Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 2852 cluster # 2852       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2852#0 length = 886 sequences # 2  

consensusID : consensus_2852#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 886
fasta sequence
                              [CGAGCTTTTCTTGGTCCACTCCCCCAAGGATTTTTAAGATTGGAAGAGCGTAATGTACAATTACAACAAGAAGCAGCAGACCAACAAGCTGCACTTGCACTTCATCAATTGCAAATGCAGAATATGCCTGCTATGCATGAACCTCATGTTGGCAGACTTAGCATAACAATTGTTCAGGCTAAACTTGTAAAAAATTATGGAATGACAAGAATGGATCCTTATGTGAGATTAAGAGTAGGTCATGCTGTATATGAAACACATACATGTTCAAATGGAGCAAAAAATCCACATTGGAATAAAGTTATTCAATGCTATTTGCCACCAGGAGTTTTACAAATCTATATAGAAATTTATGATGAATGTTCTTTTGTAATGGATGAATTAATTGCATGGGGTCATATAGATATCCCACCACAAGTTCTTCAAAAAGGAGAGACACATGAAGATTGGTACATGCTTAGTGGAAAGCAAGGAGATAATCAAGAGGGAATGATAAATTTAGTTTTTAGTTATACGACTAAGTGTCAGTCTTATATGAGTGCCCCTCCAATTATGATGGTTCCTTCTTCAACAATGTTTGGTATGACCCGATATGCCCCAGTAAATGTTTACACAGCACCAACTACAGCTACTGTATCAGCTGTTATTCCTAGTTCTATGCCAAATGCTGAAGTTGAATTAAAACAGATTTCAGAGATGTTTCCAAATGTGGATAAAGAAGTAATTAAATCAGTCTATGATGCAAATAATGGAAAAAAGGATGTAACTATAAATTCATTACTCCAAATGTGTGAATAAGTAATTTTATATACAAATTGCTATTTAATTCCAAAGGCCATGTTTATGTTTTCTGCTATGTTGTAGGTCTTTTGAATGGTAATATATT]

[+] EMBL BI513331             [CGAGCTTTTCTTGGTCCACTCCCCCAAGGATTTTTAAGATTGGAAGAGCGTAATGTACAATTACAACAAGAAGCAGCAGACCAACAAGCTGCACTTGCACTTCATCAATTGCAAATGCAGAATATGCCTGCTATGCATGAACCTCATGTTGGCAGACTTAGCATAACAATTGTTCAGGCTAAACTTGTAAAAAATTATGGAATGACAAGAATGGATCCTTATGTGAGATTAAGAGTAGGTCATGCTGTATATGAAACACATACATGTTCAAATGGAGCAAAAAATCCACATTGGAATAAAGTTATTCAATGCTATTTGCCACCAGGAGTTTTACAAATCTATATAGAAATTTATGATGAATGTTCTTTTGTAATGGATGAATTAATTGCATGGGGTCATATAGATATCCCACCACAAGTTCTTCAAAAAGGAGAGACACATGAAGATTGGTACATGCTTAGTGGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL BQ103799             [                                                                                                                                                                                     AACTTGTAAAAAATTATGGAATGACAAGAATGGATCCTTATGTGAGATTAAGAGTAGGTCATGCTGTATATGAAACACATACATGTTCAAATGGAGCAAAAAATCCACATTGGAATAAAGTTATTCAATGCTATTTGCCACCAGGAGTTTTACAAATCTATATAGAAATTTATGATGAATGTTCTTTTGTAATGGATGAATTAATTGCATGGGGTCATATAGATATCCCACCACAAGTTCTTCAAAAAGGAGAGACCCATGAAGATTGGTACATGCTTAGTGGAAAGCAAGGAGATAATCAAGAGGGAATGATAAATTTAGTTTTTAGTTATACGACTAAGTGTCAGTCTTATATGAGTGCCCCTCCAATTATGATGGTTCCTTCTTCAACAATGTTTGGTATGACCCGATATGCCCCAGTAAATGTTTACACAGCACCAACTACAGCTACTGTATCAGCTGTTATTCCTAGTTCTATGCCAAATGCTGAAGTTGAATTAAAACAGATTTCAGAGATGTTTCCAAATGTGGATAAAGAAGTAATTAAATCAGTCTATGATGCAAATAATGGAAAAAAGGATGTAACTATAAATTCATTACTCCAAATGTGTGAATAAGTAATTTTATATACAAATTGCTATTTAATTCCAAAGGCCATGTTTATGTTTTCTGCTATGTTGTAGGTCTTTTGAATGGTAATATATT]


>consensus_2852#0 CGAGCTTTTCTTGGTCCACTCCCCCAAGGATTTTTAAGATTGGAAGAGCGTAATGTACAA TTACAACAAGAAGCAGCAGACCAACAAGCTGCACTTGCACTTCATCAATTGCAAATGCAG AATATGCCTGCTATGCATGAACCTCATGTTGGCAGACTTAGCATAACAATTGTTCAGGCT AAACTTGTAAAAAATTATGGAATGACAAGAATGGATCCTTATGTGAGATTAAGAGTAGGT CATGCTGTATATGAAACACATACATGTTCAAATGGAGCAAAAAATCCACATTGGAATAAA GTTATTCAATGCTATTTGCCACCAGGAGTTTTACAAATCTATATAGAAATTTATGATGAA TGTTCTTTTGTAATGGATGAATTAATTGCATGGGGTCATATAGATATCCCACCACAAGTT CTTCAAAAAGGAGAGACACATGAAGATTGGTACATGCTTAGTGGAAAGCAAGGAGATAAT CAAGAGGGAATGATAAATTTAGTTTTTAGTTATACGACTAAGTGTCAGTCTTATATGAGT GCCCCTCCAATTATGATGGTTCCTTCTTCAACAATGTTTGGTATGACCCGATATGCCCCA GTAAATGTTTACACAGCACCAACTACAGCTACTGTATCAGCTGTTATTCCTAGTTCTATG CCAAATGCTGAAGTTGAATTAAAACAGATTTCAGAGATGTTTCCAAATGTGGATAAAGAA GTAATTAAATCAGTCTATGATGCAAATAATGGAAAAAAGGATGTAACTATAAATTCATTA CTCCAAATGTGTGAATAAGTAATTTTATATACAAATTGCTATTTAATTCCAAAGGCCATG TTTATGTTTTCTGCTATGTTGTAGGTCTTTTGAATGGTAATATATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)