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Apis mellifera
cluster # 288 cluster # 288       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_288#0 length = 1000 sequences # 5  
consensusID : consensus_288#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1000
fasta sequence 
                              [GTTCATTGGTACATTGTGAAAACCAATTGCGCTAAATAAGGTTATTTTTAAAATTTCAACATGACATTTTTAAAAACTGTACAACCAGGTTTAAAATTATTTCAAACATATCCAAAAATTTTAAATGTACCTTTACGTCGAACTAAATATTACACTGTTTACTCAGAGGAAAATAAAGAAAAATTTCTTGACGAGGCAGTAAATAGATCATTCTTCTTAGAAATCATACGAGGTTTAGGAATTACAATGTCACATTTCTTTACTGAACCTGCAACAATAAACTATCCTTTTGAAAAAGGCCCTTTAAGTCCAAGATTTAGAGGTGAACATGCATTAAGAAGATATCCATCAGGAGAAGAAAGATGTATTGCATGTAAATTATGTGAAGCTATTTGTCCAGCACAAGCAATTACTATTGAAGCAGAGGAGAGAGCTGATGGATCTCGTCGTACAACAAGATATGACATAGATATGACAAAATGTATATATTGTGGATTTTGTCAAGAAGCTTGTCCAGTGGATGCAATCGTAGAGGGTCCCAACTTCGAATTTTCCACAGAGACACATGAAGAGTTATTATATAATAAAGAAAAACTATTAAATAATGGAGATAAATGGGAATCAGAAATTGCTAGCAATATTCATGCTGATTATCTCTATCGATAAATTTAATAAATCATATAATGTAGTCAAATATTACATATATTATTAGTAATAAAAAATATTTATTGTATAATATTTACCAGCAATAATTAGATTTTGAAATATCAAAATCGATCTATTATTCGTTCAATCGCTATTTTTTTGTAAAAAAATCATTTAATACAAAATTAATTTTATTTTTAACCTCTTCGGTATAATCATTGATTTTAATCATTCCTCGTCGAACGAATAAACAATCATTTGTTTTAATTGATATTTGAATAAAAACAAATGATCTATCGTCGAGTTGAACATAGTATACGTGGCAGATGAATGCCATACGAAAGAAAAGGTTAAA]

[+] EMBL BI517267             [GTTCATTGGTACATTGTGAAAACCAATTGCGCTAAATAAGGTTATTTTTAAAATTTCAACATGACATTTTTAAAAACTGTACAACCAGGTTTAAAATTATTTCAAACATATCCAAAAATTTTAAATGTACCTTTACGTCGAACTAAATATTACACTGTTTACTCAGAGGAAAATAAAGAAAAATTTCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI504866             [                                                      TTCAACATGACATTTTTAAAAACTGTACAACCAGGTTTAAAATTATTTCAAACATATCCAAAAATTTTAAATGTACCTTTACGTCGAACTAAATATTACACTGTTTACTCAGAGGAAAATAAAGAAAAATTTCTTGACGAGGCAGTAAATAGATCATTCTTCTTAGAAATCATACGAGGTTTAGGAATTACAATGTCACATTTCTTTACTGAACCTGCAACAATAAACTATCCTTTTGAAAAAGGCCCTTTAAGTCCAAGATTTAGAGGTGAACATGCATTAAGAAGATATCCATCAGGAGAAGAAAGATGTATTGCATGTAAATTATGTGAAGCTATTTGTCCAGCACAAGCAATTACTATTGAAGCAGAGGAGAGAGCTGATGGATCTCGTCGTACAACAAGATATGACATAGATATGACAAAATGTATATATTGTGGATTTTGTCAAGAAGCTTGTCCAGTGGATGCAATCGTAGAGGGTCCCAACTTCGAATTTTCCACAGAGACACATGAAGAGTTATTATATAATAAAGAAAAACTATTAAATAATGGAGATAAATGGGAATCAGAAATTGCTAGCAATATTCATGCTGATTATCTCTATCGATAAATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI506551             [                                                                                                                         TAAATGTACCTTTACGTCGAA NNNATATTACACTGTTTACTCAGAGGAAAATAAAGAAAAATTTCTTGACGAGGCAGTAAATAGATCATTCTTCTTAGAAATCATACGAGGTTTAGGAATTACAATGTCACATTTCTTTACTGAACCTGCAACAATAAACTATCCTTTTGAAAAAGGCCCTTTAAGTCCAAGATTTAGAGGTGAACATGCATTAAGAAGATATCCATCAGGAGAAGAAAGATGTATTGCATGTAAATTATGTGAAGCTATTTGTCCAGCACAAGCAATTACTATTGAAGCAGAGGAGAGAGCTGATGGATCTCGTCGTACAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI517278             [                                                                                                                                     TACGTCGAACTAAATATTACACTGTTTACTCAGAGGAAAATAAAGAAAAATTTCTTGACGAGGCAGTAAATAGATCATTCTTCTTAGAAATCATACGAGGTTTAGGAATTACAATGTCACATTTCTTTACTGAACCTGCAACAATAAACTATCCTTTTGAAAAAGGCCCTTTAAGTCCAAGATTTAGAGGTGAACATGCATTAAGAAGATATCCATCAGGAGAAGAAAGATGTATTGCATGTAAATTATGTGAAGCTATTTGTCCAGCACAAGCAATTACTATTGAAGCAGAGGAGAGAGCTGATGGATCTCGTCGTACAACAAGATATGACATAGATATGACAAAATGTATATATTGTGGATTTTGTCAAGAAGCTTGTCCAGTGGATGCAATCGTAGNGGGTCCCAACTTCGAATTTTCCACAGAGACACATGAAGAGTTATTATATAATAAAGAAAAACTATTAAATAATGGAGATAAATGGGAATCAGAAATTGCTAGCAATATTCATGCTGATTATCTCTATCGATAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL BI504756             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATGACAAAATGTATATATTGTGGATTTTGTCAAGAAGCTTGTCCAGTGGATGCAATCGTAGAGGGTCCCAACTTCGAATTTTCCACAGAGACACATGAAGAGTTATTATATAATAAAGAAAAACTATTAAATAATGGAGATAAATGGGAATCAGAAATTGCTAGCAATATTCATGCTGATTATCTCTATCGATAAATTTAATAAATCATATAATGTAGTCAAATATTACATATATTATTAGTAATAAAAAATATTTATTGTATAATATTTACCAGCAATAATTAGATTTTGAAATATCAAAATCGATCTATTATTCGTTCAATCGCTATTTTTTTGTAAAAAAATCATTTAATACAAAATTAATTTTATTTTTAACCTCTTCGGTATAATCATTGATTTTAATCATTCCTCGTCGAACGAATAAACAATCATTTGTTTTAATTGATATTTGAATAAAAACAAATGATCTATCGTCGAGTTGAACATAGTATACGTGGCAGATGAATGCCATACGAAAGAAAAGGTTAAA]




>consensus_288#0
GTTCATTGGTACATTGTGAAAACCAATTGCGCTAAATAAGGTTATTTTTAAAATTTCAAC
ATGACATTTTTAAAAACTGTACAACCAGGTTTAAAATTATTTCAAACATATCCAAAAATT
TTAAATGTACCTTTACGTCGAACTAAATATTACACTGTTTACTCAGAGGAAAATAAAGAA
AAATTTCTTGACGAGGCAGTAAATAGATCATTCTTCTTAGAAATCATACGAGGTTTAGGA
ATTACAATGTCACATTTCTTTACTGAACCTGCAACAATAAACTATCCTTTTGAAAAAGGC
CCTTTAAGTCCAAGATTTAGAGGTGAACATGCATTAAGAAGATATCCATCAGGAGAAGAA
AGATGTATTGCATGTAAATTATGTGAAGCTATTTGTCCAGCACAAGCAATTACTATTGAA
GCAGAGGAGAGAGCTGATGGATCTCGTCGTACAACAAGATATGACATAGATATGACAAAA
TGTATATATTGTGGATTTTGTCAAGAAGCTTGTCCAGTGGATGCAATCGTAGAGGGTCCC
AACTTCGAATTTTCCACAGAGACACATGAAGAGTTATTATATAATAAAGAAAAACTATTA
AATAATGGAGATAAATGGGAATCAGAAATTGCTAGCAATATTCATGCTGATTATCTCTAT
CGATAAATTTAATAAATCATATAATGTAGTCAAATATTACATATATTATTAGTAATAAAA
AATATTTATTGTATAATATTTACCAGCAATAATTAGATTTTGAAATATCAAAATCGATCT
ATTATTCGTTCAATCGCTATTTTTTTGTAAAAAAATCATTTAATACAAAATTAATTTTAT
TTTTAACCTCTTCGGTATAATCATTGATTTTAATCATTCCTCGTCGAACGAATAAACAAT
CATTTGTTTTAATTGATATTTGAATAAAAACAAATGATCTATCGTCGAGTTGAACATAGT
ATACGTGGCAGATGAATGCCATACGAAAGAAAAGGTTAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)