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Apis mellifera
cluster # 326 cluster # 326       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_326#0 length = 1103 sequences # 5  

consensusID : consensus_326#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1103
fasta sequence
                              [ATATATTTTTTTCATTCAAGATTTTTTTTTATCTTAAAAATGAAAAGAGTTTAAACTATTTATTTTGAGTGCCTTTTTTTTCATAATCATAGAATTGTACATTTATGTGAACATATTAAAACAAATAGAGATATTTTAAGGCACTTGCTCCTTTTCCGATATATAACGTAATAGTTTTTTTAAAATTTTCTTCGTGAGCATAGAGAGTTCCTTAAAAAATTGTAATAAACATAAAAGGAACACTATCTTTTATTTGGAAAGAATACTATAAAATGTTCGTTGAGCTTGTTAAGTGCACACGAAAGGAACCTTGCTGTTTATTCTTTTAATTTTTTTCTAATTTCTTCTGTTATTCCACACATCTTATTATATTATTTCATGGAATACTTTTTTTGATATAAAACAAAACTATTTATCAACATACTTCTTGAAAATCATGCAAGAAGTTTGAGATTTCTGGACATATTTTTAGTTCGTCTTCTATTGAATGCAATAGAATACATTCAAAGCGAACATCAGCACAATTTATTACTCATAAAATTCATTAAAAGTTGTTATAGAGATTTGTCCATTCATTTCTTTATAATTCTGTATGATGTGATGGAAATTTTTTCAGAACTGCATGATAAAGATTGTAAAATGCATAAAAACTAACACTTAAGATGACGATCAATGCCGAGCCAAATATCCAAGATAAAAAATGACCATCTATGATATCCGAGGTCTCTTTTCTCTTTCTTGCGCTAATCTCGCCCAGGGTAGTACCTTTTCGCTCTTCCATCAGTCTTTTCATATTCGCTAATTTCTCACGCAGTTCATCTACTGATTCAGCGATATCTTCGATTGAATCGCCTCCAGGTAGATCTACAACTTGGCCGAATAAAGTGTAATTCCGAGAAATAGAAACGTTCAAAAGCATCATTTAAATGTAAAGCAAAAAAGTGTTTTGGAGAAAATAAAAACTTTCCATTTTAAATATATTTAAAAAAAAAAATATTAATAATTAAAAAGAAATATAATTTTTTTGTTATTCATTAAAAATAATATTTAAAGAGATACTTAGAATTTAAAAAATTGAAATATTTATAATAAAATACTTTTTT]

[+] EMBL BI511500             [ATATATTTTTTTCATTCAAGATTTTTTTTTATCTTAAAAATGAAAAGAGTTTAAACTATTTATTTTGAGTGCCTTTTTTTTCATAATCATAGAATTGTACATTTATGTGAACATATTAAAACAAATAGAGATATTTTAAGGCACTTGCTCCTTTTCCGATATATAACGTAATAGTTTTTTTAAAATTTTCTTCGTGAGCATAGAGAGTTCCTTAAAAAATTGTAATAAACATAAAAGGAACACTATCTTTTATTTGGAAAGAATACTATAAAATGTTCGTTGAGCTTGTTAAGTGCACACGAAAGGAACCTTGCTGTTTATTCTTTTAATTTTTTTCTAATTTCTTCTGTTATTCCACACATCTTATTATATTATTTCATGGAATACTTTTTTTGATATAAAACAAAACTATTTATCAACATACTTCTTGAAAATCATGCAAGAAGTTTGAGATTTCTGGACATATTTTTAGTTCGTCTTCTATTGAATGCAATAGAATACATTCAAAGCGAACATCAGCACAATTTATTACTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL BI503720             [                                                                                                                                                                            AGTTTTTTTAAAATTTTCTTCGTGAGCATAGAGAGTTCCTTAAAAAATTGTAATAAACATAAAAGGAACACTATCTTTTATTTGGAAAGAATACTATAAAATGTTCGTTGAGCTTGTTAAGTGCACACGAAAGGAACCTTGCTGTTTATTCTTTTAATTTTTTTCTAATTTCTTCTGTTATTCCACACATCTTATTATATTATTTCATGGAATACTTTTTTTGATATAAAACAAAACTATTTATCAACATACTTCTTGAAAATCATGCAAGAAGTTTGAGATTTCTGGACATATTTTTAGTTCGTCTTCTATTGAATGCAATAGAATACATTCAAAGCGAACATCAGCACAATTTATTACTCATAAAATTCATTAAAAGTTGTTATAGAGATTTGTCCATTCATTTCTTTATAATTCTGTATGATGTGATGGAAATTTTTTCAGAACTGCATGATAAAGATTGTAAAATGCATAAAAACTAACACTTAAGATGACGATCAATGCCGAGCCAAATATCCAAGATAAAAAATGACCATCTATGATATCCGAGGTCTCTTTTCTCTTTCTTGCGCTAATCTCGCCCAGGGTAGTACCTTTTCGCTCTTCCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL BI511490             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAATTTTTTTCTAATTTCTTCTGTTATTCCACACATCTTATTATATTATTTCATGGAATACTTTTTTTGATATAAAACAAAACTATTTATCAACATACTTCTTGAAAATCATGCAAGAAGTTTGAGATTTCTGGACATATTTTTAGTTCGTCTNCTATTGAATGCAATAGAATACATTCAAAGCGAACATCAGCACAATTTATTACTCATAAAATTCATTAAAAGTTGTTATAGAGATTTGTCCATTCATTTCTTTATAATTCTGTATGATGTGATGGAAATTTTTTCAGAACTGCATGATAAAGATTGTAAAATGCATAAAAACTAACACTTAAGATGACGATCAATGCCGAGCCAAATATCCAAGATAAAAAATGACCATCTATGATATCCGAGGTCTCTTTTCTCTTTCTTGCGCTAATCTCGCCCAGGGTAGTACCTTTTCGCTCTTCCATCAGTCTTTTCATATTCGCTAATTTCTCACGCAGTTCATCTACTGATTCAGCGA                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL BI515531             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATTTTTTTCTAATTTCTTCTGCTATTCCACACATCTTATTATATTATTTCATGGAATACTTTTTTTGATATAAAACAAAATTATTTATCAACATACTTCTTGAAAATCATGCAAGAAGTTTGAGATTTCTGGACATATTTTTAGTTCGTCTTCTATTGAATGCAATAGAATACATTCAAAGCGAACATCAGCACAATTTATTACTCATAAAATTCATTAAAAGTTGTTATAGAGATTTGTCCATTCATTTCTTTATAATTCTGTATGATGTGATGGAAATTTTTTCAGAACTGCATGATAAAGATTGTAAAATGCATAAAAACTAACACTTAAGATGACGATCAATGCCGAGCCAAATATCCAAGATAAAAAATGACCATCTATGATATCCGAGGTCTCTTTTCTCTTTCTTGCGCTAATCTCGCCCAGGGTAGTACCTTTTCGCTCTTCCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL BI512886             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATTCATTAAAAGTTGTTATAGAGATTTGTCCATTCATTTCTTTATAATTCTGTATGATGTGATGGAAATTTTTTCAGAACTGCATGATAAAGATTGTAAAATGCATAAAAACTAACACTTAAGATGACGATCAATGCCGAGCCAAATATCCAAGATAAAAAATGACCATCTATGATATCCGAGGTCTCTTTTCTCTTTCTTGCGCTAATCTCGCCCAGGGTAGTACCTTTTCGCTCTTCCATCAGTCTTTTCATATTCGCTAATTTCTCACGCAGTTCATCTACTGATTCAGCGATATCTTCGATTGAATCGCCTCCAGGTAGATCTACAACTTGGCCGAATAAAGTGTAATTCCGAGAAATAGAAACGTTCAAAAGCATCATTTAAATGTAAAGCAAAAAAGTGTTTTGGAGAAAATAAAAACTTTCCATTTTAAATATATTTAAAAAAAAAAATATTAATAATTAAAAAGAAATATAATTTTTTTGTTATTCATTAAAAATAATATTTAAAGAGATACTTAGAATTTAAAAAATTGAAATATTTATAATAAAATACTTTTTT]


>consensus_326#0 ATATATTTTTTTCATTCAAGATTTTTTTTTATCTTAAAAATGAAAAGAGTTTAAACTATT TATTTTGAGTGCCTTTTTTTTCATAATCATAGAATTGTACATTTATGTGAACATATTAAA ACAAATAGAGATATTTTAAGGCACTTGCTCCTTTTCCGATATATAACGTAATAGTTTTTT TAAAATTTTCTTCGTGAGCATAGAGAGTTCCTTAAAAAATTGTAATAAACATAAAAGGAA CACTATCTTTTATTTGGAAAGAATACTATAAAATGTTCGTTGAGCTTGTTAAGTGCACAC GAAAGGAACCTTGCTGTTTATTCTTTTAATTTTTTTCTAATTTCTTCTGTTATTCCACAC ATCTTATTATATTATTTCATGGAATACTTTTTTTGATATAAAACAAAACTATTTATCAAC ATACTTCTTGAAAATCATGCAAGAAGTTTGAGATTTCTGGACATATTTTTAGTTCGTCTT CTATTGAATGCAATAGAATACATTCAAAGCGAACATCAGCACAATTTATTACTCATAAAA TTCATTAAAAGTTGTTATAGAGATTTGTCCATTCATTTCTTTATAATTCTGTATGATGTG ATGGAAATTTTTTCAGAACTGCATGATAAAGATTGTAAAATGCATAAAAACTAACACTTA AGATGACGATCAATGCCGAGCCAAATATCCAAGATAAAAAATGACCATCTATGATATCCG AGGTCTCTTTTCTCTTTCTTGCGCTAATCTCGCCCAGGGTAGTACCTTTTCGCTCTTCCA TCAGTCTTTTCATATTCGCTAATTTCTCACGCAGTTCATCTACTGATTCAGCGATATCTT CGATTGAATCGCCTCCAGGTAGATCTACAACTTGGCCGAATAAAGTGTAATTCCGAGAAA TAGAAACGTTCAAAAGCATCATTTAAATGTAAAGCAAAAAAGTGTTTTGGAGAAAATAAA AACTTTCCATTTTAAATATATTTAAAAAAAAAAATATTAATAATTAAAAAGAAATATAAT TTTTTTGTTATTCATTAAAAATAATATTTAAAGAGATACTTAGAATTTAAAAAATTGAAA TATTTATAATAAAATACTTTTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)