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Apis mellifera
cluster # 306 cluster # 306       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_306#0 length = 1194 sequences # 5  
consensusID : consensus_306#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1194
fasta sequence 
                              [ATAAAATATCCCTATACACATTAAGATGGGTAGGGAGGACAAGGCAACATGGAAATCCAATTATTTTACAAAACTTGTTCAACTATTGGACGATTATCCTAAGTGTTTCATTGTGGGTGCAGACAATGTTGGTTCTAAACAAATGCAACAAATCCGTATGTCTCTTCGTGGAAATGCAGTTGTATTAATGGGAAAAAATACTATGATGAGGAAAGCAATCCGTGGTCATATTGAGCGTAATGCAGCACTTGAGAAACTTCTTCCACATATTCGTGGAAATGTTGGTTTTGTTTTTACCCGTGGAGATTTAATTGAAGTGAGAGACAAACTTTTNNAAAATAAAGTCAGAGCACCAGCTAGAGCAGGTGCCATTGCACCATTGAGCGTAATTATTCCTGCTCAAAATACTGGTCTTGGTCCTGAAAAAACCTCATTCTTTCAAGCTTTGAGTATTCCAACTAAAATTTCTAAGGGTACTATTGAAATTATTAACGATGTACATATTTTAAAACCAGGTGATAAAGTAGGTGCATCTGAAGCTACTCTTTTAAACATGTTGAATATTTCTCCATTTTCATATGGTTTACTTGTTGAACAAGTTTATGATTCTGGTACTATTTTTGCACCTGAAATTTTGGATATTAAACCAGAAGATTTATGTGAAAAATTTATGG-CTGGGGTAGCAAATTTAGCTGCAGTTTGCTTAGCTATTGGTTATCCAACAATAGCTAGTGCTCCTCACAGTATTGCAAATGGATTCAAGAATTTATTGGCAATAGCTGCTGTTACTGATATTGAATTTCCAGAAGCAACTACAATTAAAGAATATATTAAAGATCCAAGTAAATTTGCAGCCACTGTTTCTGTTGCTGCACCAGTTGTGTCTTCTACAGAAACACCTGCTGCAGAAAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAATCTGAATCAGAAGATGAAGATATGGGATTCGGTTTATTTGACTAAAATATAAATATACATACATACATGTATGTATTATGATATGGCTAAATTCACAAATTTTTCAACAAAAAAAAATTGTAATAAAATATGATTTATAATACAAAAAGGTTCATTTTATCATTCCTTTTATTTGATTTTTTATATATAAATCTATGTATTTATTTTTATTTATCAATAAAAATAAATATATCATTGAATCAATAGTTGATATTAGTTAA]

[+] EMBL BI512704             [ATAAAATATCCCTATACACATTAAGATGGGTAGGGAGGACAAGGCAACATGGAAATCCAATTATTTTACAAAACTTGTTCAACTATTGGACGATTATCCTAAGTGTTTCATTGTGGGTGCAGACAATGTTGGTTCTAAACAAATGCAACAAATCCGTATGTCTCTTCGTGGAAATGCAGTTGTATTAATGGGAAAAAATACTATGATGAGGAAAGCAATCCGTGGTCATATTGAGCGTAATGCAGCACTTGAGAAACTTCTTCCACATATTCGTGGAAATGTTGGTTTTGTTTTTACCCGTGGAGATTTAATTGAAGTGAGAGACAAACTTTTAGAAAATAAAGTCAGAGCACCAGCTAGAGCAGGTGCCATTGCACCATTGAGCGTAATTATTCCTGCTCAAAATACTGGTCTTGGTCCTGAAAAAACCTCATTCTTTCAAGCTTTGAGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI508468             [                                                                                                                                        AAACAAATGCAACAAATCCGTATGTCTCTTCGTGGAAATGCAGTTGTATTAATGGGAAAAAATACTATGATGAGGAAAGCAATCCGTGGTCATATTGAGCGTAATGCAGCACTTGAGAAACTTCTTCCACATATTCGTGGAAATGTTGGTTTTGTTTTTACCCGTGGAGATTTAATTGAAGTGAGAGACAAACTTTTNNAAAATAAAGTCAGAGCACCAGCTAGAGCAGGTGCCATTGCACCATTGAGCGTAATTATTCCTGCTCAAAATACTGGTCTTGGTCCTGAAAAAACCTCATTCTTTCAAGCTTTGAGTATTCCAACTAAAATTTCTAAGGGTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI509234             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAATTATTCCTGCTCAAAATACTGGTCTTGGTCCTGAAAAAACCTCATTCTTTCAAGCTTTGAGTATTCCAACTAAAATTTCTAAGGGTACTATTGAAATTATTAACGATGTACATATTTTAAAACCAGGTGATAAAGTAGGTGCATCTGAAGCTACTCTTTTAAACATGTTGAATATTTCTCCATTTTCATATGGTTTACTTGTTGAACAAGTTTATGATTCTGGTACTATTTTTGCACCTGAAATTTTGGATATTAAACCAGAAGATTTATGTGAAAAATTTATGG CTGGGGTAGCAAATTTAGCTGCAGTTTGCTTAGCTATTGGTTATCCAACAATAGCTAGTGCTCCTCACAGTATTGCAAATGGATTCAAGAATTTATTGGCAATAGCTGCTGTTACTGATATTGAATTTCCAGAAGCAACTACAATTAAAGAATATATTAAAGATCCAAGTAAATTTGCAGCCACTGTTTCTGTTGCTGCACCAGTTGTGTCTTCTACAGAAACACCTGCTGCAGAAAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAATCTGAATCAGAAGATGAAGATATGGGATTCGGTTTATTTGACTAAAATATAAATATACATACATACATGT                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI506030             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTTTACTTGTTGAACAAGTTTATGATTCTGGTACTATTTTTGCACCTGAAATTTTGGATATTAAACCAGAAGATTTATGTGAAAAATTTATGGNNNGGGGTAGCAAATTTAGCTGCAGTTTGCTTAGCTATTGGTTATCCAACAATAGCTAGTGCTCCTCACAGTATTGCAAATGGATTCAAGAATTTATTGGCAATAGCTGCTGTTACTGATATTGAATTTCCAGAAGCAACTACAATTAAAGAATATATTAAAGATCCAAGTAAATTTGCAGCCACTGTTTCTGTTGCTGCACCAGTTGTGTCTTCTACAGAAACACCTGCTGCAGAAAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAATCTGAATCAGAAGATGAAGATATGGGATTCGGTTTATTTGACTAAAATATAAATATACATACATACATGTATGTATTATGATATGGCTAAATTCACAAATTTTTCAACAAAAAAAAATTGTAATAAAATATGATTTATAATACATATTGGTTCATTTTATCATTCCTTTTATTTGATTTTTTATATATAAATCTATGTATTTATTTTTATTTATCAATAAAAATAAATATATCATTGAATCAATAGTTGATATTAGTTAA]
[+] EMBL BI504236             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTTTACTTGTTGAACAAGTTTATGATTCTGGTACTATTTTTGCACCTGAAATTTTGGATATTAAACCAGAAGATTTATGTGAAAAATTTATGG CTGGGGTAGCAAATTTAGCTGCAGTTTGCTTAGCTATTGGTTATCCAACAATAGCTAGTGCTCCTCACAGTATTGCAAATGGATTCAAGAATTTATTGGCAATAGCTGCTGTTACTGATATTGAATTTCCAGAAGCAACTACAATTAAAGAATATATTAAAGATCCAAGTAAATTTGCAGCCACTGTTTCTGTTGCTGCACCAGTTGTGTCTTCTACAGAAACACCTGCTGCAGAAAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAATCTGAATCAGAAGATGAAGATATGGGATTCGGTTTATTTGACTAAAATATAAATATACATACATACATGCATGTATTATGATATGGCTAAATTCACAAATTTTTCAACAAAAAAAAATTGTAATAAAATATGATTTATAATACAAAAAaa                                                                                                              ]




>consensus_306#0
ATAAAATATCCCTATACACATTAAGATGGGTAGGGAGGACAAGGCAACATGGAAATCCAA
TTATTTTACAAAACTTGTTCAACTATTGGACGATTATCCTAAGTGTTTCATTGTGGGTGC
AGACAATGTTGGTTCTAAACAAATGCAACAAATCCGTATGTCTCTTCGTGGAAATGCAGT
TGTATTAATGGGAAAAAATACTATGATGAGGAAAGCAATCCGTGGTCATATTGAGCGTAA
TGCAGCACTTGAGAAACTTCTTCCACATATTCGTGGAAATGTTGGTTTTGTTTTTACCCG
TGGAGATTTAATTGAAGTGAGAGACAAACTTTTNNAAAATAAAGTCAGAGCACCAGCTAG
AGCAGGTGCCATTGCACCATTGAGCGTAATTATTCCTGCTCAAAATACTGGTCTTGGTCC
TGAAAAAACCTCATTCTTTCAAGCTTTGAGTATTCCAACTAAAATTTCTAAGGGTACTAT
TGAAATTATTAACGATGTACATATTTTAAAACCAGGTGATAAAGTAGGTGCATCTGAAGC
TACTCTTTTAAACATGTTGAATATTTCTCCATTTTCATATGGTTTACTTGTTGAACAAGT
TTATGATTCTGGTACTATTTTTGCACCTGAAATTTTGGATATTAAACCAGAAGATTTATG
TGAAAAATTTATGGCTGGGGTAGCAAATTTAGCTGCAGTTTGCTTAGCTATTGGTTATCC
AACAATAGCTAGTGCTCCTCACAGTATTGCAAATGGATTCAAGAATTTATTGGCAATAGC
TGCTGTTACTGATATTGAATTTCCAGAAGCAACTACAATTAAAGAATATATTAAAGATCC
AAGTAAATTTGCAGCCACTGTTTCTGTTGCTGCACCAGTTGTGTCTTCTACAGAAACACC
TGCTGCAGAAAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAATCTGAATCAGAAGATGAAGATATGGG
ATTCGGTTTATTTGACTAAAATATAAATATACATACATACATGTATGTATTATGATATGG
CTAAATTCACAAATTTTTCAACAAAAAAAAATTGTAATAAAATATGATTTATAATACAAA
AAGGTTCATTTTATCATTCCTTTTATTTGATTTTTTATATATAAATCTATGTATTTATTT
TTATTTATCAATAAAAATAAATATATCATTGAATCAATAGTTGATATTAGTTAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)