cluster # 2767

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 2767 cluster # 2767 Sequences # 2 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2767#0 length = 483 sequences # 1

consensus_2767#1 length = 407 sequences # 1

consensusID : consensus_2767#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 483
fasta sequence

                              [NCTGACACTGATCAGCNCAAAGCNNATGACGTTATTGAAGGCACTATCGANGTAGAAGATACAAAAGNTCAATTGNACCTGCCCGGGCNGCCGCTCCGACTATAATNGGNATCTTGGGTCAACATCNANGTCTCAAACATCTTTATCTATATGGTCTATCAAANGATATTACGCTGTTATCCCTAANGTAATTTATNCTNTTAANTACNNTTTATAATTCAAANAATTATCTTTATATCAAAATTAAATCTTAAATAAAGNNTATTAAATTTACCAATCCTCCCAATCAAATTTAATCTTAAATATATCTATTAAAATTNTAAATAAATTNNANAATTAAATTAAATTCTATANGGTCTTATCGTCCCATAATTAAATTTTAGAATCTTAACTAAAAATTTAAATTCATTTAATAATTTANAGACNGTTNTTATTTCATTAATTCTTTCATACAATTCTTCAATTAANAGACAATTNATTATG]

[+] EMBL BG101679             [NCTGACACTGATCAGCNCAAAGCNNATGACGTTATTGAAGGCACTATCGANGTAGAAGATACAAAAGNTCAATTGNACCTGCCCGGGCNGCCGCTCCGACTATAATNGGNATCTTGGGTCAACATCNANGTCTCAAACATCTTTATCTATATGGTCTATCAAANGATATTACGCTGTTATCCCTAANGTAATTTATNCTNTTAANTACNNTTTATAATTCAAANAATTATCTTTATATCAAAATTAAATCTTAAATAAAGNNTATTAAATTTACCAATCCTCCCAATCAAATTTAATCTTAAATATATCTATTAAAATTNTAAATAAATTNNANAATTAAATTAAATTCTATANGGTCTTATCGTCCCATAATTAAATTTTAGAATCTTAACTAAAAATTTAAATTCATTTAATAATTTANAGACNGTTNTTATTTCATTAATTCTTTCATACAATTCTTCAATTAANAGACAATTNATTATG]




>consensus_2767#0
NCTGACACTGATCAGCNCAAAGCNNATGACGTTATTGAAGGCACTATCGANGTAGAAGAT
ACAAAAGNTCAATTGNACCTGCCCGGGCNGCCGCTCCGACTATAATNGGNATCTTGGGTC
AACATCNANGTCTCAAACATCTTTATCTATATGGTCTATCAAANGATATTACGCTGTTAT
CCCTAANGTAATTTATNCTNTTAANTACNNTTTATAATTCAAANAATTATCTTTATATCA
AAATTAAATCTTAAATAAAGNNTATTAAATTTACCAATCCTCCCAATCAAATTTAATCTT
AAATATATCTATTAAAATTNTAAATAAATTNNANAATTAAATTAAATTCTATANGGTCTT
ATCGTCCCATAATTAAATTTTAGAATCTTAACTAAAAATTTAAATTCATTTAATAATTTA
NAGACNGTTNTTATTTCATTAATTCTTTCATACAATTCTTCAATTAANAGACAATTNATT
ATG

consensusID : consensus_2767#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 407
fasta sequence

                              [TTACATAATATATTTAAGATTAAATTTGATTGGGAGGATTGGTAAATTTAATAAACTTTATTTAAGATTTAATTTTGATATAAAGATAATTTAATAGGGAATTTGAGTCCAATTGTTACTGCTTTTATTNNNATGGTTAAAGCAGAGAGATTGATTCGAAAATATACAAGGCTACAGATTTTACCTCCTTTAAAAGATGTAATGCATCGCCCAGAANNAGGAACTACTTTGAGGGCGAAGTTGTNNNAATTATTAACTTCTCCTTTGATAGAGTTACGNAATCTCGTTGCCGAGGTTTTATTCATACTCTGTAAAGAAAATGTTACTCGTATGGTAAAATATACGGGATATGGAAATGCTGCTGGAATGTTTGCAAACAAAGGATTATTGGGACCAAATAAAAAAAT]

[+] EMBL BI516642             [TTACATAATATATTTAAGATTAAATTTGATTGGGAGGATTGGTAAATTTAATAAACTTTATTTAAGATTTAATTTTGATATAAAGATAATTTAATAGGGAATTTGAGTCCAATTGTTACTGCTTTTATTNNNATGGTTAAAGCAGAGAGATTGATTCGAAAATATACAAGGCTACAGATTTTACCTCCTTTAAAAGATGTAATGCATCGCCCAGAANNAGGAACTACTTTGAGGGCGAAGTTGTNNNAATTATTAACTTCTCCTTTGATAGAGTTACGNAATCTCGTTGCCGAGGTTTTATTCATACTCTGTAAAGAAAATGTTACTCGTATGGTAAAATATACGGGATATGGAAATGCTGCTGGAATGTTTGCAAACAAAGGATTATTGGGACCAAATAAAAAAAT]




>consensus_2767#1
TTACATAATATATTTAAGATTAAATTTGATTGGGAGGATTGGTAAATTTAATAAACTTTA
TTTAAGATTTAATTTTGATATAAAGATAATTTAATAGGGAATTTGAGTCCAATTGTTACT
GCTTTTATTNNNATGGTTAAAGCAGAGAGATTGATTCGAAAATATACAAGGCTACAGATT
TTACCTCCTTTAAAAGATGTAATGCATCGCCCAGAANNAGGAACTACTTTGAGGGCGAAG
TTGTNNNAATTATTAACTTCTCCTTTGATAGAGTTACGNAATCTCGTTGCCGAGGTTTTA
TTCATACTCTGTAAAGAAAATGTTACTCGTATGGTAAAATATACGGGATATGGAAATGCT
GCTGGAATGTTTGCAAACAAAGGATTATTGGGACCAAATAAAAAAAT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_2767#0      NCTGACACTGATCAGCNCAAAGCNNATGACGTTATTGAAGGCACTATCGANGTAGAAGAT 60
consensus_2767#1      ---------------------TTACATAATATATTTAAGATTAAATTTGATTGGGAGGAT 39
                                               ** *  *  ** *    *   * **    ** ***

consensus_2767#0      ACAAAAGNTCAATTGNACCTGCCCGGGCNGCCGCTCCGACTATAATNGGNATCTTGGGTC 120
consensus_2767#1      TGGTAAATTTAATAAACTTTATTTAAGATTTAATTTTGA-TATAA-AGATAATTTAATAG 97
                          **  * ***      *      *       *  ** *****  *  *  **     

consensus_2767#0      AACATCNANGTCTCA-----AACATCTTTATCTATATGGTCTATCAAANGATATT-ACGC 174
consensus_2767#1      GGAATTTGAGTCCAATTGTTACTGCTTTTATTNNNATGGTTAAAGCAGAGAGATTGATTC 157
                         **    ***  *     *     *****    *****  *   *  ** *** *  *

consensus_2767#0      TGTTATCCCTAANGTAATTTATNCTNTTAANTACNNTTTATAATTCAAANAATTATCTTT 234
consensus_2767#1      GAAAATATACAAGGCTACAGA---TTTTACCTCCTTTAAAAGATGTAATGCATCGCCCAG 214
                          **    ** *  *   *   * ***  * *  *  *  **  **   **   *   

consensus_2767#0      ATATCAAAATTAAATCTTAAATAAAGNNTATTAAATTTACCAATCCTCCCAATCAAATTT 294
consensus_2767#1      A-ANNAGGAACTACTTTGAGGGCGAAGTTGTNNNAATTATTAA-CTTCTCCTTTGATAGA 272
                      * *  *  *   * * * *     *   * *   * ***  ** * ** *  *  *    

consensus_2767#0      AATCTTAAATATATCTATTAAAATTNTAAATAAATTNNANAATTAAATTAAATTCTATAN 354
consensus_2767#1      GTTACGNAATCTCGTTGCCGAGGTTTTATTCATACTCTGTAAAGAAAATGTTACTCGTAT 332
                        *    *** *   *    *  ** **   * * *    **  *** *        ** 

consensus_2767#0      GGTCTTATCGTCCCATAATTAAATTTTAGAATCTTAACTAAAAATTTAAATTCATTTAAT 414
consensus_2767#1      GGTAAAAT------ATA-CGGGATATGGAAATGCTGCTGGAATGTTTGCAAACAAAGGAT 385
                      ***   **      ***     ** *   ***  *     **  ***  *  **    **

consensus_2767#0      AATTTANAGACNGTTNTTATTTCATTAATTCTTTCATACAATTCTTCAATTAANAGACAA 474
consensus_2767#1      TATTGGGACCAAATAAAAAAAT-------------------------------------- 407
                       ***   *     *    *  *                                      

consensus_2767#0      TTNATTATG 483
consensus_2767#1      ---------

Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr)