Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 2941 cluster # 2941       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2941#0 length = 1132 sequences # 2  
consensusID : consensus_2941#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1132
fasta sequence 
                              [TTGCAACATAGAAAGAATGAATGGTCTCCGATCATCACAAGAAAGTGCTTATTATGGACTCACTGAATTTTCTGACATGTCGGAAAACGAATTTTTGTTACATACCCTTTTACCTGACTTACCAATAAGAGGAGAAAAACACATGAATGCATCGTATCATCGCAAGCATCAGGTATCTATCGATCGAATGAAAAGATCAATTAGTATACCTTTAAGATTCGATTGGAGAGATAAAGGGGTCATCACTCCAGTACGTAGTCAAGGATCTTGTGGTGCTTGTTGGGCTTTTAGTACTATTGAAGTTATCGAATCGATGTTTGCAATAAAAAATGGCACTCTACATTCTTTGAGCGTACAAGAAATGATTGATTGTGCGAAAAATAGTAATTTTGGATGTGAAGGAGGAGATATATGCAGTTTGCTCTCGTGGTTGTTAATATCAAAAGTTCAGATACTTCAAGAATCTATTTATCCGCTTGTAGGAATGACGGGTACATGTAAACTTGGAAAAATGACAGATAAAACATTTAATATAAAAATACAAGATTTTACGTGTGATAGTTTCGTAGATGCAGAGGATGAGTTATTGATAGCACTGGCCACTCATGGACCAGTAGCGGCAGCAGTAAATGCTTTATCCTGGCAAAACTATTTAGGTGGAGTAATACAATATCATTGTGATGGTTCTTTTAATAATCTGAATCATGCTGTACAAATAATAGGATATGATAAATCAGTTGCCGTATCCCCATTATATTATAAAAAATTCCATGGGGATCAAATTTCGGAGACAAAGGCTATATGTACATAGGAATAGGCAATAATTTATGCGGCATAGCAAATCAAGTTTCATCATTGGATACTTTTTAAGACAATCCATTAATATAAATGAAAATACTTGAAGAAATATTTATATCAATTTTAAAATGTACATAAATTTATAAATGTGTTCTTTAATCGAGATAAGAAATGACATGAAATAATATTATTAATAATAATAATAATATATATTAAATTATAACTCCAATATTTGTTATATAATTAACAGAATATTTAACGTTAATATTGTACTGTATATTTATCTTTATACAGTGATTTACATATTTTTTTATAAATATTTTGGTCCACACCT]

[+] EMBL BI508012             [TTGCAACATAGAAAGAATGAATGGTCTCCGATCATCACAAGAAAGTGCTTATTATGGACTCACTGAATTTTCTGACATGTCGGAAAACGAATTTTTGTTACATACCCTTTTACCTGACTTACCAATAAGAGGAGAAAAACACATGAATGCATCGTATCATCGCAAGCATCAGGTATCTATCGATCGAATGAAAAGATCAATTAGTATACCTTTAAGATTCGATTGGAGAGATAAAGGGGTCATCACTCCAGTACGTAGTCAAGGATCTTGTGGTGCTTGTTGGGCTTTTAGTACTATTGAAGTTATCGAATCGATGTTTGCAATAAAAAATGGCACTCTACATTCTTTGAGCGTACAAGAAATGATTGATTGTGCGAAAAATAGTAATTTTGGATGTGAAGGAGGAGATATATGCAGTTTGCTCTCGTGGTTGTTAATATCAAAAGTTCAGATACTTCAAGAATCTATTTATCCGCTTGTAGGAATGACGGGTACATGTAAACTTGGAAAAATGACAGATAAAACATTTAATATAAAAATACAAGATTTTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL BQ103781             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGATTGTGCGAAAAATAGTAATTTTGGATGTGAAGGAGGAGATATATGCAGTTTGCTCTCGTGGTTGTTAATATCAAAAGTTCAGATACTTCAAGAATCTATTTATCCGCTTGTAGGAATGACGGGTACATGTAAACTTGGAAAAATGACAGATAAAACATTTAATATAAAAATACAAGATTTTACGTGTGATAGTTTCGTAGATGCAGAGGATGAGTTATTGATAGCACTGGCCACTCATGGACCAGTAGCGGCAGCAGTAAATGCTTTATCCTGGCAAAACTATTTAGGTGGAGTAATACAATATCATTGTGATGGTTCTTTTAATAATCTGAATCATGCTGTACAAATAATAGGATATGATAAATCAGTTGCCGTATCCCCATTATATTATAAAAAATTCCATGGGGATCAAATTTCGGAGACAAAGGCTATATGTACATAGGAATAGGCAATAATTTATGCGGCATAGCAAATCAAGTTTCATCATTGGATACTTTTTAAGACAATCCATTAATATAAATGAAAATACTTGAAGAAATATTTATATCAATTTTAAAATGTACATAAATTTATAAATGTGTTCTTTAATCGAGATAAGAAATGACATGAAATAATATTATTAATAATAATAATAATATATATTAAATTATAACTCCAATATTTGTTATATAATTAACAGAATATTTAACGTTAATATTGTACTGTATATTTATCTTTATACAGTGATTTACATATTTTTTTATAAATATTTTGGTCCACACCT]




>consensus_2941#0
TTGCAACATAGAAAGAATGAATGGTCTCCGATCATCACAAGAAAGTGCTTATTATGGACT
CACTGAATTTTCTGACATGTCGGAAAACGAATTTTTGTTACATACCCTTTTACCTGACTT
ACCAATAAGAGGAGAAAAACACATGAATGCATCGTATCATCGCAAGCATCAGGTATCTAT
CGATCGAATGAAAAGATCAATTAGTATACCTTTAAGATTCGATTGGAGAGATAAAGGGGT
CATCACTCCAGTACGTAGTCAAGGATCTTGTGGTGCTTGTTGGGCTTTTAGTACTATTGA
AGTTATCGAATCGATGTTTGCAATAAAAAATGGCACTCTACATTCTTTGAGCGTACAAGA
AATGATTGATTGTGCGAAAAATAGTAATTTTGGATGTGAAGGAGGAGATATATGCAGTTT
GCTCTCGTGGTTGTTAATATCAAAAGTTCAGATACTTCAAGAATCTATTTATCCGCTTGT
AGGAATGACGGGTACATGTAAACTTGGAAAAATGACAGATAAAACATTTAATATAAAAAT
ACAAGATTTTACGTGTGATAGTTTCGTAGATGCAGAGGATGAGTTATTGATAGCACTGGC
CACTCATGGACCAGTAGCGGCAGCAGTAAATGCTTTATCCTGGCAAAACTATTTAGGTGG
AGTAATACAATATCATTGTGATGGTTCTTTTAATAATCTGAATCATGCTGTACAAATAAT
AGGATATGATAAATCAGTTGCCGTATCCCCATTATATTATAAAAAATTCCATGGGGATCA
AATTTCGGAGACAAAGGCTATATGTACATAGGAATAGGCAATAATTTATGCGGCATAGCA
AATCAAGTTTCATCATTGGATACTTTTTAAGACAATCCATTAATATAAATGAAAATACTT
GAAGAAATATTTATATCAATTTTAAAATGTACATAAATTTATAAATGTGTTCTTTAATCG
AGATAAGAAATGACATGAAATAATATTATTAATAATAATAATAATATATATTAAATTATA
ACTCCAATATTTGTTATATAATTAACAGAATATTTAACGTTAATATTGTACTGTATATTT
ATCTTTATACAGTGATTTACATATTTTTTTATAAATATTTTGGTCCACACCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)