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Apis mellifera
cluster # 2934 cluster # 2934       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2934#0 length = 904 sequences # 2  

consensusID : consensus_2934#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 904
fasta sequence
                              [AACCTCTGATGGTGATGCTCGTATAGCATTAGGTGGTTTGGAATTAGCAGTTCAATGCAAATTACCAAACAATGAAGACTTTTTGAAGAATGGTCCTGTGACTATTACATTAGATGATATTAAAGAAAGTCTTAAAAAAACTCATATGTTATATGATAAGAAAGGTGACCAGCATTATGATATGATTTCAGCTTTACATAAATCTGTTAGAGCAAGTGATGAAAATGCTTCTCTTTATTGGTTAACAAGAATGATATTAGGTGGAGAAGATCCAAATTATATTGCACGAAGATTAGTTAGAATGGCATGTGAAGATATTGGTTTAGAAGATCCAAAAGCTCTTGGTACCAAACATAACTAATAATTATTTTAATTCAAATTATTTGGTTTAGATTAGATACATAGTACCTATAATTTTGCTAATAATTGTCTCTAATAATTTCCC-GTAATTTCTAAAATAATTTTCAGAAATTGCTATAAATACAATGCATGGCTGTAAGATGATAGGAATGTCTGAATGTAATGTCCTTTTAGCACAATGTACGATATATTTAGCCAGAGCTCCAAAATCTAGATTGATGGAAGATGCACTTAGAGCTGCTCAAAGAGTAATAGCTGAACATAAAGGACCTCAACCAGGTGTACCTTTACATTTAAGAAATGCCCCAACAAAGCTTATGAAAAATTTAGGATACAGTAAAGGTTACAATATGAAACACAAAAATGAATCAGGTTTGAATTATTTGCCAGAAGGATTAGAAAATATAAATTTTTTTGATTATCATTAAAATTATATATGTGCATACATATATCTTAAATAAAAAAATGTATATAAACTATTATAATGTAATTATAACATTAAGAAATATATTTTAAAAATTATAATAAAAATTATTTCTTAATA]

[+] EMBL BI508050             [AACCTCTGATGGTGATGCTCGTATAGCATTAGGTGGTTTGGAATTAGCAGTTCAATGCAAATTACCAAACAATGAAGACTTTTTGAAGAATGGTCCTGTGACTATTACATTAGATGATATTAAAGAAAGTCTTAAAAAAACTCATATGTTATATGATAAGAAAGGTGACCAGCATTATGATATGATTTCAGCTTTACATAAATCTGTTAGAGCAAGTGATGAAAATGCTTCTCTTTATTGGTTAACAAGAATGATATTAGGTGGAGAAGATCCAAATTATATTGCACGAAGATTAGTTAGAATGGCATGTGAAGATATTGGTTTAGAAGATCCAAAAGCTCTTGGTACCAAACATAACTAATAATTATTTTAATTCAAATTATTTGGTTTAGATTAGATACATAGTACCTATAATTTTGCTAATAATTGTCTCTAATAATTTCCCTGTAATTTCTAAAATAATTTTCAGAAATTGCTATAAATACAATGCATGGCTGTAAGATGATAGGAATGTCTGAATGTAATGTCCTTTTAGCACAATGTACGATATATTTAGCCAGAGCTCCAAAATCTAGATTGATGGAAGATGCACTTAGAGCTGCTCAAAGAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL BQ103754             [                                                                                                                                                                                                                  AGCAAGTGATGAAAATGCTTCTCTTTATTGGTTAACAAGAATGATATTAGGTGGAGAAGATCCAAATTATATTGCACGAAGATTAGTTAGAATGGCATGTGAAGATATTGGTTTAGAAGATCCAAAAGCTCTTGGTACCAAACATAACTAATAATTATTTTAATTCAAATTATTTGGTTTAGATTAGATACATAGTACCTATAATTTTGCTAATTATTGTCTCTAATAATTTCCC GTAATTTCTAAAATAATTTTCAGAAATTGCTATAAATACAATGCATGGCTGTAAGATGATAGGAATGTCTGAATGTAATGTCCTTTTAGCACAATGTACGATATATTTAGCCAGAGCTCCAAAATCTAGATTGATGGAAGATGCACTTAGAGCTGCTCAAAGAGTAATAGCTGAACATAAAGGACCTCAACCAGGTGTACCTTTACATTTAAGAAATGCCCCAACAAAGCTTATGAAAAATTTAGGATACAGTAAAGGTTACAATATGAAACACAAAAATGAATCAGGTTTGAATTATTTGCCAGAAGGATTAGAAAATATAAATTTTTTTGATTATCATTAAAATTATATATGTGCATACATATATCTTAAATAAAAAAATGTATATAAACTATTATAATGTAATTATAACATTAAGAAATATATTTTAAAAATTATAATAAAAATTATTTCTTAATA]


>consensus_2934#0 AACCTCTGATGGTGATGCTCGTATAGCATTAGGTGGTTTGGAATTAGCAGTTCAATGCAA ATTACCAAACAATGAAGACTTTTTGAAGAATGGTCCTGTGACTATTACATTAGATGATAT TAAAGAAAGTCTTAAAAAAACTCATATGTTATATGATAAGAAAGGTGACCAGCATTATGA TATGATTTCAGCTTTACATAAATCTGTTAGAGCAAGTGATGAAAATGCTTCTCTTTATTG GTTAACAAGAATGATATTAGGTGGAGAAGATCCAAATTATATTGCACGAAGATTAGTTAG AATGGCATGTGAAGATATTGGTTTAGAAGATCCAAAAGCTCTTGGTACCAAACATAACTA ATAATTATTTTAATTCAAATTATTTGGTTTAGATTAGATACATAGTACCTATAATTTTGC TAATAATTGTCTCTAATAATTTCCCGTAATTTCTAAAATAATTTTCAGAAATTGCTATAA ATACAATGCATGGCTGTAAGATGATAGGAATGTCTGAATGTAATGTCCTTTTAGCACAAT GTACGATATATTTAGCCAGAGCTCCAAAATCTAGATTGATGGAAGATGCACTTAGAGCTG CTCAAAGAGTAATAGCTGAACATAAAGGACCTCAACCAGGTGTACCTTTACATTTAAGAA ATGCCCCAACAAAGCTTATGAAAAATTTAGGATACAGTAAAGGTTACAATATGAAACACA AAAATGAATCAGGTTTGAATTATTTGCCAGAAGGATTAGAAAATATAAATTTTTTTGATT ATCATTAAAATTATATATGTGCATACATATATCTTAAATAAAAAAATGTATATAAACTAT TATAATGTAATTATAACATTAAGAAATATATTTTAAAAATTATAATAAAAATTATTTCTT AATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)