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Apis mellifera
cluster # 363 cluster # 363       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_363#0 length = 852 sequences # 4  

consensusID : consensus_363#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 852
fasta sequence
                              [AATCCACCGGAAGAGGAAGAATCAAAAAAAATGCTGAAAAGCAAAACGATCTACTATATTATCCCAGGGCCTTTGGATGCAATTTTCTAACCTAACCTAATCTAATCTAACAAAATACGAAGTGTATTCCAAAGGTTTAATAATTAACACGTTTCGTATAAGTTTTATCTATTTATCTATGATAATCGATTTAAAATTAAATTTTTTAAACAATATAAACATATCGATTGGATAAGATTAAAAAAAGATTTAAATAAATTCGATAAATCGCTAGAATTGCTCTTATCCATGATTTTGTTGCAAAAGGAAAAAATCAGATTTGTCGATACCATGAAACTTTTCTTTATCGACGTGGAATGGAACGTGTTAAACATGAAAATCCCCAAGAGAAGTAAATATCAAAACTCTTATATTATATTATTACGAGAACCAAGAAAGAAAAAAATAAAAGTGCCTATATTCCGTATGCATTTTGGTGTAATGAATGATGAAATTACATTCGTATATAAGTGATAGAGCGTCGGTGCATTGTTCTATTCTAATGAATGTCCATGCTGCTTAGTGAAGAAACGTAATATACCTGTAATCGTATACATGTACCTTGCGTGTACGTGCTTCCTCGCGCTTGTAGAAGCGATAAGATAAGAGAAACAATTATATATAAAGAAAAAAAATATATATATTATATATATATATATATAGAATTATAAAAAGCCAGCTAGCCAGATTCGCTGGAATAACGAGTGATAATTGATTAGTAATGACAATTGCCACGTTATATATTTTTTTTCCCCCCTTTATTATTAATATCCTATCCTTTACTCGTTGATAATATGATAGTTGTACTCTTTA]

[+] EMBL BI515766             [AATCCACCGGAAGAGGAAGAATCAAAAAAAATGCTGAAAAGCAAAACGATCTACTATATTATCCCAGGGCCTTTGGATGCAATTTTCTAACCTAACCTAATCTAATCTAACAAAATACGAAGTGTATTCCAAAGGTTTAATAATTAACACGTTTCGTATAAGTTTTATCTATTTATCTATGATAATCGATTTAAAATTAAATTTTTTAAACAATATAAACATATCGATTGGATAAGATTAAAAAAAGATTTAAATAAATTCGATAAATCGCTAGAATTGCTCTTATCCATGATTTTGTTGCAAAAGGAAAAAATCAGATTTGTCGATACCATGAAACTTTTCTTTATCGACGTGGAATGGAACGTGTTAAACATGAAAATCCCCAAGAGAAGTAAATATCAAAACTCTTATATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI515428             [                                                                                                                                                                                                           TTTTAAACAATATAAACATATCGATTGGATAAGATTAAAAAAAGATTTAAATAAATTCGATAAATCGCTAGAATTGCTCTTATCCATGATTTTGTTGCAAAAGGAAAAAATCAGATTTGTCGATACCATGAAACTTTTCTTTATCGACGTGGAATGGAACGTGTTAAACATGAAAATCCCCAAGAGAAGTAAATATCAAAACTCTTATATTATATTATTACGAGAACCAAGAAAGAAAAAAATAAAAGTGCCTATATTCCGTATGCATTTTGGTGTAATGAATGATGAAATTACATTCGTATATAAGTGATAGAGCGTCGGTGCATTGTTCTATTCTAATGAATGTCCATGCTGCTTAGTGAAGAAACGTAATATACCTGTAATCGTATACATGTACCTTGCGTGTACGTGCTTCCTCGCGCTTGTAGAAGCGATAAGATAAGAGAAACAATTATATATAAAGAAAAAAAATATATATATTATATATATATATATA                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL BI515191             [                                                                                                                                                                                                                                  ATTGGATAAGATTAAAAAAAGATTTAAATAAATTCGATAAATCGCTAGAATTGCTCTTATCCATGATTTTGTTGCAAAAGGAAAAAATCAGATTTGTCGATACCATGAAACTTTTCTTTATCGACGTGGAATGGAACGTGTTAAACATGAAAATCCCCAAGAGAAGTAAATATCAAAACTCTTATATTATATTATTACGAGNNNCAAGAAAGAAAAAAATAAAAGTGCCTATATTCCGTATGCATTTTGGTGTAATGAATGATGAAATTACATTCGTATATAAGTGATAGAGCGTCGGTGCATTGTTCTATTCTAATGAATGTCCATGCTGCTTAGTGAAGAAACGTAATATACCTGTAATCGTATACATGTACCTTGCGTGTACGTGCTTCCTCGCGCTTGTAGAAGCGATAAGATAAGAGAAACAATTATATATAAAGAAAAAAAATATATATATTATATATATATATATATAGAATTATAAAAAG                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI515362             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CGTGTTAAACATGAAAATCCCCAAGAGAAGTAAATATCAAAACTCTTATATTATATTATTACGAGAACCAAGAAAG AAAAAATAAAAGTGCCTATATTCCGTATGCATTTTGGTGTAATGAATGATGAAATTACATTCGTATATAAGTGATAGAGCGTCGGTGCATTGTTCTATTCTAATGAATGTCCATGCTGCTTAGTGAAGAAACGTAATATACCTGTAATCGTATACATGTACCTTGCGTGTACGTGCTTCCTCGCGCTTGTAGAAGCGATAAGATAAGAGAAACAATTATATATAAAGAAAAAAAATATATATATTATATATATATATATATAGAATTATAAAAAGCCAGCTAGCCAGATTCGCTGGAATAACGAGTGATAATTGATTAGTAATGACAATTGCCACGTTATATATTTTTTTTCCCCCCTTTATTATTAATATCCTATCCTTTACTCGTTGATAATATGATAGTTGTACTCTTTA]


>consensus_363#0 AATCCACCGGAAGAGGAAGAATCAAAAAAAATGCTGAAAAGCAAAACGATCTACTATATT ATCCCAGGGCCTTTGGATGCAATTTTCTAACCTAACCTAATCTAATCTAACAAAATACGA AGTGTATTCCAAAGGTTTAATAATTAACACGTTTCGTATAAGTTTTATCTATTTATCTAT GATAATCGATTTAAAATTAAATTTTTTAAACAATATAAACATATCGATTGGATAAGATTA AAAAAAGATTTAAATAAATTCGATAAATCGCTAGAATTGCTCTTATCCATGATTTTGTTG CAAAAGGAAAAAATCAGATTTGTCGATACCATGAAACTTTTCTTTATCGACGTGGAATGG AACGTGTTAAACATGAAAATCCCCAAGAGAAGTAAATATCAAAACTCTTATATTATATTA TTACGAGAACCAAGAAAGAAAAAAATAAAAGTGCCTATATTCCGTATGCATTTTGGTGTA ATGAATGATGAAATTACATTCGTATATAAGTGATAGAGCGTCGGTGCATTGTTCTATTCT AATGAATGTCCATGCTGCTTAGTGAAGAAACGTAATATACCTGTAATCGTATACATGTAC CTTGCGTGTACGTGCTTCCTCGCGCTTGTAGAAGCGATAAGATAAGAGAAACAATTATAT ATAAAGAAAAAAAATATATATATTATATATATATATATATAGAATTATAAAAAGCCAGCT AGCCAGATTCGCTGGAATAACGAGTGATAATTGATTAGTAATGACAATTGCCACGTTATA TATTTTTTTTCCCCCCTTTATTATTAATATCCTATCCTTTACTCGTTGATAATATGATAG TTGTACTCTTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)