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Apis mellifera
cluster # 331 cluster # 331       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_331#0 length = 1041 sequences # 5  

consensusID : consensus_331#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1041
fasta sequence
                              [AAAGAATGAGAGAAAGAGAGGTGTGAACGAGAGAGATAAAGAGTTCAGATGTTAATCGAAGCCAGCGAAATTATCAAATATTATAAATTGTATATTCAAATTATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTATTCCACTTGTGAATATAATTTCCGATTCGGAACAATATTTTGTCAAAAATTGAAAAGAAAAACTCTCGATCACGATCGAGATCTATTCGATTCACAATTGAAAAATCGAAATTTTAAAGGACTTAACATATATTAGAATCACATAGAATCCAAGATAATTAACTCCACCGATGATAATTATTTGATTTTTAGAAAATAAAGTGTTAATCGTGTATTCTGATATGAAAAATAAAGAAATTGTCAGAAAGTGGAGTTAAACAATTTGGCTTCTTTCACTGATTGACTCGTTTAATGATCTAAGCATAATGTCCTGTTAATGTCACGACGATCTTTGCTTTCAAGTAAAGTGAGTCGCAAGTATAAATCGGGGGAAAAAAAAATAAAAATTACATATATACAGATTCATATACGAATACTGTAGCTGATTATAAATTGACATTTCGCTGCTTCGACAAGCTACAGTCTACCATGTATATATTTTCATTAATGTATGTATAATAAAAAAGTATATTCGAGACAACGATCGGCTCTGTTTAGTGTGCGCTGTCTTGTCATTCTTTACGTGAATTATATGGTCGAAAAATCGATACGTATTTGGAATCGATCGGAACTATTCCCGTTACGGAGAATATTTTTGGCTTCTAAATAATATATATATATACATATATATTATCGTAACGACGTATTTCTTCTAGAAATAAATTTTAAATGAACAAATTTCATAAGCTTTTATATTATGTAAAACGTTACCTATTTACATTCACCATTTTCAATAAATTTTCGATGTTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGCAACTATAACTATATTTCAATTCTTTATATTATAAATAAACGATAAGTAAGTATGTATCAGTGCAAACAAAAAAAAAAGGATATATATAAATATATATATTTA]

[+] EMBL BI503638             [AAAGAATGAGAGAAAGAGAGGTGTGAACGAGAGAGATAAAGAGTTCAGATGTTAATCGAAGCCAGCGAAATTATCAAATATTATAAATTGTATATTCAAATTATG    TTTTTTTTTTTTTTTAAATTTATTCCACTTGTGAATATAATTTCCGATTCGGAACAATATTTTGTCAAAAATTGAAAAGAAAAACTCTCGATCACGATCGAGATCTATTCGATTCACAATTGAAAAATCGAAATTTTAAAGGACTTAACATATATTAGAATCACATAGAATCCAAGATAATTAACTCCACCGATGATAATTATTTGATTTTTAGAAAATAAAGTGTTAATCGTGTATTCTGATATGAAAAATAAAGAAATTGTCAGAAAGTGGAGTTAAACAATTTGGCTTCTTTCACTGATTGACTCGTTTAATGATCTAAGCATAATGTCCTGTTAATGTCACGACGATCTTTGCTTTCAAGTAAAGTGAGTCGCAAGTATAAATCGGGGGAAAAAAAAATAAAAATTACATATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI508119             [                                                                         TCAAATATTATAAATTGTATATTCAAATTATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTATTCCACTTGTGAATATAATTTCCGATTCGGAACAATATTTTGTCAAAAATTGAAAAGAAAAACTCTCGATCACGATCGAGATCTATTCGATTCACAATTGAAAAATCGAAATTTTAAAGGACTTAACATATATTAGAATCACATAGAATCCAAGATAATTAACTCCACCGATGATAATTATTTGATTTTTAGAAAATAAAGTGTTAATCGTGTATTCTGATATGAAAAATAAAGAAATTGTCAGAAAGTGGAGTTAAACAATTTGGCTTCTTTCACTGATTGACTCGTTTAATGATCTAAGCATAATGTCCTGTTAATGTCACGACGATCTTTGCTTTCAAGTAAAGTGAGTCGCAAGTATAAATCGGGGGAAAAAAAAATAAAAATTACATATATACAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI505338             [                                                                                                                                       ACTTGTGAATATAATTTCCGATTCGGAACAATATTTTGTCAAAAATTGAAAAGAAAAACTCTCGATCACGATCGAGATCTATTCGATTCACAATTGAAAAATCGAAATTTTAAAGGACTTAACATATATTAGAGTCACATAGAATCCAAGATAATTAACTCCACCGATGATAATTATTTGATTTTTAGAAAATAAAGTGTTAATCGTGTATTCTGATATGAAAAATAAAGAAATTGTCAGAAAGTGGAGTTAAACAATTTGGCTTCTTTCACTGATTGACTCGTTTAATGATCTAAGCATAATGTCCTGTTAATGTCACGACGATCTTTGCTTTCAAGTAAAGTGAGTCGCAAGTATAAATC GGGGAAAAAAAAATAAAAATTACATATATACAGATTCATATACGAATACTGTAGCTGATTATAAATTGACATTTCGCTGCTTCGACAAGCTACAGTCTACCATGTATATATTTTCATTAATGTATGTATAATAAAAAAGTATATTCGAGACAACGATCGGCTCTGTTTAGTGTGCGCTGTCTTGTCATTCTTTACGTGAATTATATGGTCGAAAAATCGATACGTATTTGGAATCGATCGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL BI509693             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTCACGACGATCTTTGCTTTCAAGTAAAGTGAGTCGCAAGTATAAATCGGGGGAAAAAAAAATAAAAATTACATATATACAGATTCATATACGAATACTGTAGTTGATTATAAATTGACATTTCGCTGCTTCGACAAGTTACAGTCTACCATGTATATATTTTCATTAATGTATGTATAATAAAAAAGTATATTCGAGACAACGATCGGCTCTGTTTAGTGTGCGCTGTCTTGTCATTCTTTACGTGAATTATATGGTCGAAAAATCGATACGTATTTGGAATCGATCGGAACTATTCCCGTTACGGAGAATATTTTTGGCTTCTAAATAATATATATATATACATATATATTATCGTAACGACGTATTTCTTCTAGAAATAAATTTTAAATGAACAAATTTCATAAGCTTTTATATTATGTAAAACGTTACCTATTTACATTCACCATTTTCAATAAATTTTCGATGTTTTCTTAATATTTTATATTGCAACTATAACTATATTTCAATTCTTTATATTATAAATAAACGATAAGTAAGTATGTATCAGTGCAAACAAAAAAAAAAGGATATATATAAATATATATATTTA]
[-] EMBL BI504073             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTGTGCGCTGTCTTGTCATTCTTTACGTGAATTATATGGTCGAAAAATCGATACGTATTTGGAATCGATCGGAACTATTCCCGTTACGGAGAATATTTTTGGCTTTTAAATAATATATATATATACATATATATTATCGTAACGACGTATTTTTTTTAGAAATAAATTTTAAATGAACAAATTTCATAAGCTTTTATATTATGTAAAACGTTACCTATTTACATTCCCCATTTTCAATAAATTTTCGATGTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAa                                                                                                       ]


>consensus_331#0 AAAGAATGAGAGAAAGAGAGGTGTGAACGAGAGAGATAAAGAGTTCAGATGTTAATCGAA GCCAGCGAAATTATCAAATATTATAAATTGTATATTCAAATTATGTTTTTTTTTTTTTTT TTTTAAATTTATTCCACTTGTGAATATAATTTCCGATTCGGAACAATATTTTGTCAAAAA TTGAAAAGAAAAACTCTCGATCACGATCGAGATCTATTCGATTCACAATTGAAAAATCGA AATTTTAAAGGACTTAACATATATTAGAATCACATAGAATCCAAGATAATTAACTCCACC GATGATAATTATTTGATTTTTAGAAAATAAAGTGTTAATCGTGTATTCTGATATGAAAAA TAAAGAAATTGTCAGAAAGTGGAGTTAAACAATTTGGCTTCTTTCACTGATTGACTCGTT TAATGATCTAAGCATAATGTCCTGTTAATGTCACGACGATCTTTGCTTTCAAGTAAAGTG AGTCGCAAGTATAAATCGGGGGAAAAAAAAATAAAAATTACATATATACAGATTCATATA CGAATACTGTAGCTGATTATAAATTGACATTTCGCTGCTTCGACAAGCTACAGTCTACCA TGTATATATTTTCATTAATGTATGTATAATAAAAAAGTATATTCGAGACAACGATCGGCT CTGTTTAGTGTGCGCTGTCTTGTCATTCTTTACGTGAATTATATGGTCGAAAAATCGATA CGTATTTGGAATCGATCGGAACTATTCCCGTTACGGAGAATATTTTTGGCTTCTAAATAA TATATATATATACATATATATTATCGTAACGACGTATTTCTTCTAGAAATAAATTTTAAA TGAACAAATTTCATAAGCTTTTATATTATGTAAAACGTTACCTATTTACATTCACCATTT TCAATAAATTTTCGATGTTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGCAACTATAACTATATTTCAATT CTTTATATTATAAATAAACGATAAGTAAGTATGTATCAGTGCAAACAAAAAAAAAAGGAT ATATATAAATATATATATTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)