These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_397#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 615 fasta sequence [ATGGCTAGTGCGGGTACAAAATTGGTGGTAGTTGATTTCACAGCAACATGGTGTGGTCCATGCCAGCGAATTGCACCAATATTTGAACAACTATCACTTAAATATCCAAATGCAGTATTCCTTAAAGTCGATGTAGACAAGTGTGCAGAAACTGCTGCTATGCAAGGAGTTAGTGCAATGCCCACATTTATATTTTACCGTAACCAAACAAAATTGGGATTGTGTCAAGGAGCTGATCCAACTGGATTGGAATCAAAAATTCTACAATTTTATGGCTCTGGAGATTTAGNGGATTCTGAGAGTCCAGTATCTGGACATGTACGAAATAGTGATAATGTTTATTACCATATTTTTGGAATGATATTTCTTGCTGCAGTTCTGTACTTGTGGAATAAGTACCAATAAACAAGTTGTGATGGATCTAGCTACTTTCATTACAAAAGCACAATCTGAATGTTTAAATGAATCTGATGATCATAATTTCTTACAATGCTTGAATACTGATGATGGATATTTGGAAAGTGAATGTGATGAACAATTAATATTATCTATTGCATTTTCACAAGCAGTTAAAGTACATTCTTTAAAAATTAAAGCTCCCAAAGACAAGGGACC] [+] EMBL BI512051 [ATGGCTAGTGCGGGTACAAAATTGGTGGTAGTTGATTTCACAGCAACATGGTGTGGTCCATGCCAGCGAATTGCACCAATATTTGAACAACTATCACTTAAATATCCAAATGCAGTATTCCTTAAAGTCGATGTAGACAAGTGTGCAGAAACTGCTGCTATGCAAGGAGTTAGTGCAATGCCCACATTTATATTTTACCGTAACCAAACAAAATTGGGATTGTGTCAAGGAGCTGATCCAACTGGATTGGAATCAAAAATTCTACAATTTTATGGCTCTGGAGATTTAGNGGATTCTGAGAGTCCAGTATCTGGACATGTACGAAATAGTGATAATGTTTATTACCATATTTTTGGAATGATATTTCTTGCTGCAGTTCTGTACTTGTGGAATAAGTACCAATAAAC ] [+] EMBL BI507288 [ GGTGGTAGTTGATTTCACAGCAACATGGTGTGGTCCATGCCAGCGAATTGCACCAATATTTGAACAACTATCACTTAAATATCCAAATGCAGTATTCCTTAAAGTCGATGTAGACAAGTGTGCAGAAACTGCTGCTATGCAAGGAGTTAGTGCAATGCCCACATTTATATTTTACCGTAACCAAACAAAATTGGGATTGTGTCAAGGAGCTGATCCAACTGGATTGGAATCAAAAATTCTACAATTTTATGGCTCTGGAGATTTAGAGGATTCTGAGAGTCCAGTATCTGGACATGTACGAAATAGTGATAATGTTTATTACCATATTTTTGGAATGATATTTCTTGCTGCAGTTCTGTACTTGTGGAATAAGTACCAATAAACAAGTTGTGATGGATCTAGCTACTTTCATTACAAAAGCACAATCTGAATGTTTAAATGAATCTGATGATCATAATTTCTTACAATGCTTGAATACTGATGATGGATATTTGGAAAGTGAATGTGATGAACAATTAATATTATCTATTGCATTTTCACAAGCAGTTAAAGTACATTCTTTAAAAATTAAAGCTCCCAAAGACAAGGGACC] consensusID : consensus_397#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 571 fasta sequence [GCTAGTGCGGGTACAAAATTGGTGGTAGTTGATTTCACAGCAACATGGTGTGGTCCATGCCAGCGAATTGCACCAATATTTGAACAACTATCACTTAAATATCCAAATGCAGTATTCCTTAAAGTCGATGTAGACAAGTGTGCAGAAACTGCTGCTATGCAAGGAGTTAGTGCAATGCCCACATTTATATTTTACCGTAACCAAACAAAATTGGGATTGTGTCAAGGAGCTGATCCAACTGGATTGGAATCAAAAATTCTACAATTTTATGGCTCTGGAGATTTAGAGGATTCTGAGAGTCCAGTATCTGGACATATGGATCTAGCTACTTTCATTACAAAAGCACAATCTGAATGTTTAAATGAATCTGATGATCATAATTTCTTACAATGCTTGAATACTGATGATGGATATTTGGAAAGTGAATGTGATGAACAATTAATATTATCTATTGCATTTTCACAAGCAGTTAANNNACATTCTTTAAAAATTAAAGCTCCCAAAGACAAGGGACCAAAAAATATTAAACTGTTTATTAATCAACCTAGNACAATTGATTTTGATATGGCAG] [+] EMBL BI514441 [GCTAGTGCGGGTACAAAATTGGTGGTAGTTGATTTCACAGCAACATGGTGTGGTCCATGCCAGCGAATTGCACCAATATTTGAACAACTATCACTTAAATATCCAAATGCAGTATTCCTTAAAGTCGATGTAGACAAGTGTGCAGAAACTGCTGCTATGCAAGGAGTTAGTGCAATGCCCACATTTATATTTTACCGTAACCAAACAAAATTGGGATTGTGTCAAGGAGCTGATCCAACTGGATTGGAATCAAAAATTCTACAATTTTATGGCTCTGGAGATTTAGAGGATTCTGAGAGTCCAGTATCTGGACATATGGATCTAGCTACTTTCATTACAAAAGCACAATCTGAATGTTTAAATGAATCTGATGATCATAATTTCTTACAATGCTTGAATACTGATGATGGATATTTGGAAAGTGAATGTGATGAACAATTAATATTATCTATTGCATTTTCACAAGCAGTTAAAGTACATTCTTTAAAAATTAAAGCTCCCAAAGACAAGGGACCAAAAAATATTAAACTGTTTATTAATCAACCTAGNACAATTGATTTTGATATGGCAG] [+] EMBL BI513824 [ TGATTTCACAGCAACATGGTGTGGTCCATGCCAGCGAATTGCACCAATATTTGAACAACTATCACTTAAATATCCAAATGCAGTATTCCTTAAAGTCGATGTAGACAAGTGTGCAGAAACTGCTGCTATGCAAGGAGTTAGTGCAATGCCCACATTTATATTTTACCGTAACCAAACAAAATTGGGATTGTGTCAAGGAGCTGATCCAACTGGATTGGAATCAAAAATTCTACAATTTTATGGCTCTGGAGATTTAGAGGATTCTGAGAGTCCAGTATCTGGACATATGGATCTAGCTACTTTCATTACAAAAGCACAATCTGAATGTTTAAATGAATCTGATGATCATAATTTCTTACAATGCTTGAATACTGATGATGGATATTTGGAAAGTGAATGTGATGAACAATTAATATTATCTATTGCATTTTCACAAGCAGTT ANNNACATTCTTTAAAAATTAAAGCTCCCAAAGACAAGGGACCAAAAAATATTAAACTGTTTATTAATCAACCTAGNACAATTGATTTTGATATGGCAG] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_397#0 ATGGCTAGTGCGGGTACAAAATTGGTGGTAGTTGATTTCACAGCAACATGGTGTGGTCCA 60 consensus_397#1 ---GCTAGTGCGGGTACAAAATTGGTGGTAGTTGATTTCACAGCAACATGGTGTGGTCCA 57 ********************************************************* consensus_397#0 TGCCAGCGAATTGCACCAATATTTGAACAACTATCACTTAAATATCCAAATGCAGTATTC 120 consensus_397#1 TGCCAGCGAATTGCACCAATATTTGAACAACTATCACTTAAATATCCAAATGCAGTATTC 117 ************************************************************ consensus_397#0 CTTAAAGTCGATGTAGACAAGTGTGCAGAAACTGCTGCTATGCAAGGAGTTAGTGCAATG 180 consensus_397#1 CTTAAAGTCGATGTAGACAAGTGTGCAGAAACTGCTGCTATGCAAGGAGTTAGTGCAATG 177 ************************************************************ consensus_397#0 CCCACATTTATATTTTACCGTAACCAAACAAAATTGGGATTGTGTCAAGGAGCTGATCCA 240 consensus_397#1 CCCACATTTATATTTTACCGTAACCAAACAAAATTGGGATTGTGTCAAGGAGCTGATCCA 237 ************************************************************ consensus_397#0 ACTGGATTGGAATCAAAAATTCTACAATTTTATGGCTCTGGAGATTTAGNGGATTCTGAG 300 consensus_397#1 ACTGGATTGGAATCAAAAATTCTACAATTTTATGGCTCTGGAGATTTAGAGGATTCTGAG 297 ************************************************* ********** consensus_397#0 AGTCCAGTATCTGGACATGTACGAAATAGTGATAATGTTTATTACCATATTTTTGGAATG 360 consensus_397#1 AGTCCAGTATCTGGACAT------------------------------------------ 315 ****************** consensus_397#0 ATATTTCTTGCTGCAGTTCTGTACTTGTGGAATAAGTACCAATAAACAAGTTGTGATGGA 420 consensus_397#1 -------------------------------------------------------ATGGA 320 ***** consensus_397#0 TCTAGCTACTTTCATTACAAAAGCACAATCTGAATGTTTAAATGAATCTGATGATCATAA 480 consensus_397#1 TCTAGCTACTTTCATTACAAAAGCACAATCTGAATGTTTAAATGAATCTGATGATCATAA 380 ************************************************************ consensus_397#0 TTTCTTACAATGCTTGAATACTGATGATGGATATTTGGAAAGTGAATGTGATGAACAATT 540 consensus_397#1 TTTCTTACAATGCTTGAATACTGATGATGGATATTTGGAAAGTGAATGTGATGAACAATT 440 ************************************************************ consensus_397#0 AATATTATCTATTGCATTTTCACAAGCAGTTAAAGTACATTCTTTAAAAATTAAAGCTCC 600 consensus_397#1 AATATTATCTATTGCATTTTCACAAGCAGTTAANNNACATTCTTTAAAAATTAAAGCTCC 500 ********************************* ************************ consensus_397#0 CAAAGACAAGGGACC--------------------------------------------- 615 consensus_397#1 CAAAGACAAGGGACCAAAAAATATTAAACTGTTTATTAATCAACCTAGNACAATTGATTT 560 *************** consensus_397#0 ----------- consensus_397#1 TGATATGGCAG 571 |
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