACATAAACCAAAATACATCTATCCACCATC TAGATGTTAATGAAGTAAGATGGATGGATGTAAATTATGGTCTCCATGCTTTAATTGCAA CTGGTTGAACAGATGCTTTTATAGTAAATGGCCAAGAATTAAATTTTAACAAAGCTACAC GACTATTGGTTATACCAAATTCAGGTTGAATTGCAATGCTGCAATTTGATATAGAAAGAA ATTGTTTCATATTGGCAATTAGAGCTTCTTTGCTACTCATATCCATCACTTGTAAACCTA GTGCATTATTCATGGCAGTAGGTATCTCCCACATAGTAGGAGTTAATGCTTGTGTAGCTT TATACAAAGCAAAATGATCCAAGACAGAAACATTATTACTAATTATAATTCTTGATTGTT TATCTTTTACTTCACCTTCAGGAATCTTCACCAAGATACCAAAGGCAAAACTAAATCCAT GACTTAAGAATGTTCGAAGAATATTGCAATCAGGTAATAATATTGCAACAAGCCAAAGTT GTAAAGCAATTAATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)