Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 381 cluster # 381       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_381#0 length = 708 sequences # 4  

consensusID : consensus_381#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 708
fasta sequence
                              [CTTCTGGAATGAAAAATTTATTAATGCTTGGTATAGCAATCTAGCAAGATATGCCTTTTCCTTGAACGCAACGTGGTTGGTGAACTCTGCTGCTCATATGTGGGGCATGAGACCTTACGATAAAAATATTGGTCCGACGGAAAATCTAACTGTATCTATACTTGGATGTGGTGAGGGATGGCATAATTATCATCATGTATTTCCATGGGATTATAAAGCCGGTGAATTTGGCAACTACAACACTAACTTTTCCACTGCATTCATTGATTTCTGTGCTCGATTGGGATTGGCATACGATATGAAAACTGTCCCTGTCGAAGTGATTAAAAAACGAGCCGCTAGAACTGGAGATGGATCGAGATACAATAAAAATGAAACTATTTATCATCACAATCACGAGGATATGAAATGG-GGTTGGGGTGATACAGATATGAAGCCTGAGGAAATCCAAGAAGTCAATATTTATAACAAAGGCGATTAATCGATCGTTTGATAAATAGCAGAAATGACTGATCGATAGTGCACGGATAGTCACTAATTGGAAAACAATTAATCATTCATTACATCAATTATTGATTATCATAAAAATTATTAACAGTTTGTCGTTATATTACCTCCATGAAGGATCGATTGCTTAGTCGATAATGTGATTAATATAATTTTGATTAAATTAGACAAAATAAATACAAAACGATTTGAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI504191             [CTTCTGGAATGAAAAATTTATTAATGCTTGGTATAGCAATCTAGCAAGATATGCCTTTTCCTTGAACGCAACGTGGTTGGTGAACTCTGCTGCTCATATGTGGGGCATGAGACCTTACGATAAAAATATTGGTCCGACGGAAAATCTAACTGTATCTATACTTGGATGTGGTGAGGGATGGCATAATTATCATCATGTATTTCCATGGGATTATAAAGCCGGTGAATTTGGCAACTACAACACTAACTTTTCCACTGCATTCATTGATTTCTGTGCTCGATTGGGATTGGCATACGATATGAAAACTGTCCCTGTCGAAGTGATTAAAAAACGAGCCGCTNGAACTGGAGATGGATCGAGATACAATAAAAATGAAACTATTTATCATCACAATCACGAGGATATGAAATGG GGTTGGGGTGATACAGATATGAAGCCTGAGGAAATCCAAGAAGTCAATATTTATAACAAAGGCGATTAATCGATCGTTTGATAAATAGCAGAAATGACTGATCGATAGTGCACGGATAGTCACTAATTGGAAAACAATTAATCATTCATTACATCAATTATTGATTATCAT                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI507092             [                                           GCAAGATATGCCTTTTCCTTGAACGCAACGTGGTTGGTGAACTCTGCTGCTCATATGTGGGGCATGAGACCTTACGATAAAAATATTGGTCCGACGGAAAATCTAACTGTATCTATACTTGGATGTGGTGAGGGATGGCATAATTATCATCATGTATTTCCATGGGATTATAAAGCCGGTGAATTTGGCAACTACAACACTAACTTTTCCACTGCATTCATTGATTTCTGTGCTCGATTGGGATTGGCATACGATATGAAAACTGTCCCTGTCGAAGTGATTAAAAAACGAGCCCCTAGAACTGGAGATGGATCGAGATACAATAAAAATGAAACTATTTATCATCACAATCACGAGGATATGAAATGGNNNTTGGGGTGATACAGATATGAAGCCTGAGGAAATCCAAGAAGTCAATATTTATAACAAAGGCGATTAATCGATCGTTTGATAAATAGCAGAAATGACTGATCGATAGTGCACGGATAGTCACTAATTGGAAAACAATTAATCATTCATTACATCAATTATTGATTATCATAAAAATTATTAACAGTTT                                                                                                           ]
[+] EMBL BI509800             [                                           GCAAGATATGCCTTTTCCTTGAACGCAACGTGGTTGGTGAACTCTGCTGCTCATATGTGGGGCATGAGACCTTACGATAAAAATATTGGTCCGACGGAAAATCTAACTGTATCTATACTTGGATGTGGTGAGGGATGGCATAATTATCATCATGTATTTCCATGGGATTATAAAGCCGGTGAATTTGGCAACTACAACACTAACTTTTCCACTGCATTCATTGATTTCTGTGCTCGATTGGGATTGGCATACGATATGAAAACTGTCCCTGTCGAAGTGATTAAAAAACGAGCCCCTAGAACTGGAGATGGATCGAGATACAATAAAAATGAAACTATTTATCATCACAATCACGAGGATATGAAATGG GGTTGGGGTGATACAGATATGAAGCCTGAGGAAATCCAAGAAGTCAATATTTATAACAAAGGCGATTAATCGATCGTTTGATAAATAGCAGAAATGACTGATCGATAGTGCACGGATAGTCACTAATTGGAAAACAATTAATCATTCATTACATCAATTATTGATTATCATAAAAATT                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI504175             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTCCCTGTCGAAGTGATTAAAAAACGAGCCGCTAGAACTGGAGATGGATCGAGATACAATAAAAATGAAACTATTTATCATCACAATCACGAGGATATGAAATGG GGTTGGGGTGATACAGATATGAAGCCTGAGGAAATCCAAGAAGTCAATATTTATAACAAAGGCGATTAATNNNNNNNTTGATAAATAGCAGAAATGACTGATCGATAGTGCACGGATAGTCACTAATTGGAAAACAATTAATCATTCATTACATCAATTATTGATTATCATAAAAATTATTAACAGTTTGTCGTTATATTACCTCCATGAAGGATCGATTGCTTAGTCGATAATGTGATTAATATAATTTTGATTAAATTAGACAAAATAAATACAAAACGATTTGAAAAAAAAAA]


>consensus_381#0 CTTCTGGAATGAAAAATTTATTAATGCTTGGTATAGCAATCTAGCAAGATATGCCTTTTC CTTGAACGCAACGTGGTTGGTGAACTCTGCTGCTCATATGTGGGGCATGAGACCTTACGA TAAAAATATTGGTCCGACGGAAAATCTAACTGTATCTATACTTGGATGTGGTGAGGGATG GCATAATTATCATCATGTATTTCCATGGGATTATAAAGCCGGTGAATTTGGCAACTACAA CACTAACTTTTCCACTGCATTCATTGATTTCTGTGCTCGATTGGGATTGGCATACGATAT GAAAACTGTCCCTGTCGAAGTGATTAAAAAACGAGCCGCTAGAACTGGAGATGGATCGAG ATACAATAAAAATGAAACTATTTATCATCACAATCACGAGGATATGAAATGGGGTTGGGG TGATACAGATATGAAGCCTGAGGAAATCCAAGAAGTCAATATTTATAACAAAGGCGATTA ATCGATCGTTTGATAAATAGCAGAAATGACTGATCGATAGTGCACGGATAGTCACTAATT GGAAAACAATTAATCATTCATTACATCAATTATTGATTATCATAAAAATTATTAACAGTT TGTCGTTATATTACCTCCATGAAGGATCGATTGCTTAGTCGATAATGTGATTAATATAAT TTTGATTAAATTAGACAAAATAAATACAAAACGATTTGAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)