Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 2871 cluster # 2871       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2871#0 length = 673 sequences # 2  
consensusID : consensus_2871#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 673
fasta sequence 
                              [TTATATAGCACGTTTTGAAATTATCTCTTAATATATAGTATCTATATTATATCGTTGCATCTTTTCTCGATCGATAATATTAAAAAGAGATAAAAAATTGATAGATATCTACCATACTGTAGATAATATATCAATCTATTTCAGAATTTGCTGTTTTAAACTTAATATTCTATTCTCTGTTATACTATTTCAATTGGACAAGTTTAGCACGTGATGTTCAAATAGTTTATGTACGTAGGTGTGACTTGTCAGCTGATATATTATCAAGAATTGTTAAATTAATAATTCTTTTTTTAAATTTGCTCTGTTACTTTTGATTTTTTAAAATAATGGCTCTTCATTCCGCGGGGAAAGGTAAACTTCTTGCTGTAATAGGAGACGAGGATACTTGTGTAGGATTTCTCTTGGGAGGAGTTGGCGAGATTAATAAACATCGTCAACCTAACTTTATGGTTGTAGATAAAAATACAGCTGTAAGTGATATAGAAGATACATTTAAACGTTTTATTAAACGAGATGATATTGATATTATACTTATCAATCAAAATGTTGCTGAAATGATCCGTCATGTAATTGATAGCCACACACAACCTATACCATCAGTATTAGAAATTCCAAGTAAAGATCATCCATATGATGCTACTAAAGATTCTATTTTAAGGCGTGCTAAGGG]

[+] EMBL BI515144             [TTATATAGCACGTTTTGAAATTATCTCTTAATATATAGTATCTATATTATATCGTTGCATCTTTTCTCGATCGATAATATTAAAAAGAGATAAAAAATTGATAGATATCTACCATACTGTAGATAATATATCAATCTATTTCAGAATTTGCTGTTTTAAACTTAATATTCTATTCTCTGTTATACTATTTCAATTGGACAAGTTTAGCACGTGATGTTCAAATAGTTTATGTACGTAGGTGTGACTTGTCAGCTGATATATTATCAAGAATTGTTAAATTAATAATTCTTTTTTTAAATTTGCTCTGTTACTTTTGATTTTTTAAAATAATGGCTCTTCATTCCGCGGGGAAAGGTAAACTTCTTGCTGTAATAGGAGACGAGGATACTTGTGTAGGATTTCTCTTGGGAGGAGTTGGCGAGATTAATAAACATCG                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI508478             [                                                                                                                                                                     TTTTTTTTTTTTTTTTATACTATTTCAATTGGACAAGTTTAGCACGTGATGTTCAAATAGTTTATGTACGTAGGTGTGACTTGTCAGCTGATATATTATCAAGAATTGTTAAATTAATAATTCTTTTTTTAAATTTGCTCTGTTACTTTTGATTTTTTAAAATAATGGCTCTTCATTCCGCGGGGAAAGGTAAACTTCTTGCTGTAATAGGAGACGAGGATACTTGTGTAGGATTTCTCTTGGGAGGAGTTGGCGAGATTAATAAACATCGTCAACCTAACTTTATGGTTGTAGATAAAAATACAGCTGTAAGTGATATAGAAGATACATTTAAACGTTTTATTAAACGAGATGATATTGATATTATACTTATCAATCAAAATGTTGCTGAAATGATCCGTCATGTAATTGATAGCCACACACAACCTATACCATCAGTATTAGAAATTCCAAGTAAAGATCATCCATATGATGCTACTAAAGATTCTATTTTAAGGCGTGCTAAGGG]




>consensus_2871#0
TTATATAGCACGTTTTGAAATTATCTCTTAATATATAGTATCTATATTATATCGTTGCAT
CTTTTCTCGATCGATAATATTAAAAAGAGATAAAAAATTGATAGATATCTACCATACTGT
AGATAATATATCAATCTATTTCAGAATTTGCTGTTTTAAACTTAATATTCTATTCTCTGT
TATACTATTTCAATTGGACAAGTTTAGCACGTGATGTTCAAATAGTTTATGTACGTAGGT
GTGACTTGTCAGCTGATATATTATCAAGAATTGTTAAATTAATAATTCTTTTTTTAAATT
TGCTCTGTTACTTTTGATTTTTTAAAATAATGGCTCTTCATTCCGCGGGGAAAGGTAAAC
TTCTTGCTGTAATAGGAGACGAGGATACTTGTGTAGGATTTCTCTTGGGAGGAGTTGGCG
AGATTAATAAACATCGTCAACCTAACTTTATGGTTGTAGATAAAAATACAGCTGTAAGTG
ATATAGAAGATACATTTAAACGTTTTATTAAACGAGATGATATTGATATTATACTTATCA
ATCAAAATGTTGCTGAAATGATCCGTCATGTAATTGATAGCCACACACAACCTATACCAT
CAGTATTAGAAATTCCAAGTAAAGATCATCCATATGATGCTACTAAAGATTCTATTTTAA
GGCGTGCTAAGGG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)